Aminokisline in peptidi Flashcards
(15 cards)
definicija ak
vsaka org. molekula, ki ima vsaj eno aminsko sk. in eno karboksilno sk.
aminokisline
tetraedrična ureditev
kiralnicenter (izjema glicin)
bele kristalinične snovi
topne v vodi, netopne v org. topilih
vodne raztopine prevajajo električni tok
fiziološki pH 7,4
pI
tista vrednost pH, ko je molekula brez neto naboja
Beerov zakon
A = ε⋅c⋅l
povezava polipeptidov
z amidno oz. peptidno vezjo, spojitev aminske in karboksilne skupine preko kondenzacije (izstop vode)
smer zapisa polipeptidne verige
aminski(N-konec)
karboksilni(C-konec)
zapis peptida od N-konca proti C-koncu
določanje primarne strukture
metoda Edmanove razgradnje
ortologi
homologi, prisotniv različnih speciesih podobne ali identične funkcije
paralogi
homologi, prisotni znotraj enega speciesa *nastali z podvojitvijo gena
*ni nujno enaka funkcija
delitev proteinov
monomerni, oligomerni, enostavni (samo iz ak), konjugirani (kofaktorji), globularni, fibrilarni
kateri enantiomer se vgrajuje v proteine?
L - ak
velikost ak
110 Da
Metoda Edmandove razgradnje
fragmentacija proteinov
CNBr za Met, HLPC za ločevanje fragmentov
statistična analiza zaporedij
št. zadetkov se poveča uvedbo vrzeli, ena vrzel je 38 ujemanj
matrica Blosum 62
proteina sat homologna, če je ujemanje več kot 25%
