Cours 12 - ARN régulateurs

Question 1

Les détails de la régulation génique ont été étudiées par qui?

Answer 1

Jacob et Monod

Question 2

Quel était le modèle proposé par Jacob et Monod?

Answer 2

Expression d’un gène pouvait être contrôlée par le produit d’un autre. Ils ne pouvaient pas dire si le facteur qui agissait comme répresseur était une protéine ou un ARN

Question 3

Les ARN régulateurs agissent sur quels processus?

Answer 3

Transcription et traduction

Question 4

Quel est le rôle de l’ARN 6S chez E coli?

Answer 4

Il se lit au facteur s70 de ARN polymérase. Ça réduit la transcription de promoteurs contrôlés par s70.

Question 5

Durant la phase stationnaire chez E coli (quand la croissance n’est plus exponentielle), quel facteur est produit? Quel est son rôle?

Answer 5

Le facteur sigma s
Il entre en compétition avec sigma 70 pour se lier à la polymérase

Question 6

Comment l’ARN 6S de E coli contribue à l’expression des gènes dépendants de sigma s?

Answer 6

L’ARN 6S se lie à sigma 70, donc l’empêche de transcrire. On fabrique donc le facteur sigma s, qui entre en compétition avec sigma 70.

Question 7

L’ARN 6S est quel type d’ARN?

Answer 7

ARN court

Question 8

Que sont les sARN?

Answer 8

ARN courts bactériens. Ils régulent la traduction et la dégradation des ARNm

Question 9

Quel est le rôle des sARN?

Answer 9

Ils régulent la traduction et la dégradation des ARNm

Question 10

Les sARN procaryotes proviennent d’où?

Answer 10

Codés par des petits gènes

Question 11

Les sARN eucaryotes proviennent d’où?

Answer 11

Maturés d’un précurseur constitué d’un grand ARN double brin

Question 12

Comment les sARN entrainent la dégradation des ARNm ou inhibent la traduction?

Answer 12

Ils s’apparient avec des séquences complémentaires des ARNm cibles.

Question 13

Qu’est ce que la protéine Hfq?

Answer 13

protéine bactérienne exerçant rôle de chaperone de l’ARN

Question 14

Qu’est ce qu’une protéine chaperone?

Answer 14

protéine dont la fonction est d’assister d’autres protéines (acides nucléiques) dans leur maturation, en leur assurant un repliement tridimensionnel adéquat

Elles se lient avec sARN avant l’appariement avec ARNm. Ça augmente leur stabilité

Question 15

Quel est le rôle de Hfq avec sARN?

Answer 15

Se lie avec sARN avant leur appariement avec ARNm et augmente leur stabilité

Question 16

Vrai ou faux? Hfq se lie à sARN avant que sARN se lie à l’ARNm

Answer 16

vrai

Question 17

Quel est le rôle du sARN RybB?

Answer 17

Il entraîne la destruction de ses ARNm cibles: les ARNm qui codent pour la protéine de mise en réserve du fer.
Donc, il régule le niveau de fer.

Question 18

La traduction ARN de rpoS est réprimée et activée par quel sARN?

Answer 18

Activée par DsrA et RprA
Réprimée par OxyS

Question 19

Comment DsrA et RprA activent la traduction de rpoS?

Answer 19

Ils s’apparient à la région ARNm de rpoS qui masque le site de liaison au ribosome. Ainsi le site de liaison est maintenant libre

Question 20

Les sARN RybBm OxyS, DsrA et Rpra agissent en trans ou en cis?

Answer 20

trans

Question 21

Que sont les ribocommutateurs?

Answer 21

Contrôlent expression des gènes en réponse aux changements de concentration de petites molécules
Ils régulent l’expression aux étapes de terminaison transcription et l’initiation de la traduction, en modifiant la structure de l’ARN

Question 22

De quoi est constitué un ribocommutateur?

Answer 22

Aptamère + plateforme d’expression
p7

Question 23

Comment un ribocommutateur altère la transcription/traduction?

Answer 23

Un ligand se lie sur l’aptamère
Provoque un changement de conformation de l’ARN
Ça modifie la structure secondaire de la plateforme d’expression
Donc, altère la terminaison de la transcription

Question 24

Les ribocommutateurs régulent la terminaison/initiation de la transcription ou la terminaison/initiation de la traduction

Answer 24

terminaison de la transcription et l’initiation de la traduction

Question 25

p8-9

Question 26

Chez les eucaryotes, les ribocommutateurs peuvent controler quoi?

Answer 26

épissage alternatif

Question 27

Qu'est ce qu'un processus d'atténuation?

Answer 27

La tige boucle du ribocommutateur prévient la transcription par la polymérase

Question 28

Chez B subtilis, la liaison de SAM entraine quoi?

Answer 28

Le RBS est masqué, donc le ribosome ne peut pas y accéder. L'initiation de la traduction est inhibée

Question 29

Les mécanismes d'atténuations provoqués par la formation de structures secondaires de l'ARN ont été découverts à la suite d'étude sur quoi?

Answer 29

Opéron tryptophane chez E coli

Question 30

L'opéron tryptophane contient des gènes responsable de quOI?

Answer 30

responsables de la biosynthèse de tryptophane

Question 31

L'expression de l'opéron tryptophane est controlée par quoi?

Answer 31

la quantitée cellulaire disponible de tryptophane, qui est mesurée par ARNt trp

Question 32

Comment est régulée la synthèse de tryptophane dans l'opéron trp

Answer 32

À la fin de la région leader et avant trpe, on retrouve un terminateur de transciption, composé d'une loop. À des hauts niveaux de tryptophanes, la transcription arrête à cet endroit. Quand on est en manque de tryptophane, une tige boucle se forme et empêche la terminaison

Question 33

Qu'est ce que l'interférence à l'ARN?

Answer 33

Processus d'extinction d’expression de gènes par ARN courts

Question 34

L,extinction d'expression peut se faire par quoi?

Answer 34

1. inhibition de traduction de ARNm 2. dégradation ARNm 3. modifications de chromatine qui entraine répression de transcription

Question 35

Que sont les ARN cours interférents?

Answer 35

Produit artificiel à partir de précurseur ARNdb

Question 36

Qu'est ce que l'ARN courte tige boucle?

Answer 36

Produit artificiel

Question 37

Qu'est ce que le micro ARN

Answer 37

Dérivés d’ARN encodés par des gènes codant ou non pour des protéines

Question 38

Comment fonctionnent les ARN courts?

Answer 38

Inhibent expression gènes à la suite de leur appariement avec leurs ARNm cibles

Question 39

Quelles sont les trois facons qu'un ARN court peut inhiber l'expression des gènes?

Answer 39

1. Dégradent ARNm 2. Inhibent traduction ARNm 3. Induisent modifications de chromatine qui entraine répression de transcriptio

Question 40

Que sont les RISC?

Answer 40

Complexes protéiques qui utilise un petit ARN pour reconnaître un ARNm cible et ensuite le bloquer ou le détruire.

Question 41

Qu'est ce que Dicer?

Answer 41

Reconnaît + clive ARN longs double-brin ou structures tige-boucle formées par précurseurs de miARN

Question 42

Un siARN, shARN ou miARN sont dénaturés pour engendrer quoi?

Answer 42

ARN guide ou ARN support (souvent détruit)

Question 43

Comment fonctionnent les RISC?

Answer 43

Ils sont dirigés sur ses cibles par complémentarité de séquence entre ARN guide et ARN cible. Si la complémentarité est forte, l'ARNm cible est dégradée Argonaute est la sous-unité responsable du clivage de l'ARNm

Question 44

Comment sont formés les miARN?

Answer 44

Généré par 2 réactions successives de clivage à partir d’un ARN + long transcrit du génome

Question 45

Avant leur maturation les miARN peuvent être présent où dans l'ARN?

Answer 45

introns et exons

Question 46

Quelle enzyme permet le clivage nécessaire à la formation des miARN?

Answer 46

Drosha, qui est associée à Pasha

Question 47

La maturation des miARN a lieu où dans la cellule?

Answer 47

Dans le noyau

Question 48

Quelle est la deuxièeme enzyme responsable du clivage du pré-ARN?

Answer 48

Dicer

Question 49

De quoi est composé Dicer?

Answer 49

2 modules RNase 1 domaine de liaison appelé PAZ (pour piwi, argonaute et zwille)

Question 50

La forme active de miARN est composé de quoi?

Answer 50

Un ARNsb appelé l'ARN guide

Question 51

L'ARN guide est incorporé où?

Answer 51

Dans le RISC

Question 52

Lorsque l'ARN guide du RISC se lie à l'ARN cible, ça permet quoi au complexe RISC?

Answer 52

D'éteindre l'expression de gène cible

Question 53

Quel est le constituant principal de RISC?

Answer 53

protéine argonaute, qui clive l'ARN

Question 54

Quand argonaute clive l'ARNdb, on obtient quoi?

Answer 54

ARN guide et un ARN support

Question 55

Quelles structures ont un domaine PAZ?

Answer 55

Dicer et Argonaute

Question 56

Quel est le précurseur des miARN, shARN et siARN ?

Answer 56

ARNdb

Question 57

Les siARN peuvent réprimer l’expression des gènes au niveau de la transcription par des modifications de _

Answer 57

la chromatine

Question 58

p35-36

Question 59

Quelle est la conséquence de l'inactivation du chromosome X chez les femelles?

Answer 59

L’inactivation du chromosome X rend l’un des deux chromosomes X quasiment silencieux, pour éviter une double dose de protéines codées par les gènes du X.

Question 60

Qu'est ce que l'ARN Xist?

Answer 60

ARN régulateur qui inactive un seul chromosome X chez les femelles de mammifères

Question 61

Quel ARN inactive un chromosome X?

Answer 61

Xist