BM5 Flashcards

1
Q

Quel est l’erreur la plus fréquente lors de l’appariement des bases?

A

L’incorporation de la mauvaise forme tautomérique de la base en question.

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2
Q

Dans quels sens se fait la réparation de l’ADN par la polymérase?

A

3’-5’ (c’est une 3’-exonucléase)

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3
Q

Lors de l’incorporation d’un mauvais nucléotide dans la chaîne d’ADN, pourquoi la synthèse de ce dernier stoppe-t-il?

A

Car cela change l’orientation du OH, inhibe les interraction avec la paume. = défavorise l’ajout d’un autre nucléotide.

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4
Q

Comment se passe l’excision d’un nucléotide mésaparié?

A
  • Les ponts hydogènes sont rompus
  • Les 3-4 dernier nucléotides ajouté se retrouvent simple brin
  • L’ADN s’imple brin a plus d’affinité avec le site exonucléase que catalitique.
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5
Q

Qu’est-ce qu’un fragment d’Okazaki?

A

État transitoire des fragments d’ADN avant qu’ils soient reliées ensemble.

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6
Q

Qu’est-ce que la primase?

A

Une polymérase à ARN qui synthétise des amorces

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7
Q

Qu’est-ce qu’un site d’amorçage?

A

Des triplet particuliers de nucléotides surreprésenté dans le génome.

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8
Q

À quoi sert l’hélicase?

A

Elle sépare les brins parentaux

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9
Q

Que permettent les interactions entre l’hélicase et la primase?

A

Cela augmente considérablement l’efficacité de la primase. Cela permet aussi de réguler la longueur des fragments d’okasaki.

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10
Q

Comment peut-on retirer les amorces d’ARN lorsque le brin d’ADN est formé?

A

Grâce à la Rnase H qui reconnais les amorce et retire l’ARN apparié à de l’ADN (il laisse le dernier ribonucléotide). Puis à une 5’-exonucléase qui le retire.

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11
Q

Comment peut-on combler les troues laisser par les amorces?

A

Grâce à l’ADN pol puis a la ligase qui forme le dernier lien

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12
Q

Vrai ou faux. L’hélicase sépare l’ADN de 5’ vers 3’

A

Faux, elle sépare l’ADN peut importe le sens, peu importe le brin.

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13
Q

Quel est le diamètre de l’hélicase?

A

13A, donc plus grande que l’ADN monocaténaire mais plus petit que l’ADN bicaténaire.

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14
Q

Comment se lient les molécules SSB à l’ADN?

A

Elles se lient à l’exosquelette phosphate grâce à des interactions électrostatique et d’empilement hydrophobe.

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15
Q

Qu’est-ce que la Pol α / PRIMASE?

A

Chez l’humain, synthèse d’amorce ARN puis synthèse de l’ADN.

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16
Q

Qu’est-ce que la Pol δ?

A

Chez l’humain, synthèse du brin tardif.

17
Q

Qu’est-ce que la Pol ε?

A

Chez l’humain, synthèse du brin précoce.

18
Q

Qu’est-ce que Pol I?

A

Chez la bactérie, retrait d l’ARN (même le dernier ribonucléotide) (5’-exonucléase) et remplacement par l’ADN

19
Q

Qu’est-ce que Pol III?

A

Chez la bactérie, réplication. (3’-exonucléase)

20
Q

Où se place la pince coulissante? (PCNA) Comment?

A

Autour du complexe matrice-ADN

Le complexe gamma ouvre la pince grâce à l’hydrolyse de l’ATP, la place.

21
Q

Chez E. Coli, de quoi est composé l’holoenzyme Pol III?

A

2 coeur d’ADN pol III et du complexe gamma

22
Q

Comment est synthétiser le brin précoce?

A

Dès la séparation des deux brins, il est pris en charge par l’ADN Pol III qui synthétise un brin continue.

23
Q

Comment est synthétiser le brin tardif?

A

L’ADN est débobiner et pris en charge par les SSB, La primase synthétise des amorces.
Celle-ci est reconnue par le compelxe gamma qui appose la pince coulissante. La pince recrute la pol. Synthétise le brin jsuqu’à l’amorce précédente. Pol III se décroche quand elle a fini. Même chose pour la pince coulissante.

24
Q

Quelles est l’importance de l’intéraction hélicase-holoenzyme Pol III?

A

Cela augmente la vitesse de l’hélicase de 10X.