10- podvojevanje plazmidov

Question 1

kateri so značilni mehanizmi podvojevanja krožnih plazmidov

Answer 1

theta podvojevanje
strand displacement
podvojevanje kotalečega se kroga

Question 2

kaj je pripomoglo k razjasnitvi podvojevanja plazmidov

Answer 2

elektronska mikroskopija

Question 3

theta podvojevanje

Answer 3

• sicer značilno za kromosomsko DNA
• večina plazmidov se podvojuje na tak način
• lahko je enosmerno ali dvosmerno
• ni problemov pri odstranitvni prajmerja
• prekinejo se samo vodikove ne pa tudi fosfodiesterske vezi
• primer plazmida: ColE1, RK2

Question 4

podvojevanje po načinu kotalečega se kroga / RC-plazmidi

Answer 4

• značilno za arheje
• v plazmidu imamo regiji DSO in SSO
• pride do prekinitve fosfodiesterske vezi (to naredi rep protein) in nastane 5’ in 3’ konec. 3’ je prajmer za polimerazo lll. doda se polimeraza lll in SSB - poteče FOSFOTRANSFERAZNA REAKCIJA
• DNA ligaza zlepi verigo in tako je podvojena ena veriga. ostanem nam še ssDNA. tu je pomembna SSO regija, kamor se veže RNA polimeraza in to se podvoji.
  …. nakoncu dobimo KONKATEMER (CCC DNA)

Question 5

strand displacement

Answer 5

• značilno za plazmide s širokim gostiteljskim območjem
• med podvojevanjem se odriva druga veriga

Question 6

podvojevanje linearnih plazmidov

Answer 6

bakterije imajo lahko linearne plazmide in kromosome. problem: na sledilni verigi ostane vrzel, zato se kromosomi pri E krajšajo kar rešujejo s telomerazo.

če ima bakterija linearne kromosome je velika verjetnost da ima tudi linearne plazmide - prihranek energije

na koncu nastanejo viseči konci ki lahko tvorijo zanke, ki jih razdruži TELOMERNA RESOLVAZA in dobimo dva podvojena kromosoma

primer: streptomyces, borrelia in rhodococcus