MICROBIO 2 Flashcards
(98 cards)
1
Q
Groupes d’élements nutritifs essentiels à la croissance?
A
Les macroéléments (éléments majeurs) et les oligoéléments (éléments mineurs)
2
Q
Comment classes les bactéries et quelles sont les catégories?
A
Classes en fonction des demandes nutritionnelles/croissances et les catégories sont : le type trophique, la croissance en présence d’O2 et la température de croissance
3
Q
Fun fact :
A
bactérie dans un milieu où sa croissance est favorisée pour que la population augmente pour facilité son analyse
4
Q
Les bactéries assimilent sous quelles formes chimiques les éléments nutritifs?
A
Majoritairement sous forme de sel inorganique (les sels présents dans l’eau/dissoudre pour dissoudre)(les cellules bactériennes seront capables de capturer les éléments essentielles sous forme de sels)
Les exceptions : S,N,C,H,O
5
Q
Les éléments nutritifs sont transformés en…?
A
Matériel cellulaire et énergie
6
Q
Comment sont différenciés les groupes d’éléments nutritifs?
A
Ont classes les éléments nutritifs dans deux groupes en fonction de la concentration à introduire dans le milieu in vitro pour combler les demandes nutritionelles (besoin de bcq : macroéléments)
7
Q
Fun fact :
A
stérilisé le milieu et tous les outils
8
Q
Les macroéléments?
A
C,H,O,N,P,S,K,Mg,Ca,Fe,Na,Cl
9
Q
Les oligoéléments?
A
Zn,Mn,Mo,Se,Co,Cu,Ni,W
10
Q
Les macroéléments et la masse sèche
A
CHONPS composent 95% de la masse sèche de la cellule
11
Q
Comment K est important?
A
- Cation inorganique (équilibre électrochimique)
- Cofacteur d’enzymes
- Synthése protéique (intégrité des ribosomes)(pas de K, pas de synthèse protéique)
12
Q
Fun fact :
A
s’il manque un élément essentiel, il n’y a pas de croissance
13
Q
Comment Mg est important?
A
- Cofacteur d’enzymes surtout chez les photosynthétique
- Important pour l’intégrité de la membrane, ceci permet la bonne séparation des environnements
14
Q
Comment Ca est important?
A
15
Q
Sous quelles forment introduire CHONPS dans le milieu in vitro?
A
16
Q
Comment Fe est important?
A
17
Q
Comment Na est important?
A
18
Q
Comment Cl est important?
A
19
Q
Comment Zn est important?
A
20
Q
Comment Mn est important?
A
21
Q
Comment Mo est important?
A
22
Q
Comment Se est important?
A
23
Q
Comment Co est important?
A
24
Q
Comment Cu est important?
A
25
Comment Ni est important?
26
Comment W est important?
27
Comment Mg est important?
28
Fun fact :
- Manque 1 macroélément ou 1 oligoélément : pas de croissance
- Fournir [] de macroéléments = 10^-4M
- QUand on prépare un milieu de culture les oligoéléments sont souvent déjà présent sous forme de traces dans l'eau (souvent ce qu'il y a dans l'eau distillé est suffisant)
29
Les éléments essentielles qui ne sont pas absorbés sous forme de sels inorganiques?
S,C,H,O,N
30
Assimilation du souffre?
Utiliser le S2O3 et S2O4 (sels inorganiques), le H2S (un résultat de l'anaérobiose) et certains acides aminés (MET, CYS)
31
Archébactéries méatanogènes, what's special about them
Produit final de leur métabolisme est le méthane
32
Assimilation de l'azote?
Habituellement assimile l'azote sous forme de NH3. L'exceptions : il y a des bactéries que peuvent fixer l'azote et des bactéries qui peuvent puiser N des AA
33
Organisme fixatrices d'azote?
Azotobacter et rhizobium (vivent en symbiose avec les racines)
34
Assimilation de C,H,O?
Pour la maj, le C,H,O provient de la dégradation de la matière organique et provient l'eau
Les exceptions : les autotrophe produisent la matière organique avec les CO2 de l'environnement
35
Les bactéries utilisent les élément nutritif pour créer la matière cellulaire, quelle est la composition biochimique? Les éléments nutritifs seront transformés en quoi?
96% des éléments en macromolécules
- Protéines 60%
- Glucides 5%
- Lipides 9%
- ADN, ARN 22%
4% sels, précurseurs et intermédiaires (rôle dans l'équilibre électrostatique
36
Fun fact :
Pas bcq de molécules simples : réutilisent constament
37
Diversité des molécules qui composent les cellules bactériennes?
- Shit ton of proteins
- Glucides (2), lipides (4), ADN (1, pcq un chromosome)
- A few different types of ARN
38
Le métabolisme est...
la science des réactions biochimiques cellulaire
39
Les 2 volets du métabolisme?
Catabolisme (dégradation) et anabolisme (construction)
40
Catbolisme dégrade les nutriments en...
- précurseurs communs aux organismes (bactériens, animaux,...), sous-unités pour être assemblé
--- Principe de l'unité de la biochimie
- Énergie (stocké sous la forme de ATP,NADH,NADPH)
41
Unité de la biochimie?
Tous les organismes utilisent les mêmes unité de bases pour les réactions métaboliques
42
Anabolisme?
Construction
Intermédiraires + énergie -> biosynthèse -> matériel cellulaire
43
À quoi sert l'énergie?
- Synthèse et polymérisation (assemblage)
- Transport actif
- Maintient de la balance osmotique (avoir un cytoplasme propice aux réactions)
- Motilité (capacité à utiliser de l'énergie pour se déplacer)
44
Comment connaitre le type trophique d'une bactérie?
Par sa source d'énergie et de carbone
45
Les différentes sources d'énergie? et comment appelons les bactéries qui utilisent ses sources?
- Lumineuse (phototrophes)
- Chimique (chimiotrophes)
46
Les différentes sources de carbone? et comment appelons les bactéries qui utilisent ses sources?
- CO2 (autotrophes)
- Matière organique (hétérotrophes)
47
Les bactéries qui utilisent la lumière et la matière organique?
Photohétérotrophes (bactéries vertes)
48
Les bactéries qui utilisent la lumière et le CO2?
Photoautotrophes (cyanobactéries)
49
Les bactéries qui utilisent l'énergie chimique et le CO2?
Chimioautotrophes (thiobacillus : vie dans les mines)
50
Les bactéries qui utilisent l'énergie chimique et la matière organique?
Chimiohétérotrophes
51
La capcité des bactéries de croitre en présence de CO2 dépend de...
- Métabolisme énergétique
- Neutralisation des formes toxiques de l'O2
52
Les différentes intéractions avec l'O2?
- Aérobie strictes
- Anaérobies strictes
- Anaérobies facultatives
- Aérotolérantes
- Microaérophiles
53
Décrit les aérobies strictes.
Besoin d'O2 pour faire de l'énergie, respiration cellulaire, SOD+catalase+peroxidase sont présentes
54
Décrit les anaérobies strictes.
Zéro contact avec l'O2 car elle est toxique, fermentation lactique, pas les enzymes utilent à l'élimination des formes toxiques de O2
55
Décrit les anaérobies facultatives.
Possèdent les enzymes pour faire la fermentation lactique et la respiration cellulaire (resp > fermentation), SOD+catalase+peroxidase sont présentes
56
Décrits les aérotolérantes?
Elles tolèrent la présence de l'O2, mais ne font que de la fermentation lactique, SOD+catalase+peroxidase sont présentes
57
Décrits les microaérophiles?
Croissance dans des faibles concentration d'O2, respiration cellulaire, SOD+catalase+peroxidase sont présentes et sont sensibles à l'O2
58
3 conditions à ternir compte pour la croissance d'une culture?
Le type trophique, l'intéraction avec l'O2 et les températures de croissance
59
Capacité de croitre en présence d'O2 dépend de?
- Métabolisme énergétique (les réactions enzymatiques)
- Capacité à éliminer les formes toxiques
60
Comment les chimiotrophes produisent de l'énergie? Les voix enzymatique?
- Respiration aérobie
- Fermentation lactique
61
Incapacité de croitre en présence d'oxygène dépend de?
- Métabolisme
- Élimination des formes toxiques de l'O2
62
Enzymes ensentielles pour la croissance en présence d'O2? Besoin des X pour être méga efficace?
- SuperOxyde Dismutase (SOD)
- Catalase
- Peroxidase
63
Croissance de 0-20°C, optimum 10-15°C
Psychrophiles
64
Pourquoi on s'intéresse au psychrophiles? Pourquoi y'a 2 diapos pour les psychrophiles?
Il y a des psychrophiles qui sont capables de croitre à -20°C dans l'eau liquide.
On étudie les psychrophiles ici, car les psychrophiles pourraient ressembler aux organismes sur d'autres planètes ayant de l'eau liquide.
65
Croissance de 20-30°C, peuvent croitre à l'extrieur de cette ensemble
Psychrotrophes
66
Croissance dans les températures moyennes 20-45°CMésophiles
Mésophiles
67
Température optimal des patogènes humains?
La température du corps 37°C
68
Température optimal des patogènes aviaires?
La température des oiseaux 42°C
69
Croissance de 45-85°C
Thermophiles
70
85°C+
Thermophiles extrêmes
71
Objectif du milieu de culture?
Augmenter la population
72
Fun fact :
On veut que le milieu de culture ait ce qu'il faut pour assurer la croissance de la population du microorganisme qui m'intéresse
73
Pré-réquis important du milieu de culture?
S'assurer qu'il est stérile
74
Les types de culture?
- Culture pure
- Culture mixte, observer le comportement dans l'environnement, les intéractions
75
La composition d'un milieu de croissance?
Tout les éléments nécessaire pour permettre la croissance
- Source d'énergie et de croissance
- Facteurs de croissances
- Éléments essentiels à la biosynthèse
76
Les facteurs de croissances?
Précurseurs qui ne peuvent pas être synthétisés
- Vitamines
- AA
- Purines et pyrimidines
77
Les différents états du milieux de culture?
- Liquide
- Solide (gélosés)
78
Quand j'ai besoin de faire croitre une très très très grande population?
Milieu liquide
79
Décrit les milieux de cultures liquides.
- Il y a une répartition uniforme des microorganisme
- S'il se développe un trouble, il y a croissance
80
Décrit les milieux de cultures solides.
- Milieux de cultures solides sont des plats de Petri où le couvercle permet les échanges gazeux
- Les colonies sont isolés, séparation physique
- L'agent gélifiant : l'agar
81
Décrire l'agar?
- L'agent gélifiant des milieux de cultures solides
- [agar] et proportionelle à la rigidité de la gélose (0.5 à 1.5%)
- Généralement pas dégradé
- Solubilisation à 100°C
- Gélification à 45°C
82
Que faisons-nous des bactéries qui dégradent l'agar?
On utilise du gel de silice au lieu de l'agar comme agent gélifiant
83
La stérilisation est...
l'élimination des organismes viables
84
Les différents moyens de stérilisation?
- Chaleur
- Radiations ionisantes
- Filtration
- Substances chimiques
85
Les méthodes pour stériliser avec la chaleur?
- Flamme (Bec Bunsen)
- Chaleur sèche (four à air chaud)(utilise pour la verrerie)
- Chaleur humide (autoclave)(utiliser pour un milieu liquide)
86
Les méthodes pour stériliser par radiations ionisantes?
- Rayons gamma (utiliser pour les thermosensibles)
- Rayons UV
87
Les métodes pour stériliser par substance chimique?
- Gaz stérilisants (ozone, oxyde d'éthylène)
88
Les méthodes pour stériliser par filtration?
- Filtre nitrocellulose, rétention des corps bactériens, fait dans le vide (utiliser pour liquides thermosensibles)
89
Fun fact :
La stérilisation du milieu et des intruments est toujours nécessaires même quand on a une culture mixte
90
La biodiversité des microorganismes dans l'environnement est énorme, comment faire pour avoir une culture pure?
Par méthodes d'enrichissement, j'augmente la population du microorganisme qui m'interresse pour pouvoir le cultiver
91
Différentes méthodes d'enrichissement?
- Chimique
- Physique
- Biologique
92
Facteurs qui déterminent si la stérilisation par la chaleur est efficace?
- La température
- Durée
- Humidité
- Nombre et état des organismes
93
But d'une culture pure?
Avoir un population uniforme, tous les individus ont les mêmes caractéristique
94
Caulobacter
Oligotrophe, survie même si la [nutriments] est base
95
Enrichissement chimique, les sous catégorie?
- Ajout
- Dilution
- Substances inhibitrices
96
Enrichissement chimique par dilution?
Caulobacter, page 3
97
Enrichissement chimique par substance inhibitrices?
- Violet cri. et vert bri. : inhibe la croissance des Gr+
- Alcool phénylthylique : inhine la croissance des Gr-
- Sel biliaire : inhibe la croissance des bactéries qui n'ont pas évolué dans l'intestin
- MacConkey
page 3,4
98
MacConkey
- Violet de cri. (éliminer les bactéries Gr+)
- Sels biliaires (éliminé tous sauf les bactéries intestinales)
- Indicateur de pH (parce que les bactéries qui indiquent la présence de polution fécale utilise acidifie le milieu)
- Lactose (parce que les bactéries qui indiquent la présence de polution fécale utilise le lactose)
But : mettre en évidences les bactéries intestinales présentent dans le milieu
page 4
