Cours 1 - Introduction à la microbiologie Flashcards Preview

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Flashcards in Cours 1 - Introduction à la microbiologie Deck (19)
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1

Quels sont le sens strict et le sens large de la microbiologie?

Sens strict: Science qui étudie les organismes microscopiques

Sens large : Science qui se définit par les techniques qu’elle emploie

2

Nommer 4 impacts positifs qu'ont les bactéries chez l'homme

1- Microbiote
2- Source de nourriture
3- Antibiotiques et autres molécules
4- Biothechnologie

3

Nommer 4 impacts positifs qu'ont les bactéries dans la nature

1- Décomposition (recyclage)
2- Balance écologique
3- Biodégradation
4- Bioremédiation

4

Quels sont les 4 impacts négatifs des bactéries chez l'homme et dans la nature?

1- Infection
2- Détérioration des aliments
3- Corrosion
4- Mauvaise odeur

5

Nommer les 6 types de microorganismes

1- Algues
2- Protozoaires
3- Mycètes (levures, moisissures)
4- Bactéries
5- Virus
6- Prion

6

Définir la cellule et expliquer ses 6 propriétés

Définition simple: Le plus petit commun dénominateur de la matière vivante

Propriétés des cellules :

1- Métabolisme: Les nutriments prélevés dans l’environnement sont transformés dans la cellule et les déchets sont éliminés dans l’environnement. La cellule est un système ouvert.

2- Reproduction: Les éléments chimiques de l’environnement se transforment en de nouvelles cellules sous la conduite de cellules préexistantes.

3- Différentiation: La formation d’une nouvelle structure cellulaire.

4- Communication: Les cellules communiquent ou interagissent par des échanges
de molécules chimiques.

5- Mouvement: Les cellules possèdent diverses formes de motilité (déplacement de cellules et/ou mouvements internes).

6- Évolution: Les cellules contiennent des gènes et évoluent, présentant de nouvelles propriétés biologiques.

VOIR IMAGE COMPARAISON CELLULE DIAPO 19 + lire diapos 20-21 (classification)

7

Donner la classification des 5 règnes de Whittaker en indiquant leur type cellulaire, niveau d'organisation, nutrition et représentants

1. Monères :
- Type cellulaire: Procaryote
- Niveau d'organisation: Unicellulaire
- Nutrition: Autotrophe ou hétérotrophe
- Représentants: Archéobactéries, Cyanobactéries, Eubactéries

2. Protiste
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d'organisation: Unicellulaire (quelques pluricellulaires)
- Nutrition: Autotrophe ou hétérotrophe
- Représentants: Algues, protozoaires, myxomycètes

3. Mycètes
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d'organisation: Pluricellulaires (quelques unicellulaires)
- Nutrition: Hétérotrophe
- Représentants: Zygomycètes, Ascomycètes, Basidiomycètes, Levures, Lichens

4. Plantes
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d'organisation: Pluricellulaires
- Nutrition: Autotrophe
- Représentants: Invasculaires, Vasculaires

5. Animaux
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d'organisation: Pluricellulaires
- Nutrition: Autotrophe
- Représentants: Invertébrés, Vertébrés

8

D'un point de vue moderne, sur quoi se base la nouvelle classification des règnes de Woese (1990)?

Quelles sont les 4 nouvelles relations phylogénétiques?

Classification basée sur des caractères moléculaires

Cette nouvelle classification suggère de nouvelles relations phylogénétiques:

- Tous les organismes vivants seraient issus d'un ancêtre commun auquel on
a donné le nom de progénote

- Tous les organismes vivants pourraient être classés en trois grands règnes différents : eubactéries (Bacteria) archéobactéries (Archaea), et eucaryotes (Eucarya)

- Les mitochondries et les chloroplastes proviendraient, par endosymbiose, de bactéries aérobies et photosynthétiques, respectivement

- Les Archaea seraient phylogénétiquement plus proches des Eukarya que des Bacteria

9

Quels sont les 3 domaines primaires lorsqu'on classifient les espèces au niveau moléculaire (ARN 16S)?

Bacteria, Archéa et Eucarya

VOIR DIAPO 24

10

Pour le domaine des Bacteria, quel est:
- Type de cellule
- Organismes (5)
- Dimensions
- Paroi cellulaire
- Membrane cellulaire
- Organelles (6)
- ADN (8)

- Type de cellule : Procaryote

- Organismes : Cyanobactéries, Gram + et Gram - Streptocoques, Staphylocoques etc.

- Dimensions: 1 à 10 μm de longueur (en moyenne)

- Paroi cellulaire: Peptidoglycane

- Membrane cellulaire: Chaînes d’acides gras linéaires liées au glycérol par des liaisons ester

- Organelles : Peu d’organelles
Pas de noyau Inclusions, ribosomes, Flagelles, Pili

- ADN: Bicaténaire.
Circulaire et dans le nucléoïde.
Superhélices.
Associé à des protéines un peu semblables aux histones des Eucarya.
Pas d’introns. Généralement 1 seul chromosome. Plasmides, Génome petit

11

Pour le domaine des Archea, quel est:
- Type de cellule
- Organismes (3)
- Dimensions
- Paroi cellulaire
- Membrane cellulaire
- Organelles (5)
- ADN (8)

- Type de cellule : Procaryote

- Organismes : Méthanogènes Halophiles, Hyperthermophiles

- Dimensions: 1 à 10 μm de longueur (en moyenne)

- Paroi cellulaire: Pseudopeptidoglycane

- Membrane cellulaire: Chaînes d’acides gras linéaires liées au glycérol par des liaisons ester

- Organelles : Peu d’organelles
Pas de noyau Inclusions, ribosomes, Flagelles

- ADN: Bicaténaire.
Circulaire et dans le nucléoïde.
Superhélices.
Associé à des protéines similaire aux histones des Eucarya.
Présence d’introns. Généralement 1 seul chromosome. Plasmides, Génome petit

12

Pour le domaine des Eucarya, quel est:
- Type de cellule
- Organismes (4)
- Dimensions
- Paroi cellulaire (2)
- Membrane cellulaire
- Organelles (7)
- ADN (6)

- Type de cellule : Eucaryote

- Organismes : Protistes
Mycètes, Plantes et Animaux

- Dimensions: 1 à 100 μm de longueur (en moyenne)

- Paroi cellulaire: Polysaccharides (plantes) Chitine (mycètes)

- Membrane cellulaire: Chaînes d’acides gras linéaires liées au glycérol par des liaisons ester

- Organelles : Noyau, mitochondries, chloroplastes, Réticulum endoplasmique, Golgi, lysosomes, peroxysomes

- ADN: Bicaténaire.
Très long, linéaire avec beaucoup de régions codant pour aucune protéine ou aucun ARN (Introns). Associé aux histones. Limité par l’enveloppe nucléaire. Organisé en chromosomes. Génome important

13

Nommer 12 caractéristiques des bactéries

• Règne des monères
• Petites cellules (1-10m)
• S’adaptent très facilement
• Paroi bactérienne
• Peu d’organelles
• Petit génome
• Colonisent toutes sortes d’environnements
• Dominent en nombre et par leur activité métabolique la biosphère
• Passent malgré tout inaperçues
• Grande majorité est cependant inoffensive
• Décomposent les organismes morts et recyclent ainsi les éléments chimiques vitaux • Les eucaryotes ont besoin des procaryotes pour vivre mais le contraire n’est pas nécessairement vrai

14

Expliquer les 3 traits morphologiques bactériennes

1- Taille: 0,05um à 500 um

2- La forme: Sphérique ou ovale (coque), allongée (bâtonnet, bacille), hélice ou spirale (spirilles - rigides, spirochètes - flexibles), bourgeonnantes et apendiculées, filamenteuses

3- L'arrangement : isolé, amas, paire, chaîne, grappe, tétrade

VOIR image diapo 38, 39, 40

15

Qu'est-ce que l'Agar?

Agar = agent solidifiant, polymère de D-galactose (algue)

- Poudre ajoutée à un milieu liquide (1,5%)
- Solubilise à ébullition; solidifie à 42C (reste solide mm à 50-60C)
-Non toxique, non métabolisable

16

Qu'est-ce qu'une culture pure?

Culture composée d'une seule espèce de micro-organisme

Isolement se fait TOUJOURS sur une gélose et non en milieu liquide

17

Quelles sont les 2 méthodes d'isolements d'une culture pure sur gélose?

1- Isolement par striation
2- Isolement par dilution en milieu liquide

18

Expliquer la méthode d'isolement par striation

À l'aide d'un manche de Koch stérile (fil de platine), les micro-organismes sont étalés progressivement par des mouvements de va et vient (stries) à la surface d'une gélose. L'épuisement de l'inoculum lors de ces striations produira normalement des colonies isolées dont chacune constituera un culture pure

19

Expliquer la méthose d'isolement par dilution en milieu liquide

Dilutions successives en milieu liquide afin d'obtenir une dilution de l'inoculum permettant la croissance de colonies isolées sur une gélose

Voir images diapo 47