CICLO DE KREBS

Question 1

¿qué es el ciclo de krebs en términos generales?

Answer 1

vía metabólica cíclica que oxida el acetil-coA

Question 2

molécula que se regenera hasta el final del ciclo de krebs:

Answer 2

oxoalacetato

Question 3

¿en qué otro lado vemos el oxoalacetato?

Answer 3

gluconeogénesis y ciclo de glioxilato en plantas

Question 4

¿qué es un alfa-cetoácido?

Answer 4

carbonilo en carbono alfa de un ácido carboxílico

Question 5

papel de un alfa-cetoácido en catabolismo y anabolismo:

Answer 5

catabolismo: fácil de descarboxilar -CO2
anabolismo: fácil de transaminar +NH2

Question 6

primer paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 6

condensación, acetil-coA + oxoalacetato, citrato + coA-SH, citrato sintasa

Question 7

¿cómo funciona la citrato sintasa?

Answer 7

el oxoalacetato se une primero en el dominio flexible y provoca aparición de un sitio de unión para el acetil-coA; otro cambio de conformación provoca la hidrólisis del citril-coA y libera el coA-SH

Question 8

segundo paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 8

deshidratación/rehidratación, citrato, isocitrato, aconitasa

Question 9

composición de la aconitasa:

Answer 9

tiene un centro ferro-sulfurado, por lo que la deficiencia de hierro puede afectar el flujo por el ciclo

Question 10

enfermedades relacionadas a trastornos de hierro y qué provocan:

Answer 10

anemia y hemocromatosis (exceso de hierro)

Question 11

tercer paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 11

descarboxilación oxidativa, isocitrato + NAD+ + Mn2+, alfa-cetoglutarato + NADH + CO2, isocitrato deshidrogenasa

Question 12

dependiendo de la isozima de la isocitrato deshidrogenasa, una requiere un cofactor y la otra, otro…

Answer 12

una requiere NADP+ (matriz mitocondrial y citosol)
una requiere NAD+ (matriz mitocondrial)

Question 13

cuarto paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 13

descarboxilación oxidativa, alfa-cetoglutarato + NAD+ + coA-SH, succinil-CoA + NADH + CO2, alfa-cetoglutarato DH

Question 14

semejanza de la alfa-cetoglutarato DH con otro complejo:

Answer 14

con el complejo PDH; mismos cofactores, a excepción del lipoato, en su lugar se utiliza biotina

Question 15

quinto paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 15

fosforilación a nivel de sustrato, succinil coA + GDP + Pi, succinato + GTP + coA-SH, succinil coA sintetasa

Question 16

el GTP y ATP se consideran:

Answer 16

equivalentes energéticos

Question 17

¿de qué depende la reacción reversible de conversión de GTP a ATP y qué enzima la cataliza?

Answer 17

de las necesidades de la célula, quinasa de nucleósidos difosfato

Question 18

sexto paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 18

oxidación/deshidrogenación, succinato + FAD, fumarato + FADH2, succinato DH

Question 19

¿qué inhibe a la succinato DH? ¿de qué manera? ¿por qué?

Answer 19

malato, competitivamente, debido a que es un análogo al succinato

Question 20

séptimo paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 20

hidratación, fumarato, malato, fumarasa

Question 21

reacción de fumarasa es específica para:

Answer 21

trans-fumarato y L-malato

Question 22

octavo paso de ciclo de krebs: reacción, sustrato, producto y enzima

Answer 22

oxidación/deshidrogenación, L-malato + NAD+, oxoalacetato + NADH, L-malato DH

Question 23

¿en total, cuánto NADH, FADH2 y GTP se produce?

Answer 23

3 NADH, 1 FADH2 y 1 GTP

Question 24

resumen termodinámico del ciclo:

Answer 24

3 reacciones irreversibles y 2 con delta G positivo

Question 25

combustión total del acetil-coA:

Answer 25

228 kcal/mol

Question 26

¿en dónde se regula el ciclo?

Answer 26

en los pasos irreversibles: 1, 3 y 4

Question 27

¿qué hormonas afectan el ciclo?

Answer 27

ninguna

Question 28

regulación en paso 1:

Answer 28

+ elevadas [oxoalacetato, acetil-coA], ADP - elevadas [NADH, succinil-coA, citrato, ATP], [NADH]/[NAD]

Question 29

regulación en paso 3:

Answer 29

- elevadas [NADH]/[NAD], [ATP] + ADP, Ca2+

Question 30

regulación en paso 4:

Answer 30

+ Ca2+ - elevadas [NADH]/[NAD]

Question 31

factores influyentes en la velocidad del ciclo:

Answer 31

- disponibilidad de sustratos - inhibición por productos acumulados - retroinnibición alostérica de enzimas en rxns tempranas

Question 32

¿en dónde se encuentra la mayoría de rxn del ciclo?

Answer 32

organismos anaeróbicos

Question 33

¿qué tipo de ruta es el ciclo de krebs?

Answer 33

anfibólica - anabolismo: vías biosintéticas, el oxoalacetato y alfa-cetoglutarato son precursores de AA - catabolismo: degradación de glúcidos, AG, AA

Question 34

razones de deficiencia de biotina:

Answer 34

- falta de alimentación - dietas de huevos crudos

Question 35

¿por qué el huevo cocinado no produce deficiencia de biotina?

Answer 35

porque la proteína avidina pierde la función, y no se une a la biotina para no permitir su absorción

Question 36

efecto de la mutación de succinato DH y fumarasa:

Answer 36

crea un entorno hipóxico, ideal para el desarrollo del cáncer.. frecromocitomas y leiomas respectivamente

Question 37

¿qué es el HIF-alfa?

Answer 37

proteína que regula expresión de genes en hipoxia

Question 38

¿por qué la acumulación de succinato y fumarato es peligrosa?

Answer 38

son oncometabolitos que favorecen el crecimiento tumoral

Question 39

efecto de la mutación en isocitrato deshidrogenasa:

Answer 39

gliomas: se produce un nuevo producto "2-hidroxiglutarato", que inhibe el alfa-cetoglutarato e interfiere con la regulación génica normal (metilasas).. promueve crecimiento sin restricción de cáncer