Cours 11: ARN Flashcards
(41 cards)
quelle est la structure de l’ARN
Ribose en 2’ (OH)
Uracile au lieu de Thymine
Ribonucléotide monocaténaire avec appariement des bases intramoléculaire
structure secondaire et tertiaire plus complexes et variées (ex: ARNt structure secondaire en trèfle.)
que sont les bases modifiés et qu’est ce qu’elles confèrent à l’ARN
les bases modifiées sont des bases qui subissent un traitement chimique (ex: méthylation) et permet d’augmenter la diversité structurale au delà des 4 nucléotides de base.
ces bases modifiés peuvent déterminer liaison avec protéines ou autre ARN
Comment se forme la synthèse D’ADN
3’OH attaque le P alpha d’un NTP
Formation de liaison phosphodiester
Libération de PPi
pas contre, pas d’amorces
Procaryote vs Eucaryote début de transcription
Procaryote = élément sigma de l’ARN polymérase est indispensable à la reconnaissance au promoteur . un seul Opéron qui définit plusieurs gènes qui sont transcrit comme un tout souis la commande d’un promoteur commun
Eucaryote = reconnaissance au promoteur se fait grâce aux protéines facteur généraux de transcription
(chaque gène possède son propre promoteur en général
comment positionner ARN polymérase correctement pour la bactérie
Sigma (sous unité ARN Polymérase) lie séquence -35 et -10 du promoteur
quel sont les trois étapes d L’initiation de la transcription chez les eucaryotes et les expliquer
1) remodelage de la chromatine = commence quand les protéines du facteur de transcription reconnaissent site de liaison spécifique autour de la région promotrice du gène qui sera activé. Ensuite, ces protéines recrutent des complexes de remodelage de la chromatine qui l’ouvrent et exposent région promoteur
2) recrutement du médiateur
3) recrutement de l’ADN polymérase et des facteur généraux de transcription
Comment fonctionne le remodelage de la chromatine par rapport a sa structure
Les histones qui forment les nucléosomes one une Queue N-terminale avec des lysines qui peuvent être modifiées par acétylation ou méthylation.
Combien d’histones et de combien de type différents dans un nucléosome
8 histones de 4 types différents
= plusieurs combinaisons de modification qui forment un code de régulation = code des histones
la modification ___ des queue de lysines ferment la chromatine
la modification ___ des queue de lysines ouvrent la chromatine
méthylation lysines 9 27 de histone 3
méthylation lysine 4 de histone 3 ou acétylation lysines 9 de de Histone 3 et lysine 16 de histone 4
enzyme qui aide a décondenser la chromatine et comment elle fait
Histone acétyltransférase HAT . en ajoutant des groupements acétyles sur les queues de Lys. des HDAC histones désacétylase annulent la modification
EN GÉNÉRAL, acétylation des histones sur résidus lysine = décondensation chromatine = activation catalysé par HAT
Que fait le médiateur dans ll’initiation de la transcription
il est recruté au promoteur et il est responsable du recrutement de Pol II en réponse aux facteurs de transcription.
il assemble les complexe de préinitiation
en gros ce que médiateur amène au promoteur, c’est un complexe de l’ARN Polymérase avec plusieurs facteurs généraux. (ARN polymérase = Pol II)
qui sont les facteurs généraux
TFIIB
TFIID Lient tout deux plusieurs éléments du promoteurs
TFIID formé de TATA binding protein et TAF1
qui est TATA box d’ou elle vient
TFIID (facteur généraux) est composé de TBD (tata binding box) .
cette sous-unité lie la TATA box. cette liaison est essentielle afin d’alligner correctement ARN Polymérase (Pol II) au bon endroit , près du site d’initiation
Qui est TAF1 et d’ou il vient
TAF1 est une protéine sous-unité qui provient du facteur de transcription TFIID.
il peut : 1) Lier TBP (TATA Binding Protein)
2) Activité HAT (Histone acetyltransférase = décondense chromtatine)
3)Bromodomaine qui peut lier les lysines acétylés
4) activité kinase
5) Activité Monoubiquitine ligase de l’histone H1
Qui est TFIIH et d’ou il vient
Après que Pol II avec quelques facteurs généraux se soit liés au promoteur, TFIIH est recruté
il forme 1) bulle de transcription grace aux hélicase que TFIIH possède et active ARN Polymérase
2) dégagement du promoteur , L’ARN Polymérase dégage le promoteur l’hybride ARN-ADN atteint sa longeuur mature, la bulle avance de 5’ a 3’ au brin codant
3) mode élongation = transition mode initiation en mode élongation
A quoi sert TFIIS
Lorsque il y’a un ARN Mésapparié, il ressort du site actif à travers le canal ou rentre les ribonucléotides
TFIIS simule ARN Polymérase à retracher ARN , la transcription peut reprendre à l’extremité 3’ de l’ARN TRONQUÉ
Expliquer terminaison chez les procaryotes
on destabilise hybride ADN-ARN
1) séquence d’ADN, aprés leur transcriptin, rendent complexe d’élongation instable (boucle en épingle de cheveux)_
2) protéine particulière en jeu qui favorise dislocation du complexe d’élongation (Rho).
Rho lie des séquences libres de ribosomes dans l’ARNm. ces séquences sont riches en C pauvres en G et ne forment pas des structures secondaires.
grâce à quel enzyme on peut utiliser le lactose comme source d’énergie
grâce a la B-galactosidade . elle converti le lactose en glucose et en galactose
elle converti aussi le lactose en alloalctose (isomérisation)
enzyme inductible = présente en grande quantité de lactose.
que fait l’allolactose
il ajuste le répresseur lac, dont l’expression dépend du gène lacl.
lorsque beaucoup de lactose comme source de carbon = induction B-galactosidase== formation allolactose = binding to represseur lac I = transformation qui entraîne la dissociation du répresseur lac I de son site de liaison sur l’opérateur
cette inactivation du lac I permet à l’ARN polymérase de commencer à traanscrire l’opéron et d’induire l’expression des gènes
Quelle est la relation entre AMPc et CRP
qu’est ce que la liaison CRP à ADN fait
En absence de AMPc, CRP à une faible affinité avec l’ADN
En présende de AMPc , CRP à une grosse affinité avec l’ADN (s’y fixe)
CRP = Catabolyte activator protein)
la laison CRP-ADN permet d’accélérer initiation transcription par ARN Polymérase
quel est l’inhibiteur de l’AMPc pour la trancription ?
le glucose
Manière pour répresseurs d’agir (2)
1) empêcher ARN Polymérase d’atteindre le promoteur (site fixation du répresseur très proche du promoteur , plus d’espace pour ARN polymérase de contact avec promoteur)
2) inhibition des réactions d’initiation (ex: isomérisation ou empêche enzyme de quitter promoteur)
que sont les deux domaines des FT
1) un ou des domaines de fixation à l’ADN Spécifiques
2) Domaine qui module la transcription
(1 FT régule des milliers de gènes) (peuvent aussi réprimer les gènes)
que sont les éléments de réponse
c’est les sites de fixation initiale des FT qui vont recruter les médiateurs , les facteurs généraux et l’ARN Polymérase
