ביוכימיה 2 רשף Flashcards
(38 cards)
? counter regulators מי הם
שכן הם מבצעות פעולות הפוכות לאינסולין Counter regulators קיימים הורמונים קטבוליים ביניהם ניתן למצוא
אדרנלין, נוראדרנלין, קורטיזול
מבצעים פעולות פירוק הפוכות לפעולות האינסולין
?מאיזה בלוטה מופרש אדרנלין=אפינפרין
?האם אינסולין משפיע על המוח
?אם לא על מה הוא משפיע
?האם אינסולין הוא מבנה רבעוני
? דומה אצל A שרשרת
? באינסולין דומה אצל B שרשרת
אדרנלין=אפינפרין - מופרש מבלוטת יותר הכליה עובד על שריר
( אינסולין לא עובד על המוח (משפיע על הכבד והשריר
SS אינסולין מיוצר משרשרת אחת ולכן לא רבעוני. השרשרת הפוליפפטידית יוצרת קשרי
מופרש מחוץ לתאים C ואז עוברת ביקוע פפטיד
- A שרשרת
היא זהה אצל בני אדם, חזירים, כלבים, לווייתנים
-B שרשרת
חזירים, פרות, כלבים, כבשים וסוסים
?סוכזור בצמחים משמש
? למה משמשים ביוסינתזה של פולימרים סוכריים
כחומר תשמורת כמו גליקוגן ואמילן אצלינו
ביוסינתזה של פולימרים סוכריים המשמשים לתפקידים מבניים, הגנתיים, תקשורתיים
חמצון במסלול הפנטוזות אשר בהמשך יניב יצירה של ריבוז הדרוש לאבני הבניין של הדנ”א והרנ”א
?איך נראים נשאי אלקטרונים
פתח תמונה

אנזימים הגליקוליזה
פוספו-פרוקטו-קינאז1
אלדולאז
גליצר-אלדהיד-3-פוספאט-דה-הידרוגנאז
פוספו-גליצראט-קינאז
פוספו-גליצראט-מוטאז
אנולאז
פירובאט קינאז
?ספר על האנזימים האלה
במהלך הגליקוליזה לא נפלט פחמן דו חמצני
תהליכים רציפרוקלים, כלומר באופן עקרוני לא אמורים להתרחש בו זמנית למרות שתמיד יש גם וגם גליקוליזה וגלוקונאוגנזה
פוספו-פרוקטו-קינאז1
חיידקים רבים וכל הצמחים מבצעים ריאקציה אחרת – הקבוצה התורמת פופסאט היא פירו-
ATP פוספט ולא
אלדולאז
ישנם שני סוגים של אלדולאזות: _סוג 1-_קיים ביונקים ובצמחים מבצע מנגנון צ’יף בייס
סוג 2: קיים בפטריות ובחיידקים ,נעזר ביון אבץ לצורך מנגנון צ’יף בייס עליו נרחיב במצגת ביוכימיה ד
בתנאים סטנדרטיים הריאקציה איננה ספונטנית , בתנאים פיזיולוגיים ההפרש באנרגיה החופשית קרוב ל 0
גליצר-אלדהיד-3-פוספאט-דה-הידרוגנאז
שלב 1: אנזים המזרז חמצון של גליצראלדהיד ליצירת החומצה גליצראט:
בשלב השני האנרגיה המתקבל מתהליך החמצון מנוצלת. לחיבור של קבוצת פוספאט
חופשי מהתמיסה - לפחמן הקרבוקסילי החדש שזה עתה נוצר.
הקבוצה הקרבוקסילית המחוברת לקבוצת הפוספוריל מכונה אציל-פוספאט - מצב מאוד אנרגטי שהידרוליזה פשוטה שלו מניבה המון אנרגיה. האנרגיה ליצירתו נעוצה בתהליך החמצון שיצר
אותה.
פוספו-גליצראט-קינאז
זהו הקינאז השלישי שאנחנו נתקלים בו. הוא מזרז מעבר של קבוצת פוספאט
מפחמן 1 (הקרבוקסילי) של 1,3 ביס-פוספו-גליצראט ל ADP ליצירת .ATP
על אף שהוא קינאז, מדובר בריאקציה שהיא הפיכה בתנאים פיזיולוגיים
השם של האנזים ניתן דווקא על הריאקציה לכיוון ההפוך (תהליך חשוב ביותר באסימלציה של
פחמן דו חמצני בזמן פוטוסינתזה
פוספו-גליצראט-מוטאז
הריאקציה נעשית בשני שלבים, כאשר השלב הראשון כולל זרחון של פחמן מס’ 2 ליצירת תוצר
ביניים הדרוש כמויות קטנות (ואנחנו מכירים אותו כמעכב של המוגלובין
2,3 BPG
אנולאז – אנזים המזרז ריאקציה של דה-הידרציה ליצירת קשר כפול בין פחמן 2 ל- 3 בגליצראט
פירובאט קינאז משתמשים ביון אשלגן + מגנזיום
ADP על אף הזרחון של ה
הריאקציה עדיין בלתי הפיכה בתנאים פיזיולוגיים בשל האנרגיה הרבה המשתחררת מהטאוטומריזציה.

תסיסה לקטית
?מי האנזימים והקופקטורים שמשתתפים
?האם יש תסיסה לקטית באריתרוציטים
?למה נועד הלקטאט
תסיסה לקטית בבני אדם תאי שריר הם ממש תאים מומחים בביצוע תסיסה לקטית, ובאריטרוציטים, שהם חסרי גרעין ומיטוכונדריה, תסיסה לקטית היא תהליך מחייב על מנת
לשמור על המשכיות הגליקוליזה.
ללקטאט דהידרוגנאז יש איזואנזימים רבים (5) בכבד בשריר וברקמות נוספות.
הלקטאט המיוצר ברקמות יכול לעבור מחזור – הוא עובר דרך זרם הדם, מגיע לכבד ומשמש
כחומר מוצא נהדר ליצירה של גלוקוז אשר יכול להזין את השריר בזמן פעילות מאומצת
\עובדה מעניינת היא שלפחמנים של לקטאט ולפחמנים של גלוקוז יש את אותו מספר החמצון וגם היחס פחמנים : מימנים : חמצנים נשאר זהה לשל גלוקוז.

?מהי תסיסה כהלית
?מי האנזימים המעורבים בתהליך
?מהו התוצר הסופי
תסיסה כהלית
תסיסה כהלית היא תהליך המבוצע בשמרים ובמיקרואורגניזמים
-שלב אחד
השלב ראשון מזורז על ידי האנזים פירובאט דה-קרבוקסילאז (הנעזר ביון מגנזיום
כתוצאה מכך מפלט פחמן דו חמצני TPP וקו אנזים
השלב השני
האנזים אלכוהול דה-הידרוגנאז מזרז חיזור של אצלדהיד על הפחמן הקרבונילי עם אלקטרונים שמקורם NADH המומר בחזרה ל- +.NAD
האנזים אלכוהול דה-הידרוגנאז הוא אנזים הקיים גם בחולייתנים. אצלנו הוא משמש לתהליך של חמצון חומצות שומן – חמצון הקרוי חמצון אומגה. עם זאת, שימוש עיקרי הוא לקחת אתנול הנצרך על ידינו (או מיוצר על ידי מיקרואורגניזמים) ולחמצן אותו ליצירת אצטלדהיד (חומר מוצא
נהדר ליצירת חומצות שומן
גבינה שוויצרית – החיידק פרופיונבקטריום יוצר במהלך התסיסה חומצה פרופיונית ופחמן דו חמצני. הפחמן הדו חמצני אחראי ליצור את החורים בגבינה.
אלכוהול הוא אחד החומרים הכי משמינים , אתנול הופך לאצטאלדהיד שיהפוך
וממנו ייצרו חומצות שומן A לאצטיל קו
אצטאלדהיד היא מולקולה שומנית השוקעת בכבד ואז נקבל כבד שומני

איך אלכוהול משפיע על רמות של גלוקוז
כאשר שותים הרבה אלכוהול זה גורם לירידה של ריכוז הגלוקוז בדם
הסיבה לכך שכאשר שותים אלכוהול אז אתנול הופך לאצטאלדהיד וביחד עם זה מיוצר
ולכן כאשר הגוף נמצא במצב רעב הוא רוצה לקחת לקטאט להעביר אותו NADH
לפירובט ומשם גלוקונאוגנזה אבל הוא זקוק ל
מכיוון שהגוף בזבז את כל NAD+ אבל אין לגוף NAD+
כידי להפוך אתנול לאצטאלדהיד NAD+ המולקולות כ
שתיתת אלכוהול גורמת להיפוגלקמיה לא יהיה מספיק סוכר בדם

?HIF מהו פקטור
(פקטור שעתוק)HIF-1 -hypoxia-induced transcription factor
אחראי להגברת שעתוק של לפחות 8 אנזימים גליקוליטים ושל גלוקוז טראנספורטרים
VEGF – אשר גורם ליצירת כלי דם מסביב לגידול
FDG הזרקת גלוקוז המסומן בפלואור רדיאוקטיבי
הנטייה של גידולים לצרוך כמות מוגברת של גלוקוז משמשת לא רק לטיפול אלא גם לאבחון. אם מזריקים למטופלים גלוקוז המסומן בפלואור רדיואקטיבי
FDG
הוא ייקלט ברקמות ובאזורים בהם יש צריכה מוגברת
של גלוקוז – כמו מוח וכליות. אם למשל נראה קליטה מוגברת בעצמות – נדע כי יש שם תהליך שקולט גלוקוז –זו כנראה גרורה. לבדיקה הזו קוראים pet-CT (תמונה ימנית
נציין ש
אינו יכול לעבור איזומרציה על ידי פוספוהקסואיזומראז ולכן מצטבר בתאים במצב של FDG
מזורחן FDG
?האם נכון לומר שמבנה קויל-קויל מורכב מחלבונים סיביים בלבד
על אף שרבים הם החלבונים הסיביים שבנויים במבנה קויל קויל , לא רק חלבונים סיביים עשויים ממבנה זה . כך למשל החלבון דינאמין הקשור להנצת ממברנות הוא דימר הבנוי ממבנה קויל קויל ואיננו נחשב לחלבון סיבי
סיבי אקטין בעלי מבנה של חלבונים גלובולריים לא קויל קויל כך שלא כל הסיבים בנויים מקויל קויל

?איזה קסקדה מפעיל גלוקגון
?מכמה רמות משפיע הבקרה ההורמונאלית
על איזו חומצה אמינית סרין מזרחן
?האם קינאז ופוספטאז הוא אותו אנזים
?האם הם אותו אנזים
המזרחן חלבונים PKA גלוקגון מפעיל קסקדה תאית המסתיימת בשפעול של האנזים
מטבוליים על גבי שיירי סרין ותריאונין
אינסולין - מפעיל קסקדה תאית המסתיימת בשפעול של אנזימים מסוג
המסיר זרחנים מהאנזימים מטבוליים PPP
מודיפיקציות קוולנטיות על אנזימים
למשל גלוקגון משפעל רצפטור מסוג
GPCR –
רצפטור זה גורם לשפעול של אנזים מפתח הקרוי
PKA
אשר יודע לזרחן מטרות רבות, ביניהן אנזימים מטבוליים. זרחון שכזה יכול להגביר או להנמיך את פעילותו של האנזים. בקרה זו היא בקרה מהירה
בקרת שעתוק
למשל אינסולין משפעל רצפטור מסוג טירוזין קינאז
RTK
רצפטור זה משפעל קסקאדות שונות שמסתיימות בהפעלת פקטורי שעתוק. חלק מפקטורי השעתוק הללו אחראים להגברת ביטוי של אנזימים מטבוליים.
השפעה על טראנספורטרים וויסות רמת הסובסטרט בתא
אינסולין יכול לשפעל תהליך של טראנספורטר של וזיקולות ואקסוציטוזה
הוא סרין תריאונין קינאז מזרחן בעיקר על סרין ובמקרה אחד על תריאונין -PKa
קינאז ופוספטאז הם לא אותו אנזים
קינאז הוא טרספראז
פוספטאז הוא הידרולאז

למה משמשים
GLUT1,GLUT2,GLUT3,GLUT4
?
?איך אינסולין מווסת את רמת הסוכר בדם
? מי אלה מיוציטים
?ומי אלה אדיפוציטים
!כל הגלוטים פה בטבלה
אינסולין מווסת את רמות הסוכר בדם על ידי כך שברגע שהוא נקשר לרצפטור
יעבור אקסוציטוזה GLUT4
AKT ובביולוגיה של התא נקרא לו PKb בתהליך המערב
GLUT4 כאשר גלוקוז נכנס לתאי שריר\שומן שעליהם מצוי
רמת גלוקוז בדם יורדת
מצוי כמעט בכל הרקמות ואחראי לשמירה על רמת גלוקוז בזאלית בתא.-GLUT1
מצוי בכבד, בלבלב באיי לנגרהאנס ובמעי הדק .
סילוק עודפי גלוקוז מהדם והכנסתם לכבד ,לבלב או מעי-GLUT2
בלבלב הוא בעל תפקיד חשוב בבקרה על רמת האינסולין לא תלוי באינסולין
בנוירונים של המוח גם לא תלוי באינסולין-GLUT3
היחיד שמגיב לאינסולין במנגנון אקסוציטוזה ומצוי בשריר ,שומן ולב-GLUT4
מיוציטים הם תאי שריר
אדיפוציטים הם תאי שומן

? משפעל AMP את מי
?ומה התוצר של השפעול משפעל
?ומה תפקידו
משפעל את האנזים AMP
AMP-K
AMP-K תפקידו:
יודע לעשות את המעבר בין “פול אנרגטי נמוך” לבין מצב רעב AMPK האנזים
גבוה מפעיל סיגנל דמוי רעב AMP מופעל בסמני אנרגיה נמוכה -AMPK
מגביר תחושת רעב
משפיע על הפרשת האינסולין מדכא הפרשת אינסולין מהלבלב
מדכא רמת האינסולין מהלבלב
מגביר צריכת שומן וגלוקוז בשריר ומגביר את הפעילות המיטוגכונדריאלית של השריר
מגביר תחושת הרעב במוח
מגביר מטבוליזם בלב
מדכא יצירת שומן וכולסטרול בכבד ובתאי שומן
? מזרז ומה הוא מעקב AMP מה
?ADP
?ATP
מזרז גליקוליזה ומעקב גלוקונאוגנזה AMP
מזרז גליקוליזה ADP
מעקב גליקוליזה ATP

?מי מעקב את הקסוקינאז 1 בשריר
?מה הבקרה על הקסוקינאז 4 בכבד
?בזמן גלוקונאוגנזה מצטבר פרוקטוז 6 פוספט מה ההשלכות
הקסוקינאז1 - מצוי בשריר ומעוכב באופן אלוסטרי על ידי התוצר שלו גלוקוז 6 פוספאט
גלוקוז 6 פוספט כאשר מצטבר בעודף מעקב באופן אלוסטרי .האפיניות בין
האתר של גלוקוז שלשם נקשר וגלוקוז 6 פוספט נמוכה יחסית ולכן צריך הרבה
גלוקוז 6 פוספט כידי לעכב
גלוקוקינאז איננו מעוכב על ידי התוצר
גבוה KM אך הוא בעל
משל הקסוקינאז 1 ולכן בזמן רעב, כאשר ריכוז הגלוקוז נמוך, פעילותו תהיה נמוכה בהרבה
וריכוז גבוה של ATP גלוקוקינאז מבוקר היטב גם ברמת השעתוק, כך שבריכוז נמוך של
או בזמן צריכה מוגברת של מזון ,AMP
ברמה גבוהה של גלוקוז בדם ובזמן כיווץ שריר (כן, זו לא טעות) –
מתבצעת הגברת שעתוק של האנזים
כאשר מתרחש תהליך גלוקונאוגנזה מצטבר פרוקטוז 6 פוספט אשר גורם
להפעלה של חלבון רגולטורי המבצע סיקווסטרינג של גלוקוקינאז בגרעין. בזמן שובע, ריכוז גבוה של גלוקוז חופשי מעכב את החלבון הרגולטורי ומאפשר לגלוקוקינאז לחזור לציטוזול שם הוא
פעיל.

? מבוקר PFK1 איך
מבוקר אלוסטרית בלבד על ידי מעכבים ואקטיבטורים כמתואר בשקף PFK1 האנזים
האנזים עצמו מורכב כהומוטטרמר ובמנגנון פעילות קואופרטיבי. מעבר לכך, לכל המעכבים והאקטבטורים הספציפיים יש לו אתר אלוסטרי ייעודי
הוא גם סובסטרט וגם מעקב ATP שימו לב
הוא גם תוצר וגם אקטיבטור ADP

F 2,6 BP היכן קיימת הבקרה ההורמונאלית של
?האם הבקרה קיימת בכבד או גם בשריר
? F 2,6 BP איך נוצר

המנגנון הבא הוא מנגנון הוא הורמונאלי המתבצע בכבד בלבד. בשריר הבקרה הזו לא קיימת ולכן כל הזמן ייצור של האקטיבטור
F2,6 BP אנזים הטאנדם מזרחן פרוקטוז 6 פוספאט ליצירת
לאנזים הטאנדם קיים ראש קטליטי נוסף המאפשר הידרוליזה של הפוספאט מפחמן 2 ליצירה של
פעילות הפוספטאז F6P
אנזים הטאנדם מבוקר בעצמו ברמה ההורמונאלית
האנזים בגרסתו בכבד יכול להיות בשני מצבים מזורחן או לא מזורחן. במצב רעב, בשפעול PKa הרצפטור של גלוקגון על תאי הכבד, יופעל האנזים המזרחן
שיזרחן מגוון רחב של אנזימים ובעצם “יודיע להם” שאנחנו במצב רעב על פי החלטת הלבלב
מזורחן PKa כאשר האנזים
הפוספטאז פעיל והקינאז לא, כך שלא רק שאנחנו מפסיקים ליצר את האקטיבטור, אנחנו גם מפרקים אותו

?כמה איזו אנזימים קימים לפירובט קינאז
?במה מיוחד איזואנזים הכבדי
מה הם מעכבים אלוסטריים של פירובט קינאז
.לאנזים פירובאט קינאז קיימים שני איזו-אנזימים כבד ושריר
M שריר L כבד
ATP , ALANINE , ACETYL CO A מעכבים אלוסטריים :
אקטיבטורים אלוסטריים
פרוקטוז 1,6 ביספוספט
תוצר של שלב מוקדם
במקרה זה שלב 3 של גליקוליזה מגביר את הפעילות של שלב מאוחר במקרה זה .10
בזמן רעבPKa רק בגירסה הכבדית פירובט קינאז יודע לעבור זרחון
ובכך לעכב גליקוליזה ולאפשר גלוקונאוגנזה
שמבצע הידרוליזה לפוספאט ומחזיר את האנזים לפעילות PP ודה זרחון ע”י

?האם המיטוכונדריה קיים בכל התאים
? מיהו האנזים A פירובט הופך לאצטיל קו
?אלו קופקטורים משתתפים
? איך קוראים לתהליך
?מה אנחנו עושים בתהליך
?מהם התוצרים
?מהם הקואנזימים
?מכמה קומפלקסים מורכב פירובט דהידרוגנאז
המיטוכונדריון הוא איברון הקיים כמעט בכל התאים היוקריוטים (להוציא למשל תאים מומחים כמו אריתרוציטים שאיבדו את המיטוכונדריה במהלך ההתבגרות שלהם
פירובאט יפגוש את הקומפלקס פירובאט דה הידרוגנאז, אשר יזרז ריאקציה מסוג “דה-קרבוקסילציה אוקסידטיבית” בשפה פשוטה :נעיף את הקרבוקסיל ונחמצן את המולקולה
התוצרים של הריאקציה
זוהי גירסה מאוקטבת של אצטאט- A אצטיל קו
פחמן דו חמצני
הקו אנזים המעורבים
,פוספו-פנטאוט ,B5 נגזרת של ויטמין , A קו אנזים
B3 נגזרת של ויטמין -NAD+
B1 נגזרת של ויטמין -TPP
ליפואט -זו היא קבוצה פרוסטטית הקשורה קוולנטית לאנזים
B2 נשא אלקטרונים נגזרת של ויטמין FAD
E1,E2,E3 הקומפלקס מורכב משלושה חלבונים
כל אחד מהאנזימים הללו מצוי בקומפלקס במספר רב של עותקים
.מכיל ביונקים 2 אתרים פעילים ובאיקולי שלושה אתרים פעילים E2 האנזים
המופרדים אחד מהשני ברצף של 20-30 ח”א עשיר באלנין ופרולין. עוד ניתן למצוא בתוך הקומפלקס – אנזים מסוג קינאז הקרוי
PDH kinase

?מיהם קשרים עתירי אנרגיה
קשר תיו אסתרי הכי עתיר באנרגיה מבין הקשרים שבתמונה

?תאר מהו ליפואט
שימו לב למצבי החמצון והחיזור השונים שלו E2 ליפואט משמאל הנעוץ על
הקשור בקשר תיואסטרי S או SH במצב מחומצן קיים שם קשר די-סולפידי במצב מחוזר או
לקבוצת אציל זוהי הקבוצה היחידה שקשורה קוולנטית לאנזים, ספציפית לחומצה אמינית ליזין בקשר אמידי עם קבוצת האפסילון-אמין שלה
לכן מדוייק יותר לכנות אותה קבוצה פרוסטטית מאשר קו-אנזים זו אינה נגזרת מויטמין כלשהו

?Thioester מה זה קבוצת
מצרף צילום קבוצות פונקציונליות
בעיקרון קשר גופרית לפחמן קרבונילי

?A ממה מורכב קו אנזים
- A קו אנזים
מימין מורכב מקבוצה של בטא-מרקפטו-אתיל-אמין המחובר לחומצה פנטונית. זוהי נגזרת של
. B5 ויטמין
SH הקבוצה החשובה פה היא קבוצתה התיול
succinyl או acetyl לשם יקשר
אשר יכולה לייצר קשר תיו-אסתרי עם קבוצת האצטיל קשר תיו-אסתרי הוא קשר עתיר אנרגיה




