Fundamentos de tecnicas Flashcards

1
Q

caracteristicas de la PCR

A
  • herramienta tecnológica innovadora en el estudio de ácidos nucléicos
  • Se caracteriza por una alta sensibilidad, reproducibilidad y eficiencia
  • Genera resultados confiables en poco tiempo y son fáciles de analizar

Hay 2 técnicas
- Fundamentos de la reacción en cadena de la polimerasa (cualitativa)
- Reacción en cadena de la polimerasa en timepo real (cuantitativas)

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2
Q

Que es la PCR?

A

es ua reacción enzimática en vitro que amplifica millones de veces una secuencia en blanco es copiada fielmente

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3
Q

elementos de la PCR

A
  • El modelo de ADN o ADN complementario
  • Enzima
  • La desoxirribonucleótidos
  • El ion de magnesio
  • Oligonucleótidos: primers
  • Solución amortiguadora buffer y H2O
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4
Q

Etapas de la PCR

A

Desnaturalización
Hibridación
Extensión

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5
Q

Equipo donde se realiza la PCR

A

termocicladores

mantienen sistema homogeneo de temperatura y tiempo necesarios

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6
Q

¿Como se comprueba que la PCR fue exitosa?

A

A traves de un analisis por electroforesis en geles de agaroza de las *amplificaciones

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7
Q

Que enzima usa la PCR?

A

Taq ADN polimerasa que provienen de una bacteria termófila llamada “thermus aquaticus”

Bac vive en temperaturas muy altas, su enzima es termoestable

soporta temperaturas muy altas

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8
Q

¿Que es un primer?

A

secuencias de oligonucleótidos que delimitan la secuencia blanco que desea amplificar *( son completamentarios a esta)

Se utilizan 2 primers forward (sentido) y reward (antisentido)

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9
Q

Que pasa en la desnaturalizacion?

PCR

A

Las cadenas de ADN son calentadas y separadas a una temperatura de 95° durante 20-30 s

El timepo depende de la secuencia del templado,
- Ejemplo: si la concentración de G-C es alta, entonces será necesario mas tiempo para romper sus uniones (ya que están formados por 3 enlaces y A-T solos dos)

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10
Q

Que pasa en la Hibridacion?

PCR

A

Los primers se alinean al extremo 3’ del templado previamente separado e hibridan con su secuencia complementaria

  • La temperatura debe se entre 50-60° C

Primer correcto + Temp adecuada: complejo estable y eficiente

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11
Q

que pasa en la extension?

PCR

A

La Taq polimerasa agregua dntp’s al complejo templado-primers y empieza la función para crear las cadenas completas de ADN

  • La extensión de las cadenas es en dirección e la síntesis del ADN, es decir, 5’ a 3’
  • La temperatura óptima es de 72°C (para la Taq polimerasa)

**Al final del ciclo se habra formado los amplicones

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12
Q

electroforesis consiste en:

A

la separación de grandes moléculas como los ácidos nucléicos a través de una matriz sólida que funciona como un filtro para separar las moléculas en un campo eléctrico de acuerdo a su tamaño y carga eléctrica

Esta separación se hace bajo un buffer o tampón

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13
Q

Que pasa con los acidos nucleicos en electroforesis?

A

En el caso de los ácidos nucléicos, el grupo fosfato les otorga una carga negativa por lo que durante la electroforesis migran hacia el lado positivo

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14
Q

En la PCR en tiempo real se usa electroforesis?

A

Nop

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15
Q

caracteristicas de la PCR en tiempo real

A

cuantificar las secuencias especificas de ácidos nucleicos.

Hay detección de productos ya amplificados en cada uno de los pasos.

Es el método más sensible para detectar y cuantificar los ácidos nucleicos
- Aún con una pequeña cantidad de templado garantiza alta sensibilidad, especificidad y eficiencia

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16
Q

Elementos de la PCR en tiempo real

A

Los ingredientes son los mismos que en PCR en punto final,
- solo que enzima, los DNTP’S, Mg+, el buffer y el sistema de fluorescencia se venden por separado
- es libre de nucleasas
- los primers deben ser diseñados especialmente para garantizar un alta específicas y para que generen amplicones de un tamaño que oscile entre 100-150 pb

17
Q

Para que sirven los termocicladores?

PCR

A
  • Excitar el sistema de fluorescencia
  • Capturar la señal de emisión del mismo
  • Realizar el análisis cuantitativo
18
Q

Ingredientes de la PCR en tiempo real

A

Máster mix
Agua
DTNPS
Buffer
Magnesio
Sistema de fluorescencia

19
Q
A

Los termocicladores poseen un software que genera gráficas

  • Una de estas gráficas es la de la amplificación que muestra el curso y El Progreso de la reacción,
  • otro gráfica es la disociación que muestra la especificidad de la reacción
20
Q

Tipos de cuantificacion de la PCR en tiempo real

A
  • absoluta
  • relativa
21
Q

Para que sirve la cuantificacion absoluta:

A

Mide la cantidad exacta de copias amplificada o concentración precisa de ácidos nucleicos en una muestra

Ej: Para medir la carga viral o bacteriana

22
Q

Cuando se usa la cuantificacion relativa?

A

Cuando se desea evaluar los cambios de expresión de los genes en distinto estado fisiológico

Ej: saber la expresión del gen

23
Q

LA neta me falto un tema de estos apuntes pero ya me canse T.T

A

descansa

lo que falto fue el formato Fast A