Biochimie Module A Points importants Maechler Flashcards

1
Q

Le métabolisme fournit les éléments de ___ des cellules.

A

construction

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2
Q

Flux de l’énergie;Les hétérotrophes/autotrophes(?) produisent à l’aide de l’énergie solaire de l’O2 et des composés organiques. Les hétérotrophes/autotrophes(?) transforment ces derniers grâce à la respiration Cr en H2O et CO2.

A

autotrophes;hétérotrophes

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3
Q

• Un organisme vivant se ___ et se ___.• Cela nécessite de la ___ et de l’___. 

A

conserve;reproduit;matière;énergie

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4
Q

• Le métabolisme comprend le ___ et l’___.• Organismes hétérotrophes dérivent l’énergie de molécules simples/complexes(?) et la matière de molécules simples/complexes(?).

A

catabolisme;anabolisme;complexes;simples

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5
Q

Organisme autotrophe libérant son énergie stockée sous forme minérale/organique(?): production de ___, de ___, et d’___

A

organique;chaleur;CO2;eau

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6
Q

Bois, charbon, gaz, pétrole: des végétaux qui fournissent de l’énergie grâce à la combustion de leur carbone minéral/organique(?).

A

organique

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7
Q

• Le carbone de la matière organique est globalement oxydé/réduit(?).• Le carbone organique/minéral(?) sous forme de CO2 est oxydé/réduit(?).

A

réduit;minéral;oxydé

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8
Q

• Respiration cellulaire oxyde/réduit(?) le carbone minéral/organique(?) en carbone minéral/organique(?).• Ceci produit de l’___ (ATP).

A

oxyde;organique;minéral;énergie

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9
Q

ATP=___ ___(abr?): une ___ d’___ énergétique

A

adénosine triphosphate;monnaie;échange

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10
Q

ATP utilisée pour: • ___ • ___ ___ • ___ • ___

A

Mouvements;Gradients ioniques;Signalisation;Anabolisme

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11
Q

ATP est « la monnaie » de l’énergie:• Continuellement/alternativement(?) formé et consommé • Un être humain, au repos, en consomme: ___kg/jour • Exercice intense, consommation: ___kg/min • Concentration cellulaire: ___-___ mM

A

Continuellement;40;0.5;2-4

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12
Q

• Catabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)• Anabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)

A

exergoniques;endergoniques

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13
Q

dégradations:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

cataboliques

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14
Q

nécessite énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

anaboliques

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15
Q

réductives (nécessite des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?

A

anaboliques

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16
Q

Les voies sont convergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

cataboliques

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17
Q

oxydatives (donne des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?

A

cataboliques

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18
Q

fournit de l’énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

cataboliques

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19
Q

Biosynthèse:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

anaboliques

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20
Q

Les voies sont divergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

anaboliques

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21
Q

utilisent ___(CoE?) et ___(CoE?) comme porteurs d’électrons (accepteurs):Voies cataboliques ou anaboliques?

A

NAD+;FAD;cataboliques

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22
Q

utilisent ___(CoE?) comme donneur d’électrons:Voies cataboliques ou anaboliques?

A

NADPH;anaboliques

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23
Q

Les voies anaboliques sont le plus souvent/ne sont le plus souvent pas(?) l’inverse des voies cataboliques.

A

ne sont le plus souvent pas

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24
Q

NADH et FADH2: une monnaie ___(≠ énergétique?): des équivalents réducteurs échangés contre de l’___(molécule?)

A

red-ox;ATP

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25
Q
  • Keq = [C]eq[D]eq/[A]eq[B]eq

* Keq = ___ d’___

A

constante;

équilibre

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26
Q
  • ΔH = ___ générée/absorbée entre l’état initial et final
  • ΔS = ___ (=état de désordre) décroît/croît(?) dans l’univers par un processus spontané
  • ΔG = ___ ___ de ___ = variation de la ___ de la réaction
A
chaleur;
entropie;
croît;
énergie libre;
Gibbs;
spontanéité
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27
Q

• ΔH « – » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’enthalpie (endothermique/exothermique(?))
• ΔS « + » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’entropie
⇉ Donc ΔG « – » : réaction non-spontanée/spontanée(?) endergonique/exergonique(?)

A
favorable;
exothermique;
favorable;
spontanée;
exergonique
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28
Q

Conditions standards définissent la variation d’énergie libre standard ΔG°’:
● “ °/’(?) “ Pression = 101.3 kPa (=___ atm)
● “ °/’(?) “ Température = ___° K (___°C)
● “ °/’(?) “ pH = ___
● Conditions initiales de concentration des réactants: [A] = [B] = [C] = [D] = ___M

A
°;
1;
°;
298;
25;
’;
7.0;
1
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29
Q
  • ΔG°’= …(formule?)
  • Si ΔG°’ négative: réaction exergonique/endergonique(?)
  • Si ΔG°’ positive: réaction exergonique/endergonique(?)
A

-RTln(Keq);
exergonique;
endergonique

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30
Q

Les conditions réelles de la vie cellulaire définissent la variation d’énergie libre ΔG:
• ΔG°’= …(formule?)
• ΔG = …(formule?)
• ΔG varie/ne varie pas(?) au cours de la réaction

A

-RTln(Keq);
ΔG°’+RTln([C][D]/[A][B]);
varie

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31
Q
  • ΔG°’ est une autre manière d’exprimer la ___ d’___

* ΔG°’ reflète les propriétés des composés (i.e. ___ et ___)

A

constante;
équilibre;
substrats;
produits

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32
Q

Molécules A, B, C et D ont une énergie libre:
Lors de la réaction A+B (état initial) vers C+D (état final), il y a ___ d’énergie libre ΔG:
• ΔG = ΔGproduits – ΔGsubstrats
• Si ΔG négative: réaction non spontanée/spontanée(?) → le système a gagné/perdu(?) de l’énergie libre

A

variation;
spontanée;
perdu

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33
Q
  • Si ΔG°’ négative: réaction endergonique/exergonique(?)

* Si ΔG°’ positive: réaction endergonique/exergonique(?)

A

exergonique;

endergonique

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34
Q

ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme “réaction”?

A

1) A+B ⇆ C+D

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35
Q

ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme “spontanéité”?

A

2) ΔG°’= - RTln(Keq)

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36
Q

ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme “variation”?

A

3) +RTln([C][D]/[A][B])

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37
Q
  • ln(1)=___

* log(1)=___

A

0;

0

38
Q
  • ln(e)=___

* log(10)=___

A

1;

1

39
Q

L’ATP occupe une position basse/intermédiaire/supérieure(?) sur le thermomètre des ΔG°’ → monnaie d’échange

A

intermédiaire

40
Q

Dans les conditions cellulaire, l’hydrolyse de l’ATP est une réaction endergonique/exergonique(?). ___ kJ/mol

A

exergonique;

-30,5

41
Q

Une réaction endergonique peut/ne peut pas(?) être possible si elle est « poussée » par un rapport Produit/Substrat très favorable.

A

peut

42
Q

Une réaction endergonique (ΔG°’ positive/négative(?)) est possible si elle est couplée à une réaction exergonique (ΔG°’ positive/négative(?)).

A

positive;

négative

43
Q

ΔG# = ___ ___ d’___

A

énergie libre;

activation

44
Q

ΔG ne nous dit rien de la ___ de réaction. Cette dernière dépend de ΔG#: différence d’___ ___ entre l’___ ___ et l’___ de ___.

A
vitesse;
énergie libre;
état initial;
état;
transition
45
Q

La vitesse de réaction est directement/inversement(?)

proportionnelle au ΔG#.

A

inversement

46
Q

Comment passer la barrière de l’état de transition;
• Le chimiste ___ son tube à essai
• Le biologiste introduit des ___

A

chauffe;

enzymes

47
Q

ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre dans une réaction
(variation de la spontanéité de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre en conditions
standards (propriétés de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): énergie libre d’activation (détermine la vitesse de la réaction)

A

ΔG;
ΔG°’;
ΔG#

48
Q

Les électrons sont transférés de l’oxydant au réducteur/du réducteur à l’oxydant(?):
• réducteur: accepteur/donneur(?) d’électrons
• oxydant: accepteur/donneur(?) d’électrons

A

du réducteur à l’oxydant;
donneur;
accepteur

49
Q

un ___ ___ = un e- transféré dans une réaction d’oxydoréduction

A

équivalent réducteur

50
Q

Potentiel redox standard E°; en condition Cr (pH=___) on définit E°’;
• couple 2H+/H2: +/- x,xx(?) V
• couple NAD+/NADH+H+: +/- x,xx(?) V
• couple O2/H2O: +/- x,xx(?) V

A

7;
-0.42;
-0.32;
+0.82

51
Q

Une réaction endergonique/exergonique(?) est spontanée et spontanée ≠/=(?) instantanée.

A

exergonique;

52
Q

saccharose + H2O → ___ + ___, ΔG°’= -29.3 kJ/mol;

Une enzyme spécifique (ici la ___) catalyse (accélère) la réaction dans une échelle de secondes.

A

glucose;
fructose;
saccharase

53
Q
  • enzyme vient des racines grecques en (=___) zume (=___).
  • Le ___, est la pâte de levures vivantes utilisée pour faire lever le pain.
  • Les premières enzymes identifiées ont été extraites des levures (celles-ci transforment le glucose en ___(≠éthanol?)).
A

dans;
levain;
levain;
alcool

54
Q

Classification des enzymes;
• ___: transfert d’électrons
• ___: transfert d’atomes ou de groupements
• ___: coupure de liaison par H2O
• ___=___: autres coupures de liaison
• ___=___: crée des liaisons (produit/consomme(?) de l’ATP)
• ___: isomérisation

A
Oxydoréductase;
Transférase;
Hydrolase;
Lyase;
synthase;
Ligase;
synthétase;
consomme;
Isomérase
55
Q

La vitesse de réaction dépend de ΔG___: différence d’énergie libre entre l’état initial et l’état de transition.

A

#

56
Q

Enzyme:
• Est une ___
• ___ biologique de réactions biochimiques
• Augmente la ___ de réaction
• Change/ne change pas(?) la constante d’équilibre Keq
• ↗/↘(?) l’énergie libre d’___ ΔG#
• Est non spécifique/spécifique(?) à son substrat
• Est régulable/non régulable(?)

A
protéine;
Catalyseur;
vitesse;
ne change pas;
↘;
activation;
spécifique;
régulable
57
Q

La concentration de substrat influence/n’influence pas(?) la Vi=vitesse initiale, on détermine la vitesse maximale de E = Vmax

A

influence (+ il y a de S à t0, + Vi sera élevée jusqu’à atteindre un plateau équivalent à la Vmax)

58
Q

Modèle Michaelis-Menten;

Enzyme complémentaire à l’état de ___

A

transition

59
Q

___ = constante de Michaelis-Menten: elle définit la relation enzyme↔substrat

A

KM

60
Q

Modèle Michaelis-Menten;
Quand [S] tend vers l’infini, Vi = ___. Dans ces conditions, la vitesse dépend des propriétés de l’enzyme définies par la ___

A

Vmax;

KM

61
Q

Constante Michaelis-Menten KM = [___] à ___/___

A

S;

Vmax/2

62
Q

KM: concentration de substrat qui permet à l’enzyme de travailler au quart/au tiers/a la moitié(?) de sa vitesse maximale.

A

a la moitié

63
Q

La KM indique la ___ de travail d’une enzyme, le nombre de ___ sur un télésiège aussi.

A

cadence;

places

64
Q
  • La Vmax est la vitesse de réaction lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?)
  • La KM est la concentration de substrat lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?) (indique la ___ de travail d’une enzyme)
A

saturation;
demi-saturation;
cadence

65
Q

• KM élevée/basse(?) rime avec haute affinité et faible capacité.
• KM élevée/basse(?) rime avec faible affinité et haute capacité.
• affinité à comprendre dans le sens de ___.

A

basse;
élevée;
saturabilité

66
Q
  • Km basse → basse/haute(?) affinité=il n’y a pas besoin d’avoir bcp de substrat pour que tous les sièges du télésiège soit plein.
  • Si la Km est élevée → basse/haute(?) capacité → basse/haute(?) affinité → +/-(?) difficilement saturable
A

haute;
haute;
basse;
+

67
Q

La ___ permet de prédire:
• si une enzyme opère proche de sa Vmax
• si un changement dans la concentration du substrat va changer sa vitesse

A

KM

68
Q

KM en mM glucose:
• HEXOKINASE: ___ mM
• GLUCOKINASE: ___ mM;
La concentration sanguine de glucose (glycémie) varie de ___ à ___ mM. Laquelle de ces kinases va réagir aux changements de la concentration de glucose?

A

0.1;
10;
4 à 10;
GLUCOKINASE

69
Q

Avec son KM bas, la glucokinase/l’hexokinase(?) est continuellement en Vmax, métabolisant le glucose efficacement dans des conditions physiologiques.

A

l’hexokinase

70
Q

Avec son KM élevé, la glucokinase/l’hexokinase(?) peut « sentir » des changements de glucose entre 4-10 mM. (+/- active, donc senseur au glucose)

A

la glucokinase

71
Q

KM est directement/inversement(?) proportionnel à l’affinité de l’enzyme pour le substrat.

A

inversement

72
Q

Cinétique enzymatique;

Representation de ___-___ ou “double inverse”

A

LINEWEAVER-BURK

73
Q
Site \_\_\_ d’une enzyme:
• Site de liaison du/des substrat/s
• Lieu de la réaction
• Localisé au fond d’une poche de la zone interne/externe(?) de la protéine
• Modèle de \_\_\_↔\_\_\_
• Modèle d’\_\_\_ \_\_\_
A
actif;
interne;
clé;
serrure;
ajustement induit
74
Q

Modèle d’ajustement induit = ___ ___(ang?)

A

induced fit

75
Q

Dans le site actif des E, il y a catalyse car:
• ↗/↘(?) de la concentration des réactants
• ___ propice des molécules
• ↗/↘(?) de l’énergie libre d’activation ΔG___ pour atteindre l’___ ___ ___

A
↗;
Orientation;
↘;
#;
état de transition
76
Q

A l’extrême, une dénaturation des protéines (en l’occurrence d’E) par une température trop élevée produit une inhibition spécifique/non spécifique(?).

A

non spécifique

77
Q

Protéines = ___(all?) = blanc d’œuf

A

Eiweiss

78
Q

Les inhibiteurs:
• Irréversibles/réversibles(?) (se lient de façon covalente à un groupe fonctionnel)
• Irréversibles/réversibles(?) (compétitifs, non compétitifs, mixtes)

A

Irréversibles;

réversibles

79
Q

Inhibiteurs réversibles compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax

A

analogues;
↗;
ne changent pas

80
Q

Le cyanure est un inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de la ___ ___ ___(= complexe ___(#?) de la chaîne respiratoire mitochondriale). E essentielle à l’une des dernières étapes de la respiration Cr. Sans son activité, les mouvements respiratoires pulmonaires cessent.
Le ___-___ utilisé dans les camps de la mort nazis était constitué d’acide ___.

A
compétitif;
cytochrome c oxydase;
IV;
Zyclon-B;
cyanhydrique
81
Q

L’éthanol est catabolisé dans …(org?) par une double réduction/oxydation(?): 1) en ___, 2) en acide ___.

A

le foie;
oxydation;
acétaldéhyde;
acétique

82
Q

Antabuse: inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de l’___ ___(E?), causant une accumulation d’___ aux effets indésirables (hypotension, vomissements, nausée, inconfort).

A

compétitif;
acétaldéhyde déshydrogénase;
acétaldéhyde

83
Q

Inhibiteurs non compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, mais ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax

A

Non analogues;
ne changent pas;

84
Q

Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):

Typiquement des ions ___ (___, ___, ___ etc.) qui modifient la répartition des charges de l’enzyme.

A
non compétitifs;
métalliques;
cuivre;
mercure;
argent
85
Q

• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Augmentent la KM, ne changent pas la Vmax
• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Ne changent pas la KM, mais diminuent la Vmax

A

compétitifs;

non compétitifs

86
Q

Les activateurs:
• Ions ___ (___, ___ etc.)
• ___ ___ ___ (clivage d’une liaison peptidique d’une ___ = ___, comme pour les E de la digestion)
• Modification covalente/non covalente(?) réversible/non réversible(?) (Py/déPy)

A
métalliques;
calcium;
magnésium;
Protéolyse limitée activante;
proE;
zymogène;
covalente;
réversible
87
Q

Enzymes allostériques sont caractérisés par une courbe ___ (donc elles sont michaéliennes/non michaéliennes(?))

A

sigmoïde;

non michaéliennes

88
Q

Les enzymes allostériques:
• Vi ralenti/accélère(?) à l’approche du KM (ou plutôt K0.5), point d’___ au KM, puis Vi ralenti/accélère(?) brutalement après KM
• La fixation du substrat sur l’enzyme ↗/↘(?) l’affinité de l’enzyme pour le substrat: effet ___

A
accélère;
inflexion;
ralenti;
↗;
coopératif
89
Q

Les enzymes allostériques: coopérativité: 2 modèles s’opposent:
• modèle ___
• modèle ___


A

concerté;

séquentiel

90
Q

Les enzymes michaéliennes/allostériques(?) ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites ___ (du grec ___=
autre=différent), donc =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat

A
allostériques;
allostériques;
allos;
≠;
activateurs;
inhibiteurs;
affinité;
saturabilité