Chapitre 6 - Régulation de la transcription chez les eucaryotes

Question 1

Vrai ou faux.
Il existe chez les eucaryotes des régulateurs individuels ainsi que des séquences régulatrices.

Answer 1

Vrai

Question 2

Que sont les enhancers ?

Answer 2

Plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité. Orientation indépendante et position indépendante

Question 3

Comment les enhancers peuvent réguler certains gènes spécifiques sans avoir d’effets sur d’autres gènes à proximité ?

Answer 3

Grâce aux isolateurs ou éléments frontières.

Question 4

Vrai ou faux.
De la levure aux mammifères, tous ont une machinerie transcriptionnelle élaborée, nucléosomes et modificateurs.

Answer 4

vrai

Question 5

Chez les eucaryotes, comment se nomme la fonction de liaison à l’ADN ?

Answer 5

Domaine de liaison à l’ADN (DLA)

Question 6

Quel est l’activateur eucaryote le plus étudié ?

Answer 6

Gal4 (active la transcription de gènes galactose chez S. cerevisae)

Question 7

Vrai ou faux.
La plupart des régulateurs bactériens lient l’ADN sous forme de dimères.

Answer 7

vrai

Question 8

Quel motif utilisent la grande majorité des protéines régulatrices bactériennes ?

Answer 8

Hélice-coude-hélice comme DLA

Question 9

Quels types de protéines sont surtout impliquées dans l’embryogenèse ?

Answer 9

Les protéines à homéodomaine

Question 10

Qu’est-ce que l’homéodomaine ?

Answer 10

Structure Hélice-coude-hélice contenant 60 a.a très conservés identifié dans plusieurs protéines chez les eucaryotes.

Question 11

Vrai ou faux.
Les homéodomaine sont soit des activateurs, soit des répresseurs.

Answer 11

Vrai.
C’est dicté par l’homéodomaine

Question 12

Quel est le DLA le plus fréquent ?

Answer 12

Domaine en doigt de zinc

Question 13

Où a été initialement identifié le domaine en doigt de zinc ?

Answer 13

Chez TFIIIA

Question 14

De quoi est constitué le domaine en doigt de zinc ?

Answer 14

30 a.a parmi lesquels se trouvent 2 résidus cystéine et 2 résidus histidine.

Question 15

Vrai ou faux.
Le domaine en doigt de zinc lie l’ADN même en l’absence de zinc.

Answer 15

Faux.
S’il n’y a pas de zinc, il n’est pas possible de lier l’ADN.

Question 16

Quel activateur permet de lier 3 structures en doigts de zinc consécutives ?

Answer 16

Sp1

Question 17

Combien de nucléotides peut lier chaque doigt ?

Answer 17

3

Question 18

Quel autre DLA peuvent utiliser le zinc ?

Answer 18

Les récepteurs des glucocorticoïdes. Il sont constitués de 8 cystéines pouvant lier 2 atomes de zinc

Question 19

Vrai ou faux.
Les doigts de zinc sont toujours à l’intérieur de la protéine.

Answer 19

vrai

Question 20

Quel est le 3eme motif de DLA ?

Answer 20

Fermeture à glissière de Leucines

Question 21

Les fermeture à glissière de leucines forme des homo ou des hétérodimères ?

Answer 21

Les 2.

Question 22

Le motif de fermeture à glissière de leucine forme quelle structure si 2 protéines on ce motif ?

Answer 22

Coiled-coil

Question 23

Quel est le 4eme domaine de liaison à l’ADN ?

Answer 23

Le motif Hélice-boucle-hélice

Question 24

Vrai ou faux.
Le DLA hélice-boucle-hélice a une forte similarité avec la fermeture à glissière de leucine.

Answer 24

vrai

Question 25

Pourquoi les domaines d'activation n'ont pas de structure prédéfinie ?

Answer 25

Ce sont des recruteurs

Question 26

Les activateurs Sp1 sont riches en quoi ?

Answer 26

Glutamine

Question 27

Les activateur CTF1 sont riches en quoi ?

Answer 27

Proline

Question 28

Les régions activatrices acides sont-elles faibles ou fortes ?

Answer 28

Fortes et fonctionnent dans tous les organismes eucaryotes.

Question 29

Comment agit un activateur chez les bactéries ? (et aussi a peu près de la même façon chez les eucaryotes)

Answer 29

L'activateur stimule la transcription en liant l'ADN par une surface et interagit avec l'ARN polymérase par une autre face.

Question 30

Vrai ou faux. Les activateurs établissent toujours une interaction directe avec l'ARN pol.

Answer 30

Faux. Généralement, ils recrutent la polymérase indirectement.

Question 31

Quels sont les 2 types de modificateurs de nucléosomes ?

Answer 31

Les HAT (histone acetyl transférase) SWI/SNF à activité ATP-dépendante

Question 32

Sur quoi se fixe les protéines à bromodomaine ?

Answer 32

Sur les nucléosomes acétylés

Question 33

Quel composant majeur contient des bromodomaines ?

Answer 33

Un des composants de TFIID (TAF1/TAFII250)

Question 34

Quels sont les 3 composants avec lesquels Gal4 semble interagir ?

Answer 34

Médiateur SAGA TFIID (certains de ses TAF)

Question 35

Quel est le modèle d'activation de SAGA comme coactivateur de Gal4 ?

Answer 35

Gal4 est lié à sa séquence cible UAS par sont DLA. Par contre, le domaine d'activation est bloqué par l'inhibiteur Gal80. L'addition de galactose va induire l'expression de l'inducteur Gal3 qui va faire changer le complexe Gal80/Gal4. (Gal80 va changer de côté et exposer le domaine d'activation de Gal4) Gal4 va alors recruter SAGA et SAGA va recruter TBP via son domaine sp3. Il y aura alors activation de la transcription de Gal1.

Question 36

Comment se nomme le gène codant pour la protéine de choc thermique chez la drosophile ?

Answer 36

HSP70

Question 37

Quel est le mode de fonctionnement du promoteur HSP70 ?

Answer 37

Avant le choc thermique, il y a très peu de HSF. La Pol II est partiellement phosphorylée sur les sérines 5 de la queue CTD. Complexée avec DSIF et NELF, la pol est en pause en aval du promoteur HSP70. Lors du choc thermique, Il y aura trimérisation de HSF + liaison à ses sites. Cela va recruter une protéine kinase (P-TEFb) sur la machinerie arrêtée. P-TEFb va phosphoryler les sérines 2 + DSIF et NELF ce qui va libérer l'enzyme de sa niche et permettre la transcription du gène.

Question 38

Vrai ou faux. Les protéines qui lient les isolateurs répriment directement le promoteur et les activateurs.

Answer 38

Faux. Ils bloquent la communication entre eux.

Question 39

Qu'est-ce qu'un LCR ?

Answer 39

Locus control region.

Question 40

Le répresseur lambda est un exemple de quelle type d'action ?

Answer 40

Action synergique

Question 41

Vrai ou faux. La coopérativité est cruciale pour l'intégration du signal par les activateurs.

Answer 41

Vrai

Question 42

Quels sont les 2 activateurs qui communiquent pour le gène HO chez S. cerevisiae ?

Answer 42

Swi5 et SBF

Question 43

Vrai ou faux. Les protéines HMGA1 sont présentes en tout temps.

Answer 43

Faux. Seulement lors d'infection et vont permettre de modifier la structure de l'ADN pour permettre la transcription des gènes pour les interférons-b

Question 44

Quels sont les activateurs ciblés par l'infection virale ?

Answer 44

NF-kB, IRF et le complexe AP-1 (Jun/ATF)

Question 45

Quels sont les 4 modes différents des répresseurs eucaryotes ?

Answer 45

1. Compétition 2. inhibition 3. répression directe 4. répression indirecte

Question 46

Qu'est-ce que le gène Mig1 ?

Answer 46

C'est un répresseur qui recrute Tup1 pour empêcher la transcription du gène Gal1 avec une répression directe et indirecte.