Cours 10 - ADN Flashcards
Cause pour une réparation de l’ADN simple***
Dimère de thymine (UV)
=> Empêche la réplication
BER (Aka, Cause, corrige)***
Aka: - Réparation par excision de base
Cause*: - Cytosine —> Uracile (Désamination hydrolytique)
=> Uracil se lie à l’ADN glycosylases
Corrige: - Les lésions les plus FRÉQUENTES de l’ADN
NER (Aka, Causes, Corrige)***
Aka: - Réparation par excision de nucléotide
Causes:
- Lumière UV - Oxydation (Radicaux libres)
Corrige: - La 2e lésion la plus FRÉQUENTES de l’ADN
HR (Aka, Requiert, Corrige)*
Aka: - Recombinaison homologue Corrige: - Les cassures doubles-brins Requiert: 1) Une molécule d’ADN HOMOLOGUE 2) Des protéines de recombinaison liant l’ADN simple brin - RecA (E.Coli) - Rad51 (Humain)
Mécanisme de HR*
1) EXONUCLÉASE coupe le bout 5’
2) Un bout 3’ libre ATTAQUE l’ADN homologue
3) ADN pol.
4) Séparation des 2 brins
- Moins propice aux erreurs **
- Mutation de BRCA1/2 => Mutation => Cancer **
Enzyme pour une réparation de l’ADN simple***
PAS chez l’HUMAIN
1) Enzyme de photo-réactivation (ADN photolyase)
- Se fixe sur l’ADN en face du dimère de thymine
- Activée par la lumière
=> Inverse la dimérisation
Mécanisme pour BER***
1) ADN glycosylases
=> Hydrolyse la liaison N-glycosidique
2) Recrute l’enzyme ENDONUCLÉASE AP
=> Coupe liaison PHOSPHODIESTER 5’
3) ADN pol.
4) ADN ligase
Mécanisme de NER***
1) HÉLICASE
=> Ouvre la double hélice)
2) ENDONUCLÉASE
=> Retire le nucléotide endommagé + ~30 de ses voisins
3) ADN pol.
4) ADN ligase
NHEJ (Aka, Causes, Corrige)**
Aka: - Non-homologues end-joining Causes: 1) Radiations 2) Radicaux libres => Cassure des doubles brins
** Propice aux erreurs **
Enzymes pour NHEJ**
Ku recrute:
1) Des EXONUCLÉASES 2) Des POLYMÉRASES
3) ADN ligase
Ku (Quoi, rôle) **
Quoi: - Protéine dimérique
Rôle: - RECRUTE des EXONUCLÉASES et des POLYMÉRASES
Site de terminaison (Qui, structure)***
Qui: - E. Coli
Structure:
1) Séquences de liaison à des protéines tus 2) Séquences INDISPENSABLES à la SÉPARATION des chromosomes fils
Protéine tus (Aka, Rôles)
Aka: - Protéine de fixation aux terminateurs
Rôles:
1) INHIBE l’activité HÉLICASE du réplicateur 2) EMPÊCHE la fourche de dépasser le site de TERMINAISON
Niveaux de chromatine eucaryote**
1) Nucléosome (10X)
- Collier de perle
2) Chromatine (4X)
- Stabilisé par histone H1
3) Boucles (200X)
- Chromosome
Effet la chromatine **
Ralentie le glissement de la fourche de réplication
- FIXATION d’histone à l’ADN - EMPAQUETAGE en nucléosome
** La réplication des chromosomes eucaryotes s’accompagne d’une synthèse CONCOMITANTE d’histones EN ARRIÈRE de la fourche de réplication **
Ribonucléase (Aka, Rôle, Structure)
Aka: - RNAse H
Rôle: - DÉGRADER les amorces d’ARN
Structure:
1) Un domaine HBD (Hybrid Binding Domain) 2) Un domaine catalytique (H-domaine)
Mécanisme des ribonucléases
1) Hydrolyse le brin d’ARN (ARN-ADN)
2) Libère des extrémités 5’-phosphate et 3’-OH
* * HYDROLYSE PAS l’ARN simple/double brin **
Synthèse du brin retardé
1) Synthétisé de façon discontinue en petits fragments 5’ -> 3’
- Dans le sens OPPOSÉ au déplacement de la fourche
2) Fragments d’Okazaki réunis
Transfert d’un groupement nucléotyle
Le 3’-OH de la chaine en élongation est REQUIS
Qu’est-ce qui explique l’activité directionnelle de la polymérase
TOUJOURS de 5’ -> 3’
C’est le concept de liaison PHOSPHODIESTER entre les carbones 5’ et 3’ des 2 riboses qui explique l’activité directionnelle de la polymérase
Forme de l’ADN (3)
1) ADN-B:
- Hélice DROITE
- MAJORITÉ de l’ADN
2) ADN-A:
- Hélice DROITE
- Plus COMPACTE
- Sillons ÉGAUX
- DÉSHYDRATÉ
3) ADN-Z:
- Hélice GAUCHE
- PAS de sillon
- BEAUCOUP de G-C
Structure 3D de l’ADN (Qui, Quand, Comment, Quoi)
Qui: - Watson et Crick
Quand: - 1953
Comment:
1) Analyse de patron de diffusion de rayon X (Franklin et Wilkins 1952) 2) Règles de Chargaff
Quoi: - 2 brins antiparallèles formant une DOUBLE HÉLICE
Forces de l’ADN (4)
1) Effet hydrophobe (Paire de base)
2) Force de Van der Waals (Empilement)
3) Pont-H (A-T, C-G)
4) Ponts salins (Groupement phosphodiester - et Mg2+)
*Tm (T°C de fusion) = 50/50 simple/double brin
Quel est le dogme central de la biologie moléculaire?
L’ADN est le porteur de l’information génétique
