Basgruppsfall 7 - Johannes Elofsson Flashcards
Vad innebär apoptos?
Apoptos är cellens sätt att säkert begå självmord, utan att spy ut sitt innehåll över kringliggande celler. Den döende cellen utvecklar blebs på sitt cellmembran, för att sedan krympa. Cytoskelettet kollapsar och DNA bryts ner till fragment. Cellens yta ändras, och fagocytotiska celler (makrofager) kan plocka upp resterna..
Vad skiljer apoptos från nekros?
Vid apoptos så sker celldöden programmerad, medan nekros sker till följd av någon slags extern faktor eller sjukdom. Vid apoptos så “blebbar” cellen, cellen minskar i storlek, kärnan upplöses och apoptotiska kroppar bildas. Makrofager, genom fagocytos, tar upp de apoptotiska kropparna. Vid nekros så sväller cellen tills den sprickar, och spyr då ut sitt innehåll och inflammerar närliggande vävnad.
Det finns två typer av vägar som apoptos kan ske genom, vilka?
Apoptos kan ske till följd av både interna och externa signaler.
Beskriv den mitokondriella apoptosvägen.
Vid den mitokondriella apoptosvägen så har cellen utsatts för någon typ av stress, till exempel en otillräcklig mängd på survival factors. Detta aktiverar BH3-only proteiner, vilket leder till att Bak och Bax aktiverar samt att antiapoptotiska medlemmar i Bcl2-familjen hämmas.
Bak och Bax gör så att cytokrom C släpps ut ur mitokondrien. Cytokrom C binder i sin tur till Apaf-1 (apoptotic protease activating factor), vilket bildar en sjuarmad apoptosom. Detta binder in och aktiverar procaspas-9 (initiationscaspas).
Caspas-9 klyver i sin tur procaspas-3, vilket gör så att caspas-3 (executionscaspas) blir aktivt.
Detta möjliggör för en caspaskaspad, och apoptos kan ske.
Beskriv den extracellulära apoptosvägen.
Genom att ett protein (Fas ligand) binder till en death receptor (Fas) så bildas ett death-inducing signaling complex (DISC). Detta leder i sin tur till aktiveringen av procaspas-8 (initiationscaspas), och därefter sker klyvning av procaspas-3 (executionscaspas).
Det ska även nämnas att caspas-8 kan aktivera Bid, vilket ger upphov till tBid vilket hämmar antiapoptotiska protein på mitokondrien. Detta innebär att apoptosen kan amplifieras även på detta sätt.
Vilket är de två vanligaste sätten för att DNA-skador uppkommer? Beskriv dem kortfattat.
Depurination innebär att en purin kvävebas (adenin & guanin) faller ifrån DNA.
Deamination innebär att en aminogrupp byts ut mot en syregrupp i en kvävebas. Detta leder till att cytosin omvandlas till uracil, en kvävebas som annars inte hade existerat i DNA (deamination kan ske på andra kvävebaser också).
Hur kan ultraviolett strålning leda till DNA-skador?
Det kan orsaka “dimers”, vilket innebär att två tyminbaser i DNA-sekvensen blir kovalent bundna till varandra.
Hur sker den grundläggande DNA-reparationen?
Steg 1: En sträng av DNA är skadat, något som identifieras av en rad olika mekanismer, däribland nukleas (enzym) och som även klyver bort det skadade DNA-segmentet.
Steg 2: DNA polymerase binder till 3’ änden av den trasiga DNA-strängen. Detta bygger på samma sätt som DNA-polymeras, det vill säga i 5’-to-3’-riktningen.
Steg 3: DNA-ligas fyller gapet i sockerfosfatryggraden.
Hur sker base excision repair?
Det sker genom att ett enzym lokaliserar den felaktiga basen. Den felaktiga basen klipps därmed bort och transporteras bort. DNA-polymeras gör ersättningen, och DNA-ligas fogar samman.
Det finns två olika metoder för att reparera double-strand breaks, vilka är det? Beskriv dem kortfattat.
Det kan ske genom både homolog rekombination samt icke-homolog sammanfogning.
Icke-homolog sammanfogning innebär i princip att nukleas (enzym) tuggar tillbaka strängarna (typ för att de ska bli jämnlånga och passa), och DNA-ligas sedan syr ihop dem. Snabbt och smidigt, men tyvärr så saknas ju lite DNA-sekvens.
Homolog rekombination sker oftast efter att en cell replikerat sitt DNA, men ej hunnit dela på sig, eftersom det krävs en homolog DNA-molekyl som mall. Enzymer tuggar ned strängarna på den trasiga DNA-molekylen, medan enzymer gör så att en trasig sträng kan “invadera” en homolog DNA-molekyl och söka efter en matchande sekvens. Efter det så kan DNA-polymeras elongera den trasiga strängen tills den har passerat sprickan, och då kan den återgå till sin partner.
Beskriv homolog rekombination.
Homolog rekombination sker oftast efter att en cell replikerat sitt DNA, men ej hunnit dela på sig, eftersom det krävs en homolog DNA-molekyl som mall. Enzymer tuggar ned strängarna på den trasiga DNA-molekylen, medan enzymer gör så att en trasig sträng kan “invadera” en homolog DNA-molekyl och söka efter en matchande sekvens. Efter det så kan DNA-polymeras elongera den trasiga strängen tills den har passerat sprickan, och då kan den återgå till sin partner.
Beskriv icke-homolog sammanfogning.
Icke-homolog sammanfogning innebär i princip att nukleas (enzym) tuggar tillbaka strängarna (typ för att de ska bli jämnlånga och passa), och DNA-ligas sedan syr ihop dem. Snabbt och smidigt, men tyvärr så saknas ju lite DNA-sekvens.
Vad är p53?
p53 är en central transkriptionsfaktor som reglerar flera tumörsuppressor-mekanismer såsom cellcykelarrest, DNA-reparation och celldöd.
