8 Flashcards

Question

Décrire l'étape 3 de l'épissage.

Answer 1

FORMATION DU COMPLEXE B : – liaison d'un tri-snRNP -> U4, U5 et U6, au pré-ARNm et à U1 et U2 – U4 et U6 se lient à leur séquence complémentaire sur le pré-ARNm. – U5 est lié par des interactions protéine-protéine. - U6 va prendre la place de U1 au site d'épissage 5' (donneur). Le complexe est assemblé et prêt à catalyser l'épissage de l'intron.

Answer 2

FORMATION DU COMPLEXE C : – U4 est libéré du complexe. – Permet à U6 d'interagir avec U2 --->justapose le site donneur au site de branchement. – U5 facilite la liaison du site d'épissage 5' (donneur) avec les sites d'épissage 3' (receveur). – Libération de l'intron sous forme de lasso.

Answer 3

Des introns qui s'éliminent eux-mêmes sans ARN externe ou protéines ---> Rare L'intron se replie en une configuration précise au sein du pré-ARNm et autocatalyse la réaction d’épissage.

Answer 4

Oui, le site d'épissage en 5' (donneur) est seulement reconnu par 2 snRNP (U1 et U6), donc il est peu probable que ces deux protéines reconnaissent une séquence incorrecte. Mais des introns peuvent être très longs, alors la machinerie doit identifier des petites séquences dans un océan de séquences, alors des erreurs peuvent se produire.

Answer 5

1- Sauts de sites d'épissage : - le spliceosome ne reconnait pas le bon site d'épissage (jonction intron/exon) et saute un exon entier. Avant épissage (ARN pré-messager) : Exon 1 — Intron 1 — Exon 2 — Intron 2 — Exon 3 Après saut de l’exon 2 (erreur) : Exon 1 — Exon 3 2- Sélection d'un pseudo site : - le spliceosome choisit un faux site d’épissage Les sites d’épissages sont petits et peuvent être retrouvés dans la séquence exonique. Avant épissage (ARN pré-messager) : Exon 1 — Intron 1 — Exon 2 — Intron 2 — Exon 3 Après sélection d'un pseudo site (erreur) : Exon 1 — on 3

Answer 6

Faux, les pré-ARNm sont épissés au cours de la transcription.

Answer 7

L'ARN Pol transporte des protéines jouant un rôle dans l'épissage. Ces protéines vont être transférées de l'ARN Pol vers le pré-ARNm quand un site d'épissage en 5' (donneur) est rencontré. Ceci stimule aussi un recrutement rapide de protéines au site d'épissage en 3' (receveur).

Answer 8

1- L'assemblage du spliceosome se fait dans l'ordre que l'ARN est transcrit (ce qui rend les sauts d'exon peu probable) 2- Reconnaissance préférentielle des sites d’épissage proches d’exons à cause des protéines SR

Answer 9

- Des protéines SR se lient à des séquences amplificatrices d'épissage exonique ---> ESE - SR recrute U2AF au site d'épissage 3' et U1 au site d'épissage 5' - Le spliceosome s'assemble préférablement aux sites voisins d'exons.

Answer 10

Faux, elles sont essentielles.

Answer 11

– Un épissage avec une autre forme du spliceosome : – U1 = U11 et U2 = U12. – séquences de reconnaissance différentes. – U4 et U6 sont différentes. – U5 est pareil. – Les séquences de reconnaissance aux jonctions intron/exon sont différentes. - AU en 5' et AC en 3' - Les étapes sont identiques.

Answer 12

Un mécanisme post-transcriptionnel qui permet à un même pré-ARNm d’être épissé de différentes façons, pour générer plusieurs ARNm distincts → chacun donnant lieu à une protéine différente, appelée isoforme. Permet d'optimiser le génome.

Answer 13

Faux, majorité.

Answer 14

1- Exon sauté 2- Exon allongé 3- Intron retenu 4- Épissage trans alternatif ask for defs

Answer 15

Dépend de la position relative des sites d'épissage dans un intron ou de la taille d'un intron. EXEMPLE : – la liaison de U1 peut empêcher la liaison de U2 sur le même intron. – La liaison de U2 peut empêcher l'utilisation du site d'épissage 5' du même intron.

Answer 16

1 – À l'ARN 2. Aux protéines de la machinerie d'épissage

Answer 17

Activateur : protéines SR Répresseur : protéines hnRNP

Answer 18

Les hnRNP possèdent un domaine de liaison à l'ARN et inhibent la machinerie d'épissage par encombrement.

Answer 19

1- Deux hnRNP1 se lient à l’extrémité de 2 exons et masquent l’intron en se liant – Le spliceosome ne peut pas se lier à l'intron car il est masqué. 2- Un premier hnRNP1 se lie au site polypyrimidinique dans l'intron et lie d’autres hnRNP1 par un système coopératif. – Le spliceosome ne peut pas lier l'intron, car il est encombré.

Answer 20

Modifie la séquence d'un ARN après sa transcription et avant sa traduction ---> enlève ou insert une couple de base individuelle. (Alors se passe dans l'ARN mature)

Answer 21

1- Désamination d’adénines ou de cytosines 2- Insertion ou délétion d’uridine par un ARN guide

Answer 22

- Sur des cytosines ou des adénosines. - Phénomène rares mais importants - ADAR --> catalyse la désamination de l'adénosine pour donner une inosine qui est reconnue comme une guanine lors de la traduction. - Les désaminases reconnaissent une séquence spécifique ou une structure secondaire particulière dans l'ARN.

Answer 23

- Surtout dans les mitochondries de trypanosomes. - L'insertion de multiples U après la transcription ---> peut représenter jusqu'à la moitié des nucléotides de l'ARN mature.

Answer 24

– servent à l'insertion des U. – Comportant 3 régions : – Extrémité 5' : ancrage, dirige l'ARNg vers la région de l'ARNm à éditer. – Région d'édition : région déterminant la position d'insertion des U. – Extrémité 3' : région poly-U, rôle pas clair.

Answer 25

1- Appariement de la région d’ancrage 2- Les A non appariés (exclus de la séquence de l'ARNm) où les U seront insérés. 3- Coupure par une endonucléase dans les régions d’ARN mésappariées (les 2 A exclus). 4- Transfert de U dans les interruptions (la coupure) de l’ARNm 5- Ligation ---> ligase

Answer 26

non passif

Answer 27

- Certaines protéines favorisent le transport : – Les protéines SR (régulateurs de l’épissage) restent associées à l’ARNm suite à l’épissage et favorisent leur transport - Certaines protéines inhibent le transport : – Les protéines liées aux jonctions entre les introns (snRNP).

8 Flashcards

(55 cards)