Cours 10 Flashcards
(13 cards)
Combien de types cells ? Quelles sont les particularités des gènes de ces cells ?
+ 200, ont tous les mêmes gènes 30 000 humains mais cells différentes, -50% sont tous exprimés (housekeepings) autres = spécifiques aux cells.
Quelles sont les stratégies pour que les cells expriment certains gènes aux bons endroits ?
Localisation des ARNm = distribution ARNm à endroits précis (codent pour activ/répress.) Sont entrainés par éléments cytosquelette ! Actine/microtubule. (actine = polarisé - vers + = prot adaptatrice (myosine !) lie 3’UTR ARNm et lie cytosquelette.
Contact cell-cell = presque tjrs récept surface indique position.
Diffusion morphogène = guide positionnement cells spécifiques embryon. + proche = reçoit + prots différencie différemment… dépendant niveau induction morphogène.
Comment fonctionne la transduction du signal généralement ?
Ligand se lie récept =
Cascade enzymatique modifie prots régulatrices noyau ;
Relâchement prots rég qui migrent noyau ;
Clivage protéolytique du récept (partie intracyto) = migre au noyau et influence prots rég.
Quelle est la commutation sexuelle de S. cerevisiae ?
Se divise par bourgeonnement = chromosomes pas bien divisés, - dans bourgeon (fille)
Commutation sexuel permet de passer d’un type secuel a à alpha grâce au gène HO ici.
On veut pas que cell fille fasse ça (qu’elle se divise par mitose, car elle ne peut pas, elle n’a pas le matériel gén pour la mitose) -> répression de HO par Ash1 = migre sur l’actine (She2 sur 3’UTR ARNm de Ash1 et She 3 sur myosine V s’associent…) et va ++ dans bourgeon pendant le bourgeonnement = inhibe HO = empêche commutation.
(mode localisation ARNm)
Comment fonctionne la sporulation chez B subtilis ?
Fait spores qd enviro stressant = graine avec tout matériel et coquille rigide redevient normal quand conditions ok.
Formation préspore en division asymétrique. Doit tuer cell mère -> sigmaF préspore transcrit SpollR = loge sptum qui sépare cell mère-préspore. Fait pro-sigmaE -> sigmaE dans mère = mène mort mère.
(mode contact cell-cell)
Comment fonctionne la commutation par Notch ?
Tube neural = 2 types cells ectoderme = épiderme/neurones. Récept delta surface neuroblaste lie récept Notch cells autour = clivage intracytoplasm = NotchIC migre noyau active Su(H) transctit gènes répresseurs neuronaux = empêche de faire neuroblastes = fait épiderme.
(mode contact cell-cell)
Comment fonctionne le sonic hedgehog ?
SHH sécrété par notochorde plaque du plancher forme gradient ventro-dorsal dans tube neural vertébrés, dirigeant la différenciation cellulaire en régulant Gli (activateur transcription) -> migration noyau inhibé PTCH et SHH inhibe PTCH = active GLI. Selon gradient de GLI = active différents gènes.
(mode diffusion morphogène)
Pourquoi on utilise la drosophile pour étudier l’embryogenèse ?
(Thoms Hun Morgan 1908) car reproduct rapide, et gradient morphogènes pour rég dév.
Comment se passe l’embryogenèse de la droso ?
Fécondation oeuf (zygote)
+++ noyaux dans même cell = syncytium
Noyaux migrent périphérie = cortex et se divisent 3x (6000 tot) + membrane = plusieurs cells totipotentes alors que certaines cells vont au pôle (vers la queue) car + contact avec ARNm Nanos (deviendront cells germinales - autres = somatiques)
Comment fonctionne la régionalisation dorso-ventrale chez la droso ?
Dans oeuf non-fécondé = uniforme Dorsal et qd fécondé (noyaux ont migré cortex) = Dorsal va dans noyau cells ventrales et cytoplasme cells dorsales.
Dorsal régulé (gradient) par Spatzle (ligand se lie à Toll récept lie Spatzle APRÈS fécondation) -> gradient + fort ventral.
Cactus couplé Dorsal = inhibe Dorsal au noyau -> Spatzle + vers ventrales récept Toll active kinase Pelle phorphoryle Cactus = dégrad. Dorsal migre au noyau.
+ Dorsal = facteur transcription active Sog (gène quand peu Dorsal = actif), Rhomboid (moyen Dorsal = actif) et Twist (besoin +++ Dorsal pour être actif) toutes activées dans mésoderme + ventral, puis - en - vers ectoderme neurogénique ventral, puis dorsal.
SAUF que Rhomboid et Sog pas actives dans mésoderme alors que ça devrait ? Snail = répresseur cells mésoderme = sites Snail gènes Rhomboid + Sog.
Comment fonctionnent les gradients antérieurs/postérieurs chez droso ?
Initié ARNm Bicoid en antérieur, Oskar/Nanos postérieur (queue). Les trois sont déposés par cells nourricières en antérieur, Oskar + Nanos transportées pat microtubules 3’UTR (différent de celui Bicoid = pas transporté.)
Hunchback activé bicoid élevé/intermédiaire, inhiné Nanos (lie 3’UTR = empêche trad) comme Bicoid antérieur et Nanos (et Oskar) post = Hunchback uniforme -> gradient antérieur.
Quelles sont les eve (even skipped) stripes et quelles protéines activent/inhibent chacune ?
Déjà gène eve = très fortement exprimé séparé par stripes très peu exprimés 7 fois. Séq codant eve 2 kb avec stripes avant (3/7/2) et après (1/4/5/6) enhancer 12 kb en tout.
Gènes gap = Kruppel (réprimé Hunchback élevé) ; Knirps (réprimé intermédiaire) ; Giant (réprimé faible)
-> Tête
Stripe 2 : A = Hunchback (+Bicoid) ; R = Giant, Kruppel, knirps
3 : A = Kruppel, Hunchback (+Bicoid) ; R = Giant, Knirps
4 : A = Kruppel, Knirps, Hunchback (+Bicoid) ; R = Giant
5 : A = Knirps ; R = Hunchback (+Bicoid), Kruppel, Giant.
-> Queue
Comment tous les enhancers (5 -> 7 bandes eve) font pour travailler indépendamment les uns des autres en ayant des effets additifs ?
Par répression transcriptionnelle à courte portée : répresseurs sur un enhancer interfère pas avec activateur d’une autre région régulatrice du même gène car plus loin (séparés + 1kb). + proches = pourrait avoir un effet.
