Begrepp 2-DNA Fingeravtryck och gelelektrofores & PCR

Question 1

DNA-fingeravtryck

Answer 1

Unik DNA-profil skapad genom analys av repetitiva sekvenser.

Question 2

PCR (Polymerase Chain Reaction)

Answer 2

Teknik för att amplifiera DNA genom upprepade cykler.

Question 3

Gelelektrofores

Answer 3

Metod för att separera DNA-fragment baserat på storlek.

Question 4

Restriktionsenzym

Answer 4

Enzym som klipper DNA vid specifika sekvenser.

Question 5

Agarosgel

Answer 5

Porös gel som används för att separera DNA vid elektrofores

Question 6

DNA-laddningsfärg

Answer 6

Färgämne som används för att visualisera DNA i gel.

Question 7

Elektroforesbuffert

Answer 7

Vätska som leder ström och stabiliserar pH vid elektrofores.

Question 8

Termocykler

Answer 8

Upprepade temperaturväxlingar under PCR-amplifiering.

Question 9

Primer

Answer 9

Korta DNA-sekvenser som binder specifika målsekvenser i PCR.

Question 10

VNTR (Variable Number Tandem Repeats)

Answer 10

DNA-segment med upprepade sekvenser som varierar mellan individer.

Question 11

STR (Short Tandem Repeats)

Answer 11

Korta sekvenser av DNA som består av 2-5 baspar som upprepas flera gånger i rad. Dessa upprepningar varierar mellan individer och används ofta i genetiska analyser och identifiering.

Question 12

DNA-stege (Molekylviktmarkör)

Answer 12

Standard-DNA-fragment med kända storlekar för jämförelse.

Question 13

Denaturering (PCR)

Answer 13

Uppvärmning som bryter vätebindningar och separerar DNA-strängar.

Question 14

Annealing (PCR)

Answer 14

Nedkylning så att primers kan binda till enkelsträngat DNA.

Question 15

Vektor

Answer 15

En vektor är ett DNA-molekyl som används för att introducera genetiskt material i en cell, ofta använt i genetisk modifiering eller kloning.

Question 16

Realtids PCR

Answer 16

Realtids PCR (qPCR) är en teknik som möjliggör mätning av mängden DNA eller RNA i realtid under amplifikationen, vilket gör det möjligt att kvantifiera genetiskt material.

Question 17

6500 bp

Answer 17

Ett DNA-fragment på 6500 baspar (bp) är vanligt vid amplifikation av en gen i homozygota individer, där båda allelerna ger samma fragmentstorlek.

Question 18

2500 bp + 4000 bp

Answer 18

Vid heterozygot genotyp (Dd) kan två olika fragment, ett på 2500 bp och ett på 4000 bp, bildas som resultat av DNA-digestion.

Question 19

6500 bp + 4000 bp + 2500 bp

Answer 19

En heterozygot individ (Dd) kan ha tre olika fragmentstorlekar (6500 bp, 4000 bp och 2500 bp) när båda allelerna amplificeras, vilket ger olika resultat för varje allel.

Question 20

Termostabilt polymeras

Answer 20

DNA-polymeras som kan stå emot höga temperaturer, t.ex. Taq-polymeras.

Question 21

Cykel

Answer 21

En upprepning av denaturering, annealing och elongering i PCR-processen för att amplificera DNA.

Question 22

Amplifikation

Answer 22

Den process där DNA mängden ökar exponentiellt genom upprepade cykler av PCR.

Question 23

Mål-DNA

Answer 23

Den specifika DNA-sekvens som man vill amplificera under PCR.

Question 24

Elektroforesbuffert

Answer 24

En lösning som används för att upprätthålla rätt pH och jonstyrka under elektroforesen och för att leda strömmen.

Question 25

Laddningsbuffert

Answer 25

En lösning som blandas med DNA-prover innan de laddas i gelen för att ge proverna rätt densitet och färg för visualisering.

Question 26

Små fragment

Answer 26

DNA- eller RNA-sekvenser som rör sig snabbare genom gelen under elektrofores, då de är mindre i storlek.

Question 27

Stora fragment

Answer 27

DNA- eller RNA-sekvenser som rör sig långsammare genom gelen eftersom de är större i storlek.

Question 28

UV-visualisering

Answer 28

En teknik som använder UV-ljus för att visualisera fluorescerande DNA-färger efter elektrofores.

Question 29

Protein-elektrofores

Answer 29

typ av elektrofores som separerar proteiner istället för nukleinsyror baserat på storlek och laddning.

Question 30

RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)

Answer 30

En metod för att analysera variationer i DNA-längd genom att använda restriktionsenzymer, en viktig teknik i DNA-fingeravtryck.

Question 31

DNA-profil

Answer 31

En unik uppsättning av DNA-mönster som identifierar en individ, ofta skapad genom RFLP eller STR.

Question 32

Släktskapsbestämning

Answer 32

Processen att fastställa genetiska relationer mellan individer, där DNA-fingeravtryck används för att jämföra familjemedlemmar.

Question 33

Magnesiumjoner (Mg²⁺)

Answer 33

Kofaktor i PCR som stabiliserar DNA-strängarna och underlättar enzymaktiviteten.

Question 34

PCR-reaktion

Answer 34

Magnesiumjoner är nödvändiga för DNA-polymeras att syntetisera nya DNA-strängar under cyklerna av PCR.

Question 35

Magnesiumkoncentration

Answer 35

En optimal koncentration av magnesiumjoner krävs för att kontrollera PCR-effektiviteten och specificiteten.

Question 36

Stabilisering av primerbindning:

Answer 36

Magnesiumjoner bidrar till att primrar binder korrekt till mål-DNA under uppvärmning i PCR.

Question 37

Probe

Answer 37

En kort, märkta DNA- eller RNA-sekvens som används för att specifikt binda till ett mål-DNA i PCR för detektion eller kvantifiering.

Question 38

94°C

Answer 38

Den temperatur vid vilken DNA denatureras under PCR, vilket innebär att dubbelsträngat DNA separeras till enkla strängar.

Question 39

53°C

Answer 39

Annealingtemperaturen i PCR, där primrar binder till den komplementära DNA-sekvensen.

Question 40

72°C

Answer 40

Temperaturen där DNA-polymeras, som Taq-polymeras, syntetiserar nya DNA-strängar under förlängningsfasen i PCR.

Question 41

Taq-polymeras

Answer 41

Ett värmestabilt DNA-polymeras som hämtas från bakterien Thermus aquaticus och används i PCR för att syntetisera DNA vid höga temperaturer.

Question 42

32P

Answer 42

En radioaktiv isotop av fosfor som används för att märka probes för att möjliggöra detektion av DNA eller RNA i experiment.

Question 43

Fluorescensprobe

Answer 43

En probe märkt med en fluorescerande molekyl som används för att detektera specifika DNA- eller RNA-sekvenser genom fluorescens vid excitation.

Question 44

Hybridisering

Answer 44

Processen där en probe binder till en komplementär sekvens på mål-DNA eller RNA för detektion.

Question 45

Märkning

Answer 45

Att binda en detektionssignal, som radioaktivitet eller fluorescens, till en probe för att göra den spårbar i experiment.

Question 46

FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer)

Answer 46

En teknik som används för att mäta när två fluorescerande molekyler är nära varandra, vanligt i realtids-PCR för att detektera DNA-amplifiering.

Question 47

Molekylär sond

Answer 47

Ett annat namn för probe, ofta använd för att referera till korta sekvenser som binder till mål-DNA/RNA för analys.

Question 48

TaqMan-probe

Answer 48

En specifik typ av fluorescerande probe som används i realtids-PCR för att kvantifiera DNA genom att mäta ljusutsläpp vid varje cykel.