UA 1 Ch1_partie 2 Flashcards

1
Q

Les fonctions des molécules, grâce aux interactions non-covalentes qu’elles peuvent faire, influencent plusieurs paramètres biopharmaceutiques:

A

*Solubilité
*Perméabilité
*Absorption
*Métabolisme
*Activité / toxicité (interactions avec cibles thérapeutics / off-targets

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2
Q

Solubilité aqueuse
Une molécule (un médicament) sera soluble en milieu aqueux (hydrophile) si:

A
  • Elle possède des groupements fonctionnels ionisables (pH vs pKa) qui seront chargés au pH d’intérêt.
  • Elle peut former des liens hydrogène avec l’eau (donneurs ou accepteurs).
  • Elle possède des groupements polaires (dipôles permanents)
  • Sa portion non-polaire n’est pas trop volumineuse
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3
Q

Activité/Toxicité
Une molécule sera active et/ou toxique si:

A
  • Elle possède des groupements fonctionnels qui sont complémentaires à ceux du site actif d’un récepteur, s’un enzyme ou de toute autre cible biomoléculaire et qui peuvent interagir avec cette cible (complémentarité d’interaction)
  • Elle possède une forme et une taille complémentaire à sa cible
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4
Q

Alcène

A

Hydrophobe
Van der Waals–> London, Debye

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5
Q

Alcyne

A

Hydrophobe
Van der Waals –> London, Debye

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6
Q

Arène (composé aromatique)

A
  • Hydrophobe Van der Waals –> London, Debye
  • Hydrophobe - Interaction π
    Si N et O présents
  • Hydrophile - Ponts H
  • Hydrophile - Van der Waals–> Debye et Keesom
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7
Q

Halogénure

A

Hydrophiles et phobes -
Van der Waals - Toutes

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8
Q

Alcool

A

Hydrophile - Pont H donneur (1)
Hydrophile - Pont H accepteurs (2)
Hydrophile - Van der Waals - Debye, Keesom

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9
Q

Éther

A

Hydrophile - Pont H accepteurs (2)
Hydrophile - Van der Waals –> Debye, Keesom

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10
Q

Aldéhyde

A

Hydrophile - Van der Waals–> Debye, Keesom
Hydrophile - Pont H accepteurs

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11
Q

Cétone

A

Hydrophile - Van der Waals –> Debye, Keesom
Hydrophile - Pont H accepteurs

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12
Q

Acide carboxyliquee

A

Hydrophile - Van der Waals –> Debye, Keesom
Hydrophile - Pont H accepteurs
Hydrophile - Pont H donneur
Hydrophile - Électrostatiques et ion-dipôle (pH vs pKa)

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13
Q

Ester

A

Hydrophile - Van der Waals - Debye, Keesom
Hydrophile - Pont H accepteurs

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14
Q

Amide

A

Hydrophile - Van der Waals - Debye, Keesom
Hydrophile - Ponts H accepteurs
Hydrophile - Ponts H donneurs (0-2)

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15
Q

Amine

A

Hydrophile - électrostatique et ion-dipôle (pH vs pKa)
Hydrophile - Ponts H donneurs (0-3)
Hydrophile - Van der Waals –> Debye, Keesom
Hydrophile - Pont H accepteur (1-0)11Q2

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16
Q

Fonction acides

A

acides carboxyliques,
mono, di et tri phosphate

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17
Q

Fonctions basiques

A

Amides (et hétérocycles azotés)
imines,
amidines et
guanidines

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18
Q

À pH < pKa, un acide carboxylique existera majoritairement sous la forme…

A

protonée en tant que dimère

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19
Q

pKa typique des acides carboxylique

A

3,5 à 5

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20
Q

Au pH physiologique les acides carboxyliques sont…

A

déprotonés

21
Q

Alcaloïdes:

A

Molécule comportant un ou pls cycles azotés. Métabolites secondaires des végétaux et champignons. Terminaison en «ine».

22
Q

Amines aliphatiques:

A

sont des dérivés organiques de l’ammoniac au même titre que les alcools et les éthers sont des dérivés organiques de l’eau.

23
Q

C’est quoi un acide de Bronsted-Lowry

A

Une fonction chimique capable de donner un proton

24
Q

C’est quoi une base de Bronsted-Lowry?

A

fonction chimique qui peut accepter un protoné

25
Q

La pKa…

A

est lié à la constante d’équilibre et quantifie l’affinité pour le proton

26
Q

Pour les bases…
À pH=pKa

A

la concentration de B=BH+

27
Q

Pour les bases…
Si pH<pKa

A

alors [BH+] > [B] –> l’espèce protonée prédomine

28
Q

Si pH > pKa

A

alors [BH+] < [B] –> l’espèce neutre domine

29
Q

Quantifier l’hydrophilicité/hydrophobicité

A

On mesure la caractère hydrophile/hydrophobe d’une molécule en déterminant comment elle se distribue entre l’eau et un solvant hydrophobe immiscible (comme le 1-octanol)

30
Q

Importance de la stéréoisomérie

A

les énantiomères peuvent avoir des effets différents

31
Q

Isomères:

A

Les molécules dont la nature et le nombre d’atomes sont identiques (de même formule moléculaire) mais dont la disposition des atomes entre eux est différente

32
Q

Isomères de structure:

A

Même formule moléculaire, formule développe différente

33
Q

Isomères de structure;
de position:

A

Différent par la position d’un groupement, sans changer la fonction du groupement

34
Q

Isomères de structure;
de fonction:

A

Changement de structure entraînant un changement de fonction

35
Q

Stéréochimie:

A

Domaine de la chimie qui étudie les représentations tridimentionnelles des molécules et des mécanismes de réaction

36
Q

Stéréoisomères

A

Deux molécules dont la structure en deux dimension (enchaînement des atomes) est identique, mais dont l’arrangement spatial (en 3D) est différent

37
Q

Chiralité

A

asymétrie

38
Q

chiral

A

ne possède pas de plan de symétrie

39
Q

achiral

A

possède un plan de symétrie

40
Q

carbone stéréogénique

A
  • toujours un carbone sp3
  • Carbone qui contient 4 groupement différent
  • on marque ces carbones par un *
41
Q

Énantiomères

A

Stéréoisomères images miroir l’un de l’autre, de configuration inverse au niveau de tous les carbones asymétriques. Propriété physiques (sauf le pouvoir rotatoire) et chimiques identiques.
Leurs propriétés biologiques sont différentes

42
Q

Différence optique énantiomères

A

deux énantiomères dévient le plan de la lumière polarisée avec la même magnitude mais dans des directions opposées.

43
Q

Diastéréoisomères

A

Les diastéréoisomères sont des molécules qui ont le même enchaînement d’atomes, mais qui ne sont ni superposables, ni l’image l’une de l’autre dans un miroir.

44
Q

Cis/trans isomères

A

Configuration relative entre deux substituants d’un cycle ou d”‘un alcène.
L’isomérie géométrique se retrouve dans les molécules où la rotation complète des liaisons est empêchée par un cycle ou un alcène

45
Q

Cis

A

Substituants du même côté du plan formé par la cycle

46
Q

Trans

A

Substituant de côtés opposés du plan formé par le cycle

47
Q

Acide gras trans

A

les acides gras insaturés des huiles partiellement hydrogénées

48
Q

Acides gras cis

A

Acides gras insaturés naturels