4. intro à la microbio. Flashcards
1
Q
à partir de quand est-ce que les formes microbiologiques sont apparues?
A
Au moment de la création du monde de l’ARN
2
Q
de quand à quand il y avait seulement des formes de vie microbiologique ? histoire
A
à partir de l’apparition de l’ARN jusqu’au moment des eucaryotes modernes
3
Q
Qu’est-ce qui change entre l’arbre de vie avant l’avènement de la biologie moléculaire et dans celui dans l’état actuel des connaissances?
A
les organismes que nous voyions, prenaient le plus de place, les 5 grandes boucles étaient : Monera, Protista, Plantae, Fungi et Animalia
alors que maintenant, tout est séparé entre: Bacteria, Archae (les procaryotes) et Eukarya.
l’arbre part de Luca (dernier ancêtre universel en commun)
** 3 grands domaines de l’arbres de vie, dominés par les micro-organismes**
4
Q
les archées sont plus proches des bactéries ou des eucaryotes ?
A
plus proches des eucaryotes
bien que les 2 domaines (bact. et archées) aient beaucoup en commun (ex. pas enveloppe nucléaire, pas membrane fermée des organelles, chromosomes circulaire)
les eucaryotes sont les plus proches, selon l’arbre phylogénétique. De plus, ils ont certains points communs dans le tableau de comparaisons
5
Q
quelles sont les diff. entre cellules procaryotes et eucaryotes?
A
- procaryotes sont très simples=> pas de membrane nucléaire, l’ADN prend bcp d’espace dans la cellule, bcp de ribosomes, pas d’organelles, plasmide, les parois diffèrent
- eucaryotes: organelles, membrane nucléaire, membrane cellulaire + complexe?
6
Q
l’adaptabilité chez les procaryotes
A
les procaryotes ont des capacités très impressionnantes en ce qui concernent l’adaptabilité.
7
Q
Hyperthermophile
A
capacité d’adaptabilité aux hautes températures
minimum de T: 90°C
optimal: 106°C
max: 122°C => record obtenu par la sp => Methanopyrus kandleri (Archaea) vivant dans les cheminées hydrothermales sous-marines
8
Q
Psychrophile
A
capacité d’adaptabilité aux basses températures
minimum de T: -12°C
optimal: 5°C
max: 10°C
ex. de sp: Psychromonas ingrahamii (Bacteria) vivent dans mer de glace
9
Q
Acidophile
A
capacité d’adaptabilité aux pH bas
pH minimum: - 0.06
optimal: 0.7
max: 4
ex. de sp: Picorphilus oshimae (Archaea) vivant dans sources chaudes acides
cette sp est aussi thermophile grandit à T optimale 60°C
10
Q
Alkaliphile
A
capacité d’adaptabilité aux pH haut
pH minimum: 8.5
optimal: 10
max: 12
ex. de sp: Natronobacterium gregoryi (Archaea) vivant lacs de soude
cette sp est aussi extrêmement Halophile => situation optimale 20% NaCl
11
Q
Barophile (piezophile)
A
capacité d’adaptabilité à haute pression
minimum: 500 atm
optimal: 700 atm
max: >1000 atm
ex. de sp: Moritella yayanosii (Bacteria) sédiments océaniques profonds
cette sp est aussi psychrolphile => situation optimale près de 4°C
12
Q
quelle est la dose mortelle de radiations pour procaryotes?
A
5000 Gy = 50’000x la dose mortelle pour un mammifère
13
Q
micro-organisme, que signifie ce terme
A
cela signifie qu’ils ne peuvent être vu à l’oeil nu
14
Q
pour la classification des micro-organismes, quel est le critère de définition ?
échelle de grandeur?
A
la taille
entre 40 nm et 10 microm
15
Q
quels sont les micro-organismes en question?
A
traite un groupe hétérogène => on parle de bcp d’organismes différents
Virus ( pas organisme), Procaryotes (Archaea et Bacteria) et Eucaryotes (algues, protistes et champignons)
16
Q
découverte du virus, comment a-t-elle eu lieu? conclusions?
A
- sève extraite d’un plant de tabac portant maladie de la mosaïque
- passage de la sève à travers un filtre en porcelaine connu pour piéger les bactéries porteuses de maladies
- frotté la sève filtrée sur des plants de tabac sains
- les plantes saines ont été infectées
2 conclusions:
- agent infectieux = plus petit qu’une bactérie ( car a réussi à passer dans filtre)
- multiplication de l’agent infectieux sur plante (toujours même sévérité de symptômes après de multiples cycles d’infection) (toujours même taux d’infection)
17
Q
les virus sont quoi?
but de vie ?
A
- du matériel génétique enveloppé d’une capsule protéique (capside)
- la reproduction
18
Q
différents types de matériel génétique chez virus
A
SOUVENT 1 SEULE MOLECULE
- ADN :
ADN simple brin
ADN double brin - ARN:
ARN simple brin
ARN double brin
19
Q
Capside chez les virus
A
ASSEMBLAGE DE PLUSIEURS MONOMERES (capsomères) D’UNE MÊME PROT.
- hélicoïdale : en hélice
- icosaédrique: forme géométrique à 20 côtés, chacun composé d’un triangle équilatéral => forme la plus proche d’une sphère (petit ratio surface/volume)
- complexe : mélange de plusieurs structures
20
Q
enveloppe chez les virus
A
certains virus sont entourés d’une membrane dérivée de l’hôte sur laquelle ils intègrent des prot. et glycoprot.
21
Q
ARN double brin existe chez eucaryotes ?
A
oui, lors du silencing (gènes forment double brin après coupé ARNt?)
~non~, présence d’un ARN double brin => peut alerter la présence d’un danger ! signe de virus
22
Q
pourquoi les virus sont souvent sous la forme de sphère ?
A
car c’est une forme avec + de Surface, pour - de volume
23
Q
types de virus (4 virus pour 4 structures)
A
- virus de la mosaïque: capside hélicoïdale en forme de bâtonnet rigide (capsomères, ARN)
- adénovirus : capside polyédrique/icosaédrique avec une pointe glycoprotéique à chaque sommet
- virus de la grippe : enveloppe membraneuse externe hérissée de pointes. génome comprend 8 molécules d’ARN diff; chacune entourée d’une capside hélicoïdale
- bactériophage T4: capside complexe comprenant tête polyédrique et un appareil caudal
24
Q
ce qui est nécessaire pour la reproduction du virus
A
les virus sont des virus obligatoires incapables de se multiplier sans leur hôte
25
Cycle biologique des virus
D'après spécificité
1. **virus pénètre** dans cellule et sa **capside est décomposée**, ce qui **libère l'ADN viral et les protéines de la capside**
2. les **enzymes de l'hôte** effectuent la **réplication du génome viral**
3. pendant ce temps, les **enzymes de l'hôte effectuent la transcription du génome viral en ARNm viral**, que d'**autres enzymes utilisent pour synthétiser plus de prot. virales**
4. les **génomes viraux et les prot. de la capside s'autoassemblent** pour former de **nouvelles particules virales (virions)** qui **quittent la cellule**.
=> prise d'otage de la cellule par virus, il fait ce qu'il veut (avec les enzymes et autres)
26
spécificité chez les virus
Les virus possèdent habituellement une **spécificité d'hôte**
**spécificité est variable** entre cellule et virus => déterminée par les prot. de surface des virus et les récepteurs des cellules hôtes
27
bactériophages
virus des bactéries
28
cycle lytique du phage T4
1. **attachement**, à l'aide de ses fibres caudales, le phage T4 adhère à des récepteurs spécifiques situés sur la membrane externe de la bact. E.coli.
2. **entrée de l'ADN du phage et dégradation de l'ADN de l'hôte**: la **gaine de la queue du phage injecte** alors son ADN dans la c et laisse la capside vide à l'ext. de la c. **l'ADN de la cellule subit un processus d'hydrolyse**
3. **synthèse des génomes et des prot. du virus**: sous la direction de l'ADN du phage et **en utilisant les enzymes de la cellule bactérienne**, des protéines et des copies du génome phagique sont synthétisées **à partir de composantes de la cellule hôte**.
4. **Assemblage**: 3 jeux distincts de prot. **s'autoassenblent** de façon à former les **t^tes, les queues et les fibres caudales des phages**. le **génome phagique est emballé à l'int. de la capside pendant que se forme la tête**.
5. **libération**: le **phage commande alors la production d'une enzyme qui digère la paroi cellulaire de la bact.** => **Lysozyme**; du liquide/**eau peut pénétrer dans la cellule**, qui gonfle et finit par **éclater**. Turgescence!
=> Elle **libère 100-200 particules phagiques**
29
s.19
30
lors du cycle lytique du phage T4, parmi les premiers gènes viraux transcrits il y a...
une **DNase qui détruit le génome de la cellule hôte, alors que l'ADN viral est protégé**
31
durée du cycle lytique du phage T4
20-30 minutes
32
quantification des virus=> processus quantification indirecte
- refroidissement une première couche d'agar contenant des nutriments pour les bact.
- on y verse un mélange fait d'agar fondu, de bact. et d'une suspension de phages
- après incubation, chaque virus donnera naissance à une plaque de lyse
- **compter le nombre de plaques de lyse**
33
Comment les bactéries se défendent?
- gardent en mémoire une séquence d'ADN viral
- modification des récepteurs de la bactérie
- intégration d'ADN viral
- changement de la méthylation pour ne pas être lysée
- CRISPER - CASP
34
cycle lysogénique des bactériophages
A quoi ça sert ?
1. phage se lie à la cellule hôte et lui injecte son ADN
2. ADN phagique devient circulaire
certains facteurs déterminent si cycle lytique initié ou cycle lysogénique est intégré
cycle lysogénique est intégré =>
4. ADN phagique s'intègre dans le chromosome bactérien et devient un **prophage**
5. la bact. se reproduit normalement, copie le prophage et le transmet aux cellules filles.
6. soit après un grand nb de div. cellulaires, une importante population bactérienne infectée pas le prophage est formée
soit un prophage sort du chromosome bactérien=> un **cyclique lytique commence**
35
phase lysogénique, c'est quoi?
=> phages "tempérés" peuvent s'intégrer dans le génome de l'hôte (devient prophage) et se répliquer avec lui sans lyser la cellule
36
conversion lysogénique, c'est quoi?
tant qu'il est dans phase lysogénique, le génome du prophage est transcrit avec celui de l'hôte, ce qui peut **conférer un avantage écologique à l'hôte, ou changer son mode de vie**
37
exemples de conversion lysogénique
- escherichia coli : habitant de l'intestin ----(phage lambdoïde)---> E.coli EHEC (hémorragique)
- vibrio cholerae : habitant des rivières ---(phage CTX)----> V. cholerae, agent du choléra
- Clostridium botulinum: habitant des sols et sédiments sans oxygène---(phage)----> C.botulinum, agent du botulisme (botox)
38
Pour quelles raisons les phages sont-ils utilisés dans la société?
- **potentiel curatif** (infections bactériennes) exploré dès leur découverte, et qui trouve un regain d'intérêt en raison de la **progression des bact. multi-résistantes aux antibiotiques**
- agent de conservation et de protection des aliments (USA)
- (phase de test) pourraient être utilisé dans élevages pour réduire les antibiotiques
39
virus des animaux caractéristiques
**s.27 + d'infos à ajouter?**
- la plupart ont une **enveloppe membranaire** (contrairement aux bastériophages)
- ADN double/ simple existe
- ARN double/simple existe
40
cycle de réplication d'un virus à ARN enveloppé (virus d'animaux)
1. **liaison des glycoprot. virales aux molécules réceptrices spé.** (sur surface membrane cellule hôte) => favorise l'entrée du virus dans la cellule
2. **pénétration du génome et de la capside du génome dans la cellule**. digestion de la capside par enzymes cellulaires libère le génome viral.
3. **génome viral= matrice pour la synthèse de brins d'ARN complémentaires** par une enzyme virale (enzyme déjà présente sous forme d'enzyme) **ARN polymérase** dépendante d'ARN
4. =>**nouvelles copies d'ARN du génome viral de brins complémentaires** => servent de matrices (servent comme génome pour nouveaux virus)
5. **brins d'ARN complémentaires => ARNm => prot. de la capside** (dans cytosol) et en **glycoprotéines de l'enveloppe virale** (dans RE)
6. **vésicules transportent les glycoprot. vers la membrane plasmique** de la cellule
7. une **capside s'assemble autour de chacune des molécules d'ARN** qui constitue le génome viral
et les **glycoprotéines sont amenés sur membrane de la cellule** => enrichissent membrane LIEU D'EXOCYTOSE DES CAPSIDES
8. exocytose des capsides => **bourgeonnement des virus**, son enveloppe contient **glycoprotéines virales formant saillie et enchâssées dans une membrane provenant du RE
41
cycle de réplication d'un **rétrovirus** à ARN enveloppé
1. rétrovirus pénètre et perd sa couche/membrane
2. la transcriptase inverse : ARNss (génome viral)=> après 2 étapes => ADN ds
3. ADN viral entre noyau et intègre le génome de l'hôte
4. transcription par l'ARN polymérase => forme mRNA viral et des copies du génome (ssRNA)
5. traduction de l'ARNm=> forme protéines virales, nouvelles capsides assemblées et libérées par bourgeonnement
ss= simple brin
ds= double brin
42
diff. entre virus à ARN classiques et rétrovirus
les rétrovirus **transcrivent ARN en ADN** => **transcriptase inverse** (RT)
43
virus chez les plantes, infos
> + de 2000 virus connus => la plupart des virus à ARN (hélicoïdal ou icosaédrique)
> transmission horizontale (blessures, herbivores, greffage, taille,...) ou verticale (graines ou boutures)
> à ce jour, pas de moyen de soigner infections virales
> lutte par prévention, détection précoce et élimination des plants contaminés
44
viroïdes, c'est quoi?
- plus petits que les virus
- petites molécules d'ARN circulaire (simple brin)
- **contient pas de sqz de protéines encodées**, mais capables de se multiplier dans plante et **interfèrent avec le contrôle de la croissance végétale**
- sont pour la plupart très spécifiques
- certains sont des ribozoymes (ARN démontrant une activité catalytique, par ex. clivage ou ligation) => un peu comme des enzymes
(transmission des viroïdes par les plantes ou par les insectes)
45
s.33 résumé
46
caractéristiques des bactéries
- env. 1 mio + petits que les humains
- organismes unicellulaires
- pas noyau (procaryotes / pas d'organelles
- taille proche du micromètre
- grande activité métabolique=> très actif
- versatilité métabolique: bcp de manière diff. de métaboliser
- tolérance aux conditions défavorables
- adaptabilité
47
diversité des bactéries (nb de sp)
5000 sp décrites, mais on ne sait cultiver que 1-5% des bactéries ( diversité estimée à 1 milliard de sp) => on a vision biaisée
48
taille chez bact. (avantages)
- très petite taille
- rapport d'env. 1: 5 millions entre => les bactéries et nous (tout comme nous et le diamètre de la terre)
- sa petite taille est avantageuse => **rapport surface/volume est beaucoup plus petit** que celui d'une vache => **+ petit + il y a de surface pour échanges métaboliques**
=> **l'activité métabolique dépend du rapport S/V**
49
structure d'une bactérie
- cytoplasme
- ribosomes
- ADN
- Plasmide
- membrane plasmique
- paroi cellulaire
50
potentiel de croissance des bact. ex. Escherichia coli
- une cellule d'E.coli pèse **5*10^-13 g**
- en culture (conditions optimales 37°C) **elle double sa biomasse toutes les 20 minutes** et donc si les conditions étaient réellement optimales => après 24h, il y aurait 2500 tonnes de cellules
51
qu'est-ce qui limite la croissance des bactéries?
- limitation de **place dans le milieu**
- limitation de **nourriture**
- **le pH** => métabolisme des bact. => produisent de l'acidité => changement d'environnement
- **prédation**: protistes
52
morphologie des bactéries
il existe **bcp de morphologies différentes** chez les bactéries.
- des allongées
- des rondes
- des un peu allongées avec un endospore
53
la paroi des bactéries
ont une **paroi particulière**
- composant principal : **muréine**(peptidoglycane) = >treillis très solide
- muréine = polymère de **NAG et NAM** liés par **liaison sensible au lysozyme**
- liaison entre 2 NAM
54
liaison entre les NAM
- **L-Alanine
- Acide D-Glutamique
- Acide dimaminopimélique
- D-Alanine**
55
Principe coloration de Gram
un **colorant** (le violet cristal) est **complexé avec de l'iode**, ce qui le rend **insoluble**. En lavant les cellules avec de l'alcool (éthanol), certaines **gardent la coloration (Gram +)**, d'autres la **perdent (Gram -)**. Une contre-coloration à la **safranine permet de voir les Gram -**.
56
2 types de parois, lesquelles et qu'elles sont leur particularités?
1ere : paroi des **Gram +**:
**muréine beaucoup plus épaisse**, avec membrane plasmique (avec prot.)
2ème: paroi des **Gram -** : membrane **externe** avec Lipopolysaccharides, **en dessous muréine (fine couche)** et tout en dessous membrane plasmique (avec prot.)
57
structures membrane externe des Gram négatives (de l'intérieur à l'ext.)
(- membrane cytoplasmique (pas compris dans la paroi))
- périplasme
- **membrane externe**
=> double couche phospholipides de **8 nanomètres**, qui **comprend des Lipide A (toxique)**
=> **sur Lipide A : Lipopolysaccharide** (LPS)
=> qui traversent la membrane externe : Protéines et Porine
58
de quoi sont structurés les Lipopolysaccharides ?
- Lipide A
- Lipopolysaccharide : Core (polysaccharide central) et Antigène O
59
les lipides A servent à quoi? Quel est la particularité de ce lipide ?
- **permettent l'ancrage des lipopolysaccharides dans la membrane**
- celles de bcp de bactéries pathogènes à Gram - **= toxiques** => provoquent de la fièvre, des chocs ou des perturbations digestives
- l'antigène O que le lipide porte=> **spécifique de chaque souche de bact.** (utilisé en médecine pour le sérotypage)
60
Quels sont les antibiotiques naturels qui prennent pour cible la paroi des bactéries?
**pénicilline** ( beta-Lactamine) =>
- **inhibe la transpeptidase** (enzyme des bact.) **qui relie les couches de muréine entre elles** (liaison peptidique)
- site actif est le cycle beta-lactame qui se lie à l'enzyme et la bloque
- bactéricide (tue la bact.) sur les bact. en croissance uniquement (inhibition de la synth.)
**Lysozyme**
- enzyme **bactéricide** présente dans salive, larmes etc.
- **N-acétyl-muraminidase**: coupe la liaison glycosidique entre NAG et NAM
61
contre quelles Gram, les beta-lactamines sont les plus efficaces ?
Contre les Gram positifs
car la membrane externe des Gram - sert comme protection contre ses beta-lactamines
62
Comment certaines des bactéries se protègent contre la pénicilline ?
elles **produisent des beta-lactamases** qui **hydrolyse le cycle beta-lactam des pénicillines** => les rendent inoffensives
63
quelle est la contre-contre-attaque des ennemis des bactéries ?
produisent des **substances qui se lient irréversiblement aux beta-lactamases et les bloquent**. => **acide calvulanique**
produit pasr *streptomyces clavuligerus*, lui-même producteur d'analogues de pénicillines
64
mobilité bactéries
- possèdent des flagelles => **permettent de se déplacer activement**
- il peut y avoir **un ou plusieurs flagelles** par cellule
les flagelles peuvent être :
- **polaires**
- péritriches: **flagelles à la périphérie**
- amphitriches: **flagelles au deux bout de la bact.**
65
structure des flagelles
trois parties:
- **filament** (polymère de flagelline)
- le **crochet** (rotation)
- le **corpuscule basal** (ancrage dans la paroi, **comprend la tige et les anneaux**
66
comment fonctionne un flagelle?
c'est la **force protomotrice** qui **alimente la turbine et fait tourner le flagelle** (env. 1000 protons/rotation)
=> vitesse de déplacement : 300 tours/s, 60x la taille de la bactérie/s
les **protons H+ passent dans la Mot-protéine**, ce qui est **converti en mouvement rotatif**. Ce mouvement est transmis au flagelle, qui **agit comme une hélice et propulse la bactérie**.
67
Taxie, c'est quoi?
les bactéries peuvent se déplacer de façon dirigée: **se rapprocher d'une substance attractive et s'éloigner d'une substance répulsive**
68
chimiotaxie, c'est quoi?
réaction à des composés chimiques
69
phototaxie, c'est quoi?
réaction à la lumière
70
aérotaxie, c'est quoi?
réaction de l'oxygène
71
osmotaxie, c'est quoi?
réaction à des fortes concentrations d'ions
72
magnétotaxie, c'est quoi?
réaction au champ magnétique terrestre
73
comment fonctionne la chimiotaxie (attraction)
- les bactéries **détectent des changements de concentration** (font des comparaisons)
- les bactéries mettent les flagelles dans le sens de direction de leur choix
- ne s'orientent pas comme nous=> culbutent bcp jusqu'à se rapprocher de la substance attractive culbutent moins quand elles se rapprochent
si le gradient va dans le bon sens, elles changent moins souvent de direction; s'il va dans le mauvais sens, elles changent plus souvent de direction
74
biofilms, c'est quoi?
**colonies de bactéries**
=> une colonie peut contenir : **10 millions de cellules**
(amas de différents micro-organismes qui sont maintenus ensemble et protégés par des substances semblables à de la colle (des glucides))
75
structure et évolution des biofilms
1. **attachement** des bactéries à une surface
2. **croissance**: grandissent un peu en forme de champignon
3. **dispersion**: après avoir mangé ce qui leur étaient à disposition, elles quittent le cailloux
=> **divisions des tâches au sein de la communauté** => ne font pas ttes la même chose
=> **résistance aux antibiotiques**: plus élevée que si les cellules étaient isolées
76
métabolisme des bactéries
sont **métaboliquement versatiles** (= peuvent passer d'un type trophique à l'autre)
**sont dans tous les types trophiques**
la nourriture rentre=> catabolisée en énergie, monomères et chaleur
l'énergie et les monomères => macromolécules
77
quels sont les types trophiques?
- la source d'énergie: **phototrophique** vs. **chimiotrophe**
- la source de pouvoir réducteur (donneur d'e-): **lithotrophe** (source d'e- inorganique) vs. **organotrophe** (source d'e- organique)
- source de carbone : **autotrophe** vs. **hétérotrophe**
78
diversité métabolique: tolérance ou intolérance à l'O2
- aérobie stricte: ont besoin d'O2 (sont en zone oxique)
- anaérobie stricte: supporte pas l'O2, s'en éloignent
- aérobie facultative: plus grande densité proche de l'O2, mais survivent quand même en zone anoxique
- microaérophilie: aiment bien mais ne supporte pas bcp (sont proches de l'O2 mais très peu dans zone oxique, plus zone anoxique en contact avec oxique)
- anaérobie facultative: même densité dans les 2 zones
79
peut-on respirer sans oxygène ?
(si potentiel d'e- élevé oui)
donneur d'e- (in-/organique) =(devient)=> donneur oxydé
les e- font la chaîne respiratoire (production d'énergie cellulaire) et grâce à cela les accepteur d'e- =(deviennent)=> accepteurs réduits
80
quel cycle existait avant l'apparition de l'O2?
**cycle basé sur le soufre**
la synth. de l'oxygène par les cyanobactéries n'est apparue qu'il y a environ 2.5 milliards d'années et les bactéries étaient là depuis 1.5 milliards d'années déjà!
CO2 et H2S + énergie lumineuse => chlorobium => S° + => bactérie à respiration soufre=> cycle recommence
81
adaptabilité des bactéries exemples d'adaptabilité nég. et positive
- problématique des antibiotiques (adaptabilité négative) : les bactéries se trouvant en contact d'antibiotiques laissent une zone de non croissance, car sensibles à cet antibiotique
**mais lorsque les bactéries se trouvent être en contact avec une petite quantité d'antibiotique => développent une résistance à cet antibiotique**
- plastique (adaptabilité positive): les bactéries peuvent dégrader le plastique
82
s. 67
83
s.68
84
bactéries délétères, qu'est-ce que ça signifie?
(Qui met la santé, la vie en danger)
**corrélation entre quantités utilisées et développement de résistances**
=> + antibiotique utilisé=> + l'antibiotique va diffuser dans l'environnement => **+ de faciliter à faire résistance contre l'antibio. ( faible [antibiotique])**
85
les bactéries sont-elles nécessaires aux humains?
oui.
- nécessaires au fonctionnement du corps humain=> elles participent à notre défense immunitaire, à notre digestion et semblent même influencer notre comportement.
certaines bactéries néanmoins pathogènes, elles peuvent être **source de contaminations alimentaires (toxines) ou de maladies infectieuses**. L'augmentation de la résistance aux antibio. fait craindre une résurgence des maladies liées aux infestions bactériennes.
86
quelles sont les utilisations quotidiennes des bactéries ?
- dans les boissons et aliments fermentés
- biotechnologie
- épuration des eaux
- la production des médicaments
- outils de recherche
- synth. des enzymes utilisées dans diff. domaines industriels
87
les champignons, généralités
- eucaryotes
- **chimio-organo-hétérotrophes aérobies**
- digestion extracellulaire=> envoient des enzymes pour dégrader polymères, puis absorption des monomères
- appareil végétatif filamenteux (hyphes) sauf chez les levures
- diff. types de spores (reproduction asexuée et sexuée)
- paroi de chitine (sauf oomycètes)
88
les hyphes
- **cloisonnées ou non cloisonnées** (les noyaux des cellules peuvent passer à travers des cloisons grâce aux trous)
- **croissance apical uniquement**
- **mycélium** = ensemble formé par les hyphes
89
reproduction des champignons
- **certains champignons ont une reproduction uniquement asexuée, d'autres ont une phase sexuée et une autre phase asexuée, d'autres uniquement sexuée**
- produisent des **spores** (dans 2 cas)
- les spores se dispersent très facilement
90
cycle de vie des champignons
reproduction asexuée (n):
mycélium ==> sporanges =>spores=> Germination ==> mycélium=>...
reproduction sexuée :
mycélium =(n)=> Plasmogamie (fusion du cytoplasme =(n+n)=> stade hétérocaryotique =(n+n)=> caryogamie (fusion des noyaux) => zygote (2n) =(2n)=> méiose =(n)=>sporanges => spores =(n)=> germination => mycélium (n)
91
chytridiomycètes, caractéristiques
- **spores mobiles avec flagelle**
- le **+ ancien groupe de champi.**, la plupart **aquatique**
- **certains saprophytes** ( qui tire les substances qui lui sont nécessaires des matières organiques en décomposition), **d'autres parasites** (chez amphibiens/plantes)
- **recrudescence** (baisse après une amélioration) **des infections d'amphibiens** suite au réchauffement climatique
92
Zygomycètes
- résistants zygosporanges (stade sexuel) => au gel et la sécheresse
- grande diversité de modes de vie : sprophytes, symbiotiques ou parasites végétaux, pathogènes opportuniste de l'homme (seulement problème si faible syst. immun.)
- certaines sp. peuvent diriger leur spores dans une direction et garantir une dispersion à distance (2m), avec une accélération de 20'000 g
93
Gloméromycètes
- groupe homogène **formant des symbiose avec la plupart des sp. de plantes**
- **formation d'arbuscules**, structures maximisant la surface d'échange entre les deux partenaires
- **symbiontes obligatoires** (ne peuvent pas être cultivés sans leurs hôtes)
- donnent **eaux et minéraux** à la plante
94
Ascomycètes
- très grand groupe (> 65'000 sp)
- modes de vies divers, certains sont **mycorhiziens**, d'autres sont **saprophytes**, ou **pathogènes de plantes**
- certains **vivent en symbiose avec des algues** (lichens) ou sont **prédateurs de nématodes**
95
Basidiomycètes
- les **champignons**
- **> 30'000 sp**
- caractéristique : les **spores sont formés dans les basides**
- **mode de vie divers**: mycorhizes, saprophytes (seul organisme capable
de dégrader le bois), certains sont pathogènes des plantes
- **certains sont toxiques pour l'homme**
96
les levures sont pluricellulaires ou unicellulaires ?
unicellulaire
97
qu'est-ce que la mycorhization ?
symbiose entre champignon et les racines d'une plante
98
quels sont les 5 groupes phylogénétiques des champignons ?
- Basidiomycètes
- Gloméromycètes
- Ascomycètes
- Zygomycètes
- Chytridiomycètes
99
quels groupes phylogénétiques sont considérés comme "inférieurs" et pourquoi?
**Chytridiomycètes, Zygomycètes et Gloméromycètes**
car ils forment des **endomycorhizes**
100
quels groupes de champi. sont considérés supérieurs?
Ascomycètes et Basidiomycètes
101
la majorité des pathogènes de plantes font parties de quel groupe ?
Ascomycètes
102
quel groupe contient la plupart des organismes dont la fructification est visible en tant que champi.?
les Basidiomycètes
