Bases de Datos Flashcards

1
Q

Formato estandarizado que facilita comunicación entre bases de datos

A

FASTA

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2
Q

¿Cómo se busca en FASTA?

A

Signo mayor que con definición sin espacio entre la primera palabra y el signo

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3
Q

Bases de datos primarias características:

A

TODOS los datos secuencia hasta el momento
* Descripción
* Nombre científico
* Organismo de procedencia
* Tabla de regiones codificantes
* Refencias

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4
Q

Tres bases de datos primarias y su país:

A
  • GenBank (EU)
  • ENA (Europa)
  • DBJ (Japón)
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5
Q

Bases de datos secundarias, características:

A

Derivan de primarias, ofrecen:
* Caracterización
* Mutaciones y polimorfismos

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6
Q

Swiss-Prot pertenece a

A

UniProKb

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7
Q

¿De dónde obtiene información UniProKb?

A
  • Protein Data Bank (DTB)
  • Protein Information Resource (RIR)
  • Directamente
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8
Q

Secundaria

Fenotipos asociados a enfermedades:

A

OMIM

ADN-ARN

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9
Q

Expresión génica de microrrays:

A

ARRAYEXPRESS

ADN-ARN

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10
Q

Archiva y distribuye datos de microrrays:

A

GEO

ADN-ARN

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11
Q

Motivos de conservación de características de familias de proteínas

A

PRINTS

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12
Q

Base de datos de familias de proteínas:

A

PFAM

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13
Q

Colección de proteínas clasificadas por predicción de función

A

INTERPRO

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14
Q

Interacciones entre proteínas:

A

BIOGRID

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