28. Generowanie różnorodności immunoglobulin Flashcards
Jakich łańcuchów dotyczy rearanżacja VDJ, a jakich VJ?
VDJ - łańcuchy ciężkie
VJ - łańcuchy lekkie
Przebieg rekombinacji VDJ
- Wypętlenie fragmentu DNA pomiędzy genem J a genem D.
- Wycięcie wypętlonego fragmentu DNA.
- Połączenie genów D i J.
- Wypętlenie fragmentu DNA pomiędzy genem V a genem DJ.
- Wycięcie wypętlonego fragmentu DNA.
- Połączenie genów V i DJ.
Na których chromosomach znajdują się łańcuchy ciężkie i lekkie?
Ciężki - chromosom 14
Lekki kappa - chromosom 2
Lekki lambda - chromosom 22
Organizacja genów łańcucha ciężkiego
Segmenty V, D i J.
Przed każdym segmentem V znajduje się krótka sekwencja promotorowa.
W kierunku 3’ od segmentu J znajdują się segmenty genowe, które będą kodować domeny stałe przeciwciał.
Sekwencja kodująca łańcuch stały składa się z wielu egzonów, liczba zależna od izotypów i od tego czy przeciwciało jest błonowe czy rozpuszczalne.
Organizacja genów łańcucha lekkiego kappa
Segmenty V i J.
Przed każdym segmentem V znajduje się krótka sekwencja promotorowa.
Jeden segment kodujący łańcuch stały.
Organizacja genów łańcucha lekkiego lambda
Segmenty V i J.
Fragmenty J są poprzedzielane częściami kodującymi domenę C łańcucha lekkiego.
Jeden segment C na każdy segment J.
Występuje kilka odmian izotypowych łańcuchów stałych.
Czym są RSS? Jak są zbudowane? Jakie RSS przy jakich segmentach?
Recombination Signal Sequences
Zbudowane są z proksymalnie występujących heptamerów (7 par zasad), dystalnie występujących nonamerów (9 par zasad) i 12 lub 23 parami zasad pomiędzy nimi.
23 par zasad - two-turn RSS
12 par zasad - one-turn RSS
Łańcuch ciężki:
One-turn RSS - po obu stronach segmentów D
Two-turn RSS - od strony 3’ segmentów V i od strony 5’ segmentów J
Łańcuch lekki kappa:
One-turn RSS - od strony 3’ segmentów V
Two-turn RSS - od strony 5’ segmentów J
Łańcuch lekki lambda:
One-turn RSS - od strony 5’ segmentów J
Two-turn RSS - od strony 3’ segmentów V
Na czym polega reguła 12/23?
Każdy segment jest oflankowany przez sekwencje RSS.
Mogą łączyć się ze sobą tylko segmenty genowe oflankowane sekwencjami sygnałowymi zawierającymi odmienne wstawki.
Jak nazywają się rekombinazy biorące udział w rekombinacji VDJ? Jaką wykazują aktywność?
RAG-1 i RAG-2
Endonukleazy
Czym jest zmienność na łączach?
Powoduje powstanie różnych wariantów
tego samego zestawu VDJ. Zachodzi podczas łączenia się ze sobą segmentów.
Może nastąpić poprzez:
- Delecję 20 nukleotydów na złączu,
- Insercję 1-15 nukleotydów N (bezmatrycowe tworzenie regionów N przez dobudowywanie DNA),
- Dołączenie 1-4 nukleotydów P komplementarnych do nukleotydu złącza (przez polimerazę DNA),
- Chwytanie oligonukleotydów (przyłączanie do złącza krótkich sekwencji).
Czym są mutacje somatyczne (w kontekście zmienności przeciwciał)? Jakie białko uczestniczy w tym procesie? W jakich narządach zachodzi ten proces?
Proces prowadzący do powstania regionów hiperzmiennych (CDR) i będący podstawą dojrzewania powinowactwa przeciwciał. Zachodzi on w ośrodkach rozmnażania naczyń limfatycznych obwodowych.
Uczestniczy w nim AID - deaminaza cytydyny
AID jest ekspresjonowana głównie w aktywnych limfocytach B. Indukcja ekspresji jest sprzężona z rozwojem centrów rozrodczych.
Hipermutacje somatyczne nasilają się progresywnie w trakcie przebiegu odpowiedzi na antygen.
Czym jest rearanżacja produktywna?
Rearanżacja kończąca się efektywną transkrypcją i translacją. Prowadzi do powstania funkcjonalnego białka.
Czym jest rearanżacja nieproduktywna?
Rearanżacja, w wyniku której nie dochodzi do powstania funkcjonalnego białka.
Czym jest wyłączenie alleliczne?
Zjawisko zachodzące w limfocytach, które ogranicza rearanżację produktywną do tylko jednego jednego allelu.
Warunkuje to specyficzność antygenową, ponieważ limfocyt może mieć tylko jeden układ VDJ i VJ.
Opisz przebieg redagowania receptora (które geny po kolei).
Najpierw rearanżacja łańcucha ciężkiego. Jeśli nieproduktywna to drugi allel. Jeśli znowu nieproduktywna to śmierć.
Następnie rearanżacja łańcucha lekkiego kappa. Jeśli nieproduktywna to drugi allel. Jeśli znowu nieproduktywna to pierwszy allel łańcucha lekkiego lambda. Jeśli znowu nieproduktywna do drugi allel łańcucha lekkiego lambda. Jeśli znowu nieproduktywna to śmierć.
