מבנה ואריזת הגנום (מולקולרית א) Flashcards

1
Q

איזה זוג כרומוזימים אינם הומולוגים לחלוטין באאוקריוטים?

A

כרומוזומי המין בזכרים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

על מה מבוססת צביעת קריוטיפ מסוג

spectral karyotip?

A

DNA hybridization

העושה שימוש בפרובים פלורוסנטים לשם סימון כל כרומוזום בצבע שונה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

על מה מבוססת צביעת קריוטיפ מסוג

traditional karyotip?

A

על צביעת גימזה החופשת דפוס שונה של פסים עבור כל כרומוזום המתקבל לפי מבנה הכרומטין שלהם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

באילו מוטציות ניתן להבחין באמצעות שיטות ציטוטוקסיות?

A

שינויים כרומוזומלים גדולים, למשל- טראנסלוקציות, מחיקות, הוספות…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

בגנום האנושי, כמה גנים מקודדים לחלבון?

A

כ-21,000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

בגנום האנושי, כמה גנים אינם מקודדים לחלבון

(RNA genes)?

A

כ-9,000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה האורך הממוצע של אקסון בגנום האנושי?

A

145

זוגות בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

כמה אקסונים בממוצע מכיל גן בגנום האנושי?

A

10.4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מהו האורך הממוצע של גן בגנום האנושי?

A

27,000

זוגות בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מהו אורכו הממוצע של חלבון אנושי?

A

430

חומצות אמינו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מההם פסאודוגנים?

A

דופליקציות של גנים אשר הכפילו את עצמם ללא אזורי הבקרה ולכן אינם מתבטאים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כמו זוגות בסיסים יש במולקולת דנ”א יחידה של הגנום האנושי?

A

3.2

מיליארד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה מולקולת דנ”א צריכה להכיל ע”מ לצליח לעבור שכפול?

3

A
  1. מוצא שכפול
  2. צנטרומר
  3. שני טלומרים
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

אילו היסטוני ליבה מרכיבים את הנוקלאוזום?

A
  • 2 H2a
  • 2 H2b
  • 2 H3
  • 2 H4
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כמה זוגות בסיסים של דנ”א מתלפפים סביב היסטוני הליבה בנוקלאוזום?

A

147

זוגות בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כמה זוגות בסיסים מכילים אזורי ה
DNA linker
המחברים בין הנוקלאוזומים?

A

50
זוגות בסיסים בממוצע
(מספורים ועד 80)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

כמה זוגות בסיסים בממוצע מכיל כל נוקלאוזום?

A

200

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

כמה סיבובים יוצרים 147 זוגות הבסיסים המתלפפים על הליבה ההיסטונים בנוקלאוזום?

A

1.7

סיבובים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

היסטונים מורכבים מ______ חומצות אמינו

A

102-135

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מהו מוטיב ההיסטון?

A

הליקס-לופ-הליקס

שלושה הליקסים עם שני לופים ביניהם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

כיצד מתבצע הרכבת הנוקלאוזום?

3

A
- יצירת דימר
H3-H4
- יצירת די-דימר של
H3-H4 X2
שמתחיל ללפף על עצמו את הדנ"א
- די-דימר של
H2a-H2b
מצטרף
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מהוה מטען החיובי הכללי על ההיסטונים?

A

חיובי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

כיצד מכונה האינטראקציה המתרחשת בין הדימרים של היסטוני הליבה?

A

אינטראקציית לחיצת יד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

עם איזה
groove
בדנ”א, היסטוני הליבה מקיימים אינטראקציה?

A

minor groove

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

אלו די-נוקלאוטידים יעדיפו להימצא בחלק שפונה אל חלבוני הליבה ההיסטונית?
(3)

A
  • AA
  • TT
  • TA
26
Q

מה תפקיד הקומפלקס

CRC?

A

chromatin remodeling complex.
קומפלקס המשתמש ב
ATP
למטרת הזזת נוקלאוזומים בזמן שעתוק והכפלה

27
Q

בממוצע, כל נוקלאוזום מוחלף פעם בשעתיים. מי אחראים על ההחלפה?

2

A
  • חלק מה
    CRC
  • histone chaperons
28
Q

ההתארגנות של הנוקלאוזומים אחד על השני (זיג-זג) ליצירת סיב 30 ננומטר מתאפשרת בזכות-
(2)

A
  • זנבות ההיסטונים, בעיקר של
    H4
  • ההיסטון
    H1
29
Q

מהו היחס בין היסטון
H1
לבין ליבת הנוקלאוזום?

A

1:1

30
Q

כיצד היסטון
H1
משפיע על התארגנות סיב ה30 ננומטר?

A

מקיים אינטראקציה עם הנוקלאוזום (עם חלבוני הליבה ועם הדנ”א) ומשנה את כיוון הליפוף של הדנ”א לאחר יציאתו מהנוקלאוזום

31
Q

איזה היסטון הוא הכי פחות שמור מבחינה אבולוציונית?

A

H1

32
Q

מהי היחידה הקטנה הבונה את הכרומטין?

A

הנוקלאוזום

33
Q

הסבר/י את המושג

position effect

A

התפשטות אזור הטרוכרמטי לאזור אאוכרומטי

34
Q

הסבר/י את המושג

position effect varigation

A

הורשת ה
position effect
לכל אחד מתאי הבת בשושלת התאית

35
Q

אילו סוג רצפים מונעים את התפשטות ההטרוכרומטין כחלק מה

position effect?

A

barier sequence

36
Q

מה קורה כאשר הגן
white
בדרוזופילה עובר אינוורסיה נדירה הגורמת לו להימצא ליד אזור הטרוכרומטי?

A

הוא עובר השתקה ומתקבלות עיניים אדומות עם כתמים לבנים

37
Q

אילו מודיפיקציות שיירי ליזין יכולים לקבל?

A

אצטילציה, מונו/בי/טרי-מתילציה, הוספת ביוטין, יוביקוויטינציה והוספת מולקולת סומיל

38
Q

איזו מודיפיקציה שיירי סרין יכולים לקבל?

A

פוספורילציה

39
Q

מיהם הוריאנטים של היסטון

H4?

A

אין לו

40
Q

באיזה שלב של מחזור התא מסונתזים היסטוני הליבה?

A

S

41
Q

באיזה שלב של מחזור התא מסונתזים ההיסטונים הוריאנטים?

A

לכל אורך האינטרפאזה

42
Q

אילו משפחות אנזימים אחראיות על התפשטות הקוד ההיסטוני על נוקלאוזומים סמוכים?
(2)

A
  • readers

- writers

43
Q

למה גורם הקומפלקס
HP1
לאחר גיוסו?

A

התפשטות ההטרוכרומטין לנוקלאוזומים סמוכים

44
Q

איזו מודיפיקציה
HP1
מזהה?
(שילוב של 2)

A
  • trimethyl K9H3

- trimethyl K20H4

45
Q

למה גורמת שילוב המודיפיקציות

trimethyl K4H3 + acetyl K9H3?

A

ביטוי גנים

46
Q

למה גורמת המודיפיקציה

trimethyl K27H3?

A

גיוס קומפלקס
polycomb
והשתקת גנים

47
Q

מהו רצף

HS4?

A

barrier sequence

המפריד בין הגן לבטא-גלובין לבין איזור הטרוכרמטי

48
Q

כיצד רצפים חוסמים מגייסים חלבונים חוסמים?

שלושה מנגנונים

A
  1. מחסום פיזי- נקשרים לרצף ולקומפלקס חלבוני גדול ומונעים מעבר
  2. היקשרות לנוקלאוזומים והגנה עליהם מפני מודיפיקציות חדשות
  3. מגייסים חלבונים העושים מודיפיקציות המתנגדות למודיפיקציות של הטרוכרומטין
49
Q

מהו

CENP-A?

A

וריאנט של ההיסטון
H3
המצוי בצנטרומרים ועוזר ביצירת הקינטכור במיטוזה

50
Q

מהם

alpha satellite?

A

רצף קצר החוזר על עצמו מספר רב של פעמים שלעיתים מצוי בצנטרומרים אנושיים ולעיתים לא
(לא מחייב)

51
Q

מהם ניאו-צנטרומרים?

A

צנטרומרים חדשים שנוצרו לאורך האבולוציה כתוצאה משבירת כרומוזומים ואינם יושבים על רצפי
Alpha-sattelites

52
Q

כיצד מתרחשת הורשת מיקום הצנטרומר או הטרוכרומטין אל הכרומטידה האחות בזמן השכפול, בבני אדם?

A

(אפיגנטיקה).
חלק מחלבוני הליבה ההיסטונים מועברים לכרומטידה האחות, שיגייסו קומפלקסים שיגרמו להתפשטות המודיפיקציות על ההיסטונים החדשים שהצטרפו.

53
Q

כרומוזום
lampbrush
וכרומוזום פוליטין ניתנים לראיה במיקרוסקופ אור. מה מקורם?

A
  • lampbrush-
    ביצית של דו חיים (גם בכרומוזמים אנושיים באינטרפאזה)
  • פוליטין-
    תאי רוק של לארוות הדרוזופילה.
54
Q

אל גנים ניתן למצוא על הלולאות הבולטות החוצה מה

lampbrush chromosome?

A

גנים פעילים המקודדים למולקולות

RNA.

55
Q

מי יוצר את הפיגום החלבוני של הכרומוזומים במיטוזה?

2

A
  • קונדנסין

- טופואיזומראז 2

56
Q

הבנדים של כרומוזום פוליטין מכילים גנים ________, והאינטרבנדים מכילים גנים ________.י

A
  • מתבטאים (95% מהחומר הגנטי)

- לא מתבטאים (5% מהחומר הגנטי)

57
Q

כיצד קרוי הצנטרומר של כרומוזום הפוליטין?

A

chromocenter

58
Q

היכן בגרעין מצוי הטרוכרומטין?

A

בסמוך ללמינה הגרעינית

59
Q

היכן בגרעין מצוי אאוכרומטין שעובר ביטוי?

A

במרכז, עם דרך פנויה ל

NPC

60
Q

הגרעינן, גופיפי קחאל וגרנולות אינטרכרומטיניות הם דוגמאות ל-

A

אזורים ממודרים בגרעין המכילים ריכוזים גבוהים של רנ”א וחלבון ספציפיים, המשמשים לצרכים שונים

61
Q

מה רוחב מולקולת דנ”א בכרומוזום המיטוטי?

A

700

ננומטר

62
Q

מדוע יש צורך ברמת דחיסה גבוהה כ”כ של הכרומוזום בזמן המיטוזה?

2

A
  1. קל יותר לבצע הפרדה כך

2. הגנה על הדנ”א בהיעדר הגרעין