Genregulation auf Translationsebene Flashcards
1
Q
Was ist ein uORF?
A
=upstream open reading frame
- eukaryotische Translationsregulation, die die Initiation beeinflusst
- 35% Prozent aller Gene haben uORFs
- reduzieren in meisten Fällen die Translation des Haupt- ORFs
2
Q
Was sind wichtige Faktoren für den reprimierenden Einfluss von uORFs auf den ORF?
A
- Entfernung zur Cap
- Nähe zur MCS(main protein coding sequence)
- Länge des uORFs
- Anzahl der uORFs
- Konservierung des uORFs
- Kozak-Kontext
3
Q
Was ist NMD?
A
- Nonsense mediated decay of RNA
- Abbau von RNA, die Nonsense-Mutation tragen-> vorzeitiger Translationsstopp
- verhindert so, dass schädliche Proteine gebildet werden
4
Q
Wie wird NMD signalisiert?
A
- Ribosomen bleiben stromauf von einem EJC stecken
- > EJC wird nicht entfernt-> von Terminationsfaktoren erkannt-> decapping und Abbau Exonukleasen
- und fehlender 3´-UTR der korrekte Translationstermination ermöglicht
5
Q
Wo sind die Komponenten von NMD lokalisiert?
A
- in P-Bodies
- Aggregate von nicht-translatierten RNAs
- Komponenten der RNA-Abbau-maschinerie(Decapping,Deadenylierung,Exoribunuklease,NMD)
6
Q
Wie wird RNA i.d.R. abgebaut?
A
1.Deadenylase entfernt Poly-A-Schwanz
2.Entweder 3´->5´-Abbau durch Exosom(Exonuklease)
oder decapping durch decapping complex und 5´->3´ Abbau durch Exonukleasen
7
Q
Wie können Proteine abgebaut werden?
A
Ubiquitinierung
- Ubiquitin-ligasen erkken abzubauende Proteine
- Anhängen von Ubiquitin an Lysin
- Proteasom schneidet ubiquitinierte Peptide
