BM3 Flashcards

1
Q

Comment se forme la fibre de 30nm?

A

Une histone H1 (+) interagit avec l’ADN de liaison (-) (20pb) pour resserrer les nucléosome adjacent entre-eux. Les queue-N terminales stabilisent aussi les brins d’ADN en interragissant soit entre les 147pb du nucleosome, l’ADN de liaison ou avec les queues d’autre nucleosome.

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2
Q

Ou s’ancre H1?

A

-AU MILIEU DES 147 pb ASSOCIÉES
AU NUCLÉOSOME (AXE DE LA DYADE).
- ADN INTERNUCLÉOSOMIQUE À UNE
EXTRÈMITÉ DU NUCLÉOSOME

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3
Q

Quelles sont les caractéristiques de la fibre de 30nm?

A
  • 6 nucleosome/tour
  • 11nm de diamètre (diamètre d’un nucleosome)
  • L’ADN de liaison est à l’intérieur de la fibre
  • La surface des octamères se font face.
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4
Q

Que permettent les liaisons H (faible) entre les protéines d’histone et l’ADN?

A

Elle permettent une structure dynamique de la chromatine et ainsi permettre l’accès transitoire aux séquences d’ADN lorsqu’on en a besoin.

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5
Q

Qu’est-ce que les complexe de remodelage des nucléosome (SWI/SNF et ISWI)?

A

Ce sont des complexe protéiques qui contiennent une sous-unité capable d’hydrolyser l’ATP. Elles font la translocation de l’octamère d’histone sur l’ADN.

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6
Q

De quoi est composé le complexe de remodelage?

A

1- d’une pince de positionnement
2- du domaine ATPase
3-D’une pince de torsion

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7
Q

Comment se fait le remodelage du nucléosome?

A

1- L’ADN de liaison est tirer par la pince (grâce a E ATP)
2-Cela rompt les 5 sites de liaison en partant de la pince jusqu’à l’ADN de liaison.
3- Les liaisons se reforme mais cela forme un pli.
4-On recommence jusqu’à ce que le pli soit transmit par vague et que le nucléosome ait changé de position sur l’ADN.

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8
Q

Comment peut-on laisser des séquence d’ADN toujours disponible à la transcription?

A

Si des protéines de liaisons s’installent sur une portion d’ADN inférieur à 150pb, il n’y aura pas de nucléosome dans cette section .

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9
Q

Comment un nucléosome peut-il avoir une position spécifique?

A

En étant guidé par une protéine de liaison.

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10
Q

Le code des histone sont des modification _______

A

post-traductionnelle

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11
Q

Les lysines d’une queue N-terminale d’une histone peuvent être:

A

méthylée au acétylée.

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12
Q

Les sérines d’une queue N-terminale d’une histone peuvent être:

A

phosphorylées.

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13
Q

Comment peut-on qualifier le code des histone?

A

Site et histone spécifique

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14
Q

Comment peut-on méthyler une lysine qui a été acétylée?

A

En la désacétylant avec une désacétylase (HDA). Les modifications sont graduelles.

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15
Q

Comment se produit l’acétylation de la lysine de l’histone?

A

1- Le carboxyle de l’enzyme HAT attaque l’amine protonné de la lysine. Ce dernier devient très électronégatif.
2- Attaque nucléohpile du groupement amine de la lysine sur le carbonyle de l’acétyl-Coa

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16
Q

Quel est le résultats de l’acétylation de la lysine?

A

Elle perd sa charge + et perd du même coup son affinité pour le squelette sucre-phosphate de l’ADN

17
Q

Autre que la modification des affinités avec l’ADN, a quoi peut servir l’acétylaton ou la méthylation de l’ADN?

A

Elles crée des site de liaison pour les molécules non-enzymatique de modification de la chromatine.

18
Q

Avec quoi réagit le bromodomaine et quel en est le résultats?

A

Avec les queues N-terminale acétylées

Activation

19
Q

Avec quoi réagit le chromodomaine et quel en est le résultats?

A

Avec les queues N-terminale méthylées

Répression

20
Q

Quand àlieu l’assemblage des nucléosome?

A

Immédiatement après la réplication de l’ADN

21
Q

Quand sont synthétiser les octamère d’histone manquant au nouveau brin d’AND répliqué?

A

Avant G1

22
Q

Qu’advient-il si les octamères d’histone ne sont pas créer lors de la réplication de l’ADN?

A
  • Les chromosomes ne sont plus capable de se compacter

- On obtient deux jeu de chromosome différents

23
Q

Qu’arrive-t-il aux nucléosome à mesure que la fourche de réplication avance?

A

Ils sont clivées en tétramères H3-H4 et dimère H2A-H2B.

24
Q

Nommez les chaperons d’histone.

A

CAF-1: se lie a H3-H4

NAP-1: se lie a H2A-H2B

25
Q

Comment les chaperons se lient-ils aux histones?

A

Elle sont chargé négativement se lient ainsi aux histones chargées positivement

26
Q

Lors de la réplication de l’ADN, est-ce que les anciennes histones se lient au protéines chaperonne?

A

Non, les protéines chaperonnes ne sont utiles qu’aux tétramères d’histone nouvellement formés.

27
Q

Que fait CAF-1?

A

Elle dépose les tétramères H3-H4 sur l’ADN.

Elle opère à la fourche de réplication en se liant avec PCNA

28
Q

Qu’ont de particulier les 2 motif de liaison à PCNA PIP1 et PIP2?

A

Elles sont bien concervées chez tous les eucaryote.

29
Q

À quoi sert NAP-1?

A
  • Elle empêche l’incorporation des deux dimères H2A-H2B

- Navette nucléo-cytoplasmique

30
Q

De quoi est constituée la protéine NAP-1?

A
  • domaine NAP très conservé et chargé négativement, qui se lie à l’histone
  • queue N-terminale à séquence variable
  • queue C-terminale très acide (chargée négativement), améliore l’affinité de NAP pour l’histone.