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BIOLOGÍA > Traducción, Control de la traducción, Código Genético > Flashcards

Traducción, Control de la traducción, Código Genético Flashcards

1
Q

Que es el Código Genético

A

Conjunto de relaciones que permiten TRADUCIR la info. genética del idioma de los nucleótidos al de los aa

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2
Q

Cuál es la unidad Funcional del Código genético

A

CODÓN : asociación de 3 NU que codifica la incorporación de 1 aa a la estructura 1° de una proteína

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Q

Quién descifró el código genético

A

Marshall Niremberg

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4
Q

Que fue lo primero que descubrió Marshall Niremberg

A

El codón UUU que provoca que los ribosomas INCORPOREN ala Phe ( relación 3:1)

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Q

Características del código genético

A
  • Es universal : es el MISMO para todo ser vivo
  • Degenerado
  • No superpuesto
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6
Q

A que se refiere que el código es degenerado

A

Como hay 4 bases ( UCAG) y se deben combinar de a 3 (codón), obtenemos 64 combinaciones/codones pero no tenemos 64 aa, sino solo 20 aa.
Se llegó a la conclusión de que algunos codones codifican al mismo aa y reciben el nombre de codones SINÓNIMOS.
El reparto de codones no es equitativo

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7
Q

¿Que aa son codificados por 6 codones cada uno? (LOS MÁS DEGENERADOS)

A

SER, ARG , LEU

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8
Q

¿Que aa son codificados por 4 codones cada uno?

A

PRO, THR, ALA, VAL, GLY

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9
Q

¿Que aa son codificados por 3 codones?

A

ILE

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10
Q

¿Que aa son codificados sólo por 1 codón? (LOS MENOS DEGENERADOS?

A
  • TRP ————–> UGG

- MET————–> AUG

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11
Q

Cual es el codón de inicio del mRNA ( para empezar la traducción)

A

EL PRIMER —— AUG——–

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12
Q

Cuáles son los codones de terminación (finalizar la transcripción)

A

UAA , UAG, UGA

no codifican aa

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13
Q

Que son los codones SIN SENTIDO

A

Los codones de terminación: UAA, UAG, UGA

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14
Q

Por cuántos codones es codificada la Phe

A

2 codones

UUU y UUC

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15
Q

Código mitocondrial (rRNA5s)

A

Difieren en 4 Codones
- Met : AUG y AUA

  • TRP: UGG y UGA
  • Terminación: UAA, UAG, AGA y AGG
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16
Q

Codón de inicio de las bacterias

A

En algunas, el primer AUG

En otras, el primer GUG y codifica el aa: N-Formil-met
exclusivo de bacterias
los otros GUG codifican Val

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17
Q

Que es N-Formil Met

A

un aa presente solo en bacterias ( el primer GUG lo codifica) que es tb codón de inicio

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18
Q

Que son los aa raros

A

Son aa codificados por algunos codones de FINALIZACION, por eso es raro.

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19
Q

Cuales son los aa raros

A
  • Selenocisteína (Sec) aa n°21 ( en una docena de prot. de mamíferos)
  • Pirrolisina (Pyl) aa n°22 ( en arqueas)
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20
Q

Que codón le codifica a la Sec n°21

A

UGA

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21
Q

Que codón le codifica a la Pyl n°22

A

UAG

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22
Q

AUG

A
  • 1° codón de inicio

- los otros : MET

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23
Q

GUG

A
  • Codón de inicio de bacterias

- Codifica la N-formil met

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24
Q

UGG

A
  • TRP
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25
Q

UAA

A

Terminación normal y de mitocondrias

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26
Q

AGA

A

Terminación de de mitocondrias

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27
Q

UGA

A

Terminación

a veces Sec

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28
Q

AGG

A

Terminación de mitocondrias

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29
Q

UAG

A

Terminacion normal y mitocondrial

A veces PYL

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30
Q

Que quiere decir que el código es no superpuesto

A

Que están uno al lado del otro sin superponerse

ACC UGG UCC AAG CCG y asi

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31
Q

En qué parte del mRNA están los codones

A

En la región traducible ( que empieza con AUG y termina con UAA) por ej

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32
Q

Que pasa si ocurre una mutación sobre el mRNA

A

Si la mutación no se corrige, el mRNA tendrá un nu errado y los efectos dependerán del tipo de mutación que haya ocurrido

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33
Q

Cuales son los tipos de mutación

A
  • Mutación silenciosa/ sin cambio de sentido
  • Mutación con cambio de sentido/ no sinónimo
  • Mutación sin sentido
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34
Q

Como es la mutación silenciosa o sinónima

A

Es cuando se cambia el nu de un codón, por su sinónimo, por lo tanto no tiene efecto,
Ej: UUU —-> UUC
ambos codifican Phe

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35
Q

Como es la mutación con cambio de sentido o no sinónima

A

-Se reemplazó el codón de un aa por el de otro aa
- Pueden ser favorables o desfavorables
Ej: ANEMIA DREPANOCÍTICA:

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36
Q

Que clase de mutación es la de la Anemia Drepanocítica

A

— MUTACIÓN CON CAMBIO DE SENTIDO / NO SINONIMA—-

Cambia el codón de GLU x VAL

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37
Q

La mutación más peligrosa

A

Ocurre en el primer nu del codon

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38
Q

La mutación no tan peligrosa

A

del segundo nucleotido

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39
Q

La mutación menos peligrosa

A

del tercer nucleotido

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40
Q

Que es la mutación sin sentido

A

Se reemplaza el codón de un aa ———-> por el codón de terminación.

Terminación prematura, si o si genera un problema

Ej: UGG (trp) ———-> UGA(terminación)

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41
Q

Que son las mutaciones de adición/pérdida

A

Son muy peligrosas, porque se agrega o se pierde 1 nu y va corriendo los codones, cambiando absolutamente todo

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42
Q

Cuáles son los requerimientos para la traducción

Que se necesita para empezar a sintetizar proteínas

A
  1. El mRNA sea exportado al citoplasma
  2. Las sub. proteicas sean exportadas al citoplasma y se deben asociar al mRNA
  3. Los tRNA exportados al citoplasma y se unan a aa
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43
Q

Como se exporta el mRNA al citoplasma

A

Atraviesan el NPC asociadas a proteínas (forma una RNP)
* Al casquete del 5’ se une la prot. CBC.

  • A la cola Poli-A se unen prot. PABP
  • A los exones se unen las prot. EJC
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44
Q

Cuantas subunidades tiene el ribosoma 80 s

A

2
- Subunidad mayor 60s
- Subunidad menor 40s
ambos se unen por la mRNA

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45
Q

Estructura de la 60s

A
  • Tiene un túnel de salida del polipéptido
  • Una cámara interior EPA
    ( E exit P sitio peptidal A sitio aminoacil)
    Cada uno de estos sitios contacta con un codón del mRNA
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46
Q

Estructura de la 60s

A
  • Tiene un túnel de salida del polipéptido
  • Una cámara interior EPA
    ( E exit P sitio peptidil A sitio aminoacil)
    Cada uno de estos sitios contacta con un codón del mRNA.
  • En el sitio A tiene un sitio activo del peptidil transferasa ( responsable de unir aa por enlaces peptídicos)
    que esta formado por el rRNA 28s, por lo que el ribosoma es una RIBOZIMA
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47
Q

Estructura de la 40 s

A

Tiene un sitio activo Helicasa ( elimina los plegamientos indeseables en el mRNA)

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48
Q

Que hay en el UTR 5’ de un mRNA BACTERIANO

A

AGGAGG

—– secuencia de shine-Dalgarno——–

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49
Q

El mRNA bacteriano tiene señales de poli-adenilación y casquete 7mG. V o F

A

FALSO

únicamente el mRNA eucariota tiene los extremos 5 y 3’ con el casquete y la poli-A

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50
Q

Que hay en el UTR 3’ del mRNA EUCARIOTA

A
  • secuencia AUUUA (vida corta media) o CCUCC ( vida media larga)
  • secuencia UUUUAU ( elementos de poliadenilación citoplasmáticas de ciertos mRNA)
  • secuencia señal de poliadenilación AAUAAA ( en todo mRNA)
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51
Q

Hipótesis del Bamboleo

A

1° nu del ANTICODÓN bambolea y se adapta al 3° nu del CODÓN

esto permite que 1 tRNA reconozca en general 2 o 3 codones.
- El C NO BAMBOLEA , se une con G

52
Q

Como bambolean las dif. bases

A

G———–> C o U
U———–> A o G
I————>U , C, A

53
Q

Ser Arg Leu

A

6 codones

54
Q

Pro Thr Ala Val Gly

A

4 codones

55
Q

Ile

A

3 codones

56
Q

tRNA

Cual es el extremo aceptor de aa

A

3’ ACC

se unen los aa por enlaces ESTER

57
Q

en el tallo T hay..

A

T : Ribotimidina
Y: seudouridina
c: citidina

58
Q

En el tallo D hay

A

Dihidrouridinas

59
Q

en el tallo del anticodon encontramos

A

Y=R

pyrimidinas y purinas juntas raras

60
Q

Que hace la aminoacil tRNA sintetasa

A

une al tRNA con su aa ( enlaces ester) en su extremo 3’

61
Q

Cuantas isoformas el aminoacil tRNA sintetasa existen

A

20 ( 1 dif por cada aa)

62
Q

Cuantas tRNA hay en el citoplasma de una celula ANIMAl

A

32 tipos

63
Q

Para que secuencia NO HAY tRNA

A

codones de terminación

64
Q

A cuantos codones se puede unir 1 anticodón

A

2 CODONES

1 ANTICODON ———–> 2 CODONES

65
Q

Por que 1 anticodon se puede unir a 2 codones

A

Por la hipotesis del bamboleo

66
Q

Que es el bamboleo

A

El 1° nu del anticodon (que esta hacia 5’) se adapta y se une a dos anticodones

G ————-> U y C
U————–> G y A
Inosina——> U C A

bamboleoooo
Guc
Uga
Iuca

67
Q

Primer paso de la traducción

A

Se deben unir primero la sub. 40s y el mRNA
los factores de iniciacion EIF1 y EIF1A unen al mrna el 40s
y la EIF3, impide que se una la 60s de forma prematura.
y la secuencia de iniciacion del mRNA (AUG) debe quedar en el sitio P

68
Q

Que se hace despues de que el 40s se haya unido al mRNA

A

Viene la EIF2 y le trae al metionil-tRNA iniciador

(tRNA con un anticodon UAC que se una a AUG) y tiene como aa a la metionina

69
Q

Que es el complejos 43 s

A

esta formado por : EIF1, EIF1A, EIF3 y EIF2

70
Q

Que ocurre luego de que llegara el Metionil tRNA iniciador por la EIF2

A 
La EIF5B (gasta 1 GTP)
y le trae a la subunidad 60s .
Obviamente sale la EIF3 , tambien sale la EIF2( que tambien gasta 1 GTP para salir) y tambien salen las EIF1 Y EIF1A porque al unirse la 60s ya no hay lugar para ellas, y el aminoacil/metionil tRNA iniciador queda dentro de la cámara interna del 60s.

Queda el sitio A vacante porque salió la EIF2

71
Q

Cuantos GTP se gastan durante la iniciación de la traducción

A

2 GTP
EIf2: 1
EIF5B: 1

72
Q

Que pasa primero en la elongación durante la traduccion

A

El ribosoma se desliza hacia 3’ (poli-A)
empieza a sintetizar al peptido naciente.

  • una eEF1A—–> trae a otra aminoacil tRNA para ocupar el sitio A
  • La peptidil transferasa ubicada en la subunidad mayor del ribosoma realiza la union mediante enlace peptidico y transfiere la met al nuevo aa en el sitio A
  • una eEF2———-> se encarga del desplazamiento del ribosoma un codon hacia 3’, quedandose el AUG en el sitio E, y volviendo a haber un sitio vacio en A
73
Q

Cuantos GTP gastan las eEF1A y la eEF2

A

1 cada una = 2GTP

74
Q

Como ocurre el desplazamiento

A

1° Avanza primero la 40s y hay un angulo de 6° entre ambas subunidades
2° el eEF2 traba su retroceso (triquete)
3° la sub 40s al dar el primer paso, esta en un sitio hibrido P/E
3° Luego avanza la 60s

75
Q

Cuantos GTP se gastan en el proceso de elongación de la traducción

A

Se gasta 2 GTP por cada aa agregado.
Aprox. 200 GTP ( 2.100)
La eEF1A al añadir más aminoacidos tRNA gasta 1, y la eEF2 gasta 1 GTP al desplazar al ribosoma

76
Q

Como queda el tercer aminoacil introducido

A

El nuevo aa usa su extremo N para unirse al peptido
se introduce siempre que la metionina (en las eucariotas) quede hacia el túnel
y que la N-formil-metionina( en bacterias) tb

77
Q

Cuantos aa hacen falta para que empiecen a salir por el tunel ( el polipéptido)

A

30 aa

78
Q

Como empieza la terminación

A

Cuando alcanza un codón de terminación, ya no se unen más aa pero se unen factores de liberación (RF)
que hacen que el peptido, y todos los componentes se disocien.

La eRF1 ——-> RECONOCE AL CODON DE TERMINACION
La eRF3——–> Usa 1 GTP para separar a todos

79
Q

Que pasa despues de que se hayan disociado todas las partes del ribosoma

A

el RRF ( Factor de reciclado ribosomico) reclutan otv a la 60s y la 40s para volver a ser utilizados para traducir el mismo mRNA

80
Q

Cuantos GTP se gastan en la terminación de la traducción

A

1 GTP

81
Q

Cuantos GTP se gastan en la TRADUCCIÓN

A

203 GTP aprox.

82
Q

Como ocurre la traducción en BACTERIAS

A

de la misma manera que los eucariotas, pero con factores homólogos.
1° se une la subunidad menor 30s con el mRNA IF1, y la IF3 impide que se una la 50s
2° la IF2 le trae a la M-formil metionina
3° La IF5 le une a la 50s

4° la EF-TU une al otro aa
5° la EF-G realiza el desplazamiento
6° la EF-Ts

7° RF1 y RF2 reconocen la sec. de terminacion
8° RRF3 separa a todos

83
Q

Donde se une la sub. menor 20s con el mRNA bacteriano

A

mediante la secuencia AGGAGG (sec. de shine-dalgarno) que está en UTR5’

84
Q

Que es la secuencia de shine- dalgarno

A

Es una secuencia que esta en el UTR 5’ del mRNA bacteriano (AGGAGG) y es alli donde se une con la 30s

85
Q

Cual es la diferencia entre RF1 y RF2

A

La RF1 y RF2 son factores de reconocimiento de la secuencia de terminacion.

RF1—————> UAA UAG
RF2————–> UAA UGA

86
Q

que secuencia de terminación reconoce la RF2

A

UAA y UGA

87
Q

El casquete y la cola PoliA se unen entre si mediante…

A

EIF4 y las PABP

88
Q

OBS traduccion

A

En realidad son muchos ribosomas que se unen al mRNA, se empiezan a unir al extremo 5’ (AUG) y sevan corriendo a medida que se agregan los demas polirribosomas, hasta que cada uno llegara a la secuencia de terminacion.
para que esten asi mas cerquita y no una linea recta, los EIF4 y las papb hacen que el casquete con la cola poliA se encuentren mas cerca

89
Q

Quien le trae a los ribosomas junto al mRNA para que puedan ser unidos por los EIF1A/EIF1/IF1

A

Los ribosomas son reclutadas por la SRP, y se adhieren a la membrana del RER por los traslocones

90
Q

Que es el deterioro por falta de codificación o NMD

A

Es un control de calidad de la traducción, donde mediante el 1° ribosoma unido al mRNA, se puede detectar si el mRNA tiene una mutación sin sentido ( codón de terminación prematuro) y se lo lleva al mRNA a destrucción

91
Q

Cuales son las funciones del 1° ribosoma que se une al mRNA

A

a- Realizar la primera traducción
b- Canjear CBC por EIF4 A,E,G para formar el asa
c- Eliminar a los EJC a medida que va sintetizando cte. abajo

92
Q

En que consiste el BLOQUE GLOBAL DE LA TRADUCCION

A

Cuando durante una UPR( resp. a proteinas mal plegadas) se activa la PERK y esta fosforila a la subunidad alfa del EIF2 y lo desactiva

93
Q

Que hacen los sensores ATF-G y IRE-1

A

Envian señales al nucleo para activar los GENES DE ESTRES DEL RER, se transcribe al mRNA y se traduce como chaperonas y proteasomas.

94
Q

Los genes de estrés del RER tienen un codón de inicio que se llama…

A

IRES: Sitio Interno de entrada ribosómica ( no se usa la eif2) se encuentra en el orf

95
Q

Que es el control mediado por UTR 5’

A

El mRNA de algunas proteínas pueden ser bloqueadas en su UTR 5’, por ejemplo el mRNA de la ferritina.

En el UTR 5’ del mRNA de la ferritina, tiene un elemento de respuesta a FE (IRE) QUE ES BLOQUEADO por una Proteína de respuesta a Fe (IRP).
Cuando hay ALTAS CONCENTRACIONES DE Fe, se desactiva la IRP y se libera la traducción del mRNA

96
Q

Que es la Ferritina

A

Es una proteína citosólica que almacena hierro, por lo tanto solo debe ser sintetizada cuando hay ALTAS concentraciones de Fe para que lo pueda almacenar.

97
Q

Que es el bloqueo por UTR 3’

A

Algunos mRNA ( como el de las HISTONAS) salen al citosol SIN COLA POLI-A, no se traducen sino que se almacenan en los CUERPOS P.

Estos mRNA tienen en su UTR 3’ una secuencia UUUUAU, a esta se le une la CPEB ( prot. de union a elem. de poliadenil. citoplasmatica)
y la CPEB le recluta a la MASKIN, que se une al casquete.

ASI impide que se forme la cola Poli-A.

Tambien una señal activa a una cinasa en el cuerpo P que fosforila a la CPEB Y MASKIN para poder añadir la cola poli-A y traducir el mRNA

98
Q

Que es el IRES

A

Sitio interno de entrada ribosomica, es un codon de inicio que hacen que se traduzcan los genes de estres del RER en proteasomas y chaperonas

99
Q

Que es el IRE

A

Elemento de respuesta a FE

100
Q

Donde ocurre el bloqueo por UTR 3’

A

en el núcleo

101
Q

En que consiste la degradación por des-adenilación

A

de acuerdo a la vida media del mRNA, cuando el ciclo se cumple, son llevados a los cuerpos P (citosol) para su destrucción, y esta se produce por 2 mecanismos:

  • Degradación desde 5’
  • Degradación desde 3’
102
Q

Cual es la secuencia de un mRNA con vida media larga

A

tiene en su UTR 3’ la secuencia CCUCC

103
Q

Cual es la secuencia de un mRNA con vida media corta

A
  • tiene en su UTR 3’ la secuencia AUUUA
104
Q

En que consiste la degradación de mRNA por 5’

A

1° La enzima DESADENILASA elimina la cola poli-A hasta que queden solo 30 ADENOSINAS
2° La enzima DCP-1 elimina EL CASQUETE
3° exonucleasa 5’ digiere todo el mRNA

105
Q

En que consiste la degradación de mRNA por 3’

A

1° la enzima DESADENILASA corta la cola poli-A hasta que quede con solo 30 adenosinas
2° Un EXOSOMA digiere todo desde el extremo 3’

106
Q

Que RNA puede inhibir la traducción

A

miRNA

107
Q

Como hace el miRNA para inhibir la traducción

A
  • El pre-miRNA sale al citosol y una DICER la corta en pedacitos bicatenarios
  • Luego se elimina una de las hebras secund. y ya es unicatenaria
  • La hebra principal se une a una PROT. ARGO y se forma el complejo RISK que se une a UTR 3’ para bloquear o promover la destrucción
108
Q

Que tiene el complejo RISK

A

pedacito monocatenario de miRNA + prot. ARGO

que se unen al UTR 3’ para bloquear en utr 3 y 5, y promover la destrucción del mRNA

109
Q

¿Una vez que se termina la traducción, se puede destruir las proteínas?

A

sí, aquellas que ya no son útiles por estar en exceso, alteradas o viejas.

1° se deben unir a UBIQUITINAS( se enlazan mediante LYS 48 o 63) mediante 3 enzimas (E1, E2 y E3)
2° son destruidas por proteasomas

110
Q

Cuantos aa tienen las ubiquitinas

A

76 aa

111
Q

Estructura del Proteasoma

A

1 capuchón ( reconoce a la ubiquitina y la libera)

1 cilindro central de 4 ANILLOS HEPTAMÉRICOS
( 2 anillos de 7 alfa, 2 anillos de 7 beta con proteasas)
POR AQUI PASA LA PROT. COMO ESTRUCT 1°

1 base capuchón ( salen los péptidos cortos)

112
Q

En eucariotas, cuantas proteasas tienen las sub. Beta del anillo heptamerico del proteasoma

A

3 proteasas por cada sub. B

6

113
Q

En procariotas, cuantas proteasas tiene su proteasoma

A

las 7 subunidades de la Beta son proteasas

14

114
Q

Proteína con vida media corta

A
  • Arg o Lys (R o K) En N-terminal
  • Secuecia DEGRÓN ( la primera degrón se llama PEST)

PEST: SER, PRO, THR, GLU

115
Q

Que es la secuencia DEGRON

A

indica que una prot. tiene vida media corta

PEST : Ser, Pro, Thr, Glu

116
Q

Cuantos genes tiene el ADN de la mitocondria

A

37

117
Q

Como se transcriben los 37 genes de la mitocondria

A
  • 2 rRNA
  • 13 mRNA
  • 22 tRNA
118
Q

Como se traducen los genes de mitocondria

A

en 13 proteínas ( de 13 mRNA)

119
Q

cuantos nu tienen los tRNA

A

73- 93 nu

120
Q

Ribotimidina, Dihidrouridina y seudouridina son…

A

PIRIMIDINAS (Y)

121
Q

Inosina, Guanosina, Adenosina son…

A

PURINAS (R)

122
Q

Lleva a cabo la traslocación del ribosoma eucariota

A

EF-G

123
Q

Todos los codones codifican señales V o F

A 
F
1 COMBINACIÓN de aa codifican señales. Ej: la señal
K : Lys
D: Asp
E: Glu
L: Leu
124
Q

La variabilidad en los distintos codones sinónimos se da en:

A

La última base

ej: UUU UUC

125
Q

El eIF4E convierte al mRNA en circular V o F

A

FALSO

en asa

126
Q

Las ubiquitinas son proteínas fabricadas en el NÚCLEO.

V o F

A

FALSOOOOO

NUNGUNA PROTEÍNA SE FABRICA EN EL NÚCLEO

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