2 paskaita

Question 1

DNR superspiralizuojasi, kai molekulėje atsiranda:

Answer 1

torsinė įtemptis

Question 2

Lk

Answer 2

Sankibos laipsnis nurodo, kiek kartų DNR grandinės sukibusios apie vieną kitą tam tikra kryptimi

Question 3

Tw

Answer 3

sūkių skaičius konkrečios erdvinės struktūros DNR (a, b arba z) ir ilgio uždaroje relaksuotoje DNR molekulėje

Question 4

Wr

Answer 4

superspirališkumo laipsnis (superspiralinių vijų skaičius arba DNR duplekso sukimasis erdvėje)

Question 5

kaip priversti konkrečią relaksuotą DNR molekulę superspiralizuotis?

Answer 5

įvesti įtemptį - panaikinti sukibimus (-Lk) arba įvesti papildomus sukibimus (+Lk).

Question 6

Kaip superspiralizuota DNR, jei delta Lk > 0

Answer 6

teigiamai

Question 7

Kaip superspiralizuota DNR, jei delta Lk < 0

Answer 7

neigiamai

Question 8

etidžio bromido poveikis DNR superspiralizacijai

Answer 8

etidžio bromido dažas įsiterpia (interkaliuoja) į DNR, mažina Tw, o Wr - didėja; molekulė superspiralizuojasi

Question 9

Kaip sukasi DNR apie šerdies histonus

Answer 9

į kairę

Question 10

I tipo topoizomerazė

Answer 10

kerpa tik vieną DNR grandinę ir didina spiralės sakibos skaičių

Question 11

II tipo topoizomerazė

Answer 11

kerpa abi DNR grandines; veikimui reikalinga ATP; vadinama giraze

Question 12

RNR molekulių antrinė struktūra susidaro dėl

Answer 12

polinukleotidinės gradninės struktūrinių elementų vidumolekulinės sąveikos

Question 13

dažniausias RNR antrinės struktūros elementas

Answer 13

dvigrandinis stiebas

Question 14

dvigrandiniai stiebai molekulėje kaitaliojasi su

Answer 14

viengrandinės RNR fragmentais

Question 15

Plaukų segtuko pagrindinis struktūrinis elementas

Answer 15

stiebas, turintis nesuporuotą kilpą

Question 16

pupsas

Answer 16

nesuporuotas vienas ar keli nukleotidai RNR dvigrandiniame stiebe

Question 17

tretinę RNR struktūrą stabilizuoja

Answer 17

-stekingas tarp heterociklinių bazių
-vandeniliniai ryšiai
-mono/dvivalenčiai katijonai, poliaminai

Question 18

RNR tretinės struktūros elementai:

Answer 18

-pseudomazgas
-besibuciuojantys plauku segtukai
-segtukas-pupsas

Question 19

Pernašos RNR (tRNR) molekulės svarbiausi elementai:

Answer 19

-antikodono stiebas ir antikodono kilpa
-antikodonas komplimentarus kodonui iRNR
-5’ galas yra fosforilintas, akceptorinis stiebas, o 3’ gale - 5’RCCA3’OH iškyša
- T, D ir kintamoji kilpos

Question 20

kokia bazių pora yra paplitusi tRNR ir ką ji daro

Answer 20

G-U pora tarnauja kaip atpažinimo signalas

Question 21

kokie nukleotidai dažni nesuporintose RNR srityse

Answer 21

konservatyvus A minorinis motyvas

Question 22

kas yra ribozimas

Answer 22

katalitiškai aktyvi RNR

Question 23

HDV ribozimas

Answer 23

vineintelis žinomas ribozimas žmogaus ląsteles infekuojančioje satelitinėje RNR. Jis susilanksto į kataliziškai aktyvų pseudomazgą

Question 24

VS ribozimas

Answer 24

yra RNR molekulėje, kuri kopijuojama nuo Neurospora crassa mitochondrijų plazmidės

Question 25

kas yra viroidai

Answer 25

tai viengrandinės žiedinės RNR molekulės, funkcionuojančios be baltymų kapsidės

Question 26

kas yra ribojungiklis

Answer 26

iRNR molekulė, koduojanti baltymą, 5’ netransliuojamoje dalyje sąveikaujanti su mažomis molekulėmis (ligandais) ir galinti keisti iRNR raišką

Question 27

ribojungiklį sudaro

Answer 27

• aptametras, kuris gali įgyti alternatyvias erdvines struktūras
  -raiškos platforma