5 paskaita Flashcards
replikazės
DNr polimerazės, kurios dalyvauja DNR replikacijoje
Kas pirmą kartą išgrynino DNR polimerazę
Artūras Kornbergas
kokią reakciją katalizuoja DNR nukleotidil-transferazės?
jungia monomerus - dNTP (alfa padėtyje esantį fosfatą) prie sintetinamos DNR grandinės ribozės laisvos 3’ OH grupės. Tarp jų susidaro fosfoesterinis ryšys. Reakcijos metu atsipalaiduoja pirofosfatas
kas ir kur laiko metalo jonus DNR polimerazių katalizuojamom reakcijoj
laikomi DNR polimerazės aktyviajame centre dviejų (arba trijų) konservatyvių fermento Asparto a. r. karboksigrupių deguonies atomų
kas atakuoja dNTP alfa-fosfatą
nukleofiliškas 3 OH deguonis
ką daro antras mtalo jonas
stabilizuoja neigiamą krūvį ties nueinančios grupės deguonimis ir chelatuoja beta ir y fosfatus
heterociklinių bazių tautomerija
C (imino) sudarys porą su A
A (imino) sudarys porą su C;
T (enol) sudarys porą su G
G (enol) sudarys porą su T
DNR Pol I mažojo fragmento aktyvumas
5’-3’ egzonukleazinis aktyvumas
DNR pol I didžiojo fragmento aktyvumas
5’-3’ DNR polimerazinis aktyvumas
3’-5’ egzonukleazinis aktyvumas
nedidelis atvirkštinės transkriptazės aktyvumas
įkarpos trancliacija
Dnr pol I savybė, kai jis trūkio vietoje išstumia priekyje esančią DNR grandinę, ją hidrolizuoja ir vietoje išstumtosios sintetina naują
kur dalyvauja DNR Pol II
- SOS DNR pažaidų reparacijoje
- pakartotiniame DNR replikacijos re-starte
- episomų (plazmidžių) replikacijoje
DNR Pol III holofermentas
DNR polimerazė su papildomais baltymais, susidaro ilgų genominės DNR molekulių replikacijai in vivo
pilna DNR Pol III sandara
I. Dvi šerdinės dalelės:
a)dvi dalelės holofermente
b) po vieną pirmaujančios ir vėluojančios DNR grandinių sintezei
II. Du slystantieji žiedai beta (kiekvienas sudarytas iš 2 beta baltymo monomerų)
III. Vienas žiedo užkėlimo kompleksas
DNR Pol III šerdinės dalelės alfa, epsilon, thet ypatybės
a - DNR polimerazinis aktyvumas
e - 3’-5’ egzonukleazinis aktyvumas
0 - stimuliuoja egzonukleazės aktyvumą
kas vyksta, kai DNR Pol III prijungia žiedą ant DNR
DNR polimerazių procesyvumas išauga iki 5000 kartų, o greitis - iki 100kartų
