cours 2 Flashcards

(47 cards)

1
Q

donne moi un exemple où la chaine latérale est impliquée dans le lien peptidique.

A

Glutation (lien atypique avec le carboxyle du carbone Y avec l’amine du groupe cystéine).

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1
Q

V ou F - les chaines latérales ne sont habituellement pas impliqués dans les liens peptidiques.

A

V (habituellement) sauf quelques contres exemple.

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2
Q

V ou F les liens peptidiques sont planaires

A

V

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3
Q

Cis ou trans la forme la plus abondande dans les proteine? PK?

A

trans est plus étiré moins d’encombrement stérique,

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4
Q

CIs ou trans que les C alpha peptidique occupent les côté opposé au groupe peptidique ?

A

Trans

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5
Q

Quel acide aminé est une exception consernant l’énergie cis ou trans ?

A

Proline, autant d’énergie en trans ou cis

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6
Q

comment se nomme l’angle entre le carbone alpha et son amine

A

phi

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7
Q

comment se nomme l’angle entre le carbone alpha et son carbonyle

A

psy

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8
Q

quel acide aminé les angles psy et phi sont fixes ?

A

proline

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9
Q

definition de structure secondaire

A

repliment local de plusieurs acide aminés pour former des motif

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10
Q

les formes des structures secondaire sont maintenue par des liens covalent (V OU F)

A

F

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11
Q

quels sont les deux motifs les plus courant au niveau secondaire?

A

Feuillet plissé beta
helice alpha

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12
Q

Dans l’helice alpha, quest ce qui permet la formation de l’hélice?

A

Des ponts H entre le H de groupe amine (n) et le O du carboxyle en position (n-4)

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13
Q

36 acides aminés donnent environ combien d’hélice alpha?

A

10

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14
Q

les helices sont plus left-handed ou right-handed ? Pk?

A

right-handed, moins d’encombrement stérique

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15
Q

Les angles des angles phi et psy des helices alphas rights-handed?

A

-60 degre et -50 degré

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16
Q

quels acides aminées sont favorables et défavorables au helice alpha ?

A

favorable = méthionine, alanine, leucine, lysine, acide glutamique
défavorable = glycine et proline

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17
Q

pour quels raisons la glycine est proline sont défavorables aux helices alpha ?

A

Gly = faible contrainte en raison de l’absance de chaine latérale, très flexible
Pro = forte contraite forme une distorsion de l’hélice et pas de H sur le lien peptidique donc pas de pont H possible.

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18
Q

V ou F on retrouve parfois la glycine et proline au extremité de l’hélice?

19
Q

feuillet plissé beta ou les helices alpha qui sont formés de plusieurs chaines polypeptidiques ?

A

feuillet plissé beta

20
Q

les feuillets plissé parrallèles sont plus sable que les antiparrallèle (V OU F)

21
Q

les chaines latérales sont projetés du même plan que le plan du feuillet (V OU F)

22
Q

en général les feuillets beta sont formés de combien de segments polypeptidiques et ils ont combien d’acide aminés.

A

(2 à 15) et (6 en moyenne)

23
Q

quel sont les A.A composant la fribroine de la soie ? et ses caractéristiques ?

A

Gly-ser-gly-ala-gly-ala, feuillets beta anti-parrallèle, lien covalent (résistant) et pont H (souple)

24
sachant que les formes feuillets beta et helice alpha correspondent 50% de la proteine, c'est quoi qui correspond au 50% autre.
solénoide et boucle
25
quel boucle prend moins d'espace les boucles entre les feuillets parallèle ou les feuillet anti parrallèle ?
anti-parrallèle
26
definition de struture tertiaire ?
repliment du polypeptides en 3 dimensions, assemblage de plusieurs motif
27
les repliments en structure tertiaire depend de quoi ?
pont H, liaison électrostatique, effet hydrophobe et liaison covenlatente (pont disulfure)
28
Le tonneau alpha/beta est composé de quoi ?
8 feuillet beta et 8 helice alpha
29
comment se nomme les proteines de liaison de l'ADN et ARN ?
motif a doigt de zinc
30
quel est la principale force de repliment de la protéine ?
l'effet hydrophobe
31
les liaisons covalentes dans la structure tertiaire se fait grace à quel acide aminé?
cysteine
32
les liaisons covalents se font uniquement entre différent polypeptides. (V ouF)
F aussi à l'intérieur même d'un polypeptide
33
c'est une réduction qui permet les liaison covalente (V ou F)
F oxydation, c'est réversible
34
les pont disulfure sont catalysé par quel enzyme ? et ouo se trouve cette enzyme?
disulfure isomérase, réticulum endoplasmique
35
quels conditions pour dénaturer une proteine ? est-elle encore fonctionel? et est-ce réversible ?
1- PH, concentration saline, température inadéquat 2- non 3- oui
36
Définition des chaperonnes ?
ce sont des molécules ayant besoin d'atp qui s'assur au bon repliment de la proteine. ils existent plusieurs type. (elles replient la proteine)
37
quel est le nom de l'enzyme qui assure la dégradation des proteine mal replié?
protéasome
38
comment les protéasome font pour detecter les proteine à détruire ?
enzyme ubiquitine ligase E3 -> lie une ubiquitine avec la chaine latéral des lysine -> protéasome peut reconnaitre
39
structure quaternaire (protomère), définition
assemblage de plusieurs polypeptides identique (monomère) ou différent (hétéromère)
40
la kréatine kinase est impliqué dans quoi ?
la génération des molécule énergitique
41
nommes les 3 types de kréatines kinases et leur emplacement.
MM = squelettique MB = cardiaque BB= digestif et cérébrale
42
les maladies causé par des dépots amyloide ont un point en commun, c'est quoi?
forme des feuillets B indestructible pour les protéase , tres résistent.
43
exemple de maladie de structure de la proteine
anémie falciforme en position 6 la valine remplace la glutamine ce qui modifie la structure de la proteine
44
exemple de complémentarité moléculaire
antigène/ anticorps
45
les molécules complémentaire sont principalement lié par des liens covalents ( V OUF )
F, non covalent
46