BCM STRUC Flashcards
(181 cards)
1
Q
Wohler
A
Refuter la théorie du vitalisme en synthétisant de l’urée
2
Q
Avant _, on croyait qu’il nécéssitait une force vitale pour produire des molécules (le _)
A
Wohler et vitalisme
3
Q
Buchner
A
Démonter que les enzymes catalysent les réactions (et non les cellules) en fermentant du glucose
4
Q
Fischer (1)
A
Démontrer que les enzymes catalysent les réactions (et non les cellules) en hydrolysant du sucrose
5
Q
Découverte grâce à la fermentation du glucose?
A
Buchner
6
Q
Découverte grâce à l’hydrolyse du sucrose?
A
Fischer
7
Q
Fischer (2)
A
Découvert le système clé-serrure des enzymes en faisant des expériences sur la spécificité des enzymes
8
Q
Avery, MacLoed, MacCarthy
A
Découverte : l’ADN transporte le matériel génétique
9
Q
Kendrew et Perutz
A
Découverte de la structure des protéines
10
Q
Watson et Crick
A
Découverte de la structure le l’ADN
11
Q
Découverte : l’ADN transporte le matériel génétique
A
Avery, MacLoed, MacCarthy
12
Q
Découverte de la structure des protéines
A
Kendrew et Perutz
13
Q
Découverte de la structure le l’ADN
A
Watson et Crick
14
Q
Éléments principaux de la cellule?
A
C,H,O,N,P,S
15
Q
Ions importants pour la cellules?
A
Na+.Cl-,K+,Mg2+,Ca2+
16
Q
Pourquoi le carbone est à la base de la vie?
A
Le C peut former quatres liens covalents (liens simple, double et même triple). Liaisons C-C permettent la formation de très longues chaines de carbone
17
Q
Quel est la caractéristique de éléments principaux de la cellule?
A
C,H,O,N,P,S sont les plus petits éléments qui peuvent former des liens covalents. Plus l’élément est petit plus les liens covalents sont forts
18
Q
La partie réactive des molécules organiques?
A
Les groupements fonctionnels
19
Q
Les niveaux d’organisations hiérarchique du vivant?
A
(AIMMCOC) Atomes, molécule inorganiques, molécules simples, macromolécule, complexes surpramoléculaires, organites, cellules
20
Q
Les sortes de biomolécules?
A
Glucides, protéines, acides nucléiques, lipides
21
Q
Groupements fonctionnels des glucides?
A
Hydroxyle, carbonyle
22
Q
Groupements fonctionnels des protéines?
A
Carboxyle, amide
23
Q
Groupements fonctionnels des lipides?
A
Carboxyle
24
Q
Groupement fonctionnels des acides nucléiques?
A
Phosphate
25
Monomère des protéines?
Acide aminé
26
Monomère des acides nucléiques?
Nucléotides
27
Monomère des lipides?
Acides gras
28
Monomère des glucides?
Monosaccharides
29
Lien entre deux monosaccharides?
Lien glycosidique, lien éther
30
Lien entre deux nucléotides?
Phosphodiester
31
Lien entre deux acides aminés?
Lien amide, lien peptidique
32
Lien entre deux acides gras?
Lien ester
33
Le métabolisme...
décrit les mécanismes de synthèse et de dégradation des biomolécules
34
Terme pour décrire les réactions de synthèses?
Anabolisme
35
Terme pour décrire les réactions de dégradations?
Catabolisme
36
Une réaction métabolique qui requiert de l'énergie?
Anabolisme
37
Une réaction métabolique qui libèrent de l'énergie?
Catabolisme
38
A + B <-> C + D (k), k est...
la constante de vitesse de la réaction, elle est spécifique à chaque réaction
39
Que peut-on dire de la vitesse d'une réaction et de la concentration des produits?
Elles sont proportionnelles
40
Comment est déterminée la direction d'une réaction?
La différence entre la vitesse de la formation des produits et la vitesse de formation des réactifs
41
Une réaction est dite non-spontannée...
quand la vitesse de formation des réactif est plus grande que celle des produits : A + B <<--> C + D
42
v-1 = k[C][D]
la vitesse de la formation des réactifs
43
v1 = k[A][B]
la vitesse de la formation des produits
44
A + B <- C + D est _, alors C + D -> A + B est _
non-spontanée, spontanée
45
Qu'arrive-t-il lorsque la concentration des produits devient égale à celle des produits
Les vitesses des réactions sont égales (v-1 = v1), la réaction est à l'équilibre
46
Quelles sont les trois variables de la bioénegie?
L'enthalpie (H), l'entropie (S) et l'énergie libre (G)
47
Le formule de l'énergie libre
(delta G) = (delta H) - (T)(delta S)
48
Le changement d'enthalpie correspond...
au changement d'énergie sous forme de chaleur
49
Si delta H est -
Delta H est favorable, la réaction est exothermique (libération de chaleur)
50
Si delta H est +
Le changement d'enthalpie est non-favorable, la réaction est endothermique (absorption de chaleur)
51
La formule du changement d'énergie libre standard?
(delta G°') = -RT(lnKeq)
52
Le changement d'entropie correspond...
à la mesure du désordre
53
Si la réaction va de l'orde au désordre, le changement d'entropie est...
favorable, delta S est +
54
Si la réaction va du désordre à l'ordre, le changement d'entropie est...
défavorable, celta S est -
55
Si delta H est - et delta S est +
Les deux variables sont favorables, la réaction est spontannée
56
Si delta H est + et delta S est +
Il faut calculer le changement d'énergie libre pour conclure sur la spontanéité
57
Si delta H est - et delta S est -
Il faut calculer le changement d'énergie libre pour conclure sur la spontanéité
58
Si delta H est + et delta S est -
Les deux variables sont défavorables, la réaction est non-spontanée peut importe la température
59
Le changement d'énergie libre renseigne...
sur la spontanéité
60
Si delta G est +,...
la réaction est non-spontanée, la réaction est endergonique
61
Si delta G est -,...
la réaction est spontanée, la réaction est exergonique
62
Si delta G est =0
la réaction est à l'équilibre
63
Exergonique
Réaction libère de l'énergie
64
Endergonique
Réaction absorbe de l'énergie
65
Exothermique
Réaction libère de la chaleur
66
Endothermique
Réaction absorbe la chaleur
67
Le changmenet d'énergie libre standard (delta G°') correspond...
à la valeur de référence du changement d'énergie libre
68
Ke est...
la constante d'équilibre de la réaction, Ke = [C]eq[D]eq/[A]eq[B]eq
69
Comment calculer le changement d'énergie libre standard si le réaction n'est pas à l'équilibre?
Au lie d'utiliser Keq, on utilise Q. Q = [C]in[D]in/[A]in[B]in
70
Une cellule à l'équilibre est...
une cellule morte, c'est pour cela qu'on utilise Q au lieu de Ke
71
Réactions couplées
Une réaction spontanée libère de l'énergie qui sera utilisée pour une réaction endergonique (réaction non-spontannée)
Exergoniques sont couplées à des endergoniques pour combler le besoin énergétique de la réaction
72
Comment calculer le changement d'énergie libre d'une réaction couplé?
(delta G) = (delta G)réaction1 + (delta G)réaction 2
73
La théorie de l'origine commune de la vie est appuyée par...
1. Les cellules utilisent les mêmes biomolécules
2. Les cellules utilisent les mêmes voies métaboliques
3. Les cellules utilisent le même code génétique
74
Les empires des organismes?
1(Prokaryota) et 2(Eukaryota)
75
Les domaines des organismes?
1(archaea,bacteria), 2(eucarya)
76
Les règnes des organismes?
1(monera), 2(protista, fungi, plantae et animalia)
77
Comportement des hydrophiles dans l'eau?
Ils se solubilisent
78
Comportement des hydrophobes dans l'eau?
Les molécules d'eau forment des clathrates autour de molécules hydrophobes
79
Comportement des amphiphiles dans l'eau?
Ils forment de monocouches à la surface de l'eau, forment des micelles ou forment des bicouches
80
Décrit la diffusion
Le déplacement des solutés vers le milieu le plus concentré au moins concentré
81
Décrit l'osmose
Le déplacement de l'eau vers le milieu le plus concentré au moins concentré
82
Comment se crées les pôles à l'intérieur d'une molécule d'eau?
L'électronégativité d'un atome (l'oxygène) force la création de pôles
83
Comment l'eau est importante pour le vivant?
1. Ses propriétés physicochimiques : les valeurs de ses capacités thermiques sont élévées à cause des fortes interactions entre les molécules d'eau
2. Les interactions avec l'eau déterminent la structure et la fonction des molécules
3. Solvant idéal pour plusieurs réactions
4. Réactif pour plusieurs réactions
5. Grande solubilité grâce aux ponts H, ponts H rendent l'eau polaire
6.Constante diélectrique élevée : solubilise bien les ions
7. L'eau a deux charges partielles (une + et une -), donc l'eau peut interagir avec les deux charges
8. La densité de l'eau solide est plus petite que l'eau liquide
9. Nucléophile
84
Pourquoi l'eau est un excellent solvant?
1. Sa polarité (répartition des charges)
2. Sa constante diélectrique
85
Que dit la constante diélectrique?
Plus elle est grande, plus le solvant a une grande capacité à entourer les ions pour empêcher qu'ils interagissent entre eux
86
Les forces faibles sont...
les interactions non-covalentes (les liaisons ioniques, les ponts H, les forces de Van der Waals et les interactions hydrophobes)
87
Le phénomène d'exclusion des molécules hydrophobes?
L'effet hydrophobe
88
Les interactions hydrostatiques sont...
les liaisons ioniques, les liaisons hydrogènes et les forces de Van der Waals
89
Liaison ionique est le résultat...
de l'attraction de deux charges nettes opposées
90
Comment expliquons un dipôle transitoire?
Un dipôle transitoire est expliqué par le mouvement constant des électrons
91
Comment expliquons un dipôle induit?
C'est lorsque que les pôles transitoires induisent des pôles autour d'un autre atome (ex : pôle transitoire +, induit un pôle - chez une molécule voisine
92
Les dipôles permanents se retrouvent...
dans des groupements polaires
93
La répulsion et l'attraction des force de Van der Waals dépend...
de la distance entre les noyaux des atomes
94
L'attraction des force de Van der Waals est maximale...
Lorsque la distance entre les atomes est égale à la somme des rayons de atomes
95
Force de Van der Waals : plus les atomes sont proches...
plus la répulsion est grande
96
Les molécules d'eau forment des _ autour des molécules _
clathrates, hydrophobes
97
Est-il favorable de former une grande ou plusieurs clathrates petites?
Une grande, car une cage pour plusieurs composés hydrophobes diminuent la surface de contacte entre l'eau et les molécule hydrophobes. Aussi, une grande cage diminue le nombre de molécules d'eau ordonnées
98
Les électrophiles sont...
des molécules chargées positivement ou qui ont un manque d'électron
99
Les nucléophiles sont...
des molécules chargées négativement ou qui ont des électrons libres
100
Une attaque nucléophile est...
lorsqu'un nucléophile «attaque» un électrophile pour ses électrons
101
L'eau est faiblement nucléophile, comment peut-il tout de même faire des attaques nucléophiles?
L'eau est faiblement nucléophile, cependant sa concentration est si grande dans l'espace cellulaire qu'il parvient à dégrader des molécules par attaque nucléophile
102
L'hydrolyse est...
la coupure d'une liaison covalente par l'ajout d'une molécule d'eau
103
La condensation est...
la formation d'une liaison covalente par la perte d'une molécule d'eau
104
Un électrolyte fort dans l'eau...
se dissocient complètement
105
Tampons cellulaires?
Tampon phosphate et protéique
106
Tampons sanguins?
Tampon carbonate et hémoglobine
107
Pourquoi c'est intéressant pour la formation de vie que la densité de l'eau solide est plus petite que l'eau liquide
La glace coulerait au fond de l'eau et ne fonderait jamais, la vie est apparue dans le fond de l'eau
108
Qu'explique le fait que la densité de l'eau solide est plus petite que l'eau liquide
La densité de l'eau solide est plus petite que l'eau liquide, car à l'état solide les ponts H sont linéaires
109
Est-ce que la densité de l'eau liquide est plus grande ou plus petite que celle de la glace?
Elle est plus grande
110
Pourquoi est-ce un avantage que l'eau ne soit pas un solvant universel?
S'il était universel, il solubiliserait tout, même la membrane cellulaire
111
Les rôles de protéines?
1. Enzymes
2. Structure
3. Mouvement
4. Immunité
5. Transport
6. Régulation
7. Stokage
8. Décodage de l'information génétique
112
AA standard
Les 20 AA qui composent les protéines
113
Quels sont les rôles de AA absents de protéines?
1. Médiateurs chimiques
2. Réactifs métaboliques
114
Caractéristiques de AA standard?
1. Acides alpha-aminés
2. COOH et une NH primaire
3. Activité optique
115
Les catégories pour classer les AA selon la chaîne latérale?
1. Aliphatique
2. Alpha-iminoacide
3. Soufrée
4. Beta-hydroxylée
5. Aromatique
6. 2e fonction basique
7. 2e fonction acide et dérivé amide
116
Les aliphatiques?
G,A,I,L,V
117
Alpha-iminoacide?
P
118
Les AA soufrées?
M,C
119
Les AA beta-hydroxylées?
S,T
120
Les AA aromatiques?
F,Y,W
121
Les AA avec une 2e fonction acide?
D,E,N,Q
122
Les AA avec une 2e fonction basique?
H,K,R
123
G?
Glycine,GLY
124
GLY?
Glycine,G
125
Glycine?
G,GLY
126
A?
Alanine,ALA
127
ALA?
Alanine,A
128
Alanine?
A,ALA
129
Isoleucine?
I,ILE
130
ILE?
Isoleucine,I
131
I?
Isoleucine,ILE
132
L?
Leucine,LEU
133
V?
Valine,VAL
134
P?
Proline,PRO
135
F?
Phénylalanine,Phe
136
Phénylalanine?
F,PHE
137
Tyrosine?
Y,TYR
138
Y?
Tyrosine,TYR
139
Triptophane?
W,TRP
140
TRP?
Triptophane,W
141
W?
Triptophane,TRP
142
M?
Méthionine,MET
143
C?
Cystéine,CYS
144
S?
Serine,SER
145
H?
Histidine,HIS
146
T?
Threonine,THR
147
THR?
Threonine,T
148
Threonine?
T,THR
149
K?
Lysine,LYS
150
R?
Arginine,ARG
151
N?
Asparagine,ASN
152
D?
Aspartate,ASP
153
E?
Glutamate,GLU
154
Glutamine?
Q,GLN
155
La structure primaire des protéines?
La suite des AA qui compose la protéine
156
La structure secondaire des protéines?
L'intéraction des AA adjacents
157
La structure tertiaire des protéines?
L'interaction et l'arrangement 3D des atomes de la chaines peptidique
158
La structure quaternaire?
L'interaction et l'arrangement des sous-unités de la protéine
159
Les variable selon lesquelles il est possible de purifier les protéines?
-La taille
-La charge
-La solubilité
-L'affinité
160
Activités biologiques des AA
1. Antioxydants
2. Hormones messagères
3. Neurotransmetteurs
4. Agroalimentation
5. Venins et poisons biologiques
161
Comment décrire la séquence d'une protéine
Commencer pas le AA N-terminale, termine par le AA C-terminale
162
La loi Beer-Lambert
A=log(I0/I) et A=ecl
163
Analyser des protéines pour...
- Détecter et doser
- Verifier la pureté
- Déterminer la masse moléculaire
- Déterminer le pI
164
Quelle technique d'analyse j'utilise pour détecter et doser?
Spectrophotométrie UV ou spectrophotocolorimétrie
165
Quelle technique d'analyse j'utilise pour vérifier la pureté?
Électrophorèse
166
Quelle technique d'analyse j'utilise pour déterminer la masse moléculaire?
Chromatographie d'exclusion, le SDS-PAGE, spectrométrie de masse
167
Quelle technique d'analyse j'utilise pour déterminer le pI
Focalisation isoélectrique
168
C'est quand que je peux utiliser la spectrophotométrie UV?
Quand l'échantillon est pure, quand je connais e
169
C'est quand que je peux utiliser la spectrophotocolorimétrie?
Quand l'échantillon est un mélange de protéines ou quand je connais pas e
170
Le but de l'électrophorèse est de...
vérifier la purété OU séparer et évaluer la vitesse de migration des protéines d'un mélange dans un champ électrique
171
Lors de l'analyse par électrophorèse, les protéines de quelle traille migrent le plus rapidement?
Plus petites protéines
172
Méthodes d'électrophorèses?
PAGE, SDS-PAGE, IEF
173
Techniques pour si je veux analyser la masse moléculaire et le pI
Électrophorèse 2D
174
Étapes pour connaitre la séquence des AA de la protéine?
1. Briser les liens S
2. Briser les intéractions n-c
3. Composition en AA
4. Caractérisation des N- C-terminales
5. Fragmentation de la chaine polypeptidique
6. Séquençage des fragments
7. Reconstruction de la séquence
8. Localisation des ponts S
175
2-mercaptoéthanol
Angent réducteur : briser les ponts S
176
Iodoacétate
Agent d'alkylation : empêche la reformation des ponts S
177
Lors de quelle étape de la détermination de la structure, utilisons-nous le 2-mercaptoéthanol et l'iodoacétate?
Le bris des ponts S
178
Après quelle étape du séquençage, devons-nous purifier la chaine polypeptidique?
Après le bris de liens n-c, on purifie par HPLC ou électrophorèse
179
Lors du séquençage, on peut briser les liens n-c avec...
-SDS
-Détergent
-Agent chaotropique
180
Lors du séquençage, on détermine la composition de la chaine polypeptidique en...
Hydrolysant les liens peptidiques pour analyser les AA libérés et en ajoutant un aromatique au AA pour après faire une spectrophotométrie par UV
181
Pourquoi est-ce favorable avoir une protéine multimérique?
Plusieurs chaines courtes, plus stable, partager les mêmes sous-unités, régulation des activités est facilitée, canalisation successive
