4.1- Génétique 3: Épigénétique Flashcards
(102 cards)
toutes cellules de notre corps partagent la même info génétique sauf…
lymphocytes
un hépatocyte doit pouvoir produire quoi?
Être en mesure d’activer les gènes recquis et inactivé ceux qui ne sont pas nécéssaire pour par exemple produire les molécules de son cytosquelettes pour générer les canicules biliaires , mais pas se différencier en chondrocyte
comment s’assurer qu’un gène demeure actif ou inactif?
en modifiant sa chromatine, soit des changements épigénétiques qui contrôle la transcription
qu’arrive t-il lors d’un cancer?
- les mécanismes responsables de la transmissions épigénétiques sont défectueux;
- Les cellules cancéreuses inactivent gènes généralement actifs (P53) et activent ceux généralement inactifs (oncogènes), ce qui leur permet de devenir de plus en plus aggressive
qu’est ce que l’évolution clonale?
lorsque les perturbations épigénétiques permettent aux cellules cancéreuses de devenir de plus en plus agressive
quel gène exprime seulement allèle paternel?
IGF2
quel gène exprime seulement allèle maternel?
H19
IGF2 a une empreinte parentale..
La terminologie de l’empreinte parentale: elle ne fait pas directement référence à l’expression mais plutôt à la méthylation de l’allèle. Une empreinte maternelle indique que l’allèle d’origine maternelle est méthylé: cet allèle méthylé n’est donc pas transcrit, d’où l’expression paternelle.
Donc, IGF2
MATERNEL
car inactive (méthyle) allèle maternel et donc exprime allèle paternel
H19 a une empreinte parentale…
PATERNEL
inactive allèle paternel et exprime allèle maternel
quels sont les 4 principes fondamentaux des modifications épigénétique?
1- Marque Épigénétique doit altérer la chromatine sans changer la séquence de nucléotide de ADN
2- ME doit être transmise fidèlement d’une cellule à toutes ses descendantes; cette caractéristique garantie que la différenciation soit irréversible
3- ME doivent être effacées dans cellules de l’embryon précoce (pendant les 4 premiers jours post conception = avant stade de blastocyte)
4- après le stade blastocyte (différenciation des cellules de la morule en bouton embryonnaire et trophoblaste) les cellules de l’embryon recommencent à marquer leur chromatine selon leurs voies de différenciation
les marques épigénétiques peuvent se faire à 4 niveaux, lesquels?
1-méthylation des cytosines et guanine d’ADN
2-altération des histones
3-portéines Polycomb (PC) et Thrithorax (TTX)
4-structure des nucléosomes
à quel niveaux l’impact est local?
méthylation des cytosines et altération des histones
quel niveau contrôlent les longs segments ADN comportant plusieurs gènes?
protéines Polycomb (Pc) et Thrithorax (TTX)
quelle est la cause la plus importante de mutations ponctuelles en génétique et en oncologie?
les cytosines méthylés peuvent s’oxyder en uracile qui agiront comme des thymines
comment le principe de méthylation peut inhiber la transcription?
enzyme DNA méthyle transferase (DNMT) ajoute un méthyle CH3 sur le 5e carbone des cytosines
quelles sont les trois étapes du mécanisme de méthylation?
1-deux brins ADN méthylés sont dénaturés en ADN simple brin = ssDNA
2-DNA polymerase transforme chacun des brins de ssDNA en dsDNA (le brin original est méthyle mais le brin neuf non!)
3-DNMT (recruté par facteur de transcription inhibiteur (FT-1)); reconnait une cytosine méthylée sur un brin et méthyle la cytosine sur le brin complémentaire
qu’est ce qui est encore plus efficace que le groupe méthyle à lui seul pour empêcher la transcription? et ce dernier est essentiel pour qui?
cytosines méthylé recrutent un MeCP (methyl cytosine binding protéine)
=grosse protéines plus efficaces pour empêcher la liaison de facteur de transcription activateur!
Le MECP est essentiel pour le développement de l’embryon
vous observez un enfant (ayant un développement tout à fait normal depuis l’âge de 1 an) qui commence à développer un profond retard mental et une neurodégénérescence progressive depuis quelques années, que pourrait être la cause?
syndrome de Rett
- mutation de MECP2, gène sur chromosome X donc seul les filles sont atteintes
- transmission dominante
- essentiel chez embryon et généralement létale chez foetus masculin
comment la méthylation de ADN contrôle l’acétylation des histones?
MeCP recrutent enzyme HDAC (histone déacétylase)
nommer chacune des histones présentent en 2 copies au niveau du nucléosome
H2A
H2B
H3
H4
X2
existe-il seulement 4 paires d’histones?
NON
en plus des histones classiques, on peut en retrouver plusieurs autres
=plus que 50 histones peuvent être générées, de longueurs et de séquences variables augmentant ainsi le de beaucoup le nombre d’aa pouvant être modifiées par ajout de molécules
ou se lie les histones H1? permet quoi?
se lient à ADN à l’endroit ou il n’est pas enroulé autour de l’octamère ce qui lui permet de contrôler la configuration 3D de la chromatine
ADN internucléosomique
comment s’appelle la région de la chromatine transcriptionnellement active?
EUCHROMATINE
ouverte
comment s’appelle la région de la chromatine transcriptionnellement non active/non transcrite?
HÉTÉROCHROMATINE
Compact