cours 2 Flashcards
(57 cards)
C’est quoi le dogme de la biologie moléculaire ?
ADN -> ARN -> Protéine
Transcription -> Traduction
Combien de temps prend la décision cellulaire ?
16h
Combien de temps prend la réplication de l’ADN ?
10h
Chaque brin d’ADN _____ sert de moule pour le brin
_____, en codant la séquence ________ et _________.
Mère, fille, inverse et complémentaire.
Quelles sont les 4 caratéristiques de la réplication de l’ADN ?
– Complexe : plusieurs protéines impliquées
– Hautement spécialisée.
– Vitesse impressionnante.
– Fidélité quasi parfaite.
Quels sont les deux éléments que nécessite la réplication de l’ADN ?
1- dNTP (desoxyribonycléotides triphosphates)
2: Joncyion amorce: matrice
À quoi servent les dNTPs (2) ?
Ils fournissent :
1 – les bases azotées pour la synthèse du nouvel ADN (N) ;
2 – l’énergie pour former les liaisons phosphodiester entre les nucléotides.
D’où proviennent les dNTPs qui s’ajouteront à l’amorce ?
Du noyau
Dans quelle direction se fait la réplication ?
5’-3’
Quelle est la matrice dans la jonction amorce : matrice ?
Le brin-mère simple brin
Quelle est l’amorce dans la jonction amorce : matrice ?
Le brin complémentaire et inverse du brin-mère
Quoi va effectuer une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du dNTP ?
L’extrémité 3’-OH du brin de l’amorce
Vrai ou faux : la liaison entre le dNTP et l’amorce peut se faire même si les bases ne sont pas appariées correctement ?
Vrai, mais la liaison se fera 10 000 fois moins efficacement.
À quoi servent les deux ions métalliques divalents (paume de la main) (3) ?
1 Modifient chimiquement l’environnement de l’extrémité 3’ OH et du dNTP.
2- Un des ions vont résuire l’extrimité 3’OH en 3’O-
3- L’autre ion va stabiliser les phosphate beta et gamma
Quelle est l’activité qui se produit à l’intérieur de la paume de la main de l’ADN ?
La polymérisation
Qu’est-ce qui est impliqué dans les mésappariements de la polymérisation et quel est son mécanisme d’action ?
L’exonucléase.
1 Le brin mesapparié ralentie la catalyse et diminue l’affinité de la polymérase pour la jonction amorce:matrice et sort du site actif.
2- L’amorce va alors se lier a l’exonucléase.
3- L’ADN mesapparié est enlevé.
Quelle est l’activité qui se produit à l’intérieur des doigts de la main de l’ADN ?
Lors d’un réappariement correct, les doigts se referment sur le dNTP.
Quels sont les effets de la fermeture des doigts sur les dNTP (2) ?
1 – Le rapprochement du nucléotide aux ions métalliques
2 L’augmentation de la vitesse de catalyse
Qu’est-ce qui empêche le dNTP de se réapparier avec une 2ᵉ base et comment ?
Les doigts vont faire une rotation de 90° entre la première et la deuxième base de la matrice : la courbure de la matrice.
Quelle est l’activité qui se produit à l’intérieur du pouce de la main de l’ADN (2) ?
– Le pouce maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale.
– et permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat.
Donner un résumer des étapes du fonctionnement de la polymérase (main de l’ADN) (5).
1 – Le dNTP entre dans la main et s’apparie à la première base disponible de la matrice.
2- Un bon appariement va provoquer une fermeture des doits autours du dNTP sapparié.
3- La fermeture des doigts va placer les ions métallique en position qui permet de catalyser la formation de la nouvelle lisaion phosphodiester.
4- L’attachement du nucléotide (du DNTP) a l’amorce provoque l’ouverture des doigts et permet la jonction amorce:matrice d’avancer d’une paire de base.
5- L’ADN polymérase esr prête pour un nouveau cycle d’ajout de nucléotide sur l’amorce.
Si nous avons un fragment d’ADN (le brin mère), quelles sont les trois autres choses dont nous avons besoin pour le répliquer ?
1 – dNTP
2-ADN polymérase
3. Amorce
L’ADN polymérase est ____________, pourquoi ?
Processive, parce qu’elle peut ajouter plusieurs nucléotides consécutivement sans se détacher de l’ADN matrice (son substrat).
Quelle est l’étape limitante de la polymérisation ?
La liaison de la polymérase à sa jonction amorce:matrice.
