4 controler lexpression genique

Question 1

comment controler l’expression genique, les points de controle?

Answer 1

dans la plupart des cas pendant la transcription, a la premiere etape

Question 2

la premiere etape de la transcription (ou seffectue le controle de la transcription)?

Answer 2

liaison de l’ARN polymerase au site d’initiation de la transcription

Question 3

2 probleme pour l’ARN polymerase

Answer 3

1. genes sont disperses dans le genome, comment localiser le debut du gene
2. adn relativement innaccessible car sous forme de chromatine

Question 4

chromatine

Answer 4

complexe constitué à 50-50 d’adn et de prot (histones)

Question 5

comment permettre a l’ARN poly d’atteindre le gene, deux types de signaux?

Answer 5

• promotteur

- elements regulateurs

Question 6

promoteur en bref

Answer 6

courte region de l’adn (dizaine de bases) situee au debut du gene et qui indique a larn poly ou elle doit commencer la transcription + sa direction

Question 7

les elements du promoteur

Answer 7

• une sequence TATA (à ~25nucl du point de demarrage de la trans)
• une sequence INR (initiateur), courte sequence riche en pyrimidine (C T) au point de demarrage de la trans

Question 8

sequence consensus?

Answer 8

sequence idealisee dans laquelle chaque position represente la base rencontree la plus frequement dans le brin d’ADN sup(convention)

Question 9

ARN poly peut reconnaitre un promoteur et sy lier?

besoin de?

Answer 9

Non

facteurs generaux de trancription (proteines) qui s’assemblent au niveau du promoteur pour que poly puisse sattacher.

Question 10

Un jeu de facteur generaux de transcription different pour chacue des 3 ARN poly ?

Answer 10

Oui

Question 11

2 facteurs generaux de trancription

Answer 11

TFIID

TBP

Question 12

TFIID

Answer 12

une de ses sous unités reconnait la boite TATA

une autre de ses sous unités est TBP (deplace les brins d’adn pour voir tata)

Question 13

TFIID sert de repere à ?

Answer 13

• 100 prot differentes dont facteurs generaux de transcription
• ARN poly

Question 14

que fait TPB?

Answer 14

deplace legerement les deux brins d’ADN pour voir l’element TATA

Question 15

assemblage du complexe d’initiation de transcription est assemblé sur le promoteur ou avant?

Answer 15

avant

Question 16

fonction des facteurs generaux de transcription?

Answer 16

• positionnent bien l’arn poly sur le promoteur
• separent les deux brins dadn pour que larn poly puisse commencer
• aide poly a quitter le promoteur

Question 17

certains facteurs generaux de transcription sont aussi impliqué dans

Answer 17

le couplage entre la transcription et la maturation des transcrits primaires (coiffage, epissage)

Question 18

les elements regulateurs en bref

Answer 18

courts elements d’adn (6-20pb sequence tres variable) qui permettent

• accessibilité du promoteur
• determinent le nb de copies de genes

Question 19

elements regulateur fonctionnent par eux meme?

Answer 19

Non, ils sont des sites de liaison pour des facteurs regulateurs de transcription.

Question 20

Activateurs contiennent 3 domaines

Answer 20

• domaine de liaison (fixation de l’activateur sur lelement regulateur donc sur l’adn)
• domaine d’activation, permet de stimuler la transcription
• domaine de dimerisation, conduit 2 molecules a former un dimere.

Question 21

a quoi sert la dimerisation?

Answer 21

a doubler la surface de contact entre activateur et adn, augmente force et specificité de l’interaction

Question 22

sequence nucleotide des elements est ….? pourquoi?

Answer 22

palindromique (mm seqence quand tourne de 180 degres)

activateurs se lient a l’adn sous forme de dimere

Question 23

est ce que les domaines d’activation et de liaison a l’adn de l’activateur doivent etre ensemble?

Answer 23

oui

Question 24

quelle partie de l’activateur determine quel gene est activé?

Answer 24

le domaine de liaison

Question 25

quels signaux peuvent controler un activateur

Answer 25

hormone, kinase, facteurs de croissance, cytokines

Question 26

dimerisation de certains activateurs necessite la presence de

Answer 26

cytokines ou facteurs de croissances

Question 27

activateur peut etre sequestre dans le cyto, quest ce qui lui permet de passer au noyau?

Answer 27

hormone

Question 28

les activateurs se fixent sur quel sillon de l'ADN? pourquoi?

Answer 28

le grand | points de contacts asymetriques, discrimination entre paires de base plus facile

Question 29

mode d'activation des activateurs 2 modes

Answer 29

- certains activateurs activent direct la transcription | - dautres ont besoin dune autre prot : coactivateur

Question 30

comment les activateurs/coactivateurs facilitent lassemblage du complexe d'initiation

Answer 30

1. modifient les nucleosomes et structure de la chromatine, meilleure accessibilité du promoteur 2. certains peuvent recruter la machinerie eux meme ce qui facilite lassemblage du complexe

Question 31

comment les activateurs/coactivateurs modifient les nucleosomes?

Answer 31

1. acti modifie extremités des nucleosomes grace a des enzymes qui ajoutent des acetyles sur les N terminaux, relache la fibre 2. recrute des complexes enzymatiques qui utilisent lenergie liberee par hydrolyse de l'ATP pour deplacer les nucleosomes

Question 32

quand les activateurs recrutent eux meme la machinerie de transcription, ca implique?

Answer 32

un contact physique entre activateur et machinerie, adn forme donc une boucle

Question 33

bien qune partie des genes sont exprimés de maniere constantes, la plupart montrent un profil dexpression unique, ils peuvent etre exprimés :

Answer 33

- a differents moments du developpement - a des niveaux differents (nombre d'arnm) - dans differentes cellules - en reponse a differents signaux

Question 34

est ce quon pourrait avoir un activateur different pour les 25 000 genes? ca impliquerait quoi?

Answer 34

Non, ca impliquerait davoir le meme nombre de gene qui code les activateurs, ... nombre de genes infini

Question 35

Un activateur controle plusieurs genes grace a une

Answer 35

combinaison d'activateurs pour chaque gene

Question 36

combien de genes codants des activateurs

Answer 36

3000

Question 37

enhancer?

Answer 37

amplificateur | segment d'adn regroupant plusieurs element regulateurs reconnus par differents activateurs

Question 38

conditions au fonctionnement du controle combinatoire?

Answer 38

- seul un jeu complet d'activateur stimule efficacement la transcription - si jeu incomplet, transcription pas optimale

Question 39

synergie d'activation

Answer 39

phenomene par lequel l'effet de deux activateurs est bien plus grand que la somme des effets de chaque activateurs

Question 40

point de controle de l'expression genique peut se faire ailleurs que lors de la 1ere etape de la transcription? ou?

Answer 40

``` Oui points de controles post transcriptionnels -maturation du transcrit (coiffe,...) -transport de larnm -stabilité de larnm -synthese de la prot -activité de la prot ```

Question 41

comment reguler la stabilité des arnm ? un arnm stable? instable? exemple de proteine regulatrice

Answer 41

proteine regulatrice peut se lier a l'arnm pour l'empecher detre traduit est protégé contre la degradation rapidement degradé transferine

Question 42

syndrome des lymphocytes nus, coactivateur muté donc

Answer 42

l'empeche detre recruté sur le enhancer et donc dactiver la transcription de certains genes

Question 43

regulation de l'expression genique

Answer 43

controle la production ou non des genes et en quelle quantité