6- Caractérisation et classification des microorganismes Flashcards
Sur quoi est basée la hiérarchie des taxons?
Sur une proportion de caractères communs
Pourquoi dit-on que la hiérarchie des taxons est non chevauchante?
Parce qu’un organisme fait partie d’un seul taxon à un niveau donné de la hiérarchie
Quel est le taxon de base?
Espèce
Quels sont les 7 taxons (en ordre)?
- Espèce
- Genre
- Famille
- Ordre
- Classe
- Phylum
- Domaine
Quel est le groupe le plus homogène des taxons?
Espèce
Quels sont les 3 éléments composants la taxonomie ?
1) Identification
2) Nomenclature
3) Classification
Qu’est-ce qu’une culture pure?
Culture (population) de microorganismes où tous les individus ont les mêmes caractéristiques
Qu’est-ce qu’une souche?
Tous les descendants (sous-culture/isolat) d’une culture pure
Dans le contexte des cultures pures, à quoi correspond l’espèce?
Groupe de souches dont les caractéristiques sont presque identiques
Qu’est-ce qu’une souche type?
Souche (fréquemment la 1ère), possédant toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce
Quels sont les 2 centres de références des souches?
1) American Type and Culture Collection
2) National Type Culture Collection
Quel pourrait être un exemple d’espèces de souches?
Escherichia Coli de différents individus
Vrai ou faux. Dans une espèce de souches, tous les membres du groupes sont identiques.
Faux, 75-85% est identique, mais le reste est différent
Quel est le préalable pour procéder à l’identification d’un organisme?
Avoir une culture pure
Selon quels 8 caractères de type peut-on faire l’identification d’un organisme?
- Morphologie
- Composition chimique
- Physiologie
- Métabolisme
- Génétique
- Interactions avec l’hôte
- Écologie
- Moléculaires
Selon quels critères peut-on identifier la morphologie d’un organisme? (3)
- Taille, forme, arrangement
- Structure cellulaire/endospore
- Réaction aux colorants
Selon quels 2 critères peut-on identifier la composition chimique d’un organisme?
- Membrane
- Paroi cellulaire
Qu’est-ce qui peut différer dans la membrane des organismes?
Types de lipides et d’alcools (Ex: archae vs eubactérie)
Qu’est-ce qui peut différer dans la paroi cellulaire des organismes?
- Polysaccharides
- Protéines
De quoi peut être faite la paroi cellulaire des organismes?
- Peptidoglycane (eubactéries)
- Pseudomuréine (archaea)
- Cellulose (mycètes/algues)
Selon quels critères peut-on identifier la physiologie d’un organisme?
- Éléments nutritifs
- Conditions d’incubation
À quoi correspondent les conditions d’incubations?
- Température
- O2
- Lumière
Selon quels critères peut-on identifier le métabolisme d’un organisme?
- Produits finaux de fermentation
- Enzymes extracellulaires
Quelles peuvent être les enzymes extracellulaires d’un organisme?
- Protéines
- Exotoxines
- Hémoglobines
Selon quels critères peut-on identifier la génétique d’un organisme?
- Composition en bases G+C
- Nombre de chromosomes
- Plasmides
Avec quel instrument peut-on identifier la composition en bases G+C?
Un spectrophotomètre UV
À quoi correspond la composition en bases G+C%?
Au ratio (G+C)/(A+T)
Quelle est la longueur d’onde d’absorption des acides nucléiques?
260 nm
Vrai ou faux. L’absorbance diminue lors de la séparation des brins d’ADN.
Faux, elle augmente
Comment est la densité optique selon les 2 formes d’ADN?
Densité optique monocaténaire est 2x plus élevée que bicaténaire
Qu’est-ce que la température de fusion de l’ADN?
Température lorsque la moitié des brins sont séparés
Quel est le lien entre la composition en bases G+C et la température de fusion?
Plus la composition en bases G+C est élevée, plus la température de fusion sera élevée
Pourquoi un grand nombre de bases G+C augmente la température de fusion?
Car ils sont reliés avec 3 liens hydrogènes, comparés à 2 pour les bases A+T
Vrai ou faux. La composition en bases G+C est exclusive à une espèce.
Faux, elle est typique, mais pas exclusive (plusieurs espèces peuvent avoir la même composition)