Caudovirales : T7 (ADN db) Flashcards

1
Q

Quelles sont les caractéristiques morphologiques de T7 ?

A

Tête T=7, queue courte, contractile, avec 6 fibres.

Seul 1 brin d’ADN est codant.

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2
Q

Comment se fait l’adsorption ?

A

Les fibres cherchent une à une le contact avec la bactérie, puis se lient les 6 à la cellule : la queue et le core subissent une modification structurale.

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3
Q

Comment se fait l’entrée ?

A

gp15/16 font entrer les 850 premières pb à vitesse lente.. La RNApolP laisse entrer 7kbp à basse vitesse, puis la RNApol T7 une fois synthétisée fait traverser le reste à haute vitesse.

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4
Q

Pourquoi l’entrée en 3 étapes ?

A

éviter les systèmes de restriction.

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5
Q

En quelles classes sont regroupés les gènes de T7 ?

A

3 classes : la 1, avec les gènes précoces transcrits par la ARNpolP (antirestriction, kinase qui transforme la pol en T7pol)
La 2 : transcrits par la T7 : protéines réplication.
Classe 3 : tout ce qui est capside et morphogénèse.

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6
Q

C’est quoi le gène 0,4 ?

A

C’est un gène produit précoce, toxique pour la bactérie pour inhiber la division (FtsZ)

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7
Q

C’est quoi le gène 0,7 ?

A

C’est la P. Kinase :phosphoryle par exemple la RNApolP pour la rendre plsu processive (T7), mais aussi la RNase3, RNase E et la RNA hélicase : ça a pour but de stabiliser les transcrits.

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8
Q

Qu’est-ce que gp1 ? Quels sont les transcrits intermédiaires ?

A

Gp1 : c’est la T7 ARN pol.
Gp1.3 : ligase
Gp1.7 : nucléotide kinase.

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9
Q

A quoi sert gp2 ?

A

Régule la formation des concatémères : participe à l’encapsidation.
Inhibe aussi l’ARNpolP.

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10
Q

Qu’est-ce que gp4 A et B ?

A

Primase / Hélicase

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11
Q

Et gp5 ?

A

T7 ADN polymérase.

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12
Q

Comment est-ce que la Réplication est initiée ?

A

gp1 (ARN pol) transcrit un ARN (intermédiaire) et ouvre l’hélice à la région riche en AT : cela provoque le recrutement de l’hélicase et des SSB, et finalement l’ADN pol de T7 déplace l’ARN pol et fait sa synthèse. La primase se charge du brin lagging.

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13
Q

Qu’est-ce que la thioredoxine ?

A

Une molécule stabilisant la réplicase, cofacteur de gp5.

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14
Q

Qu’est-ce que H-NS ?

A

C’est une protéine libérée par la lyse de l’ADN bactérien lors du cycle viral qui reconnaît les sites promoteurs et bloquer l’ORI. La protéine 5.5 peut inhiber son action.

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15
Q

Pourquoi est-ce que le génome bactérien est dégradé pendant le site et par quoi ?

A

La réplication du phage (son génome étant de taille élevée) requiert énormément de nucléotides : gp3 et gp6 dégrade l’ADN donnant des mNTP, phosphorylés en dNTP par la nucléotide kinase et deux autres enzymes bactériennes (conversion GMP TMP GDP TDP NTP)

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16
Q

Comment se fait la morphogénèse ?

A

Par le biais de terminases : ce sont des protéines recrutées lors d’une pause de transcription faite sur une région entre les concatémères : elles peuvent ensuite introduire l’ADN viral dans une procapside.

17
Q

Comment est-ce que la procapside est traitée ?

A

Se remplit de molécules d’échaffaudages. L’ADN doit entrer par l’extrémité droite, et change la structure des protéines de la procapside :la queue et les fibres ajoutées ensuite. Une fois l’assemblage fini, la holine est exprimée et le lyzosymes, faisant la lyse et la libération de 200 phages environ.