Bactéries et virus marins Flashcards
(27 cards)
Comment définir le plancton?
ensemble des êtres vivants (animaux et végétaux) évoluant dans l’eau et qui se laissent dériver dans le courant
Quelle est l’importance (en biomasse) du plancton dans les océans?
90%
Nommer les différents types de micro-organismes que l’on retrouve dans les océans?
Virus
Bactéries
Archaea
Petits eucaryotes (picoeucaryotes et microalgues)
Qu’est ce qu’un virus?
Agent infectieux nécessitant un hôte pour se répliquer.
Quel organisme est entourée d’une paroi rigide de peptidoglycane lui permettant de résister à la forte pression osmotique interne
Bactéries (Archaea exclus)
Quel groupe de virus est abondant en milieu marin?
Les bactériophages
Virus reconnu pour infecter les bactéries.
Sous quel forme se retrouve le matériel génétique des virus?
Fragments d’acide nucléique (ADN ou ARN)
Quel sont les nom donnés aux bactéries et aux virus pour faire référence à leur taille?
Bactéries = picoplancton (0,2 à 2 micro m)
Virus = femtoplancton (0,02 à 0,2 micro m)
Quel groupe est le plus dominant en terme de biomasse?
Bactéries
Comment mesure-t-on la croissance bactérienne?
Efficacité de croissance (Ygr ou BGE) = Production bactérienne / (production bactérienne + respiration bactérienne)
Ygr = 10 à 30 %
Quels sont les deux grands groupes de virus?
Virus lytiques (entraine la lyse de l’hôte)
Virus lysogéniques (se maintient en dormance dans l’hôte)
Décrire les phases du cycle de propagation virale :
- Phase extracellulaire
- virus inerte en suspension dans l’eau - Phase intracellulaire
- Introduction du matériel génétique du virus dans l’hôte
Lytique = induction de reproduction virale jusqu’à la lyse de la cellule et au largage
Lysogénique = intégration des acides nucléiques viraux dans la cellule sous forme de prophage persistant (transfert de génération en génération) = latence
Quels facteurs peuvent déclenchées la fin du cycle de latence et mener à la lyse cellulaire?
Stress externe (ex : température, radiation UV, etc.)
Quels sont les avantages de la lysogénie?
Pour l’hôte : ++ capacité métabolique et immunité vis-à-vis les phages similaires
Pour le virus : survie prolongée en conditions de faible abondance d’hôtes ou de faible taux de croissance
Quelles sources d’énergie peuvent être utilisées par les bactéries?
Chimique et lumineuse
On distingue deux types de photoautotrophe.
Ceux à photosynthèse oxygénique (production d’O2)
et ceux non-oxygénique (production de sulfate)
Avantage et inconvénient de la chimioautotrophie :
- = moins efficace que la photosynthèse (croissance plus lente)
+ = permet de proliférer en absence de lumière
Quels sont les deux rôle majeurs des bactéries hétérotrophes?
Production de biomasse = BP
Respiration bactérienne (production de C inorganique = BR
Vrai ou faux.
Les bactéries hétérotrophes peuvent consommer de 20 à 40 % du carbone fixé par le phyto.
vrai
Quel événement est à l’origine de la formation d’un ciment minéral entre la particules qui favorise la sédimentation (neige marine)?
Association des bactéries hétérotrophes sur les particules en suspension
Que permet la boucle microbienne?
- Utilisation de la DOM (produite par les prod. primaires)
- Recyclage de la POM pour former une biomasse utilisable par les prédateurs supérieurs
- Régénération de nutriments essentiels à la production primaire du réseau trophique
Qu’est ce qui permet de produire de la nouvelle biomasse et de régénérer des nutriments essentiels (C, N, P) pour les producteurs?
Décomposition
Quels sont les modes de contrôle de la décomposition?
Top-Down : prédation, lyse virale
effet de sélection
Sideways : Interaction entre les différentes espèces formant la communauté (Compétition)
Buttom-up : Qualité et quantité de la ressource
Qu’est que le viral shunt?
Processus permettant d’augmenter le temps de rétention de la matière organique labile dans la couche euphotique et augmentation de la respiration oxydative
