Bio mol 3 Flashcards
(100 cards)
1
Q
Quels sont les substrats nécessaires à la synthèse de l’ADN
A
2 substrats principaux:
- dATP,dCTP,dGTP,dTTP
- Une amorce
2
Q
Vrai ou faux.La synthèse s’effectue par
extension de l’extrémité 5’ d’une
amorce.
A
Faux. 3’
3
Q
Vrai ou faux. La synthèse de l’ADN est endothermique, c’est-à-dire qu’elle nécessite de l’énergie pour se former.
A
Faux. Exothermique, libère de l’énergie. Donc la synthèse est favorisée.
4
Q
Par quoi peut-on référer une ADN polymérase.
A
Main droite
5
Q
À quoi sert l’ADN polymérase?
A
Catalyse la synthèse de l’ADN
6
Q
Comment l’ADNp fait pour vérifier la formatoin correcr des paires de bases?
A
Vérifie le positionnement optimum de 3’-
OH de l’amorce et α-phosphate du
dNTP
7
Q
Quels sont les deux types de dNTPs marqués lors de l’expérience d’incorporation pour mesurer l’activité de l’ADNp.
A
dNTP radioactifs (au niveau de l’α-phosphate) dTTP fluorescents (remplacement d’un groupement méthyl)(Non impliqué dans le pairage des bases)
8
Q
Vrai ou faux. Si on allonge la chaine latérales des a.a discriminateur de l’ADNp, il serait plus possible d’ajouter des nucléotides d’ARN à l’ADN.
A
Faux. Si les chaines latérales étaient plus courtes. (Réduit l’ecombrement du 2’-OH du ribose)
9
Q
Vrai ou faux. Les ions Mg2+ et Zn2+ sert de catalyseur à la synthèse de l’ADN.
A
Vrai. Ion métallique A • Diminue l’affinité de 3’-OH pour sont hydrogène • Ion métallique B Coordination des charges négatives des phosphates β et γ
10
Q
Qu’est-ce que l’attachement du nucléotide
entrant correctement apparié
stimule concernant l’adnp?
A
- l’ouverture du domaine en
doigt
2.le déplacement de la
jonction amorce
11
Q
Qu’est que le domaine en doigts de l’adnp fait?
A
Lorsqu’une paire de bases correct est formée • Stimule la catalyse en rapprochant le nucléotide entrant avec les ions métalliques.
12
Q
À quoi sert la courbure de l’adn matriciel au niveau du site actif engendré par l’association au domaine en doigts?
A
( courbure d’environ 90° entre la 1ère base et la 2e base de l’ADN matriciel après l’amorce) -> sert à exposer seulement la 1 ère base après l’amorce et donc à éviter toute confusion sur la base de la matrice avec laquelle doit être associée le nucléotide entrant
13
Q
Quel est le type d’interaction entre le domaine
du pouce et l’armature de phosphate de l’ADN?
A
Interactions électrostatiques
14
Q
À quoi s’associe le domaine du pouce de l’adnp?
A
à l’ADN nouvellement
synthétisé
15
Q
À quoi sert le domaine du pouce de l’adnp?
A
maintient l’amorce et le site
actif dans une position correcte.
16
Q
Vrai ou faux? Le domaine en pouce sert à la catalyse de la réaction de la synthèse de l’aDN?
A
Faux.
17
Q
Vrai ou faux. Les interactions entre l’ADN
polymérase et l’ADN ne sont pas
séquences-spécifiques.
A
Vrai
18
Q
Vrai ou faux. La vitesse de la synthèse dépend
grandement du degré de processivité
A
Vrai
19
Q
Quelle est la différence entre l’adnp distributive vs l’adnp processive?
A
ADNp distributive ajoute 1 ou quelques nucléotides
a la fois tandis que l’adn p processive en ajoute plusierus avant de se détacher.
20
Q
Vrai ou faux. Les formes alternatives (tautomériques) des
bases azotées passent
inaperçues lors de la réplication
de l’ADN.
A
Vrai.
21
Q
Vrai ou faux. Les agents anticancéreux et antiviraux ciblent les cellules qui se divisent rarement pour stimuler la croissance.
A
Faux.
22
Q
Quels sont les 3 modes d’action des agents anticancéreux et antiviraux
A
• Inhibition de la synthèse des nucléotides • Arrêt de l’élongation après leur incorporation à l’ADN • Endommage l’ADN (= bloque la réplication)
23
Q
Lors de la Correction sur épreuves de l’ADN polymérase, l’activité de l’exonucléase pour l’extrémité 5’ du simple brin augmente.
A
Faux. 3’ qu’on ajjoute des bases!
24
Q
Vrai ou faux. Le mésappariement d’une paire de bases
au site actif de la synthèse déstabilise la
jonction amorce:matrice, engendrant
plusieurs paires de bases non appariées
A
Vrai
25
Qu'est que la primase fait?
synthétise une amorce d’ARN (5-10 nucléotides)
| sur l’ADN matriciel
26
Vrai ou faux. La primase synthétise l'amorce à n'importe quel endroit de l'adn sans préférence.
Faux. préfère synthétiser à un trimère particulier
27
Vrai ou faux. L’activité de la primase est grandement ↑ lorsque
celle-ci est associée à l’ADN hélicase.
Vrai. hélicase permet sépare les brins donc plus facile. (’ADNsb servant de matrice pour la primase)
28
Pourquoi est-ce important que L’activité de la primase est grandement ↑ lorsque
celle-ci est associée à l’ADN hélicase?
s’assure ainsi d’une activité de la primase seulement
| à la fourche de réplication
29
Vrai ou faux.L’amorce d’ARN doit être remplacée par une
séquence d’ADN pour compléter la réplication de
l’ADN
Vrai.
30
Vrai ou faux. La 5' exonuclease est nécessaire pour enlever toute l'amorce d'ARN.
Faux. Seulement le dernier nucléotides. (c'est la RNase H qui enleve la majorité des nocléotide de l'amorce d'aRN)
31
Vrai ou faux. L'ADN hélicase n'utilise pas d'ATP.
FAux.
32
Vrai ou faux. L'ADN hélicase est un octamère.
Faux. hexamère
33
Vrai ou faux. L'ADN hélicase va dans le sens 5' -> 3' sur la brin distcontinu
Vrai
34
Vrai ou faux. L'ADN hélicase est une enzyme processive.
Vrai
35
Comment sont associer l'ADN hélicase et l'adnsb?
Association des boucles en épingle
à cheveux des différentes s-u de
l’hélicase avec des les groupements
phosphates des nucléotides
36
Comment l'adn hélicase fonctionne?
Succession de changement de
conformation des s-u de l’hélicase
ont pour effet de tirer l’ADNsb dans
le canal central
37
Que font les protéines SSB?
```
Après le passage de l’hélicase, les
protéines SSB s’associent à l’ADNsb
pour empêcher la formation de
paires de bases d’ici à ce que l’ADN
pol l’utilise comme matrice pour la
synthèse du brin complémentaire
ou l’ARN primase pour la synthèse
d’une amorce
```
38
Vrai ou faux. L’association d’une protéine SSB avec
| l’ADNsb est une liaison coopérative.
```
Vrai : L’association d’une protéine SSB avec
l’ADNsb favorise la liaison d’une autre
protéine SSB directement à côté de la
1
ère
```
39
Vrai ou faux. l'association entre les prot SSB et l'ADNsb est séquence-dépendante.
Faux. indépendante
40
Vrai ou faux. Les intéractions entre les prot SSB et l'adnsb sont le fruit de plusieurs pont H.
Faux. sont de nature électrostatiques
| (presqu’aucune liaison H produites
41
Vrai ou faux. 1Lk doit être retiré à chaque ≈50
| pb d’ADN déroulé.
faux. 10 pb
42
```
Vrai ou faux. Ce sont les topoisomérases II qui
gardent l’ADN dans un état
relaxé en coupant les 2
brins de l’ADN,
ce qui permet de ↓ le Lk, avant
de ressouder les brins coupés.
```
Faux. topoisomérase 1 aussi.
43
Qu'est qu'un réplisome?
L'ensemble des protéines fonctionnant à la fourche de
| réplication.
44
Quelles sont les 4 manières des enzymes de lier l'adn à la fourche de réplication?
-Par les charges négatives des
groupements phosphates (ADN pol (pouce))
-Des liaisons H dans le sillon mineur (ADN pol (paume))
-Empilement d’interactions
hydrophobes avec les bases (Protéines SSB)
-Encercle l’ADN (ADN hélicase, ADN pol (partiellement))
45
Vrai ou faux. Les enzymes du réplisome lient tous l'adn de façon séquence-indépendante.
Vrai
46
Vrai ou faux. Il y a plus de type d'AdN polymérase chez les bactéries que chez les encaryotes.
Faux.Contraire.
47
Qu'est-ce que fait l'ADN pol III chez les bactéries?
Enzyme principale de la réplication de l'ADN.
48
Vrai ou faux. De manière générale, l'ADNpol avec des chiffre romains est associée au cellules eucaryotes alors que ceux avec des lettre grecs aux procaryotes.
Faux. Contraire.
49
Vrai ou faux. Chez les eucaryotes, l'ADN Pol
| δ, ADN Polε et ADN Polα/Primase sont essentiels à la réplication du génome.
Vrai
50
Que fait l'ADN pol 1?
– retire les amorces d’ARN
51
Que font les Pol II, IV et V?
– Réparation de l’ADN
52
Vrai ou faux. Lorsqu'une ADNp s'attache à l'ADN, elle fait sont travail jusqu'à ce qu'elle arrive à une autre fourche de réplication.
Faux, Il y a une alternance de la
polymérase en action lors de la
réplication de l’ADN. (plus brins discontinue pas rapport)
53
Vrai ou faux. L’ADN Pol α débute la réplication.
Vrai.faiblement processive
alors elle se détache. mais remplacée par l’ADN Pol δ (sur le
brin discontinu) et par l’ADN Pol
ε (sur le brin continu).
54
Vrai ou faux. Les protéines à pince
| coulissante se retrouvent seulement chez les procaryotes.
Faux, chez tous les organismes. (chez l'humain, trimère de PCNA)
55
À quoi servent les protéines à pince
| coulissante(anneau coulissant)?
sont responsables du haut
degré de processivité de l’ADN Pol.(se lient à l’ADN polymérase et
stabilisent celle-ci sur l’ADN)
56
Vrai ou faux. L’ATP est nécessaire au
chargement sur l’ADN
des anneaux coulissants
Vrai.
57
Vrai ou faux. Le retrait de anneau coulissant
| de l’ADN lorsqu’elle n’est plus requis requiert de l'aTP.
Faux. (mais nécessite le poseur d'anneau
| complexe protéiques
58
Est-ce possible qu'une ADN pol s'associe à un anneau coulissant avant que le poseur d'anneau soit parti?
Non, car L’ADN Pol et le poseur d’anneaux coulissants
ont des site de liaison à la pince coulissante
qui se chevauchent
59
Qu'est-ce qu'une holoenzyme?
```
un complexe
protéique avec une activité
enzymatique principale qui est
associée à des composantes
additionnelles améliorant sa
fonction.
```
60
Qu'est-ce qu'une holoenzyme contient?
4 enzymes.
-3 ADN pol III
- 1 protéine de chargement des
anneaux coulissants
61
Combien d'ADN polymérase réplique le brin discontinue?
2
62
Vrai ou faux. à la fourche de réplication chez Ecoli, L'ADN hélicase est associé au brin continu et voyage 5' vers 3'.
Faux. discontinue.
63
Vrai ou faux. L’association faible de la primase avec
l’hélicase ↑ son activité de synthèse
d’amorces par 1000X.
Vrai.
64
Vrai ou faux. Les poseurs d'anneau eucaryotes ne
semblent pas jouer toutes les fonctions de
ceux de E. coli.
Vrai
65
Vrai ou faux. l'adn pol s'attache à l'adn sb avant que l'anneau coulissant soit chargé.
Faux. Contraire. anneau avant. (après synthèse de l'amorce)
66
Pourquoi est-ce important que L’activité de l’ADN hélicase est augmentée par
son association avec l’ADN polymérase III?
L’ADN pol III peut rattraper
| l’hélicase si elle se bloque à un mésapariement de bases. (se dissocie et activité de l'hlicase diminue)
67
Vrai ou faux. Il y a un réplicon par origine de réplication.
Vrai.
68
L'origine de réplication est controlé par quoi?
Réplicateur et initiateur
69
Vrai ou faux. L’origine de la réplication ré-initie la réplication
avant la division de la cellule chez les eucaryotes en
croissance rapide.
Faux. chez ecoli.
70
Qu'est qu'Une réplication additionnelle d’une
| région d’un chromosome eucaryote engendre?
```
lésions à l'ADN difficile à réparer.La réparation des cassures résulte
souvent en une amplification de l’ADN
associé, ce qui peut ↑ de façon
inapproprié l’expression des gènes
associés.
```
71
Vrai ou faux. Les chromosomes eucaryotes sont et doivent être
répliqués une seule fois par cycle cellulaire.
Vrai.
72
Comment les cellules eucaryotes s'assurent de ne pas se répliquer plusieurs fois?
La réplication de l’ADN inactive les
| réplicateurs chez les eucaryotes
73
Quelles sont les 4 protéines nécessaires à la pose de l'hélicase sur l'ADN.
ORC-ATP
Cdc6-ATP
Cdt1
2 copies de l'hélicase (dimère)
74
Vrai ou faux. L'hélicase (Mcm2-7)est chargée lors de la phase S, après G1.
Faux. G1 (après S?)
75
Vrai ou faux. L' Activation du réplicateur (incluant
l’assemblage du réplisome et activation
de l’hélicase) se produit dans la phase S.
Vrai
76
Qu'est-ce qui active l'hélicasse?
CDK et DDK
77
Vrai ou faux. L'ADN pol δ et α/Primase sont recrutés
avant la séparation
des brins de l’ADN
Faux. Après
78
Vrai ou faux. ADN pol ε est recruté
avant la séparation
des brins de l’ADN.
Vrai
79
Qu'est-ce que la DDK fait pour activer l'hélicase.
phosphoryle Mcm-2-7(hélicase), favorisant
l’association de Cdc45 avec Mcm-2-7 (hélicase activé par complexe CMG (Cdc45 –
Mcm2-7 – GINS))
80
Qu'est-ce que la CDK fait pour activer l'hélicase.
phosphoryle Sld2 et Sld3 qui
s’associent alors avec Dpb11 (Favorise l’association de GINS et de Cdc45
avec Mcm2-7) (hélicase activé par complexe CMG (Cdc45 –
Mcm2-7 – GINS))
81
Qu'est-ce que le complexe CMG?
Complexe protéiques qui active l'hélicase (CMG (Cdc45 –
| Mcm2-7 – GINS))
82
Vrai ou faux. L’activation de l’hélicase altère l’interaction
entre les hélicases
Vrai.
83
Vrai ou faux. à la phase G1, le niveau de CDK est élevé, permettant le chargement de l'hélicase.
Faux. Faible (CDK inhibe le changement de l’hélicase sur
| l’ADN)
84
Comment CDK inhibe le chargement de l’hélicase sur
| l’ADN ?
```
En:
• Phosphorylant Orc2 et Orc6
-Bloque 1 site de liaison de Ctd1 de Orc6
-Les 2 sites de liaisons sont nécessaires
au chargement de Mcm2-7
• Phosphorylant Cdc6
-Engendre sa dégradation
• Phosphorylant Mcm2-7
-Exportation de Mcm2-7 soluble dans le
cytoplasme
```
85
V-F.à la phase S(et G2 et M), Niveau de CDK élevé, alors inhibition du
chargement de l’hélicase.
V. Activation de l'hélicase djà chargé.
86
En ordre, quelles sont les phases du cycle cellulaire?
G1,S,G2,M
87
Pourquoi le niveau de CDK au cours des phase S,G2 et M est élevé?
Inhibe la ré-initiation de la réplication
| de l’ADN
88
V-F. L’ADN linéaire doit être décaténé comme l'adn circulaire doit être décaténé par la
topoisomérase II suite à la réplication.
```
Vrai : • La taille importantes des
chromosomes linéaires
eucaryotes et leur organisation
en boucles attachées à une
armature protéique amène le
même problème rencontré pour
l’ADN circulaire et fait ainsi en
sorte qu’une décaténation soit
également requise
```
89
Quels sont les moyens de remédier aux problèmes de la réplication des extrémités de l'adn linéaire?
- utilisation d'une protéine amorce
| - Réplication des télomères par la télomérase
90
Généralement, Les télomères sont composés de quelles séquences?
répétitives d’ADN riche en TG
séquences répétitives d’ADN riche en TG
| humains: 5’-TTAGGG-3’
91
Le segment d'ADNsb des télomères est au dela de quelle extérmité?
3' plus grand que 5' (constitue une origine de réplication pour une ADN
polymérase spécialisée, la télomérase)
92
Qu'est-e que fait la télomérase?
Allonge l’extrémité 3’ de l’ADN à l’aide d’un court
segment d’ARN, partiellement répétée (1.5X),
complémentaire à la séquence du télomère
93
Qu'est que l'extension synthétisée par la télomérase permet de faire?
```
L’extension
synthétisée par
la télomérase
permet de
compléter la
réplication de
l’extrémité
```
94
L’élongation indéfinie des télomères est empêchée par quoi?
Par les protéines s'y lianbt. Ces prot ont aussi un role de:
- protection des télomères
- protège de l'action des enzymes de réparation de l'adn. (voudrai réparer les télomère, mais pas brisé)
- Régulation de la télomérase
95
Cdc13 se lie à quoi?
à l’ADNsb du télomère
| • impliqué dans le recrutement de la télomérase
96
V-F. Rif1 et 2 se lient indirectement au télomère
| via Rap1 que se lie à l’ADNdb du télomère
Vrai
| • Impliqués dans l’inhibition de la télomérase)
97
Vrai ou faux. Plus il y a de protéines liées aux
télomères, moins la télomérase est
active, jusqu’à être complètement
inhibée
Vrai (effet additif de l'inhibition)
98
Comment se nomme la boucle formée par les télomères?
boucle-t
99
Comment est formée la boucle-t?
par l’invasion de la séquence
d’ADNsb dans une région télomérique
bicaténaire
100
V-F. La boucle-t pourrait permettre un
| contrôle de la longueur du télomère
Vrai.
