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Cours 12 : Synthèse protéique Flashcards

(80 cards)

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1
Q

Vrai ou faux : le code génétique classique est utilisé par tous les organismes (à part quelques exceptions)

A

Vrai

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Q

Qu’est ce qu’un codon

A

3 lettres associées à des triades nucléotiques d’ARNm (ou ADN d’un gène)

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Q

Dans quel sens sont traduits les codons

A

Un à la suite de l’autre dans le sens 5’–>3’

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Q

Combien de codons existe-t-il

A

64 codons (61 qui codent des AA et 3 qui donnent un signal STOP)

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Q

Vrai ou faux : le code génétique est dépourvu d’ambiguïté

A

Vrai, tout codon ne prescrit qu’une seule espèce d’AA

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6
Q

Vrai ou faux : le code génétique est dégénéré

A

Vrai, Plusieurs codons pour un AA (codons synonymes)

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7
Q

Quel est l’avantage des codons synonymes

A

Atténuer l’effet des mutation

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8
Q

Quels sont les codons de terminaison

A

UAA
UGA
UAG

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9
Q

Qu’est ce que le cadre de lecture

A

Le point de départ potentiel d’une suite de codon

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10
Q

Combien y a-t-il de cadre de lecture possible

A

3

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11
Q

Qu’est ce qu’une mutation génétique silencieuse

A

Ne change pas l’AA dans la protéine

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12
Q

Qu’est ce qu’une mutation faux sens

A

Change l’AA dans la protéine (effet important)

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13
Q

Qu’est ce qu’une mutation non-sens

A

Un AA devient un STOP (accumulation de fragments de protéines)

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14
Q

Qu’est-ce qu’une mutation de continuation

A

STOP devient un AA (protéine a une extension = mauvais pour la cellule)

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15
Q

Qu’est ce que peut entraîner un décalage de lecture

A

Une mutation, une addition ou la perte d’un ou 2 nucléotides

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16
Q

Quel est le rôle des ARNt

A

Interprètes à la lecture du code génétique (médiatrice entre la séquence nucléotidique de l’ARNm et la séquence d’AA)

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17
Q

Combien doit-il y a voir, au minimum, d’ARNt

A

20 différents (1 pour chaque AA)

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18
Q

Forme 2D des ARNt

A

feuille de trèfle avec tige

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19
Q

Que forme les bases de l’extrémité 3’ et 5’ de l’ARNt

A

La tige acceptrice

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20
Q

Qu’est ce qu’un anti-codon

A

séquence de 3 bases qui se fixe de façon complémentaire au codon de l’ARNm

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21
Q

Que comporte le lobe t-psy-c de l’ARNt

A

Thymidine
Pseudo-uridine
cytidine

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22
Q

Que comporte le lobe D de l’ARNt

A

résidus dihydro-uridine

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23
Q

Comment se fait l’appariement codons-anticodons

A

De type Watson-Crick (A-U et G-C)
Brins anti-parallèles dans les zones bicaténaires

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24
Q

Qu’est-ce que l’appariement de Wobble (codons-anticodons)

A

Appariement à choix multiple où la position 5’ de l’anticodon possède une flexibilité de conformation

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25
Comment est appelée la position 5' de l'anticodon
Position de flottement
26
Comment se nomme la molécule désaminée d'adénine en position 5' de l'anticodon
Une inosine
27
Avec quelle molécule l'inosine peut partager des liaisons hydrogènes
Adénine Cytosine Uridine
28
Qu'est-ce qu'un ARNt isoaccepteur
Diverses molécules d'ARNt qui portent tous le même AA
29
Quel est le produit de la réaction de liaison par covalence d'un AA à l'extrémité 3' d'un ARNt
Une réaction d'aminoacylation nommé aminoacyl-ARNt (ARNt activées ou chargées)
30
Vrai ou faux : la liaison formée dans l'aminoacyl-ARNt est riche en énergie
Vrai, on dit alors que l'AA est activé
31
Quelle sont les enzymes qui catalysent la réaction d'aminoacylation entre l'ARNt et l'AA
aminoacyl-ARNt synthétases
32
Combien de sorte d'aminoacyl-ARNt synthétase
Au moins 20 (1 synthétase peut reconnaître plusieurs ARNt isoaccepteurs)
33
Réaction globale de synthèse d'aminoacyl-ARNt
AA + ARNt + ATP --> Aminoacyl-ARNt + AMP + PPi
34
2 étapes de la synthèse d'aminoacyl-ARNt
1. Formation d'un intermédiaire réactionnel (aminoacyl-adénylate) 2. Transfert du groupe aminoacyle de l'intermédiaire à l'ARNt
35
Vrai ou faux : Les ribosomes sont des ribonucléoprotéines
Vrai, ils sont fait 2/3 d'ARN et 1/3 de protéines
36
Ribosomes des procaryotes vs eucaryotes
Procaryote : 50S + 30S = 70S Eucaryotes : 60S + 40S (unité Svedberg) = 80S
37
Que fait le site de fixation P (peptidyle) du ribosome
Contient une molécule d'aminoacyl-ARNt qui porte la chaîne polypeptidique naissante
38
Que fait le site de fixation A (aminoacyl) du ribosome
Contient l'autre molécule d'aminoacyl-ARNt
39
Quelle est la matrice de la synthèse protéique
ARNm
40
3 étapes de la synthèse protéique
1. Initiation (assemblage du complexe de traduction autour du 1er codon de l'ARNm) 2. Allongement/élongation 3. Terminaison
41
Qu'est ce qui est obligatoire pour le démarrage de la synthèse protéique
L'assemblage d'un complexe d'initiation au départ du cadre de lecture
42
Que comprend le complexe d'initiation du ribosome
les 2 éléments du ribosome ARNm servant de matrice à la traduction ARNt initiateur particulier Protéines auxiliaires (facteurs initiations)
43
Quel est le rôle de la formation d'initiation
Imposer le bon codon d'initiation et le bon cadre de lecture soit choisis (avant que la traduction ne démarre)
44
2 types de molécules de méthionyl-ARNtMét qui reconnaissent le codon AUG
1. ARNt initiateur : reconnait seulement le codon AUG 2. ARNt initiateur qui reconnait les codons AUG (méthionine) à l'intérieur de la séquence codante
45
Vrai ou faux : chez les eucaryotes, l'ARNt initiateur est formylé
Faux, seulement les ARNt initiateurs des bactéries (ARNtfMet)
46
Comment se nomme l'ARNtinitiateur non-formylé chez les eucaryotes
Met-ARNtiMet
47
Quel est le premier AA incorporé en tête des protéines chez les bactéries vs eucaryotes
Bactérie : formylméthionine Eucaryotes : méthionine
48
3 étapes de l'initiation de la traduction chez les procayotes
1. Dissociation des s-unités ribosomales (avec facteurs 1 et 3) 2. Assemblage du complexe d'initiation 30S (fMetARNtfMet + IF-2 + GTP) 3. La s-unité 50S s'associe (ribosome prêt à se fixer à un 2e ARNt)
49
Quels sont les rôles de IF-1, IF2, et IF3 (facteurs d'initiation traduction protéique; procaryotes)
IF-1 : Dissociation de la grande et de la petite s-unité IF-2 : Protéine de liaison au GTP, lie le f-MetARNtMet initiateur et aide sa fixation à la petite s-unité IF-3 : fixe l'ARNm sur le ribosome et empêche l'association des 2 s-unités du ribosome
50
De quoi dépend le choix du codon d'initiation chez les procaryotes (2)
1. Interaction codon-anticodon 2. Interaction petite s-unité ribosomale-matrice ARNm
51
À quel endroit sur l'ARNm s'attache la sous-unité 30S du ribosome
À une région riche en purines, placée en amont du codon initiateur de l'ARNm
52
Comment est appelée la région riche en purine en amont du codon initiateur à laquelle se lie la sous-unité 30S
Séquence Shine-Dalgarno
53
Vrai ou faux : la séquence Shine-Dalgarno est complémentaire d'un segment riche en purines du bout 3' de la molécule d'ARNr 16S
Faux, elle est complémentaire à une séquence riche en pyrimidines
54
Vrai ou faux : l'ARNm des eucaryotes contient des séquences de Shine-Delgarno
Faux, l'ARNm en est dépourvu
55
Qu'est ce que le balayage (initiation de la traduction ; eucaryotes)
La s-unité 40S se fixe à l'extrémité 5' et parcourt l'ARNm de 5' en 3' jusqu'à ce qu'elle rencontre le codon initiateur
56
Qu'est ce que la séquence Kozak
La séquence consensus qui désigne le bon codon d'initiation (ACCAUGG)
57
4 étapes le l'initiation de la traduction protéique chez les eucaryotes
1. Dissociation des 2 s-unités du ribosome 2. Assemblage du complexe ternaire avec 40 S (MetARNtMet + IF2 + GTP) 3. Recrutement de 40 S (attachement à la coiffe) + balayage 4. Association 60S-40S
58
Combien de facteurs d'initiation sont désignés par le sigle eIF
12
59
Rôle eIF2 (initiation traduction; eucaryotes)
Liaison au GTP, lie MetARNtMet initiateur et aide sa fixation à 40S
60
3 sous unités de eIF4F + rôles
eIF4E : reconnait la coiffe eIF4G : pont entre protéine et 40S eIF4A : Balayage (reconnait codon d'initiation)
61
microcycle de 3 étapes pour allonger la chaîne d'AA lors de la traduction
1. Mise ne place correcte de l'aminoacyl-ARNt au site A 2. Formation de la liaison peptidique (entre AA du site A et P) 3. Translocation (avancerment du ribosome d'un codon sur l'ARNm)
62
Chez les bactéries, quel facteur catalyse l'étape de la mise en place (1) du microcycle d'allongement (traduction protéique)
Facteur d'élongation EF-Tu (a un site de fixation pour le GTP)
63
Rôle du complexe EF-Tu-GTP (traduction protéique)
Reconnaît des propriétés communes à la structure tertiaire des molécules d'ARNt et se fixe fermement à toutes les molécules d'aminoacyl-ARNt (sauf fMet)
64
Qu'arrive-t-il quand les bases de l'anticodon de l'aminoacyl-ARNt d'un complexe ternaire sont correctement appariées au codon du site A
Hydrolyse du GTP en GDP +Pi et changement de conformation de EF-Tu-GDP
65
Quelle conséquence a l'hydrolyse du GTP en GDP lors de l'association codon-anticodon au site A
EF-Tu-GDP abandonne l'aminoacyl-ARNt et quitte le complexe d'élongation
66
Que fait EF-Ts et quel est son équivalent chez les eucaryotes (et EF-Tu)
EF-ts = EF1B : aide EF-Tu à échanger GDP pour GTP EF-Tu = EF1A
67
Vrai ou faux : il est possible de former une liaison peptidique avant l'hydrolyse du GTP par EF-Tu
Faux (mécanisme de limitation d'erreurs)
68
Enzyme responsable de la formation du lien peptidique dans la traduction protéique
Peptidyl transférase (dans la grande s-unité du ribosome)
69
Dans quel sens se fait la synthèse protéique et dans quel sens se déplace le ribosome
Synthèse : Du N-terminal au C-terminal Ribosome : 5' vers 3'
70
Qui catalyse la translocation une fois la liaison peptidique formée (traduction protéique)
EF-G
71
Quelle est la conséquence du glissement du ribosome d'un codon
Il fait passer le peptidyl-ARNt du site A au site P
72
Vrai ou faux : La translocation lors de la traduction protéique requiert l'hydrolyse d'un GTP
Vrai
73
Que se passe-t-il au site E du ribosome
L'ARNt déchargé y arrive en provenance du site P pour ensuite être libéré
74
Quel est l'énergie requise pour la formation d'une liaison peptidique
4 ATP - 2 ATP (aminoacyl-ARNt) - 2 GTP (Facteur Tu + translocation)
75
Que permet l'hydrolyse du GTP pendant l'élongation (traduction protéique)
Assure l'irréversibilité des réactions d'élongation
76
3 facteurs de terminaison chez E. Coli + rôle (traduction protéique)
RF1 : Reconnait UAA et UAG RF2 : Reconnait UAA et AGA RF3 : lié à GTP et rend + efficace l'action de RF1 et RF2
77
Quand est-ce que se produit la terminaison
Lorsque qu'après une translocation, le site A du ribosome rencontre un codon d'arrêt (UGA, UAG, UAA)
78
Vrai ou faux : les codons de terminaison sont reconnus par un ARNt
Faux, ils sont reconnus par des facteurs de relargage
79
Qu'arrive-t-il lorsque RF3/GTP + RF1 ou RF2 se fixe à l'ARNm au site A
Modification de l'activité de la peptidyl-transférase : hydrolyse la liaison ester du peptidyl-ARNt
80
2 facteurs de relargage chez les eucaryotes + rôle
eRF1 : reconnait les 3 codons de terminaison eRF3 : équivaut à RF3 (procaryotes)

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