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Flashcards in 4 controler lexpression genique Deck (43):
1

comment controler l'expression genique, les points de controle?

dans la plupart des cas pendant la transcription, a la premiere etape

2

la premiere etape de la transcription (ou seffectue le controle de la transcription)?

liaison de l'ARN polymerase au site d'initiation de la transcription

3

2 probleme pour l'ARN polymerase

1. genes sont disperses dans le genome, comment localiser le debut du gene
2. adn relativement innaccessible car sous forme de chromatine

4

chromatine

complexe constitué à 50-50 d'adn et de prot (histones)

5

comment permettre a l'ARN poly d'atteindre le gene, deux types de signaux?

-promotteur
-elements regulateurs

6

promoteur en bref

courte region de l'adn (dizaine de bases) situee au debut du gene et qui indique a larn poly ou elle doit commencer la transcription + sa direction

7

les elements du promoteur

-une sequence TATA (à ~25nucl du point de demarrage de la trans)
-une sequence INR (initiateur), courte sequence riche en pyrimidine (C T) au point de demarrage de la trans

8

sequence consensus?

sequence idealisee dans laquelle chaque position represente la base rencontree la plus frequement dans le brin d'ADN sup(convention)

9

ARN poly peut reconnaitre un promoteur et sy lier?
besoin de?

Non
facteurs generaux de trancription (proteines) qui s'assemblent au niveau du promoteur pour que poly puisse sattacher.

10

Un jeu de facteur generaux de transcription different pour chacue des 3 ARN poly ?

Oui

11

2 facteurs generaux de trancription

TFIID
TBP

12

TFIID

une de ses sous unités reconnait la boite TATA
une autre de ses sous unités est TBP (deplace les brins d'adn pour voir tata)

13

TFIID sert de repere à ?

-100 prot differentes dont facteurs generaux de transcription
-ARN poly

14

que fait TPB?

deplace legerement les deux brins d'ADN pour voir l'element TATA

15

assemblage du complexe d'initiation de transcription est assemblé sur le promoteur ou avant?

avant

16

fonction des facteurs generaux de transcription?

-positionnent bien l'arn poly sur le promoteur
-separent les deux brins dadn pour que larn poly puisse commencer
-aide poly a quitter le promoteur

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certains facteurs generaux de transcription sont aussi impliqué dans

le couplage entre la transcription et la maturation des transcrits primaires (coiffage, epissage)

18

les elements regulateurs en bref

courts elements d'adn (6-20pb sequence tres variable) qui permettent
-accessibilité du promoteur
-determinent le nb de copies de genes

19

elements regulateur fonctionnent par eux meme?

Non, ils sont des sites de liaison pour des facteurs regulateurs de transcription.

20

Activateurs contiennent 3 domaines

-domaine de liaison (fixation de l'activateur sur lelement regulateur donc sur l'adn)
-domaine d'activation, permet de stimuler la transcription
-domaine de dimerisation, conduit 2 molecules a former un dimere.

21

a quoi sert la dimerisation?

a doubler la surface de contact entre activateur et adn, augmente force et specificité de l'interaction

22

sequence nucleotide des elements est ....? pourquoi?

palindromique (mm seqence quand tourne de 180 degres)

activateurs se lient a l'adn sous forme de dimere

23

est ce que les domaines d'activation et de liaison a l'adn de l'activateur doivent etre ensemble?

oui

24

quelle partie de l'activateur determine quel gene est activé?

le domaine de liaison

25

quels signaux peuvent controler un activateur

hormone, kinase, facteurs de croissance, cytokines

26

dimerisation de certains activateurs necessite la presence de

cytokines
ou
facteurs de croissances

27

activateur peut etre sequestre dans le cyto, quest ce qui lui permet de passer au noyau?

hormone

28

les activateurs se fixent sur quel sillon de l'ADN? pourquoi?

le grand
points de contacts asymetriques, discrimination entre paires de base plus facile

29

mode d'activation des activateurs 2 modes

-certains activateurs activent direct la transcription
-dautres ont besoin dune autre prot : coactivateur

30

comment les activateurs/coactivateurs facilitent lassemblage du complexe d'initiation

1. modifient les nucleosomes et structure de la chromatine, meilleure accessibilité du promoteur
2.certains peuvent recruter la machinerie eux meme ce qui facilite lassemblage du complexe

31

comment les activateurs/coactivateurs modifient les nucleosomes?

1. acti modifie extremités des nucleosomes grace a des enzymes qui ajoutent des acetyles sur les N terminaux, relache la fibre
2.recrute des complexes enzymatiques qui utilisent lenergie liberee par hydrolyse de l'ATP pour deplacer les nucleosomes

32

quand les activateurs recrutent eux meme la machinerie de transcription, ca implique?

un contact physique entre activateur et machinerie, adn forme donc une boucle

33

bien qune partie des genes sont exprimés de maniere constantes, la plupart montrent un profil dexpression unique, ils peuvent etre exprimés :

-a differents moments du developpement
-a des niveaux differents (nombre d'arnm)
-dans differentes cellules
-en reponse a differents signaux

34

est ce quon pourrait avoir un activateur different pour les 25 000 genes? ca impliquerait quoi?

Non, ca impliquerait davoir le meme nombre de gene qui code les activateurs, ... nombre de genes infini

35

Un activateur controle plusieurs genes grace a une

combinaison d'activateurs pour chaque gene

36

combien de genes codants des activateurs

3000

37

enhancer?

amplificateur
segment d'adn regroupant plusieurs element regulateurs reconnus par differents activateurs

38

conditions au fonctionnement du controle combinatoire?

-seul un jeu complet d'activateur stimule efficacement la transcription
-si jeu incomplet, transcription pas optimale

39

synergie d'activation

phenomene par lequel l'effet de deux activateurs est bien plus grand que la somme des effets de chaque activateurs

40

point de controle de l'expression genique peut se faire ailleurs que lors de la 1ere etape de la transcription? ou?

Oui
points de controles post transcriptionnels
-maturation du transcrit (coiffe,...)
-transport de larnm
-stabilité de larnm
-synthese de la prot
-activité de la prot

41

comment reguler la stabilité des arnm ? un arnm stable? instable?

exemple de proteine regulatrice

proteine regulatrice peut se lier a l'arnm pour l'empecher detre traduit

est protégé contre la degradation

rapidement degradé

transferine

42

syndrome des lymphocytes nus, coactivateur muté donc

l'empeche detre recruté sur le enhancer et donc dactiver la transcription de certains genes

43

regulation de l'expression genique

controle la production ou non des genes et en quelle quantité