clonage des gènes 3 Flashcards

1
Q

transf des C procaryotes par transf chimique ?

A

peu efficace
→ Ca++ modifier les charges de la bicouche mbr

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2
Q

problématique 1 clonage, sélection de la C hôte ?

A

efficacité de la transf :
→ besoin de sélectionner et d’identifier des bactéries ayant intégré un plasmide

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3
Q

comment sont def les antibiotiques ?

A

comme étant des substances chimiques, produites par des micro-organismes et capables, à faible concentration, d’inhiber la croissance d’autres micro-organisme ou m̂ de les détruire

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4
Q

où peuvent agir les antibio ?

A

à ≠ nv de la Ȼ procaryote

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5
Q

qu’inhibent les antibio bactériostatiques ?

A

inhibent la croissance et la division des bactéries, mais ne les tuent pas. Les agents bactériostatiques doivent collaborer avec le syst immu pour évincer les micro-orga du corps

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6
Q

qu’entrainent les antibio bactéricides ?

A

la lyse des bactéries

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7
Q

les 5 modes d’action des antibiotiques ?

A

1) inhibition de la $ de la paroi bactérienne
2) inhibition de la $ de la mb cytoplasmique
3) inhibition de la $ protéique
4) inhibition de la $ de l’ADN
5) inhibition de la transcription

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8
Q

sur quoi repose la méthode du test blanc-bleu ?

A

méthode de sélection qui repose sur la présence d’un gène particulier sur le plasmide : le gène lacZ

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9
Q

pour quoi code le gène lacZ ?

A

pour la β-galactosidase

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10
Q

que contient la seq codante du gène lacZ ?

A

le site multiple de clonage (SMC) qui est une région insérée artificiellement dans une partie du gène lacZ.
→ sert à faciliter le clonage de fragments d’ADN en offrant pls sites de restriction dans une région non essentielle, permettant d’insérer facilement un frag d’ADN sans perturber les autres fonctions de plasmides

⚠️ tous les plasmides n’ont pas le gène lacZ

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11
Q

avec quoi réagit l’enzyme β-galalactosidase ?

A

réagit avec son substrat le X-Gal pour donner un précipité bleu (2X + 2GAL)

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12
Q

nom et formule du X-Gal ?

A

formule brute : C14 H15 Br C I N O6
nom : 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranoside

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13
Q

pourquoi couleur bleu dans test bleu-blanc ?

A

principe : l’insertion du fragment d’ADN conduit à une interruption du gène lacZ responsable de la couleur bleue.

les bactéries ayant incorporé un plasmide recombinant n’auront pas le gène lacZ fonctionnel → pas de dégradation du X-gal → colonie blanche

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14
Q

qu’auront les plasmides ayant incorporé un plasmide non-recombinant ?

A

auront le gène lacZ fonctionnel → dégradation du X-Gal → colonie bleue

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15
Q

stratégies pour ↑ l’efficacité du clonage des gènes ?

A

1) déphosphorylation du vecteur ouvert
2) ouverture du vecteur par é enzymes de restriction ≠

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16
Q

sélection des bactéries transf grâce ?

A

grâce au marqueur antibiotique du vecteur

17
Q

ouverture du vecteur par 2 enzymes de restriction ≠. Doubles effet ?

A

1) éviter le vecteur plasmide de se refermer sur lui-même
2) orienter l’insertion du gène d’intérêt

18
Q

que permet l’utiliser de deux enzymes lors d’un clonage ?

A

permet d’orienter le sens du clonage de l’insert d’ADN

19
Q

cas d’ seul enzyme pour orientation du clonage et cas de deux enzymes ?

A

1 enzyme : le frag peut être orienté dans les 2 sens (bidirectionnel)
2 enzymes : le frag peut être orienté dans une seul sens (unidirectionnel)

20
Q

que peut faire le frag du SMC ?

A

peut se religaturer avec le plasmide digéré et rentrer en compétition avec le frag à cloner

21
Q

quels sont éléments qui ne permettent pas de produire la somatotropine ?

A

transcription, traduction :
- promoteur
- UTR
- intron

22
Q

à partir de quoi est obtenu l’ARN ?

A

à partir de lignées Cr, de tissus ou d’organismes entiers
→ chaque type Cr exprime un lot donné de gènes donc pour un organisme multiCr, les ARNs sont ≠ pour chaque type Cr

23
Q

qu’auront les ADN complémentaires obtenu avec ces ≠ types Cr après purification de l’ARN + rétro-transcription ?

A

auront des ADNc en commun (gènes de ménage) et des ADNc ≠

24
Q

par quoi est produite la somatotropine ?

A

par les C hypophysaires

25
purification des ARNm ou des ARN poly A sur quoi ?
sur une colonne de sépharose sur laquelle on a greffé des oligo dT
26
ARN total : chromatographie d'affinité ?
ARNr = 80% ARNt = 15% ARN divers = 1-2%
27
qu'est-ce que la transcriptase inverse ?
une ADN pol ARN-dépendante
28
que fait le =RNase H ?
dégrade l'ARN hybridé avec l'ADN → + soude = NaOH : action sur ARN (ribose)
29
quelles informations données à partir de l'ADN donneur génomique ?
on retrouve les régions promotrices, régulatrices et les introns pour les eucaryotes d'un gène
30
quelles informations données à partir de l'ADN donneur complémentaire ?
on retrouve les régions EXON : régions codantes et régions UTR 5' et UTR 3' non traduites de ce m̂ gène