Chapitre 2 Flashcards

1
Q
A
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2
Q

Quelles sont les 4 raisons pour lesquelles il faut compacter l’ADN ?

A

1) le milieu cellulaire est un milieu sensible et instable pour l’ADN double hélice
2)Organisation chromosomique permet la recombinaison entre les chromosomes parentaux (diversité)
3) Compactage est un facteur important dans la transmission efficace du patrimoine génétique aux cellules filles
4) Le compactage doit être maximum pour se séparer correctement

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3
Q

Quelles solutions utilisent (les bactéries, les archées, les eucaryotes) pour compacter leur ADN ?

A

1) Bactérie : Protéine associées aux nucléoides
2) Protéine Hmf, homologue des histones eucaryotes
3) Eucaryotes: Octamères d’histones et autres protéines

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4
Q

Jusqu’à l’anaphase, comment s’appelle la protéine qui maintient les deux chromatides soeurs ensemble ?

A

La cohésine

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5
Q

Que se passe-t-il pour la cohésine au moment de l’anaphase ? (moment où les chromatides sœurs migrent aux deux pôles )

A

Les cohésines sont clivées
->supprime les tensions des microtubules
->permet une migration lente

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6
Q

Quelles types de protéines permettent cohésion et condensation des chromosomes ?

A

Les protéines MSC (MAINTENANCE STRUCTURALE DES CHROMOSOMES)

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7
Q

Vrai ou Faux: les MSC sont des ATPases

A

Vrai
LES MSC SONT DES ATPases, ELLES SONT CONSERVÉES DES BACTÉRIES AUX HUMAINS ! !
- AVEC DES PROTÉINES non-MSC, LES MSC FORMENT DES COMPLEXES MULTIPROTÉIQUES

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8
Q

Quelles sont les ATPases ? et leur fonction ?

A

TOPOISOMERASE II, FACTEURS DE REMODELAGE
DE LA CHROMATINE, CHROMOKINÉSINE
CES MOLÉCULES DOIVENT CERTAINEMENT COLLABORER AVEC LES CONDENSINES POUR REPRODUIRE EXACTEMENT LES STRUCTURES
DE CHROMOSOMES MITOTIQUES À CHAQUE DIVISION CELLULAIRE

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9
Q

Avec qui les ATPases collaborent et pourquoi ?

A

Avec les CONDENSINES POUR REPRODUIRE EXACTEMENT LES STRUCTURES DE CHROMOSOMES MITOTIQUES À CHAQUE DIVISION CELLULAIRE

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10
Q

Vrai ou faux : la COHÉSINE a une activité intramoléculaire et la CONDENSINE activité intermoléculaire

A

Faux, c’est l’inverse

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11
Q

A quels moments cohésine et condensine sont utilisés ?

A

Cohésine:RÉPLICATION JUSQU’À L’INTERPHASE
Condensine:APRES INTERPHASE PUIS COMPLETE LA MITOSE

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12
Q

A quels moments l’ADN est moins compacté ?

A

entre les mitoses

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13
Q

Quels sont les deux rôles de la condensine ?

A
  • ON RETROUVE DIFFÉRENTES CONDENSINES SELON LES ESPÈCES.
  • RÔLE ÉGALEMENT DANS LA RÉGULATION DE L’EXPRESSION DES GÈNES
  • RÔLE DANS LA RÉPARATION DE L’ADN
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14
Q

A quel moment la cohesine est resynthétisé ?

A

INTERPHASE :
SYNTHÈSE COHÉSINE
+RÉPLICATION DE L’ADN

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15
Q

Comment se nomme les deux formes d’ADN compacté/décompacté ?

A

Compacté=euchromatine
décompacté=hétérochromatine

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16
Q

Vrai ou faux: la forme compacté inhibe la transcription des gènes

A

Vrai

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17
Q

Qu’est ce que l’hétérochromatine constitutive ? donne un exemple et précise quel groupe est englobé

A

Hetérochromatine possédant des gènes n’ayant pas besoin d’être transcrit.
Chromosome Y contient de grandes régions d’hétérochromatine constitutive (souvent entourant le centromère + télomère)
pour une espèce

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18
Q

Même question pour l’hétérochromatine facultative

A

RÉGIONS VARIABLES SUIVANT LE TYPE CELLULAIRE (POUR UNE ESPÈCE DONNÉE)
Le chromosome X chez la femme, un des deux X est sous forme d’hétérochromatine facultative

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19
Q

Quel est la longueur des fibres d’ADN compacté chez les EUCARYOTES

A

30 nm

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20
Q

Qu’est ce que désigne le NUCLÉOSOME ?

A

Association d’ADN autour d’un Octamère (8) d’histones

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21
Q

Vrai ou Faux : la formation du nucléosome est la 3ème étape du processus de compaction jusqu’à la phase mitotique ?

A

FAUX c’est la première grosse conne

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22
Q

Une fois compacté quelles actions NE PEUVENT PLUS avoir lieu sur l’ADN ?

A

réplication, réparation,recombinaison, transcription

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23
Q

Quelle est l’utilisation positive des mécanismes inhibition de transcription ?

A

Les cellules eucaryotes régulent l’expression des gènes

24
Q

Comment se fait la régulation de l’expression génétique ?

A

-> Alteration locale des nucléosomes.
Lorsque les nucléosomes sont modifiés, certaines régions de l’ADN deviennent plus accessibles. Cela permet aux enzymes et autres facteurs impliqués dans la transcription (la machinerie transcriptionnelle) de se lier à ces régions et de démarrer la transcription des gènes situés dans ces zones

25
Quels ont été les résultats de l'expérience de Hewish et Burgoyne ?
1) la chromatine est organisée en unités répétitives appelées nucléosomes 2) Un nucléosome est composé ~146 paires de bases d'ADN enroulées autour d'un octamère d'histones (deux copies chacune des histones H2A, H2B, H3 et H4) 3) Les nucléosomes sont reliés entre eux par des segments d'ADN appelés ADN linker, qui peuvent varier en longueur mais ~ 50 paires de bases
26
Quel est le degré de compaction du nucléosome comparé au plus gros degré de compactage de l'ADN ?
2.5 10000
27
Quelle est la taille d'un chromosome d'ADN nu et du collier de perle dépliés ?
5 cm ~ 1,5 À 2 cm
28
Quelles sont les 4 paires d'histones constituant l'octamère du nucléosome ?
H2A, H2B, H3 et H4
29
Quelle est la fonction de la protéine H1 ?
1 MOLÉCULE D’HISTONE H1 EST LIÉE À L’ADN DE LIAISON = 1 HISTONE DE LIAISON PAR NUCLÉOSOME
30
Décris moi le collier de perles
1 perle= octamère d'histone enroulé par 147 pb d'ADN + H1 un fil d'ADN de liaison de 20 à 70 pb aussi lié à H1
31
VRAI ou FAUX :LA LONGUEUR DE L’ENROULEMENT DE 147 PB D’ADN AUTOUR DES NUCLÉOSOMES EST VARIABLE CHEZ TOUS LES EUCARYOTES.
Faux elle est invariable
32
Vrai ou faux: DES DIFFÉRENCES DE LONGUEUR DE L’ADN DE LIAISON (LINÉAIRE) S’OBSERVENT ENTRE LES DIFFÉRENTS ORGANISMES
VRAI
33
DES DIFFÉRENCES DE LONGUEUR DE L’ADN DE LIAISON (LINÉAIRE) QUI S’OBSERVENT ENTRE LES DIFFÉRENTS ORGANISMES REFLèTENT: 1)DES DIFFÉRENCES DE CONFORMATION DE LA CHROMATINE PAR L’ARRANGEMENT DES NUCLÉOSOMES 2)DES DIFFÉRENCES DES NUCLÉOSOMES EUX-MÊMES
1
34
Pour les Histones, comment appelle-t-on la région très conservée qu'ils possèdent ?
LE DOMAINE DE REPLIEMENT
35
SI tu dois me décrire au mieux le structures des histones, comment tu le ferais ?
Une queue N-terminale de 11 à 37 aa un domaine de repliement une queue C-terminale
36
Décris pour les domaines de repliement des histones: leur composition + leur fonction
3 hélices Alpha séparé de boucles courtes responsable de l'assemblage des octamères
37
Vrai ou faux: les histones sont très conservés chez les eucaryotes ?
Vrai Car ils ont un rôle universel et précis
38
Dis moi les 3 étapes de l'assemblage des histones
1) Initiation par formation d'un tétramère [H3-H4] x2 2) Liaison de ce tétramère à l'ADN double brin 3) Recrutement de deux dimère H2A-HB
39
Que se passe t-il pour le nucléosome si il n'y a pas d'ADN ?
LA structure en octamère ne se forme pas seul les dimères [H2A-H2B] et les tétramères [H3-H4] seforment
40
Pourquoi un fort pourcentage des Acides aminés sont chargés + ?
Parce que l'ADN est chargé -
41
Vrai ou Faux : 20% des a.a de chaque histones sont des arginines et des lysines
Vrai
42
Pourquoi 20% des a.a de chaque histones sont des arginines et des lysines ?
GROUPES AMINE (Lys) ET GUANIDINIUM (Arg) IONISÉS EN MILIEU CELLULAIRE sont NH3+ et NH2+ ->PARTICIPENT À DES INTERACTIONS IONIQUES AVEC L’ADN CHARGÉ NÉGATIVEMENT DE L’ESPACEUR ET DE LA SUPERHÉLICE AUTOUR DES OCTAMÈRES
43
Vrai ou faux : Tous les histones se lient à des régions au hasard de l'ADN enroulé ?
FAUX: LES HISTONES SE LIENT À DES RÉGIONS DISTINCTES DE L’ADN ENROULÉ
44
Où se lient les tétramères H3-H4 ?
(1) AUX EXTRÊMITÉS (13 pb) (2) AU MILIEU (60 pb) DE L’ADN. = 86 pb / 147
45
Où se lient les dimères H2A-H2B ?
LES DEUX DIMÈRES H2A - H2B S’ASSOCIENT CHACUN AVEC 30 pb DE CHAQUE CÔTÉ DE LA RÉGION CENTRALE DE 60 pb LIÉE AVEC H3 - H4
46
Est ce qu'on peut estimer que la configuration des dimères H2A et H2B permet à l'ADN de se lier avec eux ?
NOPE
47
Combien de paires de liaisons H sont impliquées dans l'association des octamères d'histones ? Combien d'entre elles se font avec le sillon mineur ?
~ 40 LIAISONS HYDROGÈNES ~14
48
A quel moment et entre quels groupes exacts se font les liaisons H ?
À CHAQUE FOIS QU’IL FAIT FACE À L’OCTAMÈRE D’HISTONES. ( = 147 pb / 10,5 = 14 ! ) CES 14 LIAISONS HYDROGÈNES SE FONT PRÉCISÉMENT ENTRE LES HISTONES ET LES OXYGÈNES (O-) DES LIAISONS PHOSPHODIESTER DU SQUELETTE EXTERNE SUCRE - PHOSPHATE
49
Combien de LIAISONS HYDROGÈNES RELIENT LES BASES AZOTÉES AUX CHAINES LATÉRALES DES ACIDES AMINÉS DES HISTONES,TOUJOURS DU CÔTÉ DU SILLON MINEUR ?
SEULEMENT 7
50
Pourquoi ces liaisons se font sur le sillon mineur ?
1) SILLON MINEUR =LIAISONS NON SPÉCIFIQUES ENTRE L’OCTAMÈRE D’HISTONES ET L’ADN 2) LE SILLON MAJEUR RESTE EN GRANDE PARTIE ACCESSIBLE POUR LA RÉGULATION DE L’EXPRESSION GÉNÉTIQUE 3)LA NATURE DE L’INFORMATION GÉNÉTIQUE D’UNE SÉQUENCE D’ADN N’INFLUENCE PAS (OU PEU) SON AFFINITÉ AVEC LES HISTONES
51
Qu'est ce que confère les 40 liaisons H aux histones ?
LES 40 LIAISONS HYDROGÈNES CONFÈRENT AUX HISTONES UNE GRANDE FORCE DE TORSION
52
Que provoquent les a.a basique des histones EN MASQUANT LES CHARGES NÉGATIVES DES PHOSPHATES dans les molécules d'ADN ?
FACILITENT L’ENROULEMENT DE L’ADN SUR PLUS D’UN TOUR
53
Comment LES QUEUES N-TERMINALES DES HISTONES STABILISENT L’ENROULEMENT DE L’ADN AUTOUR DE L’OCTAMÈRE ?
EN FORMANT LE SILLON D’UNE VIS
54
Où sortent les queues N-terminales de l'octamère d'histones ?
H2B ET H3 : SORTENT AU MILIEU, ENTRE LES DEUX HÉLICES SUPERPOSÉES. H2A ET H4 : SORTENT AU DESSUS ET EN DESSOUS DES DEUX HÉLICES
55
On sait que L’ENROULEMENT À GAUCHE (+ 1,2) DE L’ADN AUTOUR DES OCTAMÈRES D’HISTONES INDUIT DES SUPER-TOURS (S) NÉGATIFS, que se passe-t-il quand les histones sont retirés ?
L’ADN UTILISE L’ÉNERGIE DES SUPER-TOURS POUR FACILITER LA SÉPARATION DES BRINS DE LA DOUBLE HÉLICE (= CONVERTIS EN TORSIONS NÉGATIVES)