Chap 6 phys - Photosynthèse Flashcards

1
Q

Comment sont adaptées les feuilles pour la photosynthèse?

A

Adaptation pour maximiser: absorption de l’énergie lumineuse, échange gazeux, exportation des photosynthétats et approvisionnement en eau et minéraux
Chevauchement des feuilles:
utilisation plus efficace de l’énergie lumineuse, diminution des pertes d’eau, augmente l’absorption du CO2
Augmentation de la surface foliaire p/r volume
Angle d’insertion de la feuille p/r tige
Feuille mince -> transmission des ondes lumineuse à travers le mésophylle (côté lumière: épiderme translucide, cuticule épaisse, peu ou pas de stomate/ côté ombré: principal contact avec le CO2, mince cuticule, nombreux stomate)
Pour favoriser la transmission et guider la lumière: parenchyme palissadique: site principale pour photosynthèse, plusieurs chloroplaste, longue cellule +/- rectangulaire, petit espaces intercellulaires guidant la lumière, plusieurs couche pour maximiser l’interception des quanta / parenchyme lacuneux: absorption et transport du CO2, grande cellules +/- irrégulière, très grande espaces intercellulaire / la lumière est guidé selon l’architecture de la feuille vers les couches inférieurs (réflexion, réfraction, absorption) (absorption/ effet tamis/ effet lentille/ refraction/ reflection) une partie seulement de la lumière atteint les chloroplaste, une partie seulement du spectre est utile

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2
Q

Comparez la photosynthèse et la respiration.

A
Respiration: 
-besoin d'oxygène, composé organique
-produit CO2, H2O, énergie
-dans le cytoplasme et mitochondrie
Photosynthèse:
-besoin de CO2, lumière
-produit O2, composé organique
-dans chloroplaste
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3
Q

Qu’est-ce que le point de compensation? Comparez chez les plantes en C3 vs C4.

A

Quantité de lumière permettant d’avoir autant de CO2 fixé que de CO2 produit
CO2 absorbé= CO2 dégagé
synthèse net nulle car synthèse=dégradation
Point de compensation C4 plus faible que C3

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4
Q

Discutez de l’importance de la quantité, qualité et durée de la lumière pour la photosynthèse.

A

Quantité:
-Irradiance ou éclairement énergétique: flux de photon qui frappent une surface plane
-Éclairement lumineux: irradiance dans la lumière visible par unité de surface en lumen m-2
-Lumière visible active dans la photosynthèse 400-700nm
unité: Lumen (flux lumineux émis par une chandelle à une distance de 1m sur surface 1m2), Lux= lumen/m2, Einstein= énergie fournit par 1mol de photon, Pied-chandelle= énergie de 1Lm/pi2
Qualité: distribution de l’énergie spectrale (SED) variable selon la source et varie dans le spectre solaire/ lampe artificielle: fluorescence: élevé dans le bleu et diminue dans le rouge/ incandescence: peu dans le bleu, important dans le rouge et l’infrarouge/ certain processus physiologique régulé par des longueur d’onde précise (floraison, germination rouge/ photosynthèse, ouverture stomate bleu)
Durée:
-Minimum trophique: végétaux doivent recevoir une durée minimale d’éclairement
-Photopériodisme quotidien: interruption périodique de la lumière pour réguler certain processus et pour favoriser la respiration
-Photopériodisme saisonnier: permet la survie en saison froide

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5
Q

Comment se fait l’absorption de l’énergie lumineuse? (deux lois)

A

Loi de Grotthuss-Draper:
-Seule l’énergie lumineuse absorbée peut participer à une réaction photochimique
Loi Stark-Einstein(équivalence photochimique):
-Sauf exception, le nombre de photon absorbé est égal au nombre de molécule accédant à un état excité
-donc un seul photon absorbé par une molécule peut modifier l’état d’excitation de cette molécule

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6
Q

Comment l’énergie transférée du photon modifie l’électron qui l’absorbe?

A

Transfert très rapide de l’énergie du photon à l’électron du pigment, l’électron excité change d’état d’excitation (modification du spin des électrons de valence),
-électron excité= état singulet, instable, libération d’énergie pour revenir à un état plus stable
-État triplet: état plus stable ou métastable
-État stable
Électron en paire dans une orbitale, électron qui absorbe de l’énergie devient excité à niveau d’énergie plus élevé (conserve son orientation dans le spin) état singulet, lorsque l’électron excité n’est plus en paire (change de spin) devient état triplet
Excitation photon bleu: 2e état singulet –>chaleur–>1e état singulet–>fluorescence–>état triplet–>phosphorescence
Excitation photon rouge: 1e état singulet–>fluorescence–> état triplet–> phosphorescence

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7
Q

Quels sont les modes de dissipation de l’énergie lumineuse?

A
  • Chaleur: désactivation thermique
  • Lumière: sous forme de lumière
  • -Fluorescence: sous forme de photon; cesse rapidement après l’excitation
  • -Phosphorescence: sous forme de photon; persiste un temps considérable après l’arrêt de l’excitation
  • Résonance inductive: énergie excédentaire est transféré à un pigment adjacent
  • -explique la plus grande partie du transfert d’énergie entre pigment (chloroplaste)
  • -très efficace, mais les pigments doivent être très proches
  • -perte d’énergie sous forme de chaleur
  • Réaction photochimique: réaction d’oxydation où l’électron excité est cédé à un accepteur=photo-oxydation
  • -pigment oxydé, accepteur réduit
  • -électron peut participer aux réaction photochimique à l’état triplet –> désactivation thermique si excité par un photon de lumière bleue
  • –première étape de photosynthèse
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8
Q

Qu’est-ce qui permet la réaction photochimique?

A

Réaction photochimique: réaction d’oxydation où l’électron excité est cédé à un accepteur=photo-oxydation

  • -pigment oxydé, accepteur réduit
  • -électron peut participer aux réaction photochimique à l’état triplet –> désactivation thermique si excité par un photon de lumière bleue
  • –première étape de photosynthèse
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9
Q

Quels sont les différents pigments photorécepteurs?

A

Photorecepteur: pigment qui absorbe la lumière utile pour une réaction physiologique

  • Spectre d’absorption du pigment: capacité d’une substance d’absorber la lumière en fonction des diverses longueurs d’ondes
  • Spectre d’action: Efficacité du processus physiologique en fonction de la longueur d’onde, le spectre devrait s’apparenter au spectre d’absorption mais plusieurs pigments peuvent participer à un même processus
  • Chlorophylle
  • Caroténoide
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10
Q

Quels sont les particularités de la chlorophylle?

A

-Pigments capteur de lumière pour la photosynthèse
-hydrophobe, dans les membranes lipidiques des chloroplaste (thylacoide)
-plusieurs sortes: absorbe et transfère la lumière vers le centre réactif= site de réaction photochimique
Spectre d’absorption chlorophylle a et b: spécifique à certaines longueurs d’ondes, surtout rouge et bleu, peu dans le vert
Structure:
-tête porphyrine, tétrapyrrole cyclique fait en 4 anneaux pyrrolique contenant du N arrangé en cycle
-au centre Mg2+ chélaté (première molec accept e-)
-queue de phytol: 20 hydrocarbone liposoluble
Chlorophylle a:
-tout organisme photosynthétique
-groupement méthyle
-centre réactif
Chlorophylle b:
-groupement tormyl
-tout organisme photosynthétique (absence non létal)
-synthétisé a/p chlorophylle a
Chlorophylle c:
-chez les algues, sans queue de phytol
Chlorophylle d:
-seulement algue rouge
-structure très proche à chlorophylle a

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11
Q

Quels sont les particularités des caroténoides?

A

-Pigment jaune et orange présent chez tous les phototrophe
-Permettent l’élargissement du spectre d’absorption
Structure:
-terpénoide
-liposoluble, insoluble dans eau, membrane des chloroplaste ou chromoplaste
Carotène:
-orange et rouge orangé
-Béta chez algue et végétaux supérieur/ alpha petite quantité/ lycopène chez tomate
-associé a des protéines
-forte absorption dans le bleu
-absorbent jusqu’a 40 % de l’énergie lumineuse transféré aux centres réactifs
-protègent la chlorophylles de la photo-oxydation lors de forte intensité lumineuse (anti-oxydant se combine avec des radicaux libre oxygéné= xanthophylle)
Photooxydation: perte d’électron en présence de la lumière, réaction avec espèce réactive de l’oxygène (ROS)
Xanthophylle:
-jaune, carotène oxygéné
-alpha-carotène oxygéné= lutéine/ beta-carotène oxygéné=zéanxanthine

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12
Q

Définissez et distinguez spectre d’absorption et spectre d’action.

A

Spectre d’absorption du pigment: capacité d’une substance d’absorber la lumière en fonction des diverses longueurs d’ondes
Spectre d’action: Efficacité du processus physiologique en fonction de la longueur d’onde.
Le spectre d’action peut être élargie par rapport au spectre d’absorption s’il y a plusieurs pigments qui participent au même processus

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13
Q

Qu’est-ce que la phase photochimique?

– Où a-t-elle lieu?

A

Transfert linéaire d’électron: centre réactif du photosystème II via cytochrome b6/f et photosystème I; production NADPH; associé à la production ATP
À lieu dans les chloroplastes, dans les thylacoides

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14
Q

Qu’est-ce que la phase photochimique?

-Quels complexes sont impliqués dans la capture de l’énergie lumineuse?

A

Absorption de la lumière: Électron excité au centre réactif qui participe à la réaction photochimique à l’état triplet
Oxydation: l’électron excité du centre réactif est cédé à un accepteur=> photooxydation
Antenne: pigment +protéine, captent les photons, guide l’énergie d’excitation par résonance inductive -> centre réactif = 2 chlorophylle a + protéine
Plusieurs pigments différents permettent d’augmenter l’efficacité de la capture de lumière
Centre réactionnel de PSII: P680
Centre réactionnel de PSI: P700
Seul les chlorophylles a du PSII participent à la réaction photochimique

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15
Q

Qu’est-ce que la phase photochimique?

-Quels complexes sont impliqués dans le transfert des électrons?

A

Photon absorbé par la chlorophylle P680 du centre réactif PSII -> P680* devient photooxydé -> électron cédé à phéophytine- formation de P680+ et phéo- (1e accepteur e) -> Phéo- donne e à Quinone A puis Quinone B (cycle répété avec 2e électron, double réduction de QB2-) -> électron rejoigne le cycle des quinone -> QB2- se détache du complexe PSII et réagit avec 2 H+ du stroma -> PQH2= plastohydroquinone ou plastoquinol, déplacement vers cyt b6/f (et libère 2 H+ dans lumen) -> un e- passe par le cytochrome b6 (2 types) et retourne dans le pool des PQ -> un deuxième électron est tranféré du plastoquinol à une protéine fer-soufre puis au cytochrome f avant d’aller vers le PSI via le Plastocyanine (PC) (2H+ sont libéré dans le lumen par cycle Q) -> en même temps, un photon excite P700 (Photooxydation), électron transféré à une chlorophylle A0 puis quinone A1 puis au protéine FeS(Fx,Fb, Fa) et à la ferrédoxine NADP- réductase où NADPH est produit. au PSI= P700+: l’électron perdu est remplacé par celui apporté par la plastocyanine

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16
Q

Qu’est-ce que la phase photochimique?

-Quels sont les transporteurs mobiles?

A

Plastoquinone (PQ) : cycle Q: transfert des e- entre PSII et complexe cyt b6/f
Plastocyanine (PC): petite protéine hydrosoluble contenant du Cu, transfert des e- entre complexe cyt b6/f et PSI
Ferrédoxine (Fd): protéine fer-souffre, transfert des e- du PSI vers cyt b6/f

17
Q

Qu’est-ce que la phase photochimique?

-Qu’est-ce qui est produit pendant cette phase?

A

Flux continu et linéaire d’électron entre H2O et NADP+
- production de NADPH (via PSII/PSI/cyt b6-f)
- formation d’ATP associé au processus
pour 2 e- accepté par PSI, 4H+ libéré dans lumen
Cycle complet:
-6 photons requis pour la production d’une molécule d’O2
– 4 pour exciter PSII (4 e- PSII remplacé par 4e- de H2O)
–2 pour exciter PSI (2e- PSI remplacé par 2e- de PC)
-Permet la production de 2 NADPH

18
Q

Quel est l’organisation des thylacoides?

A
Les complexes ne sont pas côte à côte dans les thylacoides
Photosystème PSII (vers l'intérieur) et PSI (vers le stroma)
Complexe cytochrome b6/f (intérieur et vers stroma)
ATP synthase (vers stroma)
19
Q

Qu’est-ce que la phase photochimique?

-Comparez la photophosphorylation acyclique vs cyclique

A

Cyclique: PSI peut transporter des e- indépendamment de PSII, seul de l’ATP est produit
P700-> ferrédoxine-> cyt b6-> PQ (pompage H+) -> cyt f ->Pc-> revient P700+
Pompage de proton dans le lumen pour la production d’ATP mais pas d’oxydation de l’eau, pas de dégagement d’O2, pas de réduction de NADP+
La phosphorylation cyclique est particulièrement importante pour la production d’ATP dans les chloroplaste de la gaine périvasculaire

20
Q

Quel est l’organisation des thylacoides?

A
Les complexes ne sont pas côte à côte dans les thylacoides
Photosystème PSII (vers l'intérieur) et PSI (vers le stroma)
Complexe cytochrome b6/f (intérieur et vers stroma)
ATP synthase (vers stroma)
21
Q

Comment se fait la synthèse d’ATP associé à la phase photochimique? et l’ATP est utilisé pour quoi?

A

ATP utilisé dans la phase thermochimique + autre réactions du chloroplaste
Réalisé par l’ATP synthase: complexe protéique composé des sous-unités CF0-CF1, ne participe pas à la chaine de transfert des électrons
Le gradient de H+ accumulé dans le lumen active la synthèse d’ATP
Origine des H+: oxydation de l’eau, 4H+ a/p de 2 H2O, cycle des plastoquinones
La membrane thylacoidale est peu perméable aux ions H+ sauf via le CF0
gradient de pH entre stroma et espace inter-thylacoidal
gradient de charge électrique,le lumen étant chargé positivement

22
Q

Qu’est-ce que la phase thermochimique?

A

Fixation et réduction du CO2 pour produire des molécules à 3C (trioses phosphate) servant à la synthèse de différent glucides
aussi appelé phase obscure mais requiert lumière pour activer certaine enzymes
Cycle en C3 utilisé par toutes les espèces; cycle de réduction du CO2

23
Q

Qu’est-ce que la phase thermochimique?

-Où et quand a-t-elle lieu?

A

Dans le stroma du chloroplaste
Dans les cellules photosynthétiques:
-Enveloppe des chloroplastes : trèsperméable au CO2, mais pas au bicarbonate
-L’anhydrase carbonique AC du chloroplaste favorise la formation de HCO3- et la diffusion du CO2 dans les chloroplastes
-L’AC peut (à proximité du rubisco) reconvertir HCO3- en CO2

24
Q

Qu’est-ce que la phase thermochimique?

– Quelles sont les étapes? en C3

A

Carboxylation:
–fixation du CO2 sur accepteur 5C (ribulose-1,5-bisphosphate)/ enzyme: ribulose biphosphate carboxylase oxygénase (rubisco) (fixe CO2 ou O2 selon condition du milieu/ activité régulé par la lumière)- résultat molécule en 6C qui se scinde rapidement en 2 molec a 3C (3-phosphoglycérate)
Réduction du 3-PGA
–3-phosphoglycérate réduit en glycéraldéhyde-3-p en 2 étapes: 3-PGA phosphorylé en 1,3-biphosphoglycérate (besoin ATP) qui est réduit en glycéraldéhyde-3-P (besoin NADPH) qui est isoméré en trioses-P ou converti en dihydroxyacétone-phosphate
–pour 3 CO2 fixé= 6 trioses-P (5 G3P recyclé en RuBP/ i G3P exporté dans le cytoplasme et converti en hexose)
Régénération du RuBP
–série de réaction impliquant des sucres 4-5-6-7C/ condensation du fructose-phosphate avec un triose-phosphate pour donner des sucre en 4-5C… pls étapes… puis transformé en ribulose-5-P-> phosphorylé en ribulose-1,5-bisphosphate

25
Q

Qu’est-ce que la phase thermochimique?

– Combien de CO2 fixés pour former une molécule d’hexose? de saccharose ?

A

C3: 6 CO2 fixé pour 1 molécule d’hexose et 12 CO2 fixé pour 1 molécule de saccharose

26
Q

Qu’est-ce que la phase thermochimique?

– Combien d’énergie (ATP, NADPH) est requise?

A

C3: chaque CO2 utilise 2 NADPH et 3 ATP
C4: chaque CO2 utilise 2 NADPH et 5 ATP

27
Q

Quel sont les particularité et avantages des plante en C4?

A

Particularité:
-plante d’origine tropicale,
-particularité anatomique : séparation dans l’espace de la fixation (mésophylle ) et la réduction du CO2 (gaine périvasculaire)
-anatomie de Kranz: feuille en C4 plus mince, avec veine vert foncé, mésophylle: parenchyme non différencié en palissadique et lacuneux; moins aéré
–Cellule du mésophylle: chloroplaste n’accumulent pas d’amidon
–Cellule de la gaine périvasculaire: autour des nervure, arrangement compact, nombreux chloroplaste qui peuvent emmagasiner l’amidon, exportation rapide des photosynthétats
Avantage:
-concentration du CO2 dans les cellules de la gaine périvaculaire où à lieu la cycle à C3 (10x plus de CO2 que plante à C3/ supprime photorespiration/ augmente taux photosynthèse)
-meilleure survie en condition stress hydrique même si CO2 est limitant (coefficient de transpiration plus faible)
-pas d’inhibition de la photosynthèse par l’oxygène
-point de compensation beaucoup plus faible que les C3
–Optimum à haute température (enzyme plus stable), à forte luminosité (excès de lumière utilisé ici pour accumuler ATP, concentrer le CO2 et augmenter assimilation nette de carbone
–Mauvaise croissance à faible température

28
Q

Qu’est-ce que la phase thermochimique?

– Quelles sont les étapes? en C4

A

Carboxylation:
–mésophylle
–CO2 fixé sur molécule à 3 C le phosphoénol pyruvate
–enzyme: phosphoénol pyruvate carboxylase: fice ions HCO3- seulement, très abondant dans le cytoplasme des cellules du mésophylle; très grande affinité pour le HCO3- même dans des condition extrême de chaleur et sec
– 1e produit de la fixation du CO2 sous forme de HCO3-: molécule à 4 C oxaloacétate–> réduit en malate ou transaminé en aspartate, puis transporté vers la gaine périvasculaire
Réduction du CO2
–Gaine périvasculaire
–décarboxylation de la molécule à 4C: libère du CO2 qui est refixé sur une molécule de RuBP grâce à la rubisco, tranformation en triose-P
Régénération du PEP:
-mésophylle
-phosphorylation du pyruvate en PEP dans le chloroplaste

29
Q

Quels sont les particularités des plantes CAM?

A

Présente dans des milieux désertiques
Particularité: fixation et réduction du CO2 séparé dans le temps pour minimiser les pertes d’eau/ nuit: stomate ouvert-> entré CO2/CO2 fixé sur PEP (HCO3-) par PEPcase et donne une molécule d’oxaloacétate
Nuit:
PEP+HCO3- ->PEPcase-> oxaloacétate -> NADPH -> réduit en malate -> entreposé dans vacuole en a. malique (provenance du PEP de l’hydrolyse d’amidon des chloropkaste des cellules de garde en trioses-P
Jour:
Stomate fermé/ sortie de l’acide malique -> malate ->décarboxylation -> pyruvate ou PEP (–> réductionen trioses-P reconverti en amidon) + CO2 (cycle C3)
Avantage:
Concentre le CO2 dans les cellules photosynthétiques
Plante bien adapté aux condition de sécheresse en utilisant le CO2 entreposé la nuit
Coefficient de transpiration très faible
Désavantage:
Assimilation lente (pousse plus lentement mais CO2 est fixé même si peu d’eau )
Différence avec les C4: pas d’anatomie particulière, le PEP provient des réserves, pas de cycle de régénération

30
Q

Qu’est-ce que la photorespiration? Où et quand a-t-elle lieu? Comment? Pourquoi? Quel est son impact?

A

CO2 produit lors de la phase lumineuse de la photosynthèse (peut se poursuivre peu après l’extinction de la lumière/ uniquement cellules chlorophylienne/ cause perte de C sous forme de CO2/ consommation d’O2 et d’énergie sous forme d’ATP
Dua à la fonction oxygénase de la rubisco (oxydation des produit de la photosynthèse par le cycle du glycolate qui se déroule dans plusieurs organites : chloroplaste, peroxysome, mitochondrie)
Voie du glycolate:
-dans chloroplaste, en présence d’O2; rubisco= oxygénase/ convertit le RuBP en 3-PGA et en phosphoglycolate/ déphsophorylation en glycolate
-Péroxysome: glycolate oxydé en glyoxylate transaminé en glycine
-mitochondrie: glycine transformée en sérine + CO2 (relâché)
-Péroxysome: sérine transaminé en hydroxypyruvate puis transformé en glycérate
-Chloroplaste: glycérate phosphorylé en 3-PGA

31
Q

Quels sont les facteurs qui influencent la photorespiration? et quel est son rôle?

A

Éclairement: à la lumière et suivant l’extinction
Longueur d’onde: Plus intense de 590-700nm (rouge-orangé)
Oxygène: augmente si O2>2% / effet double jusqu’à 100% d’O2; effet inhibiteur de l’O2 sur la photosynthèse= effet Warburg
Gaz carbonique: Possible entre 0.3 à 1% CO2, supprimer si plus de 1-2%
**Une façon d’inhiber la PR serait d’avoir toujours du CO2 disponible aux cellules photosynthétique-> réussit par les plantes en C4
Température: augmente de façon importante en fonction de la température
Rôle:(hypothèse)
1. au début de l’évolution des plantes, très peu d’O2 dans l’atmosphère et beaucoup de CO2; CO2 et O2 se fixent au même site actif de la rubisco, peu d’impact jadis mais photorespiration aujourd’hui??
2. Phoyoprotection : protection des plante C3 contre des dommage dus à de fortes intensité lumineuse (photooxydation) en présence de lumière: si forte intensité lumineuse et peu de CO2, réduction de la chlorophylle et accumulation de superoxyde, PR permettrait de dissiper les surplus d’énergie par la voie glycolate (fixe O2 plutot CO2/ empêche photooxydation des pigments/ protège de la formation de radicaux libre