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Biologie moléculaire (BIO 1101) > Chapitre 2 : La réplication de l'ADN > Flashcards

Chapitre 2 : La réplication de l'ADN Flashcards

(54 cards)

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1
Q

De quel sens le nouveau brin est-il synthétisé? La lecture du vieux brin?

A

Le nouveau brin est synthétisé 5’ vers 3’,

la lecture du vieux brin se fait 3’ vers 5’.

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2
Q

Qu’est-ce qu’une origine de réplication?

A

. Les sites
spécifiques auxquels commence la réplication des deux
brins et la réplication (seq. riche en A:T).

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3
Q

Combien y a-t-il d’ori pour les procaryotes? Pour les eucaryotes?

A

Une seule

Plusieurs centaines

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4
Q

Qu’est-ce qu’un réplicateur?

A

Ensemble complet des séquences suffisantes pour permettre

l’initiation de la réplication.(Eucaryotes)

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5
Q

Qu’est-ce que le site 9-mère?

A

liaison de la protéine initiatrice (nommée DnaA chez e.coli).
o Seule protéine spécifique de séquence dans l’initiation de la réplication.
o Socle pour l’assemblage du complexe d’initiation.

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6
Q

Qu’est-ce que le site 13-mère?

A

Sites « 13-mère » : lieu de la séparation initiale des brins. Séquences riches en paires
de nucléotides A:T.

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7
Q

Quelles sont les 3 fonctions des protéines initiatrices?

A 
 Trouver et lier l’ORI
 Recrutement des autres protéines
nécessaires à la réplication
(formation d’un complexe d’initiation
avec les hélicases)
 Chez certains organismes
(procaryotes) ouvrir
la double hélice à l’ORI
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8
Q

Comment fonctionne l’initiateur chez les eucaryotes?

A

’initiateur est un complexe de six protéines, appelé le

complexe de reconnaissance de l’origine de réplication (ORC)

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9
Q

Quels sont les motifs structurels pour la reconnaissance de l’origine de réplication chez les eucaryotes?

A 
Des séquences riches en AT ou en
ilots CpG,
 Une structure d’ADN particulière,
 Des régions libres de nucléosomes,
 Des régions impliquées dans
l’initiation de la transcription.
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10
Q

Qu’est-ce que la topoisomérase?

A

enzyme
qui lie l’ADNds devant la
fourche de réplication et
réduit la tension

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11
Q

Qu’est-ce que l’hélicase?

A

enzyme en forme
d’anneau qui entraîne la
séparation des brins en brisant
les liaisons H. Utilise l’ATP.

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12
Q

Que font les protéines fixatrices d’ADN

monocaténaire (protéines SSB)?

A

Stabilisent les 2 brins séparés de l’ADN
matrice jusqu’à la synthèse des
nouveaux brins complémentaires. Empêche formation liens H

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13
Q

Que se passerait-il sans les protéines fixatrices d’ADN?

A 
la formation d’épingles
par appariement de nucléotides
complémentaires dans le même
brin d’ADN. La formation d’épingles
bloquerait la réplication.
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14
Q

Comment fonctionne hélicase?

A

 Hydrolyse ATP pour son déplacement.
 Entraîne la séparation des brins
 Haute processivité (longueur d’ADN dénaturé
avant de se détacher)

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15
Q

Qu’est-ce qui force la séparation des brins d’ADN lors de la réplication?

A

Chaque sous-unité possède une boucle agrippant la
charpente d’un nucléotide (sucre-P). Oblige l’ADN à
passer dans le pore central de l’enzyme

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16
Q

Quels sont les 2 classes de topoisomérase?

A

Topoisomérase I et topoisomérase II

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17
Q

Que fait la topoisomérase I

A

coupe et ressoude un

des brins d’ADN

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18
Q

Que fait la topoisomérase II?

A

coupe et ressoude

les deux brins d’ADN

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19
Q

Qu’est-ce qu’un oeil de réplication et que possède-t-elle à chaque extrémités?

A

À chaque origine de réplication, il y a formation d’un œil de réplication par les
hélicases qui ouvrent la double hélice d’ADN. Une fourche de réplication à chaque
extrémité d’un œil de réplication est le siège de l’élongation des nouveaux brins d’ADN.

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20
Q

Que fait la primase?

A

ARN polymérase consacrée à la
fabrication de courtes amorces ARN (5 à 10
nucléotides) en face d’une matrice d’ADN
monocaténaire.

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21
Q

Pourquoi faut-il une primase pour faire la synthèse de l’ADN?

A

Toutefois, toutes les ADN polymérases ont
besoin d’une amorce présentant un 3’-OH libre.
Elles ne peuvent pas commencer la synthèse
d’un brin de novo.

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22
Q

Que font les poseurs d’anneaux coulissants?

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A

Il reconnaissant l’amaorce ARN et installe un anneau coulissant et une ADN polymérase

23
Q

Comment fonctionne le poseur d’anneaux coulissant

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A 
Se lie à l'ATP et peut ouvrir l'anneau coulissant en le liant. Le poseur d’anneau et
l’ADN polymérase
compétitionnent pour
le site de liaison.
Une fois lié à la
polymérase, l’anneau
ne peut pas être lié de
nouveau par le poseur
d’anneau.
24
Q

Que fait l’anneau coulissant?

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A

Lie à l’ADN au niveau de l’amorce, s’associe
ensuite avec la polymérase et glisse avec elle.
 Permet de maintenir l’ADN polymérase sur le
brin matrice

25
Quel est l'avantage de l'anneau coulissant?
’empêche de s’éloigner. Augmente la processivité de la polymérase !
26
Que fait l'adn polymérase?
Ajoute des dNTP à l’extrémité 3’-OH d’un brin déjà formé selon la complémentarité des bases azotées.
27
Quelles sont les ADN polymérase des procaryotes?
``` ADN polymérase I (ADN Pol I)--> Substitution des amorces ARN, réparation de l’ADN. Fonction exonucléase 5’ ``` L’ADN polymérase III (ADN Pol III) Réplication du chromosome
28
Quelles sont les ADN polymérases des eucaryotes?
1. ADN Pol δ -->Synthèse du brin discontinu de l’ADN ; réparation par excision de nucléotides (NER) et réparation par excision de base (BER) (Chap.4) 2. l’ADN Pol ε -->Synthèse du brin continu de l’ADN, NER et BER (Chap.4) 3. l’ADN Pol α -->Synthèse des amorces pendant la réplication de l’ADN
29
À quoi est dû la distinction des rNTP et des dNTP de l'ADN polymérase?
Cette discrimination est due à l’exclusion stérique des rNTPs du site actif de l’ADN polymérase
30
Que fournit l'énergie nécessaire à l'ajout des nucléotides?
la rupture du lien avec le premier P pour former le lien phosphodiester avec la chaîne naissante  la rupture du lien du pyrophosphate libéré par la pyrophosphatase (Pi + Pi )
31
Quels sont les 3 domaines de l'ADN polymérase?
1. la paume: site catalytique et vérification de l’appariement via le sillon mineur 2. les doigts: plient l’ADN matrice pour exposer un nucléotide à la fois et referment la main en cas du bon appariement dans le site catalytique 3. le pouce: aide à maintenir le tout ensemble en s’attachant à la charpente sucre-phosphate. Joue un rôle dans la processivité de l’enzyme.
32
Le site catalytique de la paume est formé de quoi?
SITE CATALYTIQUE formé d’ions métalliques qui permettent de favoriser l’interaction entre l’amorce et le nouveau nt (A) et stabiliser le pyrophosphate produit (B)
33
Qu'est-ce que le réplisome?
Les ADN polymérases travaillant sur chacun des brins à polymériser sont maintenues ensemble via le complexe de réplicatio
34
Quelles sont les caractéristiques du brin continu?
Brin qui peut être synthétisé en continu par l’ADN polymérase qui avance en même temps et dans la même direction que la fourche de réplication. Une amorce.
35
Quelles sont les caractéristiques du brin discontinu?
La synthèse du nouveau brin antiparallèle est plus complexe. La polymérase se déplace sur le brin matrice 3' → 5‘, s’éloigne de la fourche de réplication en synthétisant un court fragment d’ADN (fragments d’Okazaki). Au fur et à mesure que l’œil de réplication s’agrandit, la synthèse d’un nouveau fragment démarre. Plusieurs amorces.
36
Les fragments d'Okazaki sont-ils plus courts ou plus longs chez les eucaryotes ou les procaryotes?
Procaryotes.
37
L’ADN Pol III holoenzyme.
``` action coordonnée de 2 ou 3 polymérases (selon les modèles) sur le brin continu et le brin discontinu) ```
38
Comment la synthàse du brin discontinu s'effectue-t-elle6
Grâce à une boucle simple brin
39
À quoi ressemble le réplisome chez les procaryote (E.coli)’
l’interaction entre deux/trois pol., le | poseur d’anneau et l’anneau coulissant, l'hélicase liée à ADN Pol II holoenzyme, intéraction entre hélicase et primase
40
Qu'est-ce qui détermine la longueur des fragments d'Okazaki?
``` Interaction faible entre l’hélicase et la primase; la force de ces interactions détermine la longueur des fragments d’Okazaki (plus interaction est forte, plus les fragments seront petits). ```
41
Comment remplace-t-on l'amorce ARN par des désoxyriobonucléotide?
RNase H Exonucléase 5' ADN polymérase ADN ligase ****Chez les procaryotes, l’ADN POL I possède une fonction exonucléase 5’ (permet d’enlever rNt ou dNt situé immédiatement en amont du site de synthèse).
42
Que fait RNase H
La RNASE H dégrade les hybrides ARN/ADN. Retire tous les nucléotides de l’amorce, excepté le dernier (ne peut couper que le lien entre 2 rNt).
43
Que fait exonucléase 5'
Une EXONUCLÉASE 5’ retire ce dernier nucléotide.
44
Que fait ADN polymérase?
L’ADN polymérase comble la brèche
45
Que fait l'ADN ligase?
L’ADN LIGASE attache ensemble deux fragments d’ADN en reformant une liaison phosphodiester entre deux nucléotides adjacents
46
Comment les polymérase on un taux bas d'erreur?
L’activité exonucléase des ADN polymérases permet d’éditer les séquences d’ADN ensuite réparation postreplicative
47
Que se passe-t-il avec nucléosome?
Tasser et déplacer Ensuite réassembler 1. On maintient les H3 et H4 au réplisome 2. recrutement pas anneaux coulissant 3. assemblage complet avec de nouveaux H2A- H2B 4. Transfert des marquers post-traductionnel sur histones
48
Que se passe-t-il si on laisse une brèche dû au retrait de la dernière amorce du brin discontinu?
ceci résulte un raccourcissement progressif du chromosome à | chaque génération cellulaire.
49
Est-ce que l'extrémité 3' d'un chromosome linéaire peut être répliqué?
non
50
Qu'est-ce que la télomérase?
La télomérase est une ribonucléoprotéine | (RNP), ayant une activité polymérase.
51
Que fait la télomérase?
``` Contient un long ARN non-codant qui agit comme matrice pour allonger l’extrémité 3’ des chromosomes. ``` crée séquences répétitives complémentaires à sa propre matrice à 3' : télomères
52
de quoi sont composés les télomères humains?
Les télomères humains sont composés d’environ 10-15kb de la répétition TTAGGG.
53
Comment se sépare les chromosomes circulaire après la réplication?
Cette séparation est assurée par une ADN topoisomérase de type II --> Coupe et passe les molécules au travers de la coupure
54
Quelles sont les fonctions des topoisomérases chez les eucaryotes?
``` 1. Les topoisomérases I et II sont utilisées pour réduire la tension formée par l’avancée des fourches de réplication. 2. La convergence des fourches de réplication forme des caténanes (twist dans adn) qui doivent être résolues. ```

Biologie moléculaire (BIO 1101) (4 decks)

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