BIDI Flashcards
BIDI luennot 1-13 (29 cards)
Prediktiivinen vs prognostinen biomarkkeri
Prognostinen biomarkkeri: Kuvaavat sairauden etenemistä, riippumaton lääkityksestä.
Prediktiivinen biomarkkeri: Lääkityksen ennustettu reaktio.
Ideaalinen biomarkkeri
- Helposti mitattavissa/saatavilla. (virtsasta, kuvantaminen ym)
- Halpa testaus
- Ilmentyminen riippuvainen sairauden tilasta.
- Löytyy korrelaatiota kliinisestä lopputuloksesta
- Sensitiivinen ja spesifinen.
Sensitiivisyys vs spesifisyys
+Vaikuttavia tekijöitä?
-Sensitiivisyys eli todellisten positiivisten määrä.
+Montako sairasta ihmistä tunnistetaan oikein sairaaksi.
-Spesifisyys eli todellisten negatiivisten määrä.
+Montako tervettä ihmistä tunnistetaan oikein terveeksi.
Molemmissa vaikuttavia tekijöitä:
- Näytteen tyyppi (kudos vs bioneste)
- Näytteen stabiilisuus ja käsittelyaika analyyseissä
- Negatiivisten kontrollien asianmukainen käyttö
- Potilaan taustatiedot
Lisää sensitiivisyys vs spesifisyys kysymyksestä: ROC-käyrä
Antaa havainnollisen ja tarkan kuvan biomarkkerin luokkittelukyvystä.
ROC-käyrän AUC=Area Under Curve
Sensitiivisyys y-akselilla, 1-spesifisyys x-akselilla.
(y= true positive rate, x = false positive rate)
Suurempi AUC=parempi
Alzheimerin taudille (AT) altistavia ja suojaavia tekijöitä
- Korkea ikä
- Dementia lähisuvussa
- Downin syndrooma
- APOE4-alleeli
- Geenivirheet (APP, PSEN1/2)
- Sydän/verisuonitaudit
- Matala koulutus
\+Koulutus \+Vireys(harrastukset) \+Liikunta \+Ravintotekijät \+Antioksidantit \+Statiinit \+Tulehduskipulääkkeet \+Estrogeeni \+APOE2-alleeli \+APP A673T-alleeli
Amyloidihypoteesin vaiheet
1) A-beta oligomerisaatio/kasaantuminen
2) Inflammaatio, oksidatiivinen stressi
3) Tau-kimput
4) Neurodegeneraatio
Tutkimustyökaluja Alzheimer taudissa
- Rakenteellinen magneettikuvaus, tutkitaan aivoatrofiaa.
- Beta-amyloidiplakkien kuvantaminen PET:illa (keskeinen työkalu AT:ssa!!)
- Aivo-selkäydinnesteen(CSF) A-beta42 ja tauproteiinitasot.
Milloin kannattaa lääkeainepitoisuuksia määrittää?
Lääkekohtaiset syyt ja edellytykset:
– Kapea terapeuttinen leveys/alue
– Kliininen vaste vaikea mitata tai tulee viiveellä
– Lääkevaste tai toksisuus korreloivat seerumin lääkeainepitoisuuteen
– Jos korkeat lääkeainepitoisuudet voivat aiheuttaa vakavia haittavaikutuksia
Potilaskohtaiset pitoisuusmittausten syyt:
– Hoidon seuranta
– Lääkeaineen tehoon vaikuttaa toinen sairaus/fysiologinen tila/muu lääkitys
– Potilas poikkeuksellisen herkkä tai resistentti lääkehoidolle
– Toksiset oireet sekoitetaan helposti sairauden oireisiin
– Myrkytyksissä
– Epäillään huonoa hoitomyöntyvyyttä tai väärinkäyttöä
– Oikeuslääketieteelliset syyt
Lääkeaineiden määritysmenetelmiä
=Immunokemialliset määritysmenetelmät:
+Nopea, tehokas ja automaattinen.
=Nestekromatografia (HPLC)
+Lääkkeet, joille ei immunologista +menetelmää.
+Spesifiset ja tarkat menetelmät.
-vaatii käsityötä
-ei päivystysanalytiikkaa (hidas)
=Massaspektrometria
+erinomainen spesifisyys/sensitiivisyys
+Useita analyyttejä samasta näyteajosta
+Hyvä pienille yhdisteille
- Käsityötä
- Kallis
Näytteenkulku laboratoriossa
Potilas-> Näytteenotto-> Näyte ja lähete -> Mikrobiologian laboratorio jossa -> Suoraosoitus/viljely/vasta-ainemääritys-> Vastaus (lääkärille)-> Hoidonvalinta-> Potilas->...
Bakteriologian menetelmiä
Bakteerivärjäys, varsinkin Gram
Viljely-> bakteerin nimi ja mikrobilääkeherkkyydet
+Normaalifloora = iho, limakalvot
+Steriili = kaikki “muut” alueet
Aerobit/anaerobit/fakultatiiviset anaerobit
Sokerifermentaatiotesti
DNA-sekvensointi
Tulehdus: akuutti vaihe
Reaktiot pyrkivät tuhoamaan taudinaiheuttajan ja rajaamaan infektiota.
Makrofagit,
Sytokiiniaktivaatio(kuume) -> varsinkin interleukiinit
Hyytymiskaskaatio(fibrinogeeni lisääntyy)
Tulehdusmarkkerit
Leukosyytit: Leukosytoosi, eli valkosoluja vapautuu ja tuotanto lisääntyy, varsinkin neutrofiilit
(Tutkimus: B-PVK-T tai fB-Leuk)
Lasko: mitataan matkaa, jonka antikoaguloitu veri laskeutuu pystysuorassa putkessa tunnin aikana.
CRP: C-reaktiivinen proteiini (!!!)
- Maksan tuottama akuutin vaiheen proteiini
- Kiinnittyy kudosvauriossa paljastuviin fosfolipideihin
- Sitoutuu myös fagosytoiviin soluihin
- Anti-inflammatoriset vaikutukset
Eli: Kuvastaa infektion invasiivisuutta, kudostuhoa, tulehdussolujen toimintaa
-Epäspesifinen, mutta yleensä korkeampi bakteeriinfektiossa kuin virusinfektiossa.
Etuja/haittoja:
+ Verrattuna laskoon: halvempi, nousee ja laskee nopeasti.
- ei kerro missä tulehdus on tai aiheuttaja
- Myös traumoissa tai maligniteettien yhteydessä
Prokalsitoniini:
- Nousee bakteeri-infektiossa, varsinkin gram negatiivisten.
- Nopea nousu.
- Varsinkin sepsispotilailla käytössä
- CRP mahdollisesti parempi vaihtoehto
Kalprotektiini:
- Tulehdukselliset suolistosairaudet (esim Chronin tauti).
- Pitoisuus liittyy todettuun taudin aktiviteetin tasoon
- Ulostenäyte, ELISA-menetelmä
NB! Paikallinen tulehdus = paikallinen näyte
Paljon epäspesifejä tekijöitä jotka nostavat tai laskevat tuloksia!
Paikallinen tulehdus ei välttämättä nosta arvoja!!
Veren rasvat.
Ateroskleroosin aiheuttajia
Ateroskleroosia aiheuttavia.
Yleiskolesteroli tavoite:
fP kolesteroli <5mmol/l
LDL: “paha kolesteroli”, <3mmol/l
HDL: “hyvä kolesteroli” >1.0-1.2mmol/l
Triglyseridit: fP Trig <1.7mmol/l
Dyslipidemia, jos poikkeus em. viitearvioista.
Pohdi mekanismeja/rakennetta taudissa!
Troponiini ja Kreatiinikinaasi
Sydäninfarkti
Sepelvaltimotauti
Hapenpuute->soluvaurio->merkkiaineet vuotaa.
Troponiini-T kohoa 3-4h kuluttua infarktin oireiden alkamisesta:
nousu tarkoittaa infarktia jos kahden näytteen välillä eroja.
Tarvitaan myös muita diagnostisia menetelmiä, kuten EKG:n muutokset
Kreatiinikinaasi vapautuu nopeasti verenkiertoon kudosvauriossa. Löytyy paljon sydänlihaksessa, vähän tavallisissa.
Sydämen vajaatoiminnan markkerit
BNP: B-tyypin Natriureettinen peptidi
- Normaali (<125ng/l)
- Vajaatoiminnassa (>2000ng/l)
Myös NT-proBNP
Diagnoosissa tarvitaan muita varmennuksia.
Merkkiaineet syövässä yleisesti.
Määritystä voidaan käyttää diagnostiikassa, hoidon seurannassa, ennusteen arvioinnissa.
Ero enemmän kvantitatiivinen kuin kvalitatiivinen: lisääntynyt markkerin tuotanto syöpäsolussa.
“Täydellinen kasvainmerkkiaine”
- Mahdollisiman sensitiivinen: Ei havattaisi ei-syöpä tilassa)
- Mahdollisiman spesifinen: Ainoastaan yhdenlaisen kasvaintyypin yhteydessä.
- Suuri analyyttinen sensitiivisyys: riittävästi aikaa sairauden luonnollisen kulun muuttamiseen
- Prognostiset ja prediktiiviset käyttöarvot
- Lyhyt puoliintumisaika
- Yksinkertainen ja halpa testi
- Helposti saatavat näytteet.
Syövän merkkiaineet A: syövälle ominaiset antigeenit
-Syöpäsolu tuottaa enemmän kuin normaali solu.
Ei ole syöpäspesifinen. Eli löytyy myös muista soluista.
Esimerkkejä: CEA,AFP,CA125
Usein pintaproteiinien muutoksia.
Syövän merkkiaineet B: Elinspesifiset antigeenit
Voivat olla erittäin hyviä kasvainmerkkiaineita.
- Eivät pääse verenkiertoon normaalikudoksesta.
- Erittyy vereen jos kasvain häiritsee kudosrakennetta.
Esim. hCG ja PSA
Poikkeukset hormonituotannossa liittyvät usein syöpään.
Syövän merkkiaineet C: Reaktiotuotteet
Invaasio ja etäpesäkkeet aiheuttavat reaktioita, esim. lymfosyyttiaktivaatio.
- Proteiinifragmentit
- Verenvuodot syöpäinvaasion seurauksena (esim ulosteessa)
Laajemassa mielessä voidaan käyttää esim: P-CRP, B-Hb, B-La testejä
Reaktiot EIVÄT ole syöpäspesifisiä
Kasvainmerkkiaineen pitoisuus: vaikuttavia tekijöitä ja kasvaimesta riippuvat tekijät
Ikä, kuukautiskierto, munuaistoiminta, maksan toiminta, tulehdustaudit
- Merkkiaineen pitoisuus riippuu kasvaimen koosta.
- Heterogeenisessa populaatiossa merkkiaineen tuotanto voi muuttua.
- Merkkiaineiden tuotanto vähenee jos solujen erilaistuminen taantuu
- Merkkiaineiden pääsy verenkiertoon voi lisääntyä.
Karsinoembryonaalinen antigeeni (CEA)
- Paksu- ja peräsuolen syövät
- Mahdollisia virheellisiä positiivisia eri tulehdustiloissa.
- Tupakointin nostaa arvoja
- Tuloksissa vaihtelua. Eri muotoja.
Alfa-1-fetoproteiini (AFP)
Lapsilla korkea seerumitaso joka alenee ensimmäisten ikävuosien aikana.
-Aikuisella pieniä määriä maksasta.
- Seerumitasot voivat nousta maksasyövissä ja kivessyövissä.
- Virhelähteitä ovat maksasairaudet.
