Classification des microorganismes Flashcards
(43 cards)
Un groupe est défini comme un…
taxon.
On définit la hiérarchie comme basée sur…
des caractères communs. Elle est non-chevauchante.
Les trois domaines sont…
eubactéries, archaebactéries et eucaryotes.
Les 6 règnes sont…
animal, végétal, protiste, mycète (tous les 4 sous le domaine eucaryote), bactéries, archeas.
Les protistes sont des…
eucaryotes unicellulaires. Ils sont eucaryotes car leur noyau est isolé.
Les archea et bacteria sont des organismes…
procaryotes, par contre les archea se rapprochent des humains par la présence d’histones dans leur ADN.
Un isolat est…
la descendance d’une culture pure. Il a normalement conservé ses caractéristiques.
Une espèce est…
un groupe d’isolats provenant de différent environnements mais ayant les même caractéristiques.
Elle est la 1ère identifiée et définit l’espèce:
La souche type. On en conserve des représentations dans un centre de références.
Vrai ou faux. Pour identifier une culture, elle peut être mixte.
Faux. Elle doit être pure.
Les caractères morphologiques:
Taille, forme, structure, réactions aux colorants…
Les caractères de composition chimique (quantification):
Types de lipides/alcools dans la membrane, composition de la paroi cellulaire:
- Cellulose: algues et mycètes
- Peptidoglycanes: eubactéries
- Pseudomuréine: archae
- Autres polysaccharides, protéines
Les caractères physiologiques:
Éléments nutritifs du milieu de culture, conditions d’incubation (pH, T°, lumière)
Les caractères métaboliques:
Produits finaux de fermentation, enzymes extracellulaires (SOD, hémolysine, exotoxines).
Les caractères génétiques:
La composition G+C%, les séquences nucléotidiques, le nombre de chromosomes (plus élevé chez les eucaryotes), les plasmides
Explique la recherche de G+C%.
La température de fusion TM augmente avec le taux en G+C car ayant 3 ponts H plutôt que 2 avec A+T, ils sont plus difficiles à dissocier.
L’ADN absorbe les UV et ainsi l’absorbance du milieu peut-être mesurée avec l’augmentation de la température. Quand l’absorbance a doublé, c’est que tous les brins sont monocaténaires. Selon la température de dissociation, on peut déterminer le G+C%.
Un G+C% élevé est souvent vu chez les micro-organismes…
thermophiles. En général, les micro-organismes ont environ 25-80%, comparé aux plantes et animaux 30-50%.
V ou F. Le G+C% est spécifique.
Faux, mais il est typique d’une espèce.
Les caractères d’interaction avec l’hôte:
Pathogénicité (capacité à provoquer une infx, spécificité d’hôte ex: Virus d’Immunodéficience Féline), symbiose (avec plantes, poissons).
Le caractère écologique:
Habitat d’où provient l’isolat.
Les caractères moléculaires:
- Comparaison des séquences protéiques et nucléiques (gènes et protéines conservées, homologie des séquences)…
- Hybridation d’ADN: à partir d’un organisme de référence, on analyse la complémentarité des séquences chromosomiques. 1-Dissociation des brins par chauffage 2-Refroidissement permissif entraîne l’appariement A-B (hybridation partielle) 3-Niveau d’appariement de plus de 80%=même espèce, mais descend très vite (35-45% même genre)
Jacques Monod a dit: Tout ce qui est vrai pour le Colibacille est vrai pour l’éléphant. Signification?
Le métabolisme central est le même pour tous les êtres vivants.
Nommez les caractères pouvant servir à l’identification:
morphologie, composition chimique, physiologie, métabolisme, génétique, interactions avec l’hôte, écologie, moléculaire… On les compile puis on compare avec des espèces connues.
La nomenclature linéenne est…
binominiale et italique. ex: Clostridium lavalense
