בקרות שלאחר שעתוק (מולקולרית ד)

Question 1

מהו מנגנון האטניואציה?

RNA editting

Answer 1

מבנים שניוניים הנוצרים במרנ”א גורמים לטרמינציית שעתוק מוקדמת. חלבוני בקרה מסוימים נקשרים אליהם וגורמים למניעת אטניואציה ולהמשך שעתוק.

Question 2

מהו מנגנון האטניואציה של ווירוס ה

HIV?

Answer 2

נוצר מבנה של גבעול ולולאה במרנ”א של הווירוס. בתנאי סביבה טובים החלבון
TAT
נוצר ונקשר לרצף
TAR
באותו מבנה שניוני שגורם לטרמינציה. הוא מגייס חלבונים המאפשרים את המשך הסינתזה ע”י הפולימראז.

Question 3

מהו מנגנון ה
riboswitch?
(RNA editting)

Answer 3

מבנה שניוני הנוצר בד”כ ב
5’UTR
שמשועתק ראשון וגורם לטרמינציית שעתוק כאשר מולקולה קטנה רלוונטית קשורה

Question 4

באילו אורגניזמים יש שימוש נרחב במנגנון הריבוסוויצ’ים?

Answer 4

בעיקר בחיידקים

Question 5

היכן הריבוסוויצ’ים ימצאו במולקולת המרנ”א המשועתקת?

Answer 5

בד”כ ב

5’UTR

Question 6

איזו דוגמא למנגנון הריבוסוויצ’ים מביא הספר?

Answer 6

גאוונין שנקשר לריבוסוויץ’ המבקר יצירת גנים הקשורים לסינתזת פורינים. כאשר גאוונין נקשר אליו מתקיימת טרמינציית שעתוק מוקדמת .
(בחיידקים)

Question 7

כיצד נקבע דגם השחבור החליפי בסוגי התאים השונים?

Answer 7

ע”י קומבינציה של פקטורי מעודדים שחבור ופקטורים מעכבי שבור

Question 8

הגן
Dscam
של דרוזופילה מהווה דוגמה ל-

Answer 8

לשחבור חליפי

נון מוצא לכ-38 אלף חלבונים שונים

Question 9

בקרה על אתר הביקוע של הרנ”א יכולה להוות דרך ל
RNA editting.
כיצד מנגנון זה בא לידי ביטוי ביצירת נוגדנים?

Answer 9

לנוגדן שני אתרי פולאדנילציה על המרנ”א- אחד מוקדם חלש ואחד מאוחר חזק.
- תאי
B
לפני סטימולציה ע”י אנטיגן משעתקים את הנוגדן תוך דילוג על האתר המוקדם החלש.
- תאי
B
לאחר סטימולציה מגבירים את ביטוי הפקטור
CstF
כך שהאתר המוקדם החלש מזוהה ע”י והביקוע מתבצע בו לקבלת נוגדן מופרש קצר יותר ללא החלק הטראנסממברנאלי

Question 10

מה תפקיד האנזים

ADAR?

Answer 10

adenosine deaminase acting on RNA.
מזהים מבנים דו-גדילים הנוצרים בשל זיווגי בסיסים של הרנ”א עם עצמו, ועושים דה-אמינציה לאדנוזינים המצויים בהם לקבלת אינוזין במקום

Question 11

על אילו רצפים
ADAR
יכול לעבוד במרנ”א?

Answer 11

גם באינטרונים וגם באקסונים (פחות שכיח)

Question 12

דומגא לעריכת רנ”א ע”י האנזים
ADAR
היא עריכה של מרנ”א המקודד לתעלת סידן של מערכת העצבי. למה גורמת העריכה?

Answer 12

• גורמת להפיכת הח”א אספרגין לארגנין (מבוצעת בתוך אקסון)

- ברמה התפקודית גורמת לשינוי הפרמביליות של התעלה לסידן (עריכה חיונית להתפתחות תקינה של המוח)

Question 13

מה עושה משפחת האנזימים

CDAR?

Answer 13

דה אמינציה של ציטוזין לאורציל

Question 14

דוגמא לעריכת רנ"א ע"י האנזים
CDAR
מתרחשת בגן ל
ApoB.
כיצד מבצעת העריכה?

Answer 14

- במעי: האנזים פעיל והופך קודון
CAA
(גלוטמין)
ל
UAA
(קודוןן סיום)
מה שגורם לטרמינציית שעתוק וקדמת לקבלת
ApoB48
של כילומיקרונים
- בכבד: האנזים אינו קיים והפולימראז משעתק את כל הגן לקבלת
ApoB100
של
LDL, VLDL

Question 15

הוצאת מולקולות רנ”א מהגרעין מאוד מבוקרת באאוקריוטים. כיצד ווירוס
HIV
מצליח לעקוף בקרה זו בשלבי הדבקה מאוחרים?

Answer 15

הווירוס מקודד לחלבון
Rev
שמעל לריכוז קריטי מסוים (=שלב הדבקה מאוחר), נקשר לרצף
RRE
ומגייס את האקספורטין
Crm1
המכריח הוצאה של הגנום הויראלי השלם (עם האינטרונים) מהגרעין ליצירת קפסידים שישמשו להדבקה

Question 16

אילו מנגנונים קיימים ללוקליזציה של מרנ”א לאזור מסוים בתא?

4

Answer 16

1. שינוע המרנ” בעזרת מיקרוטובולי
2. דיפוזיה רנדומלית של במרנ”א לאזורים עם חלבונים הכולאים אותו באזור זה
3. דגרדציה של כל המרנ”א המסוים בתא למעט באזר ייעודי (אינטראקציה עם חלבונים באזר זה מונע דגרדציה)
4. חסימת תרגום המרנ”א באזור שאינו ייעודי עבורו

Question 17

היכן בד”כ ימצא הסיגנאל שיכווין מרנ”א לאזור תאי מסוים?

לוקליזציה של מרנ”א

Answer 17

3’UTR

Question 18

כיצד פרוקריוטים מבקרים את יעילות התרגום?

4

Answer 18

1. חלבון בקרה חוסם את רצף שיין דלגרנו
2. רצף שיין דלגרנו מצוי כחלק מ
   stem& loop
   שרק בטמפרטורות גבוהות נפתח ומתאפשר תרגום
3. כמו ריבוסוויץ’ של תרגום- כשמולקולה קטנה נקשרת רצף שיין דלגרנו נכנס למבנה השניוני ונמנע תרגום
4. RNA interfirence
   כנגד רצף שיין דלגרנו

Question 19

מהו רצף שיין דלגרנו?

Answer 19

רצף חיידקי עשיר בפורינים המצוי ב
5'UTR
ומסמן את ה
AUG
הראשון של תרגום. הוא יוצר זיווג בסיסים עם ה
16SrRNA
של הריבוזום

Question 20

מה תפקידו של פקטור האניציאיה

eIF2B?

Answer 20

משמש כ
GEF
של
eIF2

Question 21

מה קורה כאשר
eIF2
מזורחן?

Answer 21

נוצרת אינטראקציה חזקה מידי בינו לבין
eIF2B
כך שהשחלוף אינו יוצא לפועל
(סקווסטרינג)
- התוצאה היא עיכוב תרגום כללי בתא

Question 22

מהו

IRES?

Answer 22

internal ribosome emtery site.
אלו הם רצפים המכילים מאות נוקלאוטידים המתארגנים למבנים שניוניים היודעים לגייס פקטורי אניציאציה ללא תלות ב
5'cap
וב
eIF4E

Question 23

כיצד ווירוסים עושים שימוש במערכת ה
IRES
האאוקריוטית?
(2)

Answer 23

- הם מבקעים את 
eIF4G
ומונעים תרגום כמעט מוחלט של התא שנדבק
- מכילים 
IRES
וכך מגייסים את מערכת התרגום התאית לטובתם

Question 24

פוליאדנילאז מסיר את האדנוזינים של זנב הפולי
A
מקצה 3 ל5. מה קורה כאשר מגיעין לאורך של 25 אדנוזינים?
(2)

Answer 24

1. פירוק במרנ”א ממשיך בכיווניות 3 ל5
2. טבעת המרנ”א נפתחת בפירוק המרנ”א מתרחש בכיוון 5 ל3.

(*שניהם יכולים להתרחש במקביל)

Question 25

מהם
P-bodies
ומה תפקידם?

Answer 25

אזור בציטוזול בעל ריכוז גבוה של חלבונים שתפקידם לאחסן ולפרק מולקולות רנ”א.

Question 26

מהם
stress granules
ומה תפקידם?

Answer 26

אזור בציטוזול בעל ריכוז גבוה של פקטורי אניציאציה, תת יחידות קטנות של הריבוזום וחלבונים קושרי פולי
A.
כל אלו מכינים מרנ"א שחמקו מה
P-bodies
לתחילת תרגום בעת מתן סיגנל מתאים.