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Bio Mol 2 Flashcards

(88 cards)

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1
Q

Vrai ou faux.Les cellules eucaryotes n’ont que 2 copies de chaque chromosomes.

A

Faux. ( mais majorité oui - diploides) Ovule et sperm haploides et mégacaryocytes polyploides (28 copies de chaque chromo!)

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2
Q

Vrai ou faux.Les plasmides font partie du génome des bactéries.

A

Faux

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3
Q

Vrai ou faux. Les cell. Procaryotes ont généralement 1 copie de leur chromosomes

A

Vrai

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4
Q

Vrai ou faux. La taille du génome n’a rien à vour avec la complexité de l’organisme.

A

Faux, corrélé mais pas parfaitement

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5
Q

Vrai ou faux. La nombre de gènes est plus représentatif que la taille du génome pour déterminer la complexité d’un organisme.

A

Vrai.

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6
Q

Vrai ou faux. La densité des gènes est la même pour les procaryotes.

A

Faux, varie selon les organismes

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7
Q

Vrai ou faix. La densité des gènes de singes est plus élevée que celle d’E. Coli., puisqu’il y a plus de gènes codant.

A

Faux! La densité des gènes diminue avec la complexité des organismes

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8
Q

Pourquoi la densité des gènes diminue chez les eucaryotes?

A
  • augmentation de la taille des gènes à cause des introns

- augmentation des séquences intergéniques

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9
Q

Comment enlève-t-on les introns?

A

Épissage

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10
Q

Vrai ou faux. Les introns sont la séquences non codante d’un gène tandis que les extrons sont la séquence codante d’un gène.

A

Faux. Exons

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11
Q

Quel est le role des introns?

A

Influ sur l’expression génique

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12
Q

Vrai ou faux. Les séquences intergéniques constituent la majorité des gènes humains.

A

Faux. De l’adn humain.

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13
Q

Quelle est la fonction des séquences intergéniques?

A

Aucune

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14
Q

Vrai ou faux. On parle de répétition dispersée lorsqu’une sequence unique ou des regroupements de séquences sont répétés plus de 50 fois.

A

Faux. Plus de 100fois, parfois 1000

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15
Q

Vrai ou faux. L’adn microsatellite et moins présent (3% du genome) que les répétitions dispersées(44% ).

A

Vrai

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16
Q

Comment obtient on des adn microsatellites?

A

Erreur de replication de l’adn

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17
Q

Combien est le max de pb répétées dans l’adn pour qu’on ait un adn microsatellite?

A

En dessous de 13 pb répétées ; generalement repetitions de dinucléotides (CACACA)

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18
Q

Voici une sequence données: AGAGAGAGAGAG. De quel type de séquences s’agit il?

A

Microsatellite

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19
Q

Qu’est-ce qui différencie un pseudogène d’un gène?

A

Pseudogène est un gène sans intron donc non fonctionnel car pas de sequences de regulation les précèdent

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20
Q

Vrai ou faux. Les origines de réplications se trouvent généralement dans les regions. Non codante.

A

Vrai

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21
Q

Vrai ou faux. Les origines de réplications se trouvent à chaque 30-40 kb le long de tous les chromosomes des procaryotes et des eucaryotes.

A

Faux. Bactérie 1 unique site

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22
Q

Qu’est-ce que l’origine de réplication?

A

Site d’assemblage de la machinerie de la réplication de l’adn

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23
Q

Qu’est-ce qu’un centromère?

A

Site d’assemblage des kinétochores (lors de la division cell)

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24
Q

Qu’est-ce que les télomères?

A

Séquences de trouvant aux extrémités de chaque chromosome linéaire

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25
Vrai ou faux. Les telomères agissent comme origines de réplication.
Vrai. Permette a la telomerase de copier la fin des chromosomes
26
Vrai ou faux. La télomérase est une ADN polymérase.
Vrai, mais particulière
27
À quoi servent les protéines télomériques?
Identifient la fin des chromosomes (telomère) et empechent leur degradation ou recombinaison
28
Vrai ou faux. Il est possible d’avoir plusieurs centromères sur un chromosomes.
Faux. 1 seul. L’adn se briserait
29
Qu’arriverait-il aux chromosomes s’il n’y avait pas de centromère?
Ils se repartiraient au hasard dans les cell filles.
30
Nommez 3 exemples de compositions d’un centromère.
- séquences non repetitives uniquement - melange séquences non repetitives et repetitives - séquences repetitives uniquement (ex humains et drosophiles)
31
Vrai ou faux. La taille et la conposition des centromères varie en fonction des organismes.
Vrai.
32
Vrai ou faux. Les telomeres sont constitués d’une sequences repetitive riche en T et A.
Faux. T et G
33
Vrai ou faux. Les telomères est un simple brin.
Faux. Une portion est en simple brin.
34
De quoi est composé un nucléosome?
8 protéines histones et adn de coeur ( enroulé 1,65 fois)
35
Vrai ou faux. Tous les segments d’adn sont associés à des protéines.
Vrai. Soit histones ou protéines non histones quk regulent l’expression genique, replication, recombinaison
36
Vrai ou faux. | La majorité de l’adn est dans les nucléosomes.
Vrai
37
Comment est nommé l’adn qui relie deux nucleosomes?
Adn de liaison ou adn linker
38
Le nucléosome correspond à quel niveau de compaction de l’adn?
1 er
39
Vrai ou faux. Les eucaryotes ont une taille semblable d’adn de liaison?
Faux. Chaque organisme à une taille propre d’adn de liaison
40
Vrai ou faux. L’adn polymérase est la protéine associée à l’adn la plus abondante.
Faux. C’est les histones.
41
Quels sont les 4 histones de coeurs ?
H2A, H2B, H3, H4
42
Quelle est l’histone de liaison?
H1
43
Quels résidus(a.a) sont les plus importants dans les histones?
Arginines et lysines (chargés positivement (donc interagit avec adn negatif (phosphate)))
44
Qu’est-ce qui permet au histones d’interagir avec l’adn?
Les histones contiennent beaucoup de charges positives (adn negatif)
45
Vrai ou faux. Les histones s’associent ensemble en octomère et l’adn s’attache par la suite.
Faux. L’adn est necessaire a l’assemblage complet du coeur du nucléosome. 1. Tetramere H3•H4 se lie à l’adn 2. 2 dimeres H2A•H2B se joignent au complexe
46
Comment sait-on que les queues N-terminales des histones ne sont pas necessaires à l’association avec l’adn?
Digestion des queues par la trypsine montre que le nucléosome est quand meme viable (mais elles ont d’autres roles!)
47
Vrai ou faux. Le nucléosome est parfaitement symétrique, l’axe de symétrie est appelé axe dyade
Faux. Pas parfaitement. Pseudo axe de symetrie
48
Quel histone de coeur se lie aux extrémités de l’adn?
H3
49
Comment les histones H3 lie l’extrémité des adn de coeur?
La région histone-fold forme une 4e hélice alpha capable de se lier aux 13 pb terminales (région amino-terminale de l’adn) (pas certain)
50
Combien y a t-il de sites de contacte entre l’adn et les histones?
14 (1 site pour chaque fois qu’un sillon mineur fait face à l’ocatamère d’histones)
51
Combien y a t-il de ponts H entre l’adn et les histones?
40 (se forment entre les histones et l’atome d’oxygène des liaisons phosphodiester près des sillons mineurs ; seulement 7 pont H avec b.a)
52
Qu’est-ce qui permet la courbure de l’adn sur les histones?
- nombre important de pont H (40) | - protéines basique (+) masque les charge - des gr. Phosphate
53
Quel type de liaison retrouve t on entre les histones et l’adn?
Pont H ET liaison ionique (avec phosphate (- +)
54
Qu’est ce qui engendre le surenroulement negatif chez les procaryotes?
Adn gyrase ; surenroulement positif par adn gyrase inverse
55
Quel type de liaison retrouve t on entre les queues des histones et l’adn?
Pont H
56
Vrai ou faux. Les queues des histones H3 et H4 emergent au dessus et en dessous des helices d’adn.
Faux. H2A et H4
57
Vrai ou faux. Les queues des histones H3 et H2B emergent au dessus et en dessous des helices d’adn.
Faux. Emergent autour de l’ocatamère
58
Quel est le role des queues des histones?
Dirigent l’enroulement de l’adn autour de l’octamere (supertour toroidaux negatif)
59
Pourquoi les nucleosomes stabilise l’adn?
Surenroulement negatif , reduit tension (diminue Lk)
60
Vrai ou faux. Le surenroulement negatif de l’adn circulaire stabilise celui-ci en diminuant le Lk.
Faux. Le Lk global de l’adn circulaire demeure le même( adn linker doit compenser en augmentant le Lk -> seul la topoisomerase peut relacher l’adn c)
61
Vrai ou faux. La topoisomerase est necessaire pour ajouter un nucleosome à de l’adn circulaire.
Vrai. Car seul facon de changer Lk
62
Pourquoi l’enroulement engendré par un nucléosome sur l’adn observé est de -1,2 alors qu’il est surenroulé de -1,65?
À cause que le nombre de paires de bases par tour de l’adn associé au nucléosome est reduit à 10,2 au lieu de 10,5 (plus enroulé, augmente Lk)
63
Vrai ou faux. L’histone H1 s’associe à l’ADN linker à l’extrémité du nucléosome et à l’octomère de coeur.
Faux. Et à l’ADN de l’hélice centrale
64
Qu’est-ce que H1 provoque?
- entoure 20 pb de plus autour du nucléosome - change l’angle d’entré ou de sortie de l’adn dans le nucléosome - permet la formation de la fibre 30 nm
65
Vrai ou faux. Il y a deux H1 par nucléosome (un à l’entré et à la sortie de ladn).
Faux. Seulement un H1 par nucléosome.
66
Vrai ou faux. L’histone H1 permet à l’adn d’être plus accessible au protéines.
Faux. Elle met l’adn plus compacte, donc moins accessible.
67
Quels sont les deux modeles de la fibres 30 nm?
Solénoïde (adn linker encercle l’axe longitudinale) Zig-zag (forme plus compacte, nucléosome disposé en zigzag, adn linker traverse axe longitu., favorisé par adn linker plus long)
68
De combien de fois la fibre de 30 nm permet de compacter l’adn?
40fois
69
Qu’est-ce que fait les queues des histones dans la formation de la fibre 30 nm?
Stabilise la structure en etablissant des liens entre differents histones (ex; H4 avec H2A)
70
Vrai ou faux. La fibre de 30 nm peut se former quand même si les histones n’ont pas de queues.
Faux. Peut pas
71
L’armature centrale du niveau supérieur de l’enroulement de l’adn est composé de quoi?
- Topoisomerase 2 | - Protéines SMC (maintenance structurelle des chromosomes)
72
À quoi sert la topoisomerase 2 dans l’armature du niveau superieur d’enroulement de l’adn?
Si une boucle isolé éjecte nucléosome (pour pouvoir avoir acces aux infos par exemple), augmente Lk, tension, doit relacher donc topo à chaque boucle
73
À quoi servent les protéines de l’armature centrale du niveau supérieur d’enroulement de l’adn?
Organisation des fibres de 30nm en boucle Maintient de la base des boucles Maintient les boucles isolées les unes des autres
74
Vrai ou faux. Les bouts des boucles de niveaux supérieurs sont plus propices à l’expression génique?
Vrai. Bout des boucles: fibre de 10nm, plus facile à derouler
75
Qu’est-ce qui différencie H2A.X de H2A?
H2A.X possède un résidu de sérine
76
Vrai ou faux. L’intersction de l’adn avec l’octamère d’histones est dynamique.
Vrai.
77
Qu’est-ce qu’un complexe de remodelage des nucléosomes?
Con’mexes protéiques facilitant le deplacement des nucléosomes en utilisant l’atp
78
Quels sont les 3 types de changements produits par les complexes de remodelage des nucléosomes?
Glissement de l’adn Transfert de nucleosomes d’une helice à une autres Échange du dimère H2A/H2B par H2A.X/H2B
79
Vrai ou faux. Certaines séquences d’adn ont une affinité plus grande pour les nucléosomes.
Vrai. A:T a tendance à se courber vers le sillon mineur G:C à tendance à faire courber le sillon mineur dans le sens opposé = plus facile de courber dans un certain sens donc plus facile pour l’histone
80
Vrai ou faux. Les queues N-terminales des gistones sont fréquemment modifiées .
Vrai
81
Quelles sont les conséquences associées à la modification des queues d’histones?
- favorise l’expression génique - inhibe l’expression génique - marque les histones nouvellement synthétisées
82
Vrai ou faux. Le queues d’histones non-modifiées ou méthylées s’associent plus fermement à l’adn des nucléosomes que les queues d’histobes acétylées.
Vrai
83
Vrai ou faux. L’acérylation et la phophorylation des queues d’histones favorisent l’expression génique.
Vrai car acé et phospho neutralise charge positives ce qui diminue leur affinité avec l’adn
84
Vrai ou faux. Après une division cellulaire, les nucléosomes sont créés à des endroits aléatoires des nouveaux adn.
Faux. Ont tendance à s’associer au même endroit que l’adn mere (entre autres grace au dimere H3H4 qui demeure associé à l’un des adn fils)
85
Vrai ou faux. Après réplication cellulaire, l’octomère des nucléosomes sont réformés à partir de vieux et de nouveaux monomères.
Faux. Les tétramères H3•H4 et les dimères H2A et H2B ne sont pas mélangés (soit neuf soit vieux)
86
Vrai ou faux. Pendant la réplication, Les dimères H2A•H2B reste accroché à l’adn étant plus petit et les tetramères H3•H4 sont relachés, servant à l’assemblage de nouveaux nucléosomes.
Faux. H3H4 demeure associé (au hazard sur l’un des brins) et H2AH2B sont relaché
87
Vrai ou faux. Au moins 50% des histones sont nouveaux après une réplication cellulaire et ceux-ci sont répartis aléatoirement sur chaque chromosome.
Vrai
88
Quel est le rôle des chaperonnes d’histones(prot chargé -)?
Empêchent les histones de s’associer à l’adn de manière non productive en formant un complexe avec un dimère h3.h4 ou h2a.h2b

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