biology of the cell2 Flashcards

Question

למה שייך 50 אחוז מסך כל הממברנות של התא האיאוקריוטי?

Answer 1

לממברנה של ה- er

Answer 2

החלל שנמצא ברשתית האנדופלסמתית

Answer 3

כ-10 אחוזים

Answer 4

תפקיד מרכזי בביוסינתזה של ליפידים וחלבונים אך גם אתר מרכזי לאגירת יוני סידן

Answer 5

הגולג'י הליזוזום האנדוזום ווסיקולות ההפרשה המיטוכונדריה הפירוקסיזום והממברנה הפלסמטית

Answer 6

- חלבונים שמיועדים לצאת החוצה מהתא - חלבונים שהם חלק מהליזוזום והאנדוזום - חלבוהים שהם חלק מהאי אר בעצמם

Answer 7

במרבית היונקים מעבירים את החלבונים ל- er המחוספס בגרסה שנקראת co-traslationa כלומר בזמן שיעתוק כלומר ריבוזומים שהיו בציטוזולו צריכים עכשיו ללכת לממברנת ה- er ולהתחיל לתרגם חלבונים על ה-er

Answer 8

להנצה של וזיקולות אל גולגי תוך כדי שהם נושאים בתוכם חלבונים וליפידים שסונטזו ב-er transleitional er

Answer 9

לא יש תאים שיש להם ers גדול יותר כי הם צריכים לייצא ליפידים, כולסטרול או הורמונים סטרואידים

Answer 10

מכילה אינזים שאחראים לדהטוקסיפיקציה כמו cyp 450 שהופך מולקולות לא מסיסות למסיסות

Answer 11

ה-er יודע לאגור סידן בטכינקה שנקראת reuptake והיא דורשת atp תאי שריר משתמשים בזה

Answer 12

כאשר תאים עוברים הומוגנציה- שבירה עי כוח מכאני- התאים המיקרוזומים הם למעשה השברים של ה- er

Answer 13

שומרים על תכונות ה- er ומקיימים את אותן התכונות שיש ב- er

Answer 14

קל לבודד אותם אותם

Answer 15

סדמינצטציה בגראדיינט של גלוקוז

Answer 16

לא נקבל גם חלקים מהגולג'י אנדוסומים ומיטוכודנריה

Answer 17

חלבונים ממברנאליים, שעוברים רק באופן חלקי אל תוך חלל ה- ER וחלבונים מסיסים במים שעוברים באופן מלא אל חלל ה- ER.

Answer 18

בקצה האמיני

Answer 19

1. להישאר ב- ER. 2. להגיע אל הגולג'י ולהיות חלבון פעיל בחלל הגולג'י. 3. להמשיך מהגולג'י אל הליזוזום. 4. להמשיך מהגולג'י אל הממברנה הפלסמטית.

Answer 20

20 ח"א ו-8 מהן הידרופוביות, לאחר שהרצף הזה יציץ מהריבוזום הוא יקשור אותו לקומפלקס ייעודי שיכווין אותו לאי רק להמשך התרגום ל הממברנה של ה ER יושב Translocator שיפתח רק עם הגעת הריבוזום. לאחר הגעת הריבוזום לממברנת ה- ER הרצף המדובר יעבור ביקוע כך שהחלבון הבוגר יהיה קצר באותן 20 חומצות אמינו. הביקוע נעשה על ידי Signal Peptidase שהוא אנזים ממברנאלי, אשר יושב בסמוך ל- Translocator.

Answer 21

על מנת להכווין את הריבוזומים אל ממברנת ה- ER, יש צורך בלפחות שני מרכיבים: החלקיק SRP שנקשר לסיגנאל שמבצבץ מהריבוזום, ורצפטור עבור SRP היושב על גבי ממברנת ה- ER וכך מכווין את הריבוזומים אל ה- Translocator.

Answer 22

6 יחידות חלבוניות ומולוקולת rna קטנה

Answer 23

SRP היונקי הינו בעל מבנה דמוי מתג

Answer 24

תפקיד ה- RNA הינו לחבר את הפפטידים השונים, ביניהם זה שאחראי לאינטראקציה עם הסיגנאל (הכיס ההידרופובי) עם האתר שתפקידו לעצור את התרגום.

Answer 25

SRP וגם הרצפטור שלו קיימים בכל סוגי התאים, כולל בחיידקים, אך שם הם מכילים פחות יחידות. זה כמובן מצביע על קשר אבולוציוני בהכוונת חלבונים.

Answer 26

לא היכולת של החלקיק לזהות מגוון רחב של סיגנאלים, שונים בגודלם ובהרכב חומצות האמינו שלהם, נעוץ בכיס הידרופובי שנוצר על ידי מספר חומצות אמינו מתיונין בתוך החלקיק. מאחר ומתיונין היא בעלת שייר R שאינו מסתעף אך גמיש, הדבר מקנה פלסטיות רבה לאתר הקישור לסיגנאל, בתנאי שהוא הידרופובי. זה מאפשר אינטראקציה עם מגוון עצום של סיגנאלים שונים בגודלם ובהרכב חומצות האמינו שלהם.

Answer 27

אחר האינטרקציה עם הסיגנאל, החלקיק מתקפל בצורה כזו שעוטפת את הריבוזום, והקצה השני שלו משמש לחסימת אתר הקישור לפקטור אלונגציה, הממוקם בין שתי יחידות הריבוזום – פעולה זו עוצרת את סינתזת החלבון ומאפשר זמן מספק לריבוזום להגיע לממברנת ה- ER, ומונעת את המשך התרגום ושחרור החלבון בציטוזול.

Answer 28

עי צפרונים כמו במיטוכונדריה?

Answer 29

לא, אין

Answer 30

קישור ה- SRP לרצפטור מאפשר לחלקיק המחובר לריבוזום להגיע ל- Translocator פנוי הידרוליזה של GTP על גבי החלקיק SRP והן על גבי הרצפטור, תוביל לפתיחת ה- Translocator לשחרור הרצפטור והסיגנאל ולהחדרת הסיגנאל אל תוך ה- Translocator

Answer 31

משתי שרשראות פוליפפטידיות קושרות gtp

Answer 32

האחת קשורה לממברנת ה- ER מהעלעל הציטוזולי והשנייה היא ריבוזומים חופשיים.

Answer 33

מצטרף לו לריבוזומים החופשיים

Answer 34

תישאר סמוך לממברנת ה ER בשל אוכלוסיית ריבוזומים משתנה אשר מתרגמת אותה כל הזמן.

Answer 35

יוצר תעלה המלאה במים דרכה עובר הפפטיד.

Answer 36

הליבה של ה- Translocator מכונה Sec61 ומורכבת מ 3 יחידות – אלפא בטא וגמא, אשר כולן שמורות היטב באבולוציה מחיידקים ועד אאוקריוטים. תת היחידה אלפא הינה הגדולה ביותר ובעלת מבנה של Inverted repeat מה שמקנה מבנה של פסאודו-סימטריה. תת היחידות בטא וגמא קטנות יותר במרכז הטראנסלוקטור יש פלאג שתפקידו להיפתח כאשר הפפטיד רוצה להגיע ל- er הפךאג הוא אלפא הליאלי כדי שהפלאג יוכל להיפתח יש צורך בשינוי של כל המבנה

Answer 37

לא היא נפתחת בשני הכיוונים

Answer 38

תת היחידה הגדולה שבה יש את האתר ליצירת הפפטיד

Answer 39

לא בשמרים זה נעשה כ- post

Answer 40

על מנת להעביר חלבונים ל- ER לאחר תרגומם המלא בציטוזול יש צורך בצ'פרונים כמו חלבון Bip, שהוא חלבון מסוג ATPase הומולוגי לחלבוני משפחת Hsp70 ומשתתף בתהליך הכנסת החלבון השלם אל תוך ה- ER הידרוליזה של ATP מאפשרת לחלבון למשוך אל תוך ה- ER את החלבון לאחר שזה מבצבץ מבעד לתעלת הטראנסלוקון , הנעזרת בחלבונים sec 62 ו- sec 63.

Answer 41

- חיידקים משתמשים בחלבון secA שהוא ATPase המצוי בצד הציטוזולי של הממברנה. -הידרוליזה של ATP גורמת ל- SecA לשנות את המבנה המרחבי שלו ולדחוף חתיכה נוספת מתוך הפפטיד אל תוך התעלה עד שהחלבון כולו עובר דרכה. התעלה נקראת sec y בכל הידרוליזה של ATP מועברים דרך התעלה כ-20 חומצות אמינו. מעניין שהעברת חלבונים מבעד לממברנה התילקואידית בכלורופלסט עובדת בצורה דומה.

Answer 42

1. עי srp 2. עי תעלת טראנסלוקון

Answer 43

על ממברנת ה- er

Answer 44

כן הוא יכול לעבור כי לטרנסלוקון יש תעלה קטנה שמובילה אותו פנימה

Answer 45

אינטגרציה של חלבונים לממברנה, מצריכה שמרכיב הידרופובי של הפפטיד שעובר דרך התעלה, ייפלט דרך צידה של התעלה אל תוך הליבה ההידרופובית של הממברנה.

Answer 46

Type 1 – הצורה הפשוטה ביותר בה רצף הסיגנאל בקצה האמיני משמש גם כ- Start transfer ובאופן זהה למה שלמדנו עד כה ישנו ביקוע של הסיגנאל על ידי סיגנאל פפטידאז. בהמשך החלבון מופיע רצף הידרופובי המכונה גם stop transfer שהוא רצף, הידרופובי, אשר נפלט מהתעלה אל הליבה ההידרופובית של הממברנה. בדרך זו העברת החלבון אל חלל ה- ER נעצרת מאחר והפפטיד יוצא החוצה מהתעלה, כאשר רצף ה- Stop משמש כהליקס חוצה ממברנה. המשך התרגום יתקיים בציטוזול. ההעברה תסתכם בכך שהקצה האמיני של החלבון מצוי בתוך חלל ה- ER והקצה הקרבוקסילי יישאר בציטוזול. Type 2 – רצף יחיד של Start transfer מסתדרים כך שהקצה האמיני בציטוזול והקרבוקסילי ב -ER. Type 3 – רצף יחיד של Start transfer מסתדרים כך שהקצה הקרבוקסילי בציטוזול והאמיני ב- ER.

Answer 47

type 1- על הקצה האמיני type 2 and type 3 חלק מהחלבון- לא נחתך

Answer 48

לא נכון יהיו רמה רצפי start and stop

Answer 49

SRP סורק את הפפטיד החל מהקצה האמיני ועד שיגיע לרצף הידרופובי ראשון וייקשר אליו. לאחר מכן יתחיל את הטראנסלוקציה, אבל רק של הרצף ההידרופובי הראשון. לאחר שהטראנסלוקציה התחילה, יהיה זה ה -Translocator שיזהה את הרצף הבא ההידרופובי הבא שישמש כ STOP וכן הלאה.

Answer 50

לא בהכרח כי התהליך הביולוגי אינו

Answer 51

רודופסין הוא הקולטן לאור בתאי ה Rhods ברשתית העין של יונקים

Answer 52

סביר שנמצא אותו ב- er כיוון שהח"א שלו שליליות

Answer 53

מערכת חלבוני Get , ביניהם Get1+2 שהם חלבונים ממברנאליים על גבי ה -ER, ו- Get3 שהוא ATPase בעל יכולת קישור לחלבוני המזהים את השיירים ההידרופובים המצויים בקצה הקרבוקסילי אותו נרצה לעגן בכוח לממברנה. Get3 הוא גם דימר, והידרוליזת ATP מאפשרת דיסוציאציה של היחידות. שחלוף ל- ATP חדש יגרום לו לעבור למצב דימרי שוב ולקשור את ה pre-targetting complex. הזנב ההידרופובי הקרבוקסילי יוצר מבנה אלפא הליקאלי שננעץ על גבי הממברנה ואילו הזנב האמיני שוחה בציטוזול.

Answer 54

חלבוני Tail anchored החיוניים לטראגטינג של ממברנות ולאיחוי שלהם

Answer 55

הכולל 4 חומצות אמינו בקצה הקרבוקסילי ומסמן אותם להישאר ב- ER.

Answer 56

טרנסלוקציה, עיבוד, קיפול ומודיפיקציה של חלבוני מערכת ההפרשה

Answer 57

שייר אספרגין ב- er

Answer 58

גליקוליזציה מסוג n

Answer 59

אוליגו-סאכריל טראנספראז, היושב על ממברנת ה- ER עותק של האנזים אוליגו-סאכאיל טראנספראז ממוקם ליד כל תעלת טראנסלוקון, כך שההוספה נעשית עם הגעת חומצות האמינו הרלוונטיות לחלל ה- ER.

Answer 60

nH2----------N-X-S/T-------COOH x can be anything exept prolinr

Answer 61

בפירופוספא של דוליכול זה מתצע בשלב 1

Answer 62

הם יודעים לעבור N- גליקוליזציה אך על שייר תראינאון או סרין

Answer 63

גליקוליזציה שנעשת על שירי תריאוני או סרין משמשת לחלבונים שהם ציטוזוליים או גרעיניים

Answer 64

UDP מאקטב גלוקוז וגאלקטוז ו- GDP מאקטב מאנוז. שימו לב שהתהליך מתחיל בציטוזול, שם מנצלים גם נוקלאוטיד של CTP על מנת לזרחן את דוליכול, ורק שקיים 7 מונומרים (2 גלוקנאק ו-5 מאנוז) המשך הסינתזה מבוצעת בחלל ה- ER עד להגעה למספר כולל של 14 שיירי סוכר.

Answer 65

מהפרקורסר המסתיים ב- 3 גלוקוז, לרוב מוסרים עוד בהיותו ב- ER שלושת הגלוקוזים הקיצוניים ועוד מאנוז אחד. התהליך הזה מנוצל לבקרה על הקיפול הנכון של החלבון. ההסרה של הסוכרים והמודיפיקציות שלהן ימשיכו בגולג'י.

Answer 66

1. אלו הם חלבנים קושרי פחמימות (או: לקטינים), הנקשרים לאוליגוסכרידים על פני חלבונים שלא מקופלים לחלוטין ומחזיקים אותם ב- ER כמו צ'אפרונים אחרים הם מונעים אגרגציה בלתי הפיכה של חלבונים לא מקופלים. 2. גם קלנקסין וגם קלרטיקולין מקדמים את הקשר של חלבון שלא קופל כראוי לצ'אפרון ER אחר,הנקשר לציסטאינים שטרם יצרו קשרי די סולפיד.

Answer 67

אוליגוסכרידים הקשורים בגליקוזילציה מסוג N בעלי גלוקוז בודד בקצה. לכן, הם יכולים להיקשר רק אחרי ששניים משלושת מולקולות הגלוקוז באוליגוסכריד הפרוקרסור הוסרו ע"י ER glucosidases רק כאשר הוסר הגלוקוז השלישי, הגליקופרוטאין מתנתק מהצ'אפרון שלו ויכול לעזוב את ה-ER.

Answer 68

האנזים גליקוזיל טרנספראז. גליקוזיל טרנספראז מוסיף כל הזמן גלוקוז לאוליגוסכרידים שאיבדו את הגלוקוז האחרון שלהם, ורק לאוליגוסכרידים שמחוברים לחלבונים לא מקופלים.

Answer 69

1. לכל חלבון שעבר N גליקוזילציה יש 3 סוכרים טרמינליים של גלוקוז. 2. שתי מולקולות גלוקוז של העץ עוברות חיתוך ע"י גלוקוזידאז, עד שנשאר גלוקוז יחיד. 3. קלנקסין (חלבון טראנס ממברנאלי) שיודע להיקשר לגלוקוז הבודד, ייקשר אליו ויעכב את יציאתו לציטוזול. 4. הגלוקוז האחרון נחתך תוך כדי שהוא קשור לקלנקסין, מה שמאפשר את שחררו מקלנקסין. 5. החלבון פוגש את גליקוזיל טרנספראז. 6. אם הוא קופל כראוי, אין עליו יותר גלוקוזים והוא יוכל לצאת מה-אי אר ללא הפרעות. אם הוא לא קופל כראוי, יושלם לו הגלוקוז האחרון ע"י גליקוזיל טרנספראז 7. כעת שוב יש עליו גלוקוז בודד והוא ישוב לקנלקסין שיכריח אותו להישאר באי אר 8. התהליך יחזור על עצמו שוב ושוב עוד שהחלבון ישיג את מצבו המקופל במלואו. 9. קלרטיקולין מתפקד באופן דומה פרט לכך שהוא חלבון ER מסיס ולא טראנס ממברנאלי כמו קלנקסין. 10. צ'אפרון נוסף שלא מופיע כאן קרוי ERp57 משתף פעולה עם קלנקסין וקלרטיקולין בשמירה על חלבון לא מקופל עד הסוף ב- ER. ERp57 מזהה קבוצות סולפדריל חופשיות, שהן סימו ליצירת קשר דיסולפידי לא שלם.

Answer 70

לא נכון 80 אחוז מהם מפורקים בפרוטיאוזום

Answer 71

ש צורך בצ'פרונים בכדי לשמור על שרשרת הפוליפפטיד במצב לא מקופל לפני הטרנסלוקציה ובמהלכה. נדרש מקור אנרגיה כדי לספק כיווניות להובלת ומשיכת החלבון לציטוזול. יש צורך בטרנסלוקטור.

Answer 72

-האוליגוסכארידים הקשרים הגליקוזילציה מסוג N משמשים כ"טיימרים" המלמדים על הזמן שנשארה מולקולת החלבון ב- ER. -הכנת החלבון והעברתו לציטוזול – ע"י קישור ללקטינים, צ'אפרונים ואנזימי disulfide isomerases . -סימון בפולייוביקוויטין – על פני הטרנסלוקטור עם היציאה לציטוזול. פירוק החלבון בפרוטאוזום.

Answer 73

האוליגוסכרדים הקשורים בגליקוזילציה מסוג N שמשמשים כמעין "טיימרים" המודדים כמה זמן בילתה מולקולת החלבון ב- ER מסייעים לבצע את ההבחנה הזו: החיתוך האיטי של מנוז מסויים על עץ הליבה האוליגוסכרידי ע"י מנוזידאז ב- ER יוצר מבנה אוליגוסכרידי חדש שמזהים לקטינים ב- ER. אם חלבון יתקפל לאט הוא יפגוש את המנוזידאז הזה שיחתוך ממנו מנוז. לעומת זאת, חלבונים שמתקפלים ויוצאים מה- ER מהר יותר ממנוזידאז יכולים להסיר את המנוז שלהם וכך להתחמק מפירוק.

Answer 74

בנוסף ללקטינים ב- ER המזהים את האוליגוסכרידים, צ'אפרונים ואנזימי disulfide isomerases נקשרים לחלבונים המיועדים לפירוק. הצ'אפרונים מונעים את הצטברותם של החלבונים שיוצרים אגרגטים. אנזימי ה- disulfide isomerases מפרקים קשרים דיסולפידים שעלולים להיווצר בצורה לא נכונה, כך שניתן יהיה להעביר שרשרת פוליפפטיד ליניארית חזרה לציטוזול.

Answer 75

קומפלקסים של טרנסלוקטורים מעבירים את החלבון מה- ER לציטוזול. מאפיין נפוץ שלהם הוא שכל אחד מהם מכיל אנזים 3E המחבר פולייוביקוויטין לחלבונים שנפרשו ויוצאים אל הציטוזול. ע"י האנרגיה שמופקת מהידרוליזת ATP, ATPase הקסמרי ממשפחת ה- AAA-ATPases מושך את החלבון הלא מקופל דרך הטרנסלוקטור אל הציטוזול. בשלב הבא, N-glycanase מסיר את שרשרת האוליגוסכריד שלו כבלוק. כעת, החלבון מסומן בפוליוביקוויטין ומובל במהירות לפרוטאוזומים, שם הוא יפורק לפפטידים קצרים. נציין כי חלבונים ממברנאלים שלא מקופלים כראוי הולכים בדרך דומה אך משתמשים בטרנסלוקטור שונה.

Answer 76

חלבונים שקופלו כראוי

Answer 77

הצ'אפרונים יכסו את סיגנלי היציאה או יעגנו את החלבון ל- ER חלבונים כושלים כאלו יועברו בסופו של דבר חזרה לציטוזול, שם יפורקו על ידי פרוטאוזומים. שלב זה של בקרת איכות מונע את ההובלה הלאה של חלבונים "מקולקלים" או לא מורכבים שעלולים להפריע לתפקודים של חלבונים תקינים.

Answer 78

שכיח- כך למשל בתאי טי, כ-90% מהיחידות החדשות של ה-TCRS שמסונתזות יכולות שלא להתקפל טוב ואז מופעלת התגובה התאית לקיפול שגוי. התופעה מתרחשת גם בקולטן לאצטילכולין, שם גם כן ברוב המקרים היחידות החדשות שמסונתזות נשלחות לפירוק עוד לפני שבכלל הגיעו לפני התא. לפיכך, על התאים לייצר עודף גדול של מולקולות חלבון כדי להפיק כמה שמתקפלים, מורכבים ומתפקדים כראוי.

Answer 79

המנגנון הקפדני הזה גורם לכך שבמחלת הציסטיק פיברוזיס, מחלה תורשתית רצסיבית הנגרמת כתוצאה מפגיעה בתעלות כלור, החלבון המוטנטי מזוהה ב-ER ומושמד בפרוטאוזום, על אף שהוא היה יכול לתפקד כרגיל לו היה מגיע לממברנה הפלסמטית. כלומר, המחלה נגרמת לא בגלל מוטציה שגורמת לייצור חלבון לא פעיל, אלא בגלל שהחלבון הזה ושמד לפני שהוא בכלל מגיע לממברנה הפלסמטית.

Answer 80

Unfolded Protein Response ## Footnote unfolded protein response. תגובה זו גורמת ל: 1. שעתוק מוגבר של גנים המקודדים לחלבונים המעורבים בהעברה של החלבון לציטוזול ופירוקו שם 2. שעתוק מוגבר של גנים המקודדים לצ'אפרוני ER 3. חלבונים רבים אחרים המסייעים להגדיל את קיבולת קיפול החלבונים של ה- ER

Answer 81

1.המסלול של IRE1: מבקר את תהליך הספלייסינג בהקשר של קיפול שגוי – שחבור חליפי שיגרום להופעת פקטורי שעתוק סלקטיביים. 2. המסלול של PERK מבקר את תהליך התרגום הסלקטיבי של פקטורי שעתוק סלקטיביים 3. המסלול של 6ATF באמצעות פרוטאליזה בגולג'י מגיע לגרעין ומעודד שעתוק גנים

Answer 82

1. חלבונים שלא קופלו כראוי ב - ER 2. מפעילים פרוטאין קינאז טרנסממבראנלי בשם IRE1 3. IRE1 גורם לאוליגומריזציה וזרחון עצמי. 4. תהליכים אלו מפעילים דומיין endoribonuclease domain המצוי בצד הציטוזולי שלו. 5. דומיין זה אחראי לחתוך מולוקולות mRNA ציטוזוליות ספציפיות בשתי עמדות ומוציאה אינטרון 6. RNA ליגאז מחבר את שני האקסונים. 7. ה- mRNA מתורגם לייצור active transcription regulatory protein 8. החלבון הזה מאקטב את השעתוק של גנים המקודדים לחלבונים שעוזרים לתווך את ה-unfolded protein response.

Answer 83

1. חלבונים שלא קופלו כראוי מפעילים גם את PERK 2. PERK מזרחן translation initiation factor וכך מעכב אותו 3. כך למעשה הוא מפחית את הייצור של חלבונים חדשים ברחבי התא ולכן מפחית את כמות החלבונים שצריכים לעבור קיפול. חלבונים אחרים מתורגמים בעדיפות דווקא במצב בו מעוכב translation initiation factor. 4. אחד מהם הוא פקטור שעתוק שמסייע לשעתוק גנים המקודדים לחלבונים הפעילים ב- unfolded protein response.

Answer 84

- ATF6 מסונתז בתחילה כחלבון ER טרנסממברנלי. - מכיוון שהוא שקוע בממברנת ה- ER הוא לא יכול להפעיל שעתוק גנים בגרעין. - כאשר חלבונים מתקפלים שלא כהלכה, ATF6 מועבר לגולג'י. - בגולג'י ATF6 פוגש פרוטאזות שמבקעות את הדומיין הציטוזולי שלו, שיכול כעת לנדוד לגרעין ולעודד שעתוק של גנים המקודדים לחלבונים המעורבים ב- unfolded protein response.

Answer 85

מעוגנים אליה על ידי פוספוליפיד מסוכרר בשם GPI - glycosylphosphatidylinositil ופונים כלפי חוץ התא.

Answer 86

כולם עוברים תהליך של Co-translational והם כולם מכילים סיגנאל פפטיד שנחתך בתהליך העברת החלבון אל ה- ER במקביל לתרגום.

Answer 87

הקצה הקרבוקסילי של כל החלבונים הללו הוא הידרופובי ומשמש כ Stop Transfer. לאחר פליטתו החוצה מתעלת הטראנסלוקון, הוא ננעץ בממברנה של ה- ER.

Answer 88

הקישור לליפיד המסוכרר נעשה על ידי התקפה נוקלאופילית של הקצה האמיני של הפוספוליפיד, התקוף קבוצה קרבונילית המצויה בקשר פפטידי עם הזנב ההידרופובי הנעוץ על הממברנה . התוצאה היא ביקוע האזור ההידרופובי

Answer 89

טריפונוזומות

Answer 90

ע"ג ממברנת ה-er?

Answer 91

בעלעל הציטוזולי של ה- er כי מיש שמייצר אותו הוא חלבון ממבראנלי כשהאתר הפעיל שלו הוא לכיוון הציטוזול

Answer 92

1. ראשית יש להביא חומצות שומן שסונתזו בציטוזול או הגיעו אל התא מבחוץ על ידי חלבון הובלה הטוען אותן כחומצות שומן חופשיות על העלעל הציטוזולי. 2. בשלב הבא יש לשפעל את חומצות השומן הללו על ידי Co-A 3. כאשר שתי חומצות שומן כאלו סמוכות מאוקטבות, מובא פוספוגליצרול, אותו אנחנו מחברים לשתי חומצות השומן. 4. האנרגיה ליצירת הקשר מצויה בקשר התיואסטרי עם הקו- A. 5. בשלב הבא הגליצרול המזורחן עובר דה-פוספורילציה, ומגיע CDP-Choline אשר מפורק לפוספוכולין ונצמד לפחמן הפנוי בגליצרול.

Answer 93

בממברנה שלל ה- er יש רק סקראמבלבז -סקארמבלז פועל על פי דיפוזיה לעומת הפליפאז והפלופאז

Answer 94

1. ביוסינטזה של כולסטרול (לפחות באופן חלקי). 2. ביוסינתזה של צרמיד - ה- ER מהווה את השלב הראשון לסנתז גם ספינגוליפידים, כאשר חומר המוצא הוא צרמיד ומיוצר ב- ER. צרמיד כלשעצמו נוצר על ידי דחיסה של חומצת שומן לחומצה האמינית סרין, ובהמשך נדחוס חומצת שומן נוספת דרך הקצה האמיני – וכך נוצר צרמיד. ממנו ניתן לייצר ספינגוליפידים רבים. המשך העיבוד של ספינגוליפידים או גליקוליפדים נעשה בגולג'י – לכן הם נחשבים שלב מאוחר יחסית בביוסינתזה של ממברנות. מאחר והחלל של הגולג'י, בדומה לחלל ה ER הינו "סימולציה" של החלל החוץ תאי – גליקוליפידים וספינגוליפידים יפנו כלפי חוץ התא.

Answer 95

מיטוכונדריה מייצרת חלק מהליפידים שלה לבדה, אך היא זקוקה לפרקורסוקרים שמגיעים מה- er

Answer 96

עי אנדוציטוזה ואקסוציטוזה

Answer 97

היא תהליך שבו התא מפריש חלבונים, קרבוהידרטים ושומנים לממברנה הפלסמטית או לחוץ התא. מסלול ההפרשה מתחיל ב- ER ממשיך בגולג'י ומשם לחוץ התא או לאנדוזום ולליזוזום. מערכת ההפרשה כוללת את: ER גולג'י, אנדוזום, ליזוזום וחוץ התא. שימו לב לא להתבלבל עם אברונים אחרים כמו פרוקסיזום שאינם חלק ממערכת ההפרשה

Answer 98

היא תהליך שבו התא מסיר קומפוננטים ממברנאליים ומעביר אותם למדורים פנימיים הנקראים אנדוזומים. משם הם יעברו מחזור או יישלחו לליזוזום לפירוק. בנוסף, התא משתמש באנדוציטוזה כדי ללכוד נוטריינטים כמו ויטמינים, כולסטרול וברזל. הם נלקחים יחד עם המקרומולקולה שקושרת אותם ומועברים איתה לאנדוזום ולליזוזום, משם יישלחו לציטוזול וישמשו לתהליכים ביוסינתטיים. מסלול האנדוציטוזה מתחיל מהממברנה הפלסמטית.

Answer 99

רוב הממברנות מיוצרות ב- ER ו,ממברנות בתא נעות בין איברונים לאיברונים אחרים, בין איברונים לממברנה הפלסמטית ובין הממברנה הפלסמטית פנימה. התנועה הזו מתבצעת באמצעות וזיקולות טרנספורט המניצות מאברון אחד ומתאחות לאחר, נושאות על גביהן רכיבי ממברנליים שונים או רכיבים מסיסים המכונים מטען.

Answer 100

הן נעות במסלול מאורגן כאשר הן מניצות ממקום אחד לאחר, ולהתמזג עם מקום שני כאשר יש עליהן מטען

Answer 101

תנועת הוזיקולות זורמת בנתיבים מאורגנים מאוד המאפשרים לתא לאכול, להפריש ו"לשפץ" את הממברנה הפלסמטית והאיברונים שלו.

Answer 102

כן, הוזיקולות המניצות הן ספציפיות

Answer 103

1. יציאה מהתא: סינתזה של חלבונים ל- ER או העברתם ל- ER מעבר של החלבונים לגולג'י, משם דרך הציסטרנות של הגולג'י לממברנה הפלסמטית, לאנדוזום שמגיע לליזוזום. הגולג'י יכול להחזיר את הוזיקולות ל- ER. 2.כניסה לתא: וזיקולות מניצות מהממברנה הפלסמטית פנימה לאנדוזום המוקדם שהופך למאוחר, שמתאחר לליזוזום, או ששולח וזיקולות אל הגולג'י.

Answer 104

מרבית וזיקולות הטרנספורט נוצרות מאזורים מיוחדים ומצופים של ממברנות ה"ממוקצעים" לכך. הוזיקולות מניצות כוזיקולות מצופות בעלות "כלוב" ייחודי של חלבונים המכסה את פני השטח הציטוזולי שלהן. לפני שהוזיקולה מתמזגת עם ממברנת המטרה שלה, הציפוי שעליה מוסר כדי ליצור אינטראקציה ישירה ולהתמזג.

Answer 105

קלתרין – שייך למה שאנו נכנה כ"מערכת ההפרשה המאוחרת", אל הממברנה ומהממברנה וכן בין מדורי הגולג'י והאנדוזומים. COP – משפחה של חלבונים השייכים למה שנכנה "מערכת ההפרשה המוקדמת", מה- ER אל הגולג'י ולהיפך. חלבוני COPI – מהגולג'י אל ה- ER וחלבוני COPII – מה- ER אל הגולג'י.

Answer 106

1. על מנת להניץ וזיקולה, יש צורך שרצפטור יקלוט מולקולה שאמורה להיארז . 2. הרצפטור נקשר למטען ויש צורך לגייס את חלבוני הקלתרין. אולם, על מנת לגייס את חלבוני הקלתרין, יש תחילה צורך בחלבונים מתאמים 3. החלבון המתאם מגייס את חלבוני קלתרין שמתחילים בביצוע ההנצה של הוזיקולה. 4. על מנת לעקור את הווסיקולה שהתרוממה,יש צורך בחלבונים מסוג Membrane-Bending Proteins המכילים דומיין BAR. 5. חיתוך הוזיקולה מהממברנה מתבצע הודות לפיעלותם של חלבונים ציטופלסמטיים מסיסים, כולל דינאמין. 6. כשהוזיקולה מנותקת לגמרי, היא מאבדת במהירות את הציפוי. זאת הודות ל PIP פוספטאז שעושה הידרוליזה פוספוליפידים וכך הקשר שלהם עם החלבון המתאם נחלש. 7.צ'פרוני HSP70 יגויסו ויבצעו הידרוליזה של ATP הם מתפקדים כ- uncoated ATPase על מנת לגרום להסרה מושלמת החלבון אוקסילין נחשב כמאקטב את ה- ATPase.

Answer 107

וזיקולות עטופות בקלתרין הן הוזיקולות העטופות הראשונות שזוהו.

Answer 108

קלתרין הוא הקסמר הבנוי משלוש יחידות כבדות ושלוש יחידות קלות היוצרות יחד את המבנה המיוחד שלו המכונה טריסקליון. טריסקליונים של קלתרין מתאספים למסגרת דמויית סל או כלוב של משושים ומחומשים, ולעיתים גם משובעים.

Answer 109

יחידות של קלטרין שיוצרות מבנים מיוחדים

Answer 110

לאקטין

Answer 111

הפוספורליציה על הקלטרין

Answer 112

לחלק ה- n טרמינאלי שלו

Answer 113

לא נכון הקלטרין קובע את צורת הוזיקולה ניתן לייצר אותו באופן ספונטי ולכן יש כלוב של קלטרין

Answer 114

1. ליצור שכבה פנימית נפרדת שמחברת בין הקלטרין לבין הממברנה 2. לכידת חלבונים טרנסממבראנלים שונים כמו רצפטורים שנושאים מולקולות מטען מסיסות

Answer 115

טטרמרים ומונומריפ

Answer 116

cargo receptors

Answer 117

תחילה חשוב להבין כי על מנת לזהות ממברנות באופן ספציפי, ניתן להשתמש בפוספואינוזטידים ל-2AP יש 4 תת יחידות: אלפא, בטא2,סיגמא2,מיו2. הוא יוצר אינטרקציה עם פופואינוזיטיד pi(4,5)p2 המצוי בעלעל הציטוזולי. כאשר 2AP נקשר אליו הוא חושף אתר קישור לרצפטורים ומיו2 וסיגמא2 קושרות את הרצפטור מצידו הציטוזולי כמובן. כל קומפלקס AP2 קושר ארבע PI (4,5) P2 מולקולות הקשירה בו זמנית הן לרצפטור והן לראש הליפיד משפרת מאוד את קשירת AP2 לממברנה. 2AP משמש גם כגלאי לאירועי הרכבה: שכן הקישור שלו לרצפטור ולפוספאינוזיטיד צריך להיות בו זמנית. לאחר קישור של AP2 לרצפטור, הוא יוצר עיקום בממרנה שגורם: 1.קישור של חלבוני 2AP נוספים, מה שמגביר מאוד את תהליך הנצת הוזיקולה. 2. ההרכבה השיתופית של שכבת ה- AP2 מועצמת עוד יותר על ידי קישורו של קלתרין, מה שמוביל ליצירת והנצת וזיקולות.

Answer 118

פחות מעשרה אחוזים

Answer 119

יש להם תפקיד בקביעת המיקום והטיימינג של הולכת הוזיקולות בתא, כמו גם תפקיד חשוב בהולכת אותות, מחזור חלוקת התא ועוד.

Answer 120

איהם עוברים מחזורים מהירים של זרחון ודה זרחון על פחמנים 4,3 ו-5 של אינוזיטול ליצירת סוגים שונים של פוספואינוזיטידים.

Answer 121

על פי הזרחונים והדה זרחונים שלהם

Answer 122

piקינאזות ו- piפוספטאזות שנמצאים באופן ספציפי בכל מדור. לכן, התפלגות PIPs שונים משתנה מאיברון לאיברון, ולעתים קרובות בתוך משטח ממברנה רציף מאזור לאזור, ובכך מגדירה תחומי ממברנה מיוחדים.

Answer 123

ניתן להשתמש בשליטה מקומית בקינאזות ובפוספטזות של PI ו-PIPs כדי לשלוט במהירות על קשירת חלבונים לאזור ממברנה מסויים. ייצור של סוג PIP מסויים מגייס חלבונים המכילים את הדומיין שנקשר אליו. עם היקשרם, חלבונים אלה מסייעים בבקרת תנועת הוזיקולות.

Answer 124

השם שלהם מורכב לפי עמדת הזרחן בטבעת הסוכר אינזיטול ולפי כמה זרחונים יש על הטבעת הזאת. למשל pi(3,4)p2 – יש 2 זרחונים, אחד על פחמן 3 ואחד על פחמן 4. עם זאת, נשים לב שמסםר הזרחונים הכולל ב- pi(3,4)p2 למשל הוא 3, משום שהאינוזיטול מחובר דרך פוספט!

Answer 125

דומיין שיש ל-membrane bending protein חלבונים שמסייעים לוזיקולות שעטופות קלטרין להניץ

Answer 126

על הצד הציטוזולי

Answer 127

חלבוניפ שיכולים להיות גם הליקסים אמפיפיליים

Answer 128

בצורה קואפרטיבית במנגנון משוב חיובי

Answer 129

אקטין

Answer 130

כדימר עם coiled- coil

Answer 131

דינאמין מכיל דומיין הקושר PI(4,5) P2 המחבר אותו לממברנה, ודומיין המבקר את הקצב בו הוזיקולות נצבטות מהממברנה.

Answer 132

במהלך תהליך הצביטה שני העלעלים הלא ציטוזוליים של הממברנה מוצמדים ומובאים לידי מיזוג, כך שהוזיקולה נאטמת. כדי לבצע את המשימה הזו, דינאמין מגייס חלבונים אחרים לצוואר הוזיקולה המתהווה. יחד עם דינאמין הם עוזרים לכופף את החלק הרלוונטי בממברנה, על ידי עיקום ישיר של מבנה הדו שכבה או על ידי שינוי הליפידים בה (באמצעות גיוס אנזימים מתאימים), או על ידי שני המנגנונים הללו.

Answer 133

הליך האנדוציטוזה מתווכת קלתרין בזבובים המוטנטים נפסק וממברנת הוזיקולות הסינפטיות לא מצליחה להתמחזר, וכך חוסמת את שחרור הנוירוטרנסמיטרים. בקצות העצב של תאי העצב של הזבוב נוצרים אינווגינאציות עמוקות מצופות קלתרין וחגורות של דינאמין מוטנטי מקיפות אותן, אולם תהליך הצביטה נכשל מכיוון שהאיחוי הממברנה הנדרש אינו מתרחש.

Answer 134

לאחר שהשתחררה מהממברנה, הוזיקולה מאבדת במהירות את ציפוי הקלתרין שלה. PIP פוספטאז שנארז לתוך וזיקולות מצופות קלתרין מדלל את מאגר ה- PI(4,5) P2 מממברנת הוזיקולה, מה שמחליש את הקשר עם החלבון המתאם.

Answer 135

בנוסף צ'אפרוני HSP70 מתפקדים כ- uncoating ATPase ומשתמשים באנרגיית ההידרוליזה של ATP כדי לקלף את ציפוי הקלתרין.

Answer 136

מאתחל את ה- atpase ב- hsp 70

Answer 137

1. החלבון Sar1 במצב קושר GDP מרחף בציטוזול. 2. Sar1-GEF הוא חלבון ממברנאלי המצוי על גבי ממברנת ה- ER. הוא משחלף את Sar1 ומצמיד אותו לממברנה במצב פעיל קושר GTP שינוי קונפורמציה המופעל על ידי GTP ב- sar1 חושף סליל אמפיפילי, כעת sar1 לכן הוא נצמד לממברנה במצב פעיל קושר GTp. 3. כאשר חלבון המיועד אל הגולג'י מגיע אל הרצפטור, החלבון sec23 נקשר ל- Sar1 ו sec24 נקשר לרצפטור. חלבונים אלו שייכים למשפחת COP2 ובעזרת חלבוני COP2 אחרים הם מסייעים בהרמת הוזיקולה ויצירת COP2-coated vesicle.

Answer 138

טיימר בציטוזול

Answer 139

הידרוליזה של gtp הפיכה ל- gdp אבלל זה מתייצב בזכות אינטראקציות עם הרצפטורים

Answer 140

ינאז יזרחן את חלבוני הציפוי וישלים את פירוק הציפוי ומכין את הוזיקולה לאיחוי.

Answer 141

קלטתרין- איך שהיא מונצת cop2 בסוף עי זרחון cop1 איך שהיא מונצת

Answer 142

עבור וזיקולה עם COP1 , העקמומיות של קרום הוזיקולה משמשת כטריגר ל"התפשטות" מהציפוי שלה. ARF-GAP הוא חלבון שמגוייס לציפוי COP1 כאשר הוא מתהווה, יוצר אינטראקציה עם הממברנה ו"מרגיש" את צפיפות הליפידים. הוא מופעל כשעקמומיות הממברנה מתקרבת לזו של וזיקולת הטרנספורט. זה גורם לאינאקטיבציה של ARF מה שגורר פירוק של הציפוי.

Answer 143

מניע וזיקולות מהציסטרונות של הגולג'י ובחזרה ל- er

Answer 144

הממברנה הפלסמטית היא יחסית שטוחה ונוקשה כתוצאה מהרכב הליפידים העשיר בכולסטרול ובקורטקס עשיר באקטין, לכן הפעולה המתואמת של ציפוי הקלתרין וחלבונים מכופפי הקרום חייבת ליצור מספיק כוח בכדי ליצור מספיק עקמומיות, במיוחד בצוואר בו נדרשים כיפופים חדים לתהליך הצביטה. לעומת זאת, הנצת וזיקולות ממברנות תוך תאיות רבות מתרחשות בעדיפות לאזורים שבהם הממברנות כבר מעוקלות, למשל שולי ציסטרנות הגולג'י. במקומות אלה, התפקיד העיקרי של הציפויים הוא יותר ללכוד את חלבוני המטען המתאימים מאשר לעוות את הממברנה.

Answer 145

לא למשל כאשר נעטוף מולקולות ענק כמו פרוקולגן בדרכן החוצה מהתא, לא נוכל לארוז אותן בוזיקולות ספריות, אלא בוזיקולות בצורת מתג, שכן מולקולת פרוקולגן כזו לא יכולה להיארז בוזיקולות 2COP שאורכן כ- 60-80 ננומטר הנצפות בדרך כלל. כל מה שצריך הוא כמובן חלבוני עזר שיסייעו לנו לארוז אותן בצורה הזו. במקרה של פרוקולגן, מולקולות המטען שלו נקשרות לחלבוני אריזה טרנסממברנאלים ב- ER השולטים על הרכבת רכיבי ציפוי ה- COP2.

Answer 146

sec 31 sec13

Answer 147

משולשים מחומשים מרובעים

Answer 148

1. גיוס של חלבון הציפוי הפנימי sec24 המשפר באופן מקומי את הקצב בו sar1 מסתובב על הממברנה 2. חלבון sec31 מוסף מונויוביקוויטין שמשנה את תכונות ההרכבה של הכלוב החיצוני. 3. חלבוני Sec23,24 מסתדרים כעת במערכים גדולים יותר 4. Sec13 ,31 מסתדרים בסריג קבוע בצורת יהלום.

Answer 149

הפרעות בשלד ופגמים התפתחותיים אחרים.

Answer 150

וזיקולות צינוריות

Answer 151

הספציפיות מובטחת משום שכל וזיקולת טרנספורט מציגה סמנים פנימיים המזהים אותה על פי מקורה וסוג המטען שהיא נושאת, ואילו ממברנות היעד מציגות קולטנים משלימים המזהים את הסמנים המתאימים.

Answer 152

תהליך מכריע זה מתרחש בשני שלבים. ראשית חלבוני Rab ו- Rab effectors מכווינים את הוזיקולה לממברנת היעד הנכונה. שנית, חלבוני SNARE ו- SNARE regulators מתווכים את האיחוי של ממברנות הדו שכבה

Answer 153

1. חלבונים אלו ממלאים חלק מרכזי בספציפיות של הובלת וזיקולות. 2. חלבונים אלו הם חלבוני G מונומרים המצוים על ממברנות ומגדירים את הזהות שלהן. ישנם למעלה מ- 60 חלבונים שונים כאלו השייכים למשפחה, ולכן משפחת חלבוני Rab היא הגדולה ביותר מבין חלבוני ה-G המונומרים. 3. חלבוני ה- Rab מצויים על גבי הממברנה על הצד הפונה לציטוזול (כדי שיהיה אפשר לזהות אותן מבחוץ), באיברונים, וזיקולות או גם וגם. במצב הלא פעיל, חלבוני Rab קושרים GDP ומעוכבים על ידי חלבוני GDI המרתקים אותם לציטוזול ומונעים מהם להתיישב על גבי הממברנה. במצב הפעיל, חלבוני Rab קושרים GTP ונמצאים באסוציאציה חזקה עם הממברנה.

Answer 154

לא נכון לחלבוני rab יש התפלגות סלקטיבית מה שמוביל את הוזיקולות לאיברוני המטרה

Answer 155

כאמור, החלבונים ממשפחת Rab מבוקרים על ידי חלבוני ה- GDI שהם חלבונים השומרים את חלבוני ה- Rab בציטוזול. כאשר חלבון ה- Rab משוחלף, מוציאים ממנו GDP ישן ושמים GTP חדש, מה שיגרום לו להתנתק מהחלבון GDI ולחשוף הליקס אמפיפטי שיגרום לנעיצה שלו בממברנה. למעשה Rab-GEFs משחלפים את Rab והופכים אותו פעיל. כאמור, כשזה קורה Rab חושף הליקס אמפיפתי – ולכן ננעץ בממברנה, כך שבמצב קושר GTP חלבוני ה- Rab פעילים וקשורים בחוזקה למברנת האיברון או הוזיקולה.

Answer 156

אחר מכן, חלבוני Rab נקשרים לחלבונים אחרים המכונים Rab effectors שמתווכים במורד הזרם הובלת וזיקולות וקירוב לממברנה.

Answer 157

חלבוני snare

Answer 158

rab-gap עושה הידרוליזה הופך אותו ל- rab gdp

Answer 159

קצב הידרוליזת ה- rab

Answer 160

rab לעומת זאת rab effector הינם ואריאבילים מאוד

Answer 161

הם יכולים להיות gap or gef

Answer 162

1. חלקם הם דומיינים גדולים של חלבון המקשרים בין שתי ממברנות שנמצאות קרוב יותר ויוצרים אינטראקציה עם מגוון רחב של חלבונים אחרים המאפשרים איחוי של הממברנה 2. ואחרים משמשים כחלבוני מנוע על גבי אקטין ומיקרוטובולי שמניעים את הוזיקולות לממברנת היעד שלהן. 3. חלקם בעלי פעילות משולבת למשל של חכה ושל קינאז המזרחן את חלבוני המעטפת (כמו במקרה של קופ 2) הזרחון מסייע להשלמת הסרת הציפוי. צימוד תהליך הסרת הציפוי לתהליך מסירת הוזיקולה לממברנת היעד עוזר להבטיח כיווניות של תהליך ההעברה והאיחוי שנעשה כמו שצריך

Answer 163

המשפט השני

Answer 164

Rab5 עובר שחלוף על ידי ה- GEF שלו שמצוי סמוך לממברנת האנדוזום. כאשר הוא קושר GTP הוא גם עוזב את ה- GDI שמעכב אותו וגם מוציא את הקבוצה הליפופילית שלו שאחראית לעגן אותו על גבי הממברנה של האנדוזום. כאשר הוא על הממברנה הוא משפעל את K3PI המזרחן פוספטידיל אינוזטול על גבי הממברנה, תהליך החשוב לזיהוי הממברנה כממברנה של האנדוזום. בסיוע של אפקטורים נוספים Rab5 מגייס עוד Rab5-GEF שיצליחו לשחלף עוד מולקולות של Rab5 ועוד אפקטורים. המשוב החיובי הזה מעצים מאוד תהליך ההרכבה ועוזר לבסס מתחמי ממברנה מובחנים באופן פונקציונלי בתוך ממברנה רציפה. מה משפיע על עוצמת התהליך? קצב ההידרוליזה והשחלוף.

Answer 165

לא נכון Rab5 מקבל וזיקולות אנדוציטיות הנכנסות מהממברנה הפלסמטית, אזורים מובחנים ש לRab11 ו- Rab4 באותה הממברנהמארגנים את הנצת וזיקולות המיחזור המחזירות חלבונים מהאנדוזום לממברנה הפלסמטית.

Answer 166

החלפה זאת מאפשרת החלפה של זהות האיברון ## Footnote Rab כלשהו מגייס חלבוני אפקטור שלו – אבל גם של ה- Rab הבא. האפקטור של ה-Rab הבא משמש כ- GEF והופך את ה- Rab הבא לפעיל וכן הלאה. כך למשל עם הזמן הדומיין של Rab5 באנדוזום המוקדם, מוחלף בדומיין של Rab7 שמתאים לאנדוזום המאוחר בתהליך הנקרא endosome maturation על הפונקציונאליות שלו נרחיב בהמשך כשנדון באנדוזום.

Answer 167

כאשר הוזיקולה הובאה לממברנת המטרה שלה, היא פורקת את מטענה באמצעות איחוי ממברנות. על מנת לייצר איחוי של ממברנות, עלינו לקרב אותן למרחק של 1.5 נ"מ וכמובן, להרחיק את המים מהחלקים ההידרפילים שעל הממברנה.

Answer 168

35 סוגים כל אחד מצוי על גבי איברון ספציפי או וזיקולה ספציפית במסלולי ההפרשה והאנדוציטוזה.

Answer 169

הם מתחלקים ל- tSNARE ו-vSNARE המצויים על גבי הוזיקולה (V) או איברון המטרה (T) בהתאמה. V הוא בדרך כלל שרשרת פוליפפטידית אחת ו- T בדרך כלל מורכב משלוש שרשראות. המוטיב המרכזי במבנה של החלבונים הללו הוא המבנה ההליקאלי המאפשר להם להתסובב אחד על השני ליצירת קומפלקס 4-הליקאלי יציב מאוד הקרוי גם trans-SNARE ש"נועל" את שתי הממברנות זו בזו.

Answer 170

לא נכון הן אינטראקיציות ספציפיות

Answer 171

כלל לא נכון אין צורך

Answer 172

עי התלפפות

Answer 173

true story

Answer 174

תחילה מתרחש "זיווג" הדוק בין tSNARE ו-vSNARE המוביל לקרבה של הממברנות ויציאת מולקולות מים מהאזור העומד להיות מושק. לאחר מכן, מולקולות הליפידים בעלעלים הציטוזוליים של הממברנות זורמים בין הממברנות ליצירת "connecting stalk". ליפידים של שני העלעלים הלא ציטוזוליים מתקשרים זה לזה ויוצרים דו-שכבה חדשה, המרחיבה את אזור האיחוי חתך בדו-שכבה החדשה משלים את תגובת האיחוי.

Answer 175

1.ככל הנראה, האחראים להאצת התהליך אלו אפקטורים של Rab שמשתפים פעולה עם ה-SNAREs. 2. אנחנו יכולים לעכב את התהליך של סיום האיחוי או להאיץ אותו על ידי שימוש באלוסטריקה. רגולציה נוספת יכולה להיות של חלבוני Rab עצמם אשר יכולים לעכב חלבונים שהתפקיד שלהם בעצמם הוא לעכב את חלבוני ה - SNARE.

Answer 176

הקסאמר הוא משתמש ב-aaaatpase על מנת להפריד את האינטקראציות ההדוקות בין חלבוני snare

Answer 177

מניעת התמזגות ממברנות

Answer 178

הזרע וביצית מתאחות זו עם זו במהלך ההפריה ואילו מיובלסטים מתאחים זה עם זה במהלך התפתחות סיבי שריר

Answer 179

בגלל שהוא רוצה זמן לוזיקולה להתקפל

Answer 180

משם וזיקולות בדרך כלל מניצות ואין בהם ריבוזומים

Answer 181

1. זה יכול להיות סלקטיבי 2. יכול להיות ברירת מחדל

Answer 182

סיגנאל יציאה מהממברנה

Answer 183

שלב היציאה מה- er

Answer 184

לקטינים

Answer 185

בערך 200

Answer 186

כאשר וזיקולות הטרנספורט מתחילות להתמזג זו עם זו- איחוי ממברנות מאותו המדור

Answer 187

איחוי ממברנות ממקומות שונים

Answer 188

איחוי הומטיפיק הינוי איחוי של שתוי ואזיקולות של אותו מדור ועל כל ואזיקולה צריך שיהיה גם tsnare וגם vsnare בצורה סימטרית לעומת זאת בהטרוטיפיק זה כלל לא סימטרי ויש על וזיקולה - v-snare ועל המטרה tansre

Answer 189

לא נכון

Answer 190

מבנה צינורי שה- nsf יוצרים

Answer 191

נוצרים ללא הפסקה ומתפקדים כ"מכולות הובלה" המביאות חומר מה- ER אל הגולג'י, ומובלים במהירות לאורך המיקרוטובולי לכיוון הגולג'י עימו הם מתמזגים.

Answer 192

ברגע שנוצרים הקלסטרים הללו, הם מתחילים להניץ וזיקולות טרנספורט משלהם. שלא כמו וזיקולות שמניצות מה- ER המצופות COP2 הוזיקולות שהונצו מהקלסטרים הצינוריים מצופות ב- COP1.

Answer 193

הן ייחדויות בכך שהרכיבים המרכיבים את שכבות הציפוי הפנימית והחיצונית שלהן מגוייסים כקומפלקס מורכב מראש המכונה coatomer.

Answer 194

לא נכון זה החלפה שמתבצעת בשניות

Answer 195

חלבונים שהשתרבבו מה- er

Answer 196

אם הם מסיסים יש להם רצף של ארבע חומצות אמינו - kdel רצף KKXX במידה והם ממברנאלים

Answer 197

כדי שיוכלו לעשות מודיפיקציות שונות

Answer 198

רצפטורים כמו kdel

Answer 199

זהו רצפטור טראנס-ממברנאלי מסוג מולטי-פאס הנקשר לרצף KDEL ואוגד כל חלבון המציג אותו לתוך וזיקולה מצופה COP1 שפונה רטרוגרייד.

Answer 200

האפיניות שלו גבוהה באותם קלסטרים צינוריים ובגולג'י על מנת לתפוס חלבונים תושבי ER שהתשרבבו לשם, ואילו ב-ER האפיניות שלו נמוכה על מנת שיוכל לשחרר אותם, על אף ריכוזם הגבוה באותו מדור.

Answer 201

ההסבר כל הנראה נעוץ בעובדה שהגולג'י הוא סביבה חומצית יותר שכן יש שם משאבות פרוטונים.

Answer 202

הם יחזור ל- er ככל הנראה יש להם קצף kdel

Answer 203

לא בהכרח,כאילו התא מודע לכך שהוא לא אמור להיות מופרש

Answer 204

ה- er בונה מלכתחילה חלבונים שהם קומפלקסים ככה שהם לא יצליחו לצאת - הם מתארגנים בסוג של אגרגציה

Answer 205

במיקרוסקופ אור

Answer 206

ציסטרנות

Answer 207

4-6 ציסטרנות למרות שיכול להגיע אף ל-20 ציסטרנות

Answer 208

ממוקם ליד גרעין התא קרוס לצנטרוזום

Answer 209

הגולג'י מתארגן מחדש לערימות בודדות שנמצאות ברחבי הציטופלסמה הסמוכות לאתרי היציאה של ה-ER (ER exit sites).

Answer 210

לחמישה מדורים

Answer 211

חלבונים הנכנסים ל- CGN יכולים להתקדם הלאה במנגנון הוא להיות מוחזרים ל -ER ואילו חלבונים היוצאים מה-TGN עוברים הלאה וממוינים לפי היעד הבא שלהם: אנדוזומים, וזיקולות הפרשה או אל פני שטח התא. ניתן להחזיר אותם גם למדור קודם. חלבונים ממברנאלים מסויימים נשמרים באותו חלק של הגולג'י בו הם מתפקדים.

Answer 212

גליקוליפידים – מיוצרים בגולג'י ספינגומיאלין – מיוצר בגולג'י, כאשר האנזים המייצר אותם פונה לתוך הלומן של הגולג'י ולכן ימצאו בעלעל החוץ תאי.

Answer 213

מסוג סיגנאל פאס על גבי הממברנה

Answer 214

האחת, complex oligosaccharides והשניה high-mannose oligosaccharides.

Answer 215

שני הסוגים חולקים אזור ליבה משותף שמקורו באוליגוסכאריד N-linked שמוסף ב -ER הכולל שני GlcNAc ושלושה מנוזים, אבל ההבדל ביניהם הוא שבראשונה יש תוספת של סוכרים בהמשך התהליך ובשניה אין תוספת של סוכרים בגולג'י.

Answer 216

במחלקה זו האוליגוסכאריד N-linked שמוסף ב- ER נחתך וכאמור מתווספים סוכרים בהמשך, שמספרם משתנה כתלות באוליגוסכריד שאנו מייצרים. הרבה פעמים האזור הסופי נחתך כך שנשארים רק עם GlcNAc וגלקטוז או רק עם GlcNAc. כמו כן, פרוקטוז יכול להיות מוסף לפעמים, בד"כ בליבת ה-GlcNAc מחובר לאספרגין. מכאן ש Complex oligosaccharides יכולים להיות הטרוגניים.

Answer 217

במחלקה זו האוליגוסכאריד N-linked שמוסף ב- ER נחתך, עד נקודה מסויימת ולא ממשיך להיחתך הלאה. מה שחשוב במיוחד הוא שבמחלקה זו אין תוספת של סוכרים חדשים בגולג'י כמו NANA למשל. העץ פשוט כולל מנוזים נוספים. במחלקה זו אפשר למצוא גם "אוליגוסכרידים היברידיים" עם ענף מנוז אחד וענף GlcNAc וגלקטוז. לפעמים, שני הסוגים מחוברים (במקומות שונים) לאותה שרשרת פוליפפטידית

Answer 218

כיוון שהיא בעלת מטען שלילי

Answer 219

דבר תלוי במידה רבה במיקומו בחלבון. אם האוליגוסכריד נגיש לאנזימי העיבוד בגולג'י, סביר להניח שהוא יומר להיות Complex oligosaccharide. אם הוא אינו נגיש כיוון שהסוכרים שלו מוחזקים חזק על פני השטח של החלבון, הוא יישאר במצב high mannose .

Answer 220

1.ב- ER הוסף עץ הסוכרים לחלבון. 2. ב- ER מתבצעת הסרה של 3 גלוקוז ומאנוז ספציפי. 3. בגולג'י האנזים mannosidase I מסיר שלושה מנוזים. 4.האנזים N-acetylglucosamine transferase I מוסיף GlcNAc 5.האנזים Mannosidase II מסיר שני מנוזים. בשלב זה יש שלושה מנוזים שנמצאים ב- complex oligosaccharide. 5.בשלב זה הקשר בין שני N-acetylglucosamines בליבה הופך להיות עמיד בפני התקפה על ידי אנדוגליקוזידאז ספציפי ביותר מכיוון שכל המבנים המאוחרים יותר במסלול הם גם עמידים בפני אנדו H , הטיפול באנזים זה נמצא בשימוש נרחב כדי להבדיל בין complex oligosaccharide לבין high-mannose oligosaccharides. 5.בסופו של דבר מוספים N acetylglucosamines גלקטוזים וחומצה סיאלית. 6. השלב האחרון ליצירת complex oligosaccharide קורה בציסטרנות הגולג'י (ציס, מדיאל וטרנס). שלושה סוגים של אנזימי glycosyl transferase פועלים ברצף תוך שימוש בסוכרים שאוקטבו באמצעות נוקלאוטיד. הממברנות של ציסטרנות הגולג'י מכילות חלבונים נשאים ספציפיים לכל sugar nucleotide כזה להיכנס בתמורה לפוספט שמשוחרר לאחר שהסוכר נקשר לחלבון.

Answer 221

1.שימו לב שכאיברון ביוסינתטי, הגולג'י שונה מה- ER כל הסוכרים בגולג'י מורכבים בתוך הלומן מה- sugar nucleotide, ואילו ב- ER ה- N-linked precursor oligosaccharide( , מורכב חלק בציטוזול וחלק ב- ER, 2.ב- ER רוב התגובות שבלומן עושות שימוש ב- dolichol-linked suga

Answer 222

כל הגליקוליזציה שקורית בגולג'י

Answer 223

-מתבצעות על גבי החנקן האמידי בקבוצת ה- R של אספרגין -מתרחשות בעיקר ב-ER בגולג'י , גליקוזילציה מסוג N מתבצעת ל-GlcNAc הוא מוסף כמונוסכריד על אספרגין ואחריו מוספות עוד יחידות סוכריות.

Answer 224

\ מתבצעות על גבי ההידרוקסיל בשייר של סרין ותריאוניןובמקרים מסויימים גם על הידרוקסיל בהידרוקסיליזין והידרוקסיפרולין (כמו למשל בקולגן). מתבצעות בגולג'י על כל ארבעת חומצות האמינו שהזכרנו. אפשר למצוא O גליקוזילציות ב- ER אבל זה לא הכי שכיח. גם בציטוזול ובגרעין אפשר למצוא O גליקוזילציות, אך רק למונוסכריד של GlcNAc .

Answer 225

glycosyl transferase שמשתמשים ב-sugar nucleotides בלומן של הגולג'י. בד"כ, N-acetylgalactosamine מוסף ראשון ואחריו מספר וריאבילי של סוכרים – החל מכמה בודדים ועד מעל 10.

Answer 226

1. גורמת לתוצרי ביניים של קיפול להיות יותר מסיסים שכן השיירים הסוכריים הם מסיסים, וכך מונעת אגרגציה 2. , יוצרת "גליקו-קוד" של המשכיות על גבי החלבון: הקוד הזה מודיע איפה החלבון הזה כבר עבר, מאפשר קישור החלבון לצ'פרונים ו"מדריך" את החלבון, למשל ע"י קישור ללקטינים בER לטובת הולכה לגולג'י

Answer 227

לא נכון, היא מעלה את הספיחה של מולקולות מים

Answer 228

זאת כיוון ששרשראות סוכרים הם בעלות גמישות מוגבלת ואפילו אוליגוסכריד קטן שבולט מעל פני השטח של חלבון יכול להגביל גישה של מקרומולקולות אחרות אל החלבון. יכול להיות שהאוליגוסכרידים על חלבוני שטח התא סיפקו במקור מעין שכבת הגנה לתא. בהשוואה לדופן התא החיידקי הנוקשה, ל"ציפוי" סוכר כזה יש את היתרון בכך שהוא מותיר לתא את החופש לשנות צורה ולזוז.

Answer 229

ציפוי הריר באיברים כמו הריאות והמעי, מגן מפני פתוגנים רבים. ההכרה בשרשראות הסוכר על ידי לקטינים במרחב החוץ תאי חשובה בתהליכים התפתחותיים רבים ובזיהוי תא-תא. סלקטינים, למשל, הם לקטינים טרנסמברנרליים הפועלים בהיצמדות של תאים במהלך נדידת תאי דם. הם גם טובים בהתפתחות העובר

Answer 230

למשל העברת אותות דרך פני התא היא גורם חשוב בקביעת גורל התא. כך למשל Notch הוא חלבון טרנסממברנאלי שעובר גליקוזילציה מסוג O כך שמוסף לו fructose בודד על כמה שיירי סרין, תראונין והידרוקסיליזין. כמו כן, סוגי תאים מסויימים מבטאים glycosyl transferase נוסף שמוסיף N-acetylglucosamine לאותו fructose בגולג'י. התוספת הזו משנה את הספציפיות של Notch עבור אותות על פני התא שמגיעים אליו ומפעילים אותו, מה שיכול לשנות את הייעוד של התא.

Answer 231

בגולג'י שני המקרים התהליך תלוי בתורם הסולפט – 3ʹ phosphoadenosine- 5ʹ-phosphosulfate (PAPS), המועבר מהציטוזול אל הלומן של ה- TGN.

Answer 232

נכון מאוד

Answer 233

מודל הרואה את ציסטרנות הגולג'י כמבנים דינאמיים שעוברים שלבי "התבגרות" ולמעשה רוכשים ומאבדים חלבונים תושבי גולג'י ספציפיים. לפי מודל זה נוצרות כל הזמן ציסטרנות חדשות כקלסטרים צינוריים שהובאו מה-ER ואלו מתבגרים בהדרגה והפוכים להיות ציסטרנה מדיאלית ואז ציסטרנת טראנס. החלבונים תושבי גולגי הנישאים קדימה בתוך ציסטרנה בשלה מועברים לאחור באמצעות וזיקולות מצופות COP1 . לסיכום, לפי המודל הזה, הציסטרנה מתחילה בזהות מסויימת ומתקדמת להיות אחרת – כאמור, מבנה דינאמי שמשתנה.

Answer 234

מודל הרואה את ציסטרנות הגולג'י כמבנים ארוכי חיים, השומרים על מערכת החלבונים שלהם באופן קבוע במקומם. לפי מודל זה, חלבוני מטען מועברים מציסטרנה אחת לאחרת באמצעות וזיקולות טרנספורט. כלומר, ישנה העברת מולקולות מציס לטרנס דרך הגולגי שמתבצעת על ידי העברת וזיקולות קדימה, אותן שולחות הציסטרנות אחת לשנייה .

Answer 235

מודל ההתבגרות הציסטרנות מודל וזיקולת הטרנספורט שתינן נכונות

Answer 236

מטריקס הגולג'י

Answer 237

-גולג'ינים שהם חלבונים כמו מעין זרועות או חכות ארוכות הבנויים מדומיינים קשיחים של coiled-coil עם אזורי ציר השזורים זה בזה. הם מהווים "יער של זרועות" ויכולים להתרחב 100–400 nm מפני השטח של הגולג'י. תפקידם לעזור בשמירה על העברת וזיקולות הגולג'י קרוב לאיברון באמצעות אינטראקציות עם חלבוני Rab. הם "דגים" את ממברנות הגולג'י ואת הוזיקולות שמניצות מציסטרנה לציסטרנה. הם tail anchorsd והם מחוברים לציטוסקלון -

Answer 238

עוברים זרחון דבר שיגרום לפרגמנטציה של הגולג'י ולחתיכות להתפזר בציטוזול. לאחר מכן, הפרגמנטים מופצים לשני תאי הבת, שם הם עוברים דה זרחון שמאפשר בנייה מחדש של הגולג'י. באפופטוזיס מתרחש ביקוע פרוטאוליטי של הגולג'ינים על ידי קספאזות – מה שמותיר פרגמנטים של גולג'י כאשר התא משמיד את עצמו.

Answer 239

ממיין את החלבונים שיש בגולג'י

Answer 240

הליזוזום הוא איברון עטוף ממברנה המלא באנזימים הידרוליטיים מסיסים המעכלים מאקרומולקולות.

Answer 241

הליזוזומים מכילים כ-40 סוגים של אנזימים כאלה כולל פרוטאזות, נוקלאזות, גליקוזידאזות, ליפאזות, פוספוליפאזות, פוספטזות וסולפטאזות, כולם עובדים בצורה המיטבית ב- pH חומצי.

Answer 242

בליזוזום 4.5-5pH כלומר הוא פי מאה יותר חומצי מהציטזול, (7.2pH)

Answer 243

הנזק שהם יגרמו יהיה קטן יחסית (שכן הם יעבדו פחות טוב ב-pH7.2).

Answer 244

מה שמסייע להגן עליהם מפני פרוטאזות הליזוזום בלומן.

Answer 245

נושאים את התוצרים הסופיים של פירוק המאקרומולקולות כמו למשל חומצות אמינו, סוכרים ונוקלאוטידים, אל הציטוזול, שם התא יכול לעשות בהם שימוש חוזר או להפריש אותם. לכן אנו לפעמים מכנים אותו "איברון המחזור של התא".

Answer 246

האנדוזום

Answer 247

משאבת ATP מסוג ווקואולה (vacuolar H+ ATPase) כל הזמן מחמיצה את ה pH שלו.

Answer 248

למשאבה שנמצאת בכלורופלסט ולמשאבה שנמצאת במיטוכונדריה

Answer 249

נוסף למתן סביבה בעלת רמת pH נמוכה שמתאימה לתגובות המתרחשות בלומן האיברון, מעבר H + מספק מקור אנרגיה המניע את הובלת מטבוליטים קטנים על פני ממברנות האיברון.

Answer 250

הטרוגנית

Answer 251

ניתן לזהות אותם גם על ידי טכניקות היסטוכימיות החושפות אילו אברונים מכילים הידרולאזות חומציות.

Answer 252

בכמות וריאציות בכמות ובאופי החומר שהם מעכלים.

Answer 253

הוא מבצע בזכות ההידרוליזות - סטריליזציה של מה שהגיע אליו כמו למשל חיסול חיידקים ווירוסים, הרב מיקרואורגניזמים פאגוציטיים, ייצור נוטריינטים לתא. הגיוון המורפולוגי משקף גם את האופן בו הליזווזם נוצר. כמו כן יש טכניקה לפרק רכיבים אנדוגניים במנגנון האוטופגיה.

Answer 254

אנדוזומים מאוחרים מכילים חומר שהתקבל הן מהממברנה הפלסמטית על ידי אנדוציטוזיס והן מהידרולזות ליזוזומליות חדשות שסונתזו, ואלה מתמזגים עם לליזוזומים קיימים מראש ליצירת מבנים שלעתים מכונים אנדוליזוזומים, אשר אז מתאחים זה עם זה. בתמונה ניתן לראות מודל ל"התבגרות" ליזוזום – אנדוזומים מאוחרים מתאחים עם ליזוזומים קיימים או אנדוליזוזומים קיימים. אנדוליזוזומים מתבגרים בסופו של דבר לליזוזומים כאשר ההידרוליזות משלימות את העיכול.

Answer 255

בתוך האנדוליזוזום יש מרכיבי הידרוליזה כאשר הן מסיימות לפרק את כל מה שצריך האנדוליזוזום הופך לליזוזום

Answer 256

פשוט כ אחד מהם נמצא בשלבים אחרים במחזור ההתבגרות

Answer 257

וזייקולות שהן מלאות בנוזלים

Answer 258

30-90 אחוזים

Answer 259

הן דומות לליזוזומים

Answer 260

1. יכולות לאחסן נוטריינטים וחומרי פסולת 2. איברון מפרק 3. בקר לחץ טורגור 4. מכשיר הומאוסטטי ל- Ph

Answer 261

היא מייצרת ומפרקת מונומרים ע"י פוליפוספאט, היא מעבירה סוכרים וחומצות אמינו,

Answer 262

בוואוקולה

Answer 263

אנוציטוזה קלאסית – תהליך בו מאקרומולקולות נלקחות מהנוזל החוץ תאי. גורמת ליצירת האנדוזום המאוחר שיתאחה לליזוזום. פאגוציטוזה – בליעה של וירוס או חיידק כמו בניוטרופילים ובמאקרופגים בחולייתנים מובילה ליצירת פגוזומים. מאקרופינוציטוזה – מסלול זה מתמחה בספיגה לא ספציפית של נוזלים מהמברנה וחלקיקים המחוברים לממברנה הפלסמטית. במסגרת התהליך מתרחשת החזרת ממברנות אל הליזוזום (או ליתר דיוק, שליחה של חתיכת ממברנה אל האנדוזום המאוחר שיוביל לליזוזום), ללא מחזור של רכיבים לממברנה הפלסמטית. אוטופאגיה – תהליך בו התא "אוכל את עצמו" לצרכי שרידות או עיכול איברונים שחוקים. התא מייצר ממברנה כפולה סביב הרכיב אותו הוא רוצה לבלוע (למשל מיטוכונדריה) ליציאת אוטופאגוזום. בהמשך הוא יתאחה לליזוזום.

Answer 264

נכון, כולם מבצעים

Answer 265

- בדיפרנציאציה של תאים - הסתגלות ללחצים כמו רעב וזיהום

Answer 266

-מאפשרת לבלוע מאקרומולקולות, אגרגטים, חלבונים גדולים ואפילו איברונים שלמים שמנגנוני סילוק אחרים כמו פירוק פרוטאוזומלי אינם יכולים להתמודד איתם.

Answer 267

- יכולים למנוע מהתאים לפנות את החיידקים הפולשים אליהם - להוביל להצטברות אגרגטים של חלבונים לא רצויים וחלבונים לא תקינים וכך לתרום למחלות רבות החל מהפרעות זיהומיות ועד התנוונות עצבית וסרטן.

Answer 268

ביצירה של ממברנה דו שכבתית מסביב לאיזשהו איברון

Answer 269

1. פרוטאין קינאזות ו-mTOR בקומפלקס 1 שלו מאוקטבים ומאותתים על מצב מטבולי של התא. 2.התהליך מתחיל כשחלבון 9ATP חלבון טרנס ממברנאלי, גורם ליצירת ממברנה כפולה סביב האזור המיועד לבליעה ולמעשה יוצר אוטופאגוזום. אולם תחילה, אזור זה יסומן על ידי פולי-יוביקוויטין – מדובר על שרשרות ארוכות מאוד – מעל 20 יוביקוויטין ולא שרשרות קצרות כפי שיש בשליחה לפרוטאוזום. היוביקוויטין ייקשר קוולנטית לליפיד phosphatidylethanolamine ככל שתהליך מתקדם הממברנות מתאחות ונוצר מבנה דמוי חצי סהר. כאמור 9ATG קריטי לתהליך אבל מעניין לראות שהוא לא מצוי באוטופאגוזום השלם. כנראה בדרך לא ברורה הוא עוזב את הממברנה. לאחר מכן מתרחשת סגירה של הממברנה ליצירת אוטופאגוזום עם ממברנה כפולה. חלבוני SNARE מניעים את איחוי האוטופאגוזום והליזוזום. עיכול של הממברנה הפנימית ותוכן הלומן של האוטופאגוזום ע"י ההידרולאזות החומציות הפועלות שם.

Answer 270

לא נכון, היא יכולה להיות גם לא סלקטיבית

Answer 271

חלק גדול מהציטופלסמה נמצאת באוטופאגוזומים. אוטופאגיה כזו יכולה להופיע למשל בתנאי רעב: כאשר הנוטריינטים החיצוניים מוגבלים, מטבוליטים הנגזרים מעיכול הציטוזול שנלכד שם עשויים לעזור לתא לשרוד.

Answer 272

טען ספציפי ארוז ליצירת אוטופאגוזום הנוטה להכיל מעט ציטוזול, ושצורתו משקפת את צורת המטען. אוטופאגיה סלקטיבית מתווכת את הפירוק של מיטוכונדריות שחוקות או לא רצויות, פרוקסיזומים, ריבוזומים ו- ER , ויכולה לשמש גם להרס חיידקים ופולשים.

Answer 273

מיטופגיה

Answer 274

נזק למיטוכונדריה לא יכול לתחזק את גרדיאנט הפרוטונים, כך שייבוא חלבונים אליה נחסם. באופן נורמלי, פרוטאין קינאז בשם Pink1 מיובא לתוך המיטוכונדריה, נשמר במקום זאת על השטח המיטוכונדריאליים, שם הוא מגייס את היוביקוויטין ליגז Parkin מהציטוזול. הפרקין מסמן את חלבוני הממברנה החיצונית של המיטוכונדריה וכך האיברון מובל להרס סלקטיבי באוטופגוזומים.

Answer 275

יכול להוביל לפרקינסון

Answer 276

M6P אשר מוסף באופן בלעדי לעץ הסוכרים העשיר במאנוז של אנזימים ליזוזומליים מסיסים כאשר הם עוברים באתר ה CGN. הסימון ייקח את החלבון, שלרוב הוא הידרולאז, אל הליזוזום שם הוא עובד.

Answer 277

ב- TGN קיימים רצפטורים עבור M6P הממיינים הידרולאזות אל האנדוזום המוקדם אשר בהמשך יתאחה לליזוזום. חלבון המעטפת האחראי על פעילות זו הוא קלתרין.

Answer 278

בזכות ה- pH הנמוך באנדוזום המוקדם: הרצפטור שנקשר ל-M6P עושה זאת בpH6.5-6.7 שהוא הpH בלומן ה-TGN. לעומת זאת, הרצפטור משחרר אותו בpH6, שהוא הpH של האנדוזומים

Answer 279

לא נכון, הם יחזרו ל- tgn

Answer 280

זה כבר תלוי ב- rab

Answer 281

מחזור של kdel

Answer 282

אימרה לא נכונה ישנם הידרוליאזות אשר יצליחו להתחמק חלקן נמלטות מתהליך האריזה הרגיל ב- TGN ומועברות, כ"ברירת מחדל" לשטח הפנים של התא, שם הן מופרשות החוצה, לנוזל החוץ תא

Answer 283

הם יצליחו לתפוס הידרולאזות בעלות m6p ולהחזיר אותן אל התא העסרת אנדוציטוזה מתווכת קולטן

Answer 284

רצף חומצות אמינו שמסמן איזה מן החלבונים יהיו בעלי M6p

Answer 285

אותם ליקויים גורמים להצטברות של מצע לא מעוכל בליזוזומים, ולכך השלכות פתולוגיות קשות, לרוב במערכת הכצבים.

Answer 286

רוב המקרים קיימת מוטציה בגן המקודד להידרולאז ליזוזומלי מסויים

Answer 287

מחלת אגירה ליזוזומיאלית שבה חסר הידרולאז שהוא גליקוזאמינוגליקן

Answer 288

מחלת אגירה ליזוזומיאלית שבה כמעט כל האנזימים ההידרוליטיים חסרים בליזוזומים של סוגים רבים של תאים, והמצעים הבלתי מעוכלים שלהם מצטברים בליזוזומים, וגורמים כתוצאה מכך לגופיפים ששוקעים בתאים והורגים אותם. הפתולוגיה הנובעת מכך מורכבת, ומשפיעה על כל מערכות האיברים, שלמות השלד והתפתחות מנטאלית. רק לעיתים רחוקות אנשים הלוקים במחלה חיים מעבר לשש או שבע שנים.

Answer 289

מפגם בגן בודד והיא רצסיבית,המוטציה נמצאת בגן המקודד לאנזים GlcNac phosphotransferase אשר מעביר פוספאט מ- UDP-GlcNac למאנוז שמצוי על גבי הידרולאז שעתיד להיות פעיל בליזוזום. לפיכך, במחלה זו כל ההידרולאזות החסרות מהליזוזומים נמצאות בדם, זאת כיוון שהן לא מתמיינות כראוי בגולג'י – הן מופרשות במקום להיות מועברות לליזוזומים.

Answer 290

לא כי יש להם מסלולים אלטרנטיבים

Answer 291

אין פירוק של גליקוליפיד ספציפי ונוצרת שקיעה של חמרים של הגליקוליפיד הזה. שם האנזים החסר בטאי זקס: A-HEX והוא מפרק גנגליוזידים. מחלת אגירה ליזוזומיאלית

Answer 292

מחלת אגירה ליזוזומיאלית- חסר האנזים גלוקוסרברוזידאז החיוני כדי לפרק גליקוזיל-סרמיד. ספינגוליפיד זה מצוי בשפע גם במערכת העצבים המרכזית וגם בתאי דם אדומים (אריתרציטים). מכאן שהמחלה משפיעה גם על המוח שם קיימים גנגליונים וגם על הטחול שם מפורקים האריתרוציטים.

Answer 293

לא חלק מהתאים רכשו תכונות כך שהליזוזום יתאחה עם הממברנה הפלסמטית

Answer 294

פיגמנטים

Answer 295

תאי של האפידרמיס על ידי אקסוציטוזיה. לאחר מכן תופסים את הפיגמנט על ידי קרטינוציטים, מה שמוביל לפיגמנטציה רגילה של העור.

Answer 296

לאחר מכן תופסים את הפיגמנט על ידי קרטינוציטים, מה שמוביל לפיגמנטציה רגילה של העור. בחלק מההפרעות הגנטיות, ישנם פגמים ביציאת המלנוזומים,

Answer 297

מה שעוטף את הוזיקולה אשר מחזירה את m6p חזרה ל- גולגי

Answer 298

הוא תהליך איחוי של וזיקולות עם הממברנה הפלסמטית. וזיקולות הטרנספורט המיועדות לממברנה הפלסמטית עוזבות בד"כ את ה- TGN בזרם קבוע של "צינורות" סדירים. חלבוני הממברנה והליפידים באותן וזיקולות מספקים רכיבים חדשים לממברנה הפלסמטית ואילו אלו המסיסים מופרשים לחלל החוץ תאי

Answer 299

תאי הפרשה

Answer 300

חלבונים המיועדים לליזוזומים (דרך אנדוזומים) – חלבונים אלו בעלי סיגנאל M6P ויועברו בוזיקולות מצופות קלתרין. חלבונים המיועדים לוזיקולות הפרשה – חלבונים בעלי סיגנאל המפנה אותם לוזיקולות שהן חלק ממסלול הפרשה שנמצא רק בתאי הפרשה מיוחדים. חלבונים המיועדים לשליחה מיידית לפני שטח התא – בתאים לא פולאריים, אין צורך בסיגנאל שיוביל את החלבונים לפני השטח של התא. בתאים פולאריים כמו אפיתל זה מורכב יותר והחלבון צריך להיות מופנה למתחם הממברנלי הרלוונטי (למשל אפיקלי או באזולטראלי).

Answer 301

קונסטיסטיוטיבי

Answer 302

מסלול ההפרשה הקונסטיטוטיבי פועל בכל התאים. הרבה חלבונים מסיסים מופרשים כל העת באמצעות מסלול זה, המספק גם לממברנה הפלסמטית ליפידים וחלבונים ממברנאלים חדשים.

Answer 303

מסלול ההפרשה המושרה מתרחש בתאים מתמחים. במסגרת המסלול חלבונים נבחרים ב- TGN מועברים לויזקולות ההפרשה שם מרוכזים ומאוחסנים החלבונים עד אשר אות חוץ תאי ממריץ את הפרשתם. גם ההפרשה של מולקולות קטנות כמו היסטמין ונירוטרנסמיטרים מתרחשת באופן דומה - מולקולות אלה מועברות באופן פעיל מהציטוזול אל וזיקולות הפרשה, שם הן בדרך כלל קשורות למקרולולקולות ספציפיות (במקרה של היסטמין לפרוטאוגליקנים) כך שניתן לאחסן אותן בריכוז גבוה מבלי לייצר לחץ אוסמוטי גבוה מדי.

Answer 304

מעביר את רוב החלבונים ישירות לפני התא. משום שהכניסה למסלול לא דורשת אות מסויים הוא בבחינת "ברירת מחדל", ובאמת נקרא גם the default pathway. כך, בתא לא פולארי כמו תא דם לבן או פיברובלסט, נראה כי כל חלבון שמגיע ללומן הגולג'י נישא אוטומטית על ידי המסלול הקונסטיטוטיבי אל פני התא (אלא אם יש לו סיגנאל להחזרה ל-ER, או שהוא חלבון שמיועד להישאר בגולג'י או בליזוזום). בתאים פולאריים בהם יש לספר רכיבים שונים למתחמים שונים של ממברנת התא האפשרויות מורכבות יותר.

Answer 305

האחד, ריכוז חלבוני ההפרשה בוזיקולה תוך יצירת אגרגטים והחזרת ממברנות, והשני, ביקוע פרוטאוליטי.

Answer 306

חלבונים המיועדים להפרשה נקראים secretory proteins והם נארזים לוזיקולות מתאימות ב- TGN ע"י מנגנון הכרוך בצבירה סלקטיבית של חלבוני הפרשה. ניתן לראות במיקרוסקופ אלקטרוני מעין צברים באזור, וישנם סיגנאלים שמכווינים חלבוני הפרשה לצברים האלה. לא ברור כיצד אותם אגרגטים של חלבוני הפרשה מופרדים לוזיקולות הפרשה, והספר בוחר לא לפרט על הנושא. נציין כי וזיקולות ההפרשה כוללות חלבונים ייחודיים, חלקם עשויים לשמש לאגרגטים ב-TGN. עם זאת, הם גדולים מדיי ולכן כנראה הכנסת האגרגטים דומה לפאגוציטוזה בה ממברנת הפלזמה מכסה על מבנים גדולים. בתחילה, רוב הממברנה של וזיקולת ההפרשה העוזבת את ה- TGN עטופה באופן רופף סביב האגרגטים של חלבוני ההפרשה.

Answer 307

כל שהוזיקולות מתבגרות, הן מתאחות זו עם זו ותוכנם מתרכז . 1.הדבר קורה ככל הנראה הן מהחזרה של ממברנה ל- TGN 2.מהחמצה מתקדמת של לומן הוזיקולה הנובעת מהריכוז הגובה של V-type ATPases

Answer 308

מה- er לאדום גולגי

Answer 309

הוזיקולות שמתווכות את החזרת הממברנות הן וזיקולות מצופות קלתרין שכפי שניתן לראות בתמונה A נראות מניצות כבר מוזיקולה לא בוגרת שטרם הונצה מהגולג'י.

Answer 310

בנוזל חוץ תאי אובוזיקולות הפרשה סיבה: להפיעל חלבונים

Answer 311

לחלבוני פרקורסור רבים יש זנב N טרמינאלי פרו פפטידי (N-terminal pro-peptide) שביקועו מוביל ליצירת החלבון הבוגר. חלבונים אלה מסונתזים כ-pre-pro-proteins וה- pre-peptide מורכב מרצף ה- ER signal peptide שנחתך מוקדם יותר בER.

Answer 312

1.לחלבוני פרקורסור רבים יש זנב N טרמינאלי פרו פפטידי (N-terminal pro-peptide) שביקועו מוביל ליצירת החלבון הבוגר. חלבונים אלה מסונתזים כ-pre-pro-proteins וה- pre-peptide מורכב מרצף ה- ER signal peptide שנחתך מוקדם יותר, ב ER. 2. מולקולות סיגנלים חלבוניות מיוצרות כ-polyproteins וכוללות עותקים רבים של אותו רצף חומצות אמינו. 3.במקרים עוד יותר מורכבים, מולקולות סיגנאלים חלבוניות מסונתזות כ- single polyprotein המהווה פרקורסור לתוצרים הסופים שמבוקעים מאותו פוליפפטיד התחלתי (בשונה מקודם, לא מדובר על אותו רצף של חומצות אמינו אלא על תוצרים שונים מאותו חלבון התחלתי).

Answer 313

-חלק מהפפטידים המיוצרים בדרך זו למשל ה-enkephalins (נוירופפטידים עם 5 חומצות אמינו בעלי פעילות דמויית מורפין), הם קצרים מדיי בצורתם הבוגרת כדי להיות מועברים ללומן ה- ER או לכלול את הסיגנאל לאריזה בוזיקולות הפרשה. 2. סיבה נוספת היא שיש בכך יתרון לאנזימים הידרוליטיים שמופרשים או לכל חלבון אחר שפעילותו עלולה להזיק לתא שמייצר אותו – עיכוב הפעלת החלבון עד שהוא מגיע להפרשה, זאת כדי למנוע הפעלה בטרם עת של חלבון שיכול להזיק.

Answer 314

תאי עצב וכמה תאים אנדוקריניים, מכילים שני סוגים של וזיקולות הפרשה. כמו כל התאים המפרישים, התאים הללו אורזים חלבונים ונירופפטידים בוזיקולות הפרשה בצורה צפופה בדרך הרגילה שתיארנו. עם זאת, הם משתמשים גם בסוג מיוחד של וזיקולות הפרשה זעירות (כ-50 ננומטר קוטרן) הנקראות וזיקולות סינפטיות.

Answer 315

מאחסנות מולקולות נוירוטרנסמיטורים קטנות כמו אצטילכולין, גלוטמט, גליצית ו- GABA(γ-aminobutyric acid) , המתווכות סיגנאלים מהירים מתאי העצבים לתאי המטרה בסינפסה הכימית. כאשר פוטנציאל פעולה מגיע לטרמינל עצמי, הוא גורם לשטף של סימן דרך תעלות סידן תלויות מתח, מה שמפעיל את הוזיקולות הסינפטיות להאחות עם הממברנ ההפלסמטית ולשחרר את תוכן לחלל החוץ תאי. חלק מהנוירונים יורים יותר מ-1000 פעמים בשניה, ומשחררים נוירוטרנסמיטורים בכל פעם.

Answer 316

לא נכון .

Answer 317

1. לאחר עגינת הוזיקולה בממברנה הפלסמית הם עוברים שלב של "תיחול" שמכין אותם לאיחוי מהיר. 2. חלבוני SNAREs מזווגים חלקית זה ללזה, והם לא נסגרים במלואים להידוק ההליקס הדורש לאיחוי. 3. חלבונים בשם complexins "מקפיאים" את קומפלקסי ה-SNARE . ה"בלם" על חלבוני ה- SNARE משתחרר כאשר חלבון אחר, בשם synaptotagmin המכיל אתרי קישור לסידן נקשר בעת שריכוז הסידן עולה. כאשר ה-SNARE נכרכים אחד על השני נפתח "חור" שנוצר מהאיחוי. והנוירוטרנסמיטרים משתחררים.

Answer 318

לא נכון מעט

Answer 319

v-SNARE בשם synaptobrevin ו-t-SNARE בשם syntaxin שניהם חלבונים טרנסממברנאליים וכל אחד מהם תורם אלפא הליקס לקומפלקס. לעומת זאת, SNAP25 שהוא גם t-SNARE הוא חלבון פריפריאלי, ותורם 2 אלפא הליקסי. עוד משתתפים בתהליך – סינפטוטגמין (שהוא סנסור של סידן) ו-complexin שמהווה "בלם" ל-SNAREs. בתחילה הוזיקולה עוברת עיגון וצרור ה- SNAREs נוצר חלקית כך שנוצרת "primed vesicle”". קומפלקסין מונע את האיחוי בטרם עת. בהגעת פוטנציאל פעולה, סידן נכנס לתא וריכוזו עולה, הוא נקשר לסינפטוטגמין שמשחרר את ה"בלם" שהיווה הקומפלקסים. ארגון נוסף משלים את תגובת האיחוי בצעד הבא SNAREs משוחררים כך שניתן לעשות בהם שימוש חוזר. הסידור המשוכלל הזה מאפשר כמור למנגנון האיחוי להגיב בסולם הזמן המהיר והחוזרני של אלפיות השניה הנדרש לסינגנלים סינפטיים.

Answer 320

לחדש את מלאי הוזיקולות הסינפטיות במהירות לאחר שחרורן.

Answer 321

מרביתן לא נוצרות ממברנת הגולג'י בגוף תא העצב אלא ע"י מחזור מקומי של הממברנה הפרה-סינפטית.

Answer 322

הכנסת הנוירוטרנסמיטר ישירות לוזיקולות האנדוציטיות הקטנות הנוצרות מהממברנה הפלסמטית מתווכת כ"י גרדיאנט פרוטונים המתוחזק ע"י משאבות ATPase H+ המצויים על ממברנת הוזיקולה.

Answer 323

מכיוון שהוזיקולות הסינפטיות שופעות ואחידות יחסית בגודלן

Answer 324

7000 מולקולות פוספוליפידים ו-5700 מולקולות כולסטרול. אחת מהוזיקולות מכילה גם קרוב ל -50 מולקולות חלבון אינטגרליות שונות, המשתנות במידה רבה בשפע היחסי שלהן ותורמות יחד כ- 600 אלפא הליקסים טראנסממברנאלים.

Answer 325

v-SNARE synaptobrevin

Answer 326

V-ATPase שעושה שימוש ב-ATP כדי לשאוב פרוטונים לוזיקולה, קיימת רק בעותק אחד או שניים בכל וזיקולה. גרדיאנט הפרוטונים מספק את האנרגיה למעבר נוירוטרנסמיטרים ע"י אנטיפורט פרוטון-נוירוטרנסמיטר אשר מעמיס 1800 מולקולות נוירוטרנסמיטר .

Answer 327

כאשר וזיקולת הפרשה מתאחה לממברנה הפלסמטית תכולתה מופרשת ע"י אקסוציטוזה אבל הממברנה שלה הופכת להיות חלק מהממברנה הפלסמטית ולכאורה הדבר מגדיל את שטח הממברנה הפלסמטית, אולם למעשה מתקיימת אנדוציטוזה כמעט באותו קצב. לאחר שהיא מוסרת מהממברנה, הוזיקולה ממוחזרת או מועברת לליזוזומים לפירוק.

Answer 328

אקסוציטוזה- כי התא צריך לגדול

Answer 329

תהליך שבו יש איחוי של ממברנות, והגדלה של ממברנה בגלל חלוקת תאים של זבוב

Answer 330

בתהליך מדהים המערב הן איחוי הומוטיפי של וזיקולות והן אקסוציטוזה, מתרחש תיקון זמני ומהיר של פני התא ממברנות פנימיות וזמינות. התיקון מסייע הן לחסימת נזילות והן להורדת מתח הממברנה של האזור הפצוע. תהליך התיקון הזה מופעל ע"י עלייה פתאומית ביוני הסידן הנמצאים בשפע בחלל החוץ תאי ולכן בעת קרע הוא נכנס במהירות לתא

Answer 331

אפשר לחשוב על שתי אסטרטגיות לפתרון – האחת, היא להעביר רכיבי ממברנה בדיוק לאן שהם צריכים להגיע, והשניה, להעביר רכיבי ממברנה לכל שטח התא ללא הבחנה ולאחר מכן להוריד משם או לחסל את אלו שלא צריך.

Answer 332

-במסלול הישיר חלבונים המיועדים לתחומי ממברנה מסויימים ממוינים ונארזים לוזיקולות טרנספורט שונות. לדוגמה , lipid-raft-dependent delivery system לממברנה האפיקלית עליה נדון מיד. - במסלול העקיף חלבונים מוחזרים מאזור הממברנה הלא מתאים ע"י אנדוציטוזה ואז מועבר לאזור הממברנה הנכון דך אנדוזומים מוקדמים (וזו למעשה טראנסציטוזה). לדוגמה, הפטוציטים בכבד משמשים אותנו כדי להעביר חלבונים למתחם האפיקלי הגובל בדרכי המרה.

Answer 333

במסלול הישיר חלבונים המיועדים לתחומי ממברנה מסויימים ממוינים ונארזים לוזיקולות טרנספורט שונות.

Answer 334

כך למשל תאי אפיתל המצפים את המעי מפרישים אנזימי עיכול וריר על פני השטח האפיקליים (הפונים לסביבה החיצונית) ורכיבים מסויים ללמינה הבזאלית לפני השטח הבאזולטרליים. חלבונים מה-ER המיועדים לאזורים שונים נודדים יחד שהם מגיעים ל-TGN שם הם מופרדים ונשלחים להפרשה או לממברנה הפלסמטית המתאימה.

Answer 335

גליקוספינגוליפידים המסייעים בהגנה על משטח חשוף זה מפני נזק .

Answer 336

כמו כן, חלבונים ממברנלים שקושרים ממברנה דו שכבתית ע"י GPI anchor נמצאים בעיקר בממברנה האפיקלית . חלבונים מעוגנים ב-GPI נשבים ככאלה שנקשרים לצד האפיקלי בגלל שהם נקשרים לגליקוספינגוליפידים ב-lipid rafts הנוצרות ב -TGN (ולאחר שקשרו מטען מתאים נודדות הרפסודות ההלו לממברנה האפיקלית).

Answer 337

חלבוני ממברנה המיועדים לממברנה הבזולטראלית מכילים אותות בזנב הציטוזולי שלהם. כאשר הם נמצאים בהקשר מבני מתאים, אותם אותות מוכרים ע"י חלבוני מעטפת אשר אורזים אותם לוזיקולות טרנספורט ב- TGN. אותם האותות הבזולטראליים המוכרים ב- TGN מתפקדים גם באנדוזומים המוקדמים לשם הפניית החלבונים חזרה לממברנה הבזולטראלית לאחר האנדוציטוזה.

biology of the cell2 Flashcards

(420 cards)