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SBM-1003 Introduction à la génétique moléculaire > Chapitre 3 - Réplication de l'ADN > Flashcards

Chapitre 3 - Réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le dogme de la biologie moléculaire?

A
  • Réplication
  • Transcription
  • Traduction
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Q

Combien de temps dure la réplication cellulaire?

A

Environ 16 heures

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3
Q

Combien de temps dure la réplication de l’ADN?

A

Environ 10 heures

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4
Q

Comment nomme-t’on le brin d’ADN qui sert de moule?

A

Brin mère

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5
Q

Quels éléments sont nécessaires à la réplication de l’ADN?

A
  • dNTPs
  • Jonction amorce matrice
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6
Q

Vrai ou faux.
C’est l’extrémité 3’-OH qui est en croissance lors de la réplication ?

A

Vrai

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7
Q

L’attaque nucléophile du 3’-OH se fait à quel endroit lors de l’appariement des bases?

A

Sur le premier phosphate attaché au sucre

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8
Q

Les 2 phosphates issues de l’attaque nucléophile lors de l’appariement des bases sont séparés en phosphate distinct par quelle enzyme ?

A

La pyrophosphatase

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9
Q

Vrai ou faux.
L’ADN polymérase catalyse l’appariement des bases en discriminant les mauvaises bases.

A

Faux.
L’ADN polymérase catalyse sans discrimination des bases.

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10
Q

Est-ce que l’ADN polymérase peut quand même ajouter une base comme par exemple G:T?

A

Oui. L’appariement, même incorect peut se faire. L’attaque nucléophile sera seulement vraiment moins efficace.

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11
Q

Quelle est la principale cause de mutations dans l’ADN ?

A

Dommages à l’ADN (mésappariement)

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12
Q

À quoi servent les 2 ions métalliques divalents ?

A
  • Modifient l’environnement chimique du 3’-OH et du dNTP
  • Un des ions réduit le 3’-OH en O-
  • L’autre stabilise les phosphates B et Y
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13
Q

À quoi sert l’exonucléase?

A

Lorsqu’il y a des base mal appariées, l’affinité de l’ADN polymérase pour la jonction amorce:matrice diminue ce qui force la sortie de l’amorce du site actif.

L’amorce va se lier à l’exonucléase et l’ADN mésapparié est enlevé.

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14
Q

Vrai ou Faux.
Les doigts de la main vont venir se fermer de 40 degrés pour approcher le phosphate.

A

Vrai.
Lors d’un appariement correct, les doigts se referment sur le dNTP. Ça aura pour effet de :
- Rapprocher le nucléotide des ions métalliques
- Augmente la vitesse de catalyse.

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15
Q

Qu’est-ce qui empêche l’appariement d’un dNTP avec la 2eme base ou une autre base plus loins. Autrement dit, comment l’ADN polymérase ajouter les dNTPs successivement un à un?

A

Les doigts induisent une rotation de 90 deg. entre la 1ere et la 2eme base de la matrice. Ça va permettre un meilleur appariement.

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16
Q

Vrai ou Faux.
Le pouce aide à la catalyse.

A

Faux.
Il stabilise le complexe.
Il maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale.
Il permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat.

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17
Q

Dans un tube, on veut répliquer un fragment d’ADN. Qu’a-t-on besoin?

A
  1. Polymérase
  2. dNTPs
  3. Amorce
  4. Matrice
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18
Q

Que veut-on dire par : L’ADN polymérase est processive?

A

Elle ne va pas se détacher après un seul nucléotide.

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19
Q

Quelle est l’étape limitante de la réplication de l’ADN?

A

La liaison de la polymérase à sa jonction amorce:matrice.

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20
Q

Comment se nomme l’endroit ou l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaires ?

A

La fourche de réplication

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21
Q

Où se trouvent les fragments d’Okazaki ?

A

Sur le brin discontinu

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22
Q

Vrai ou faux.
L’ADN polymérase peut créer des amorces.

A

Faux.
L’ARN polymérase peut.

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23
Q

Quelles sont les étapes d’élimination des amorces d’ARN ?

A
  1. RNase H
    - dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN
    - Enlève tout, sauf le dernier ribonucléotide
  2. Exonucléase 5’
    - Enlève le dernier ribonucléotide
  3. ADN polymérase remplit la brèche
  4. La césure est réparée par une ADN ligase
24
Q

Vrai ou Faux.
Les hélicases sont processives.

A

Vrai

25
Q

Vrai ou Faux.
Les hélicases fonctionnent avec la polarité 5’ vers 3’ seulement.

A

Faux.
5’ vers 3’ ou 3’ vers 5’

26
Q

Qu’est-ce que les SSB ?

A

Single strand binding protein

27
Q

À quoi servent les protéines SSB ?

A

Empêche le réappariement, la dégradation, et la formation de boucles.

28
Q

Vrai ou Faux.
Les SSB se recrutent de manière coopérative.

A

Vrai.

29
Q

Les topoisomérases enroulent l’ADN de quelle façon ?

A

Ils déroulent l’ADN enroulé positivement pour le rendre avec un enroulement négatif

29
Q

Quelles sont les protéines de la fourche ?

A
  • Hélicase
  • Les SSB
  • La primase
  • ADN polymérase
  • La Topoisomérase
30
Q

Quelles sont les polymérases qui participent à la réplication chez les eucaryotes ?

A

Pol a, pol d, et pol e

30
Q

Vrai ou faux.
Les ADN polymérase nommé en lettres sont procaryotes.

A

Faux.
Les ADN polymérase avec des chiffres sont procaryotes. Celles avec des lettres appartiennent aux Eucaryotes.

31
Q

Si la processivité de la pol a est faible, quel est son rôle ?

A

Elle participe à l’initiation des brins neufs en commencant la réplication de quelques nucléotides.

32
Q

Sur quel brin agit la pol d ?

A

Le brin discontinu

33
Q

Sur quel brin agit la pol e ?

A

Le brin continu

34
Q

Qu’est-ce qui augment la processivité de l’ADN polymérase ?

A

L’anneau coulissant

35
Q

Vrai ou Faux.
L’anneau coulissant est présent en plus grande importance sur le brin discontinu.

A

Vrai.

36
Q

Vrai ou Faux.
L’ADN polymérase a, en tout temps, une forte affinité pour l’anneau coulissant.

A

Faux.
Seulement lorsque l’ADN pol est dans sa jonction amorce:matrice

37
Q

Quelle est l’autre fonction des anneaux coulissants ?

A

Recruter des protéines ( RNase H, etc)

38
Q

Comment se nomme le complexe qui régule les anneaux coulissants, les hélicases et les ADN pol lors de la réplication ?

A

L’holoenzyme de l’ADN polymérase

39
Q

De quoi est composé le Replisome ?

A
  • ADN polymérase holoenzyme
  • Hélicase
  • Primase
40
Q

Qu’est-ce que le réplicateur ?

A

Région avec séquences d’ADN suffisante pour initier la réplication. (AT riches)

41
Q

Qu’est-ce que l’initiateur ?

A

Protéine qui reconnait spécifiquement une séquence du réplicateur.
Active l’initiation de la réplication.

42
Q

Quelles sont les étapes de la réplication ?

A
  1. Réplicateur
  2. Initiateur
  3. Poseur d’hélicase
  4. Primase
  5. Holoenzyme pol
43
Q

Vrai ou Faux.
La sélection des réplicateurs se fait en phase G1.

A

Vrai.

44
Q

Vrai ou faux.
L’activation des origines de réplications se fait en phase G2.

A

Faux.
En phase S

45
Q

Où s’installe le complexe réplicatif ?

A

Sur plusieurs millier d’origines de réplication en attendant la phase S

46
Q

Quelles sont les étapes de formation du complexe réplicatif ?

A
  • Reconnaissance du réplicateur par l’initiateur (ORC)
  • ORC recrute 2 poseurs d’hélicases (Cdc6 et Cdt1)
  • Ce complexe recrute l’ADN hélicase
47
Q

Vrai ou faux.
En phase G1, le niveau de kinase est bas. Il va donc y avoir formation des pré-rc.

A

Vrai.
Le niveau cdk bas va inhiber l’activation des pré-rc mais va favoriser leur formation.

48
Q

Quelle est la séquence des télomères ?

A

5’TTAGGG répété des milliers de fois

49
Q

Quelle est la particularité des télomères ?

A

Répétitions bicaténaires possédant une extrémité 3’ monocaténaire.

50
Q

Qu’est-ce qu’est la télomérase ?

A

Ribonucléoprotéine possèdant une matrice interne

51
Q

Qu’est-ce que la TERT ?

A

C’est une sous unité catalytique qui sert de polymérase. C’est une réverse-transcriptase. Elle rétro transcrit l’ARN en ADN

52
Q

Qu’est-ce qui inhibe l’élongation réalisée par les télomérases ?

A

Des protéines qui vont s’accumuler derrière la TERT et favoriser l’arrêt de l’élogation.

53
Q

À quoi sert le boucle-T ?

A

Protéger le bout d’ADN simple brin laissé par la télomérase et ainsi empêcher la dégradation.

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