Défense et contre-défense I : anti-adsorption, toxines...

Question 1

Quels mécanismes de défense aboutit à une survie de phage et de la cellule ?

Answer 1

Résistance à l’adsorption
Lysogénie
Infection chronique

Question 2

Quels mécanismes de défense aboutit à une survie de la cellule, mais pas du phage ?

Answer 2

Système de restriction.
SiE.
CRISPR

Question 3

Quels mécanismes de défense aboutit à la mort de la cellule, mais survie du phage ?

Answer 3

Infection lytique

Ralentissement de cycle.

Question 4

Quels mécanismes de défense aboutit à la mort du phage et de la cellule ?

Answer 4

L’infection abortive, par les système ABI avec les blocages de l’expression génomique du phage.

Question 5

Qu’est-ce que le quorum sensing ?

Answer 5

Certaines bactéries sont capables de détecter la population bactérienne pour exprimer ou non un certain récepteur visé par le phage lambda, selon la densité.

Question 6

Quels mécanismes de défense / contredéfense par récepteurs ?

Answer 6

Délétion du récepteur / entraîne perte de fonction importante, ou sensibilité pour un autre phage.
Mutation du récepteur / phage peut s’adapter
Masquage de récepteur.

Question 7

Qu’est-ce que le mécanisme de défense par EPS ?

Answer 7

La bactérie est capable de produire des Exopolysacchardies dans le but de bloquer l’accès du virus aux récepteurs.

Question 8

Quelle contredéfense à la défense EPS ?

Answer 8

Le virus peut s’adapter, et ou détruire les EPS avec des lyases, ou encore reconnaître spécifiquement les EPS pour s’y fixer (ag O et K). Ces antigènes peuvent à leur tour être modifiés pour échapper au phage.

Question 9

Comment a-t-on mis en évidence la protéine A chez S. Aureus ?

Answer 9

Utilisation de deux souches, l’une déficiente pour la protéine A et on infecte. Ensuite, on fait un test d’adsorption et le virus est adsorbé uniquement chez les bactéries à déficience en A.

Question 10

Comment est-ce que le phage peut attaquer par dégradation d’alginates ?

Answer 10

Possède une activité enzymatique au niveau de sa queue permettant de dégrader l’antigène O des LPS sur 100nm. De plus, capable de modifier cet antigène par acetylation pour éviter une infection par des virus apparentés.

Question 11

Qu’est-ce qu’un mécanisme par variation de phase?

Answer 11

Bpp+ infecte une bactérie, et produit 99% de virus identiques aux parents. Le 1% restant possède un phénotype identique, mais un génotype différent. La descendance de ces 1% aura phéno et géno modifiés, et possibilité de reconnaître d’autres récepteurs, permettant d’augmenter le spectre d’hôtes possible.

Question 12

Décrire le mécanisme Sie du phage T4.

Answer 12

Exprime une protéine imm, capable de modifier le site d’insertion de l’ADN et en plus une protéine Sp inhibtant l’activité du lysozyme situé dans la queue des phages.

Question 13

Donner un mécanismes SiE présents chez les bactéries à gram +.

Answer 13

• inhibation du transfert de génome par lipoprotéine

Question 14

Quel type de système de restriction utilise des enzymes reconnaissant des séquences palindromiques de 4 à 8 nucléotides ?

Answer 14

Il s’agit du type II.

Question 15

Décrire le système de modification/restriction et les réponses des phages.

Answer 15

la bactérie méthyle son génome et utilise de la restriction pour dégrader le génome viral. Du coup, le virus méthyle avec HMC. La bactérie met alors en place un système mDS pour cibler l’ADN viral. Du coup, virus développe Glu-HMC pour le contourner. Alors bactérie utilise GmrS et GmrD. Du coup IPI chez phage. Alors fusion GmrS GmrD. etc.

Question 16

Qu’est-ce que l’Abi et que cible ce mécanisme ?

Answer 16

L’Abi est un mécanisme d’infection abortive, visant les étapes essentielles de l’infection du phage (transcription, réplication, traduction). A pour conséquence la mort cellulaire. Existent généralement chez les bactéries à gram +.

Question 17

Qu’est-ce que le mécanisme Abi lit ?

Answer 17

Système activé par l’expression de la protéine de capside majeure du phage T4. Lit clive alors le facteur d’élongation de la traduction EF-TU et provoque la mort cellulaire.

Question 18

Qu’est-ce que le mécanisme Abi Rex ?

Answer 18

Système à deux composants, RexA et RexB. RexA est un senseur intracellulaire activant la protéine transmembranaire RexB qui sert de canal ionique. Ceci induit un changement de potentiel de membrane et entraîne une fuite d’ATP… Qui tue la cellule.

Question 19

Comment est-ce que les phages sont capables de contourner les systèmes Rex ?

Answer 19

Exprime des protéines RIIA et B. Mais une surexpression de Rex cause quand même une résistance au phage…

Question 20

A quel autre système est généralement lié un système Toxine/antitoxine ?

Answer 20

Aux systèmes Abi.

Question 21

Qu’est-ce qu’une toxine ?

Answer 21

Il s’agit d’une molécule généralement spécifique d’une séquence qui interfère avec un ARN pour le détruire, et dont l’effet est neutralisé par une antitoxine.

Question 22

Quels sont les trois principaux modes d’action de Toxine Antitoxine ?

Answer 22

Type I : les ARNm des toxines et antitox sont transcrit séparéments, et forment un duplex pour empêcher la traduction de la toxine.
Type II : les ARNm de toxine sont produits à partir du même promoteur, et les complexes traduits régulent le promoteur. Si stress, antitoxine clivée et toxine lâchée.
Type III : l’ARN se fixe directement à la toxine pour bloquer son activité.

Question 23

Décrire le système avec MazE mazF,

Answer 23

Maze E et F sont traduits à partir du même promoteur. Ils forment un complexe, et l’antitoxine E est clivée en cas de stress par une protéase. mazeF alors relâché est capable de cliver son propre ARN, s’autoréguler, et empêcher la croissance cellulaire.

Question 24

Décrire le système ToxIN.

Answer 24

Toxine et l’ARN antitoxine forment des complexes triangulaires. En cas de stress, l’ARN est clivé et la toxine relâchée. Le virus code alors pour des ARN mimant ceux de l’antitoxine, pour garder la toxine attachée et non active.