Cours 7 - Altérations, réparations et mutations de l'ADN ! Flashcards
(75 cards)
1
Q
De quoi dépend la probabilité d’apparition d’une mutation?
A
La fréquence de dommages
La vitesse de réparation
Du potentiel mutagène des dommages
2
Q
Quelles sont les causes de mutations?
A
- Erreurs de réplication (la machinerie n’est pas 100% fidèle)
- Les lésions chimiques ou physiquess:
- L’ADN subit des agressions par des agents chimiques, naturels ou artificiels, et par des radiations qui peuvent modifier les bases et casser l’ADN.
- Ça crée des mutations (définitif) et peut bloquer la réplication/transcription
3
Q
Qu’est ce qu’une mutation?
A
Tout changement de séquence de l’ADN
4
Q
Qu’est ce qu’une substitution dans une mutation?
A
Changement d’une base par une autre, transition ou transversion
5
Q
Qu’est ce que MutS?
A
Protéine qui reconnait les mésappariement chez e coli
6
Q
Explique le fonctionnement de MutS
A
- Il inspecte et reconnaît le mésappariement
- Il recrute MutL, puis MutH, qui lui va faire une incision près du mésappariement (sur le brin non-méthylé) au niveau du site GATC
IMPORTANT: MutL+MutH sont sur le mismatch. MutS va sur GATC (??) - MutH est activé
- MutH clive en 5’ de GATC et en 3’ du mésappariement
- Une hélicase enlève le bout d’ADN contenant le mésappariement
- ADN pol III et la ligase remplissent la brèche
7
Q
Quel est le rôle de DAM méthylase?
A
Elle méthyle le A de la séquence GATC. ca permet de méthyler les brins d’ADN chez les procaryotes
8
Q
Une cytosine désaminée donne:
A
Uracile
9
Q
Quelle est la base la plus fréquemment désaminée? Elle va donner quoi?
A
Cytosine, va donner uracile
10
Q
L’uracile s’apparie à quoi?
A
Adénine
11
Q
Une adénine désaminée donne:
A
Hypoxanthine
12
Q
Un uracile est une _ désaminée
A
Cytosine
13
Q
Un hypoxanthine est une _désaminée
A
Adénine
14
Q
À quoi s’apparie une hypoxanthine?
A
Cytosine
15
Q
Une guanine désaminée donne _
A
Xanthine
16
Q
À quoi se lie une xanthine?
A
Cytosine
17
Q
Qu’est ce que du 5’méthylcytosine?
A
Cytosine méthylé
18
Q
La désamination d’une 5’méthylcytosine donne quoi?
A
Thymine
19
Q
C’est quoi une dépurination? Ça donne quoi?
A
Hydrolyse spontanée de la liaison N-Glycosidique (lien entre base et sucre). Crée le site AP (désoxyribose sans purine)
20
Q
Une oxydation qui dommage l’ADN vient de source exogène ou endogène?
A
Peut être les deux
20
Q
Une oxydation de l’ADN peut venir de quelles sources?
A
Endogène: radicaux libres créés lors de la chaine respiratoire
Exogène: radiations, UV, agents chimiques
21
Q
L’oxydation de quelle base est la plus fréquente?
A
Guanine
22
Q
La guanine oxydée s’apparie avec quelle base?
A
Adénine
23
Q
Une dépurination est de source endogène ou exogène?
A
Endogène
24
Qu'est ce qu'une alkylation?
Groupements méthyle (CH3) ou éthyle (CH2CH3) sont
ajoutés sur les phosphates ou les bases de l’ADN
25
L'alkylation est de source exogène ou endogène?
Exogène
26
Quel est un site sensible à l'alkylation dans les bases?
Oxygène du carbone 6 de la guanine
27
Que génère l'oxygène du carbone 6 de la guanine quand il est alkylé?
O6-méthylguanine
28
O6-méthylguanine peut s'apparier à quelle base?
Thymine
29
L'ADN absorbe les longueurs d'ondes près de _nm
260nm
30
Les UV sont entre _ et _ nm
100-400
31
Quelles sont les conséquences directes lorsque les bases absorbent les UV?
Fusion photochimique de 2 pyrimidines adjacentes. (voir word):
1. Dimères cyclobutaniques de pyrimidines (CPD)
2. Photoproduit pyrimidine (6-4) pyrimidone (6-4PP)
32
Quels sont les dommages indirects des UV?
Excitent d'autres chromophores cellulaires: ex tryptophane, sérotonine, etc. Ces chromophores excités génèrent des ROS. L'ADN se fait oxyder par ces ROS
33
Que causent les rayons gamma et x sur l'ADN?
Cassures bicaténaires (brise la double-hélice). Ils attaquent le désoxyribose du squelette.
34
Que sont les analogues de bases?
Composés qui se substituent aux bases normales
35
Qu'est ce que le 5-BrDU?
Analogue de base le plus mutagène
Analogue de la thymine
S'apparie à la guanine
36
Que provoquent les agents intercalants dans l'ADN?
Addition ou délétion d'une ou plusieurs paires de bases
37
Pourquoi les addition/délétions causées par les agents intercalants sont problématiques?
Problème pour la traduction: le reading frame est décalé
38
Quelles sont les deux conséquences principales des altérations de l'ADN?
- Empêchent la réplication/transcription
- Provoquent un changement permanent de l'ADN après réplication
39
Qu'est ce que la photoréactivation?
Réparation des dommages par réversion directe:
- La photolyase utilise l'énergie de la lumière pour rompre les liens covalents entre les pyrimidines adjacents (utilise la lumière UV longue pour réparer les dommages fait par les courts.)
- Présent chez les procaryotes et eukaryotes inférieurs.
40
Quelle enzyme répare les O6-méthylguanine? Comment elle fonctionne?
Méthyltransférase
Enlève le méthyl de la guanine et le transfère sur ses cystéines
Enzyme suicide :'(
41
Comment fonctionne l'excision de base (BER)?
Enzyme spécifique qui va enlever seulement la base
endommagée. Une glycosylase différente pour chaque type de dommage
42
Vrai ou faux? NER et BER sont spécifiques de lésion
Faux, seulement BER (un glycosylase par lésion)
NER reconnaît plutôt des déformations
43
NER est responsable de reconnaître quels dommages?
Ceux non-reconnus par les autres mécanismes
- Reconnaît une déformation de la double hélice
44
Comme NER est générale, pourquoi on a besoin de la BER?
1. BER est moins énergivore
2. Ce n'est pas tous les dommages qui créent une distorsion. Donc, NER passerait à côté
45
Qu'est ce que la synthèse translésionnelle?
Permet de synthétiser de l'ADN, lorsqu'un dommage n'a pas été réparé et que l'ADNpol est bloquée. Ça fait beaucoup d'erreurs, mais cest mieux que tout arrêter !
46
Explique la translésion chez les mammifères
1. L'anneau coulissant PCNA est ubiquitiné suite à un blocage de l'ADNpol par un dommage
2. PCNA-ubi recrute ADNpol translésionnelle
47
Vrai ou faux? NER et BER ont un brin matrice comme modèle
Vrai
48
Lors de cassures bicaténaires, qu'est ce qu'on utilise comme modèle?
Chromosome homologue
49
Quelles peuvent être des causes de cassures bicaténaires?
Radiations ionisantes/agents mutagènes qui causent des cassures directement ou via un blocage de la fourche de réplication
50
Explique le processus de recombinaison avec cassure bicaténaire
notes
51
Qu'est ce que la théorie mutagenèse somatique?
La probabilité d'apparition d'une mutation dépend de: – La fréquence de dommages – La vitesse de réparation – Du potentiel mutagène des
dommages
On garde les sélections de mutations avantageuses
52
Une délétion dans l'ADN peut être causée par quoi?
Quand un brin matrice fait une boucle
53
Pendant la réplication, quelle structure s'occupe de corriger les erreurs?
Exonucléases 3'
54
Quels sont les défis que doivent répondre les exonucléases 3'?
- Inspecter/réparer les mésappariement vite, avant la réplication de l'ADN
- Doit reconnaitre le nucléotide mal placé, et non celui sur l'autre brin
55
Comment les mésappariements sont réparés chez les eucaryotes?
Les brins d'ADN ne sont pas méthylés comme chez les procaryotes. À la place, on a des cassures qui servent de point de départ à la réparation sur les fragments d'Okazaki.
On a aussi des analogues au sysème MUT, qui détecte/casse l'ADN au mésappariement
56
Chez e coli, comment on corrige un mésappariement?
1. Les séquences d'ADN sont méthylées aux sites GATC par la DAM méthylase
Lors de la réplication, seul le brin de l'ADN fille qui a été utilisé comme template est méthylé. On a donc un moment où un seul brin est méthylé.
Le système mut va sur le brin non méthylé et localise les mésappariements
57
La 5'méthylcytosine se lie à quelle base?
Guanine
58
Rappel: La 5'méthylcytosine n'est pas une altération !
59
Pourquoi on dit que la 5'méthylcytosine n'est pas une altération?
Car elle se lie toujours à la guanine, comme si c'était une cytosine standard
60
Les désaminations sont de source endogène ou exogène?
Endogène
61
Quelle est la mutation la plus fréquence?
5'méthylcytosine-Guanine
devient
TA
(C devient T)
62
Les dépurinations sont causées par des sources endogènes ou exogènes?
Endogènes
63
C'est quoi un dimère cyclobutanique de pyrimidine? C'est causé par quoi?
Liaison entre deux pyrimidines adjacentes. Crée une distortion p/r à la conformation B de L'ADN. Ça bloque les ADN et ARN pol
Causé par les UV
64
C'est quoi un photoproduit de pyrimidine? C'est causé par quoi?
Liaison entre deux pyrimidines adjacentes, cause une grande distortion p/r à la conformation B de l'ADN (+ grande que par un CPD). Bloque les ADN et ARN pol
Causé par les UV
65
Les altérations causées par les analogues de bases viennent de sources exogène ou endogène?
Exogène
66
Quel est l'analogue de base le plus mutagène?
5-BrDU
67
Le 5-BrDU est analogue à quoi et s'apparie à quoi?
Analogue à la thymine, s'apparie à la guanine
68
Quelle serait une hypothèse pour expliquer la délétion causée par un agent intercalant?
Il serait capable de stabiliser une boucle (qui crée une délétion)
69
Les agents intercalants sont de source endogène ou exogène?
Exogène
70
Qu'est ce que la réversion directe?
Réparation du dommage, sans le remplacer
71
C'est quoi la recombinaison homologue?
Permet des échanges génétiques entre région
homologues
1. Pendant la méiose (permet la diversité)
2. Réparation de l'ADN
72
Qu'est ce que la voie RecBCD?
Complexe enzymatique qui sert à la réparation des cassures bicaténaires chez E. coli.
- Il déroule la double hélice tout en découpant les brins.
- Rendu au site Chi, Il arrête de dégrader un des deux brins. Il va garder un brin simple qui va être utilisé pour la recombinaison homologue.
- Il va être invadé par RecA
73
Explique le processus d'invasion des brins par RecA
1. RecA se lie sur l'ADN simple brin
2. Il forme un filament actif, qui cherche dans le génome une séquence identique sur un ADN double brin intact.
3. Quand il trouve une région homologue, le brin simple s’insère dans la double hélice et déplace l’un des brins d’origine. C’est l’invasion de brin.
74
Les exonucléases réparent les lésions à quel moment?
Pendant la réplication
