ARN Flashcards

Question

Taux d'erreur transcription

Answer 1

Toxine : alpha amanitine non détruite par la cuisson cause la plus fréquente de mort par ingestion de champignons inhibition de l'ARN polymérase 2 voir de l'ARN polymérase 3 à forte concentration cela inhibe la synthèse protéique trois phases - gastro-entérite - amélioration des symptômes atteinte hépatorénales - mort

Answer 2

100 nt ( Différentes seq comme boîte tata, caat, gc) Boite tata + facteur TIIB permet de définir précisément site d'initiation + Facteurs transregulateurs parfois, dépend des cellules

Answer 3

Les facteurs de transcription généraux s'assemblent de manière séquentielle et dans un ordre strict pour former le complexe de préinitiation - 1 étape: Fixation TFII-D en amont de boite TATA TFII-D = TBP ( commun au TFII-D) + TAFs (plusieurs, permet a l'ARNpol de reconnaitre plusieurs promoteurs) - 2 étape: TBP se fixe sur le petit sillon de l'ADN courbure ADN - 3 étape: TFII A stabilise le complexe TFII-D-ADN - 4e étape: TFII-B permet à l'ARNpol de savoir où commencer précisément - 5 étape: TFIIF amène ARNpol au niveau du promoteur - 6e étape: Implication facteur TFII-E et TFII-H

Answer 4

- Plusieurs sous unités - Impliqué dans transcription et réparation - ATPase ADNdépendante, kinase, hélicase - Activité kinase phosphorylation du domaine Cterm (CTD) de l'ARNpol II, nécessaire a l'élongation - Mutation activité hélicase du TFII-H • Xeroderma pigmentosum (enfant lune) * Syndrome de Cockayne * anomalies de réparation de l'ADN lors de l'exposition aux UV

Answer 5

Intervention de complexe de remodelage de la chromatine + enzyme HAT + activateur de la transcription qui peuvent interagir avec le complexe d'initiation par le biais du complexe médiateur : pontage entre facteurs activateurs et domaine CTD de l'ARN polymérase 2 - il peut aussi y avoir des facteurs inhibiteurs

Answer 6

La phosphorylation du domaine CTD ( domaine C term) => ARN polymerase se detache des facteurs de transcription et rendre en phase d'élongation ( S'accompagne de facteurs qui modifie la chromatine pour permettre à l'enzyme d'avancer, empêche la formation d'obstacle et facilite l'avancée de la polycondensation) En même temps on a les facteurs de maturation de l'ARN ( epissage)

Answer 7

Chez les eucaryotes seulement, dans le noyau 3 grands types de modifs: - Coiffe en 5' 7-methylhguanosine (ARNm) - Queue polyadénylée à l'extrémité 3' (sauf histone et U ARN) - Épissage = élimination d'intron (que ARNm)

Answer 8

- Dès le début de la transcription - Guanosine méthylée sur N7, sur le premier nt - Liaison 5'-5' triphosphate au 1er nt: pas d'extrémité 5' libre - Méthylation éventuelle en 2' du ribose sur les 2 nt adjacents - Coiffe 0: 7mG seul = 7 methyl guanosine - Coiffe 1: 1groupement + 7mG - Coiffe 2 : 2 groupement + 7mG

Answer 9

- ARN triphosphatase: élimine le phosphate Y (n°3) en 5' de ARNpré-m - ARN guanilytranférase (=enzyme de coiffage): ajout d'un GMP a partir de GTP en 5' → liaison 5'-5' triphosphate (Étape réversible) ARN (guanine 7) méhyltransférase: méthylation en position 7 de la Guanine => Groupement méthyl fourni par le groupement SAM = S-adénosyl-Lméthionine 2 autres enzymes peuvent se lier au domaine COOHterm de l'ARNpol seulement si il est phosphorylé Co transcriptionnelle: se déroule en même temps que la transcription (maturation ARNm)

Answer 10

Sur presque tous les ARNm sauf histone On a deux signaux - le signal de polyadenylation en 3': seq AAUAAA - seq riche en GU ou U : 25 nt en aval

Answer 11

Fixation du facteur CPS qui reconnait signal polyA te bi Recrutement de différent facteur CStF se liant à séquence riche en GU/U et interagit avec CPSF boucle Facteur de clivage CFI et CFII La poly(A) polymérisé (PAP) coupure entre 10 à 30 nt en 3' PAP synthétise la queue polyA grâce a l'ATP Extrémité clivée est dégradé et facteur libéré Au fur et a mesure de la synthèse, fixation de la protéine de liaison aux polyA (PABP) (polyA ajoute 200 à 250résidus adénylés recouvert par PABP (recouvre 10 à 20 résidus))

Answer 12

Migration des ARNm dans le cytoplasme Protège ARNm de la dégradation Initiation de la traduction

Answer 13

Role de stabilisation des ARNm (empêche la dégradation par exonucléase) Transport des ARN mature vers le cytoplasme Intervention dans l'epissage des ARNm Initiation de la sythèse protéique in vitro Autrement efficacité de liaison de la sous unité 40s ribosomique lors de la traduction

Answer 14

Dans le noyau Très précis Élimination intron On ne garde que les extrémité 5'UTR et 3'UTR + exon

Answer 15

Loi de Breathnach et Chambon : système de reconnaissance intronique Séquence GU en 5' de l'intron = site donneur d'épissage Séquence AG en 3' de l'intron = site accepteur d'épissage Moindre mutation empêche leur rôle Site d'embranchement: 20 à 50nt de l'extrémité 3' de l'intron ➤ C'est une adénine, au sein d'une séquence très conservé : YNCURAY ➤ Elle est suivie d'un élément polyPyr (riche en pyrimidine)

Answer 16

Epissage des ARNm = 2 étapes de transesterification - Clivage de l'extrémité 5' de l'intron et liaison avec l'adénine du site de branchement (1ere transestérification) => formation du lasso. Puis il est coupé de l'extrémité 3' Liaison groupement 3'OH libre de l'exon en amont avec le 5'-P de l'exon en aval (2 transesterification) => Sans apport d'energie

Answer 17

=> particule d'épissage composée de - Pré-ARNm - Protéine accessoire - Ribocunécloprotéine (=150) Snurps, contenant de petits snARN: => SnRNP U1, U2, U4, U5 et U6 (PAS U3) U1 se lie au site de clivage 5' de l'intron (donneur) U2 se lie au site de branchement US se lie au site de clivage 3' de l'intron accepteur) → Permet clivage 5', formation du lasso, clivage 3'

Answer 18

Les U ARN ont eux aussi un coiffe en 5' mais celle-ci est une guanosine triméthylée: la coiffe 2-2-7-triméthyl-guanosine Dans ce cas cela se déroule dans le cytoplasme puis elle retourne dans le noyau

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